More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1970 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1970  glutathione peroxidase  100 
 
 		 193 aa  399  9.999999999999999e-111  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4659  glutathione peroxidase  71.78 
 
 		 208 aa  246  2e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0237  putative glutathione peroxidase transmembrane protein  59.79 
 
 		 205 aa  235  4e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1677  glutathione peroxidase  75.64 
 
 		 151 aa  233  9e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0042  glutathione peroxidase  68.15 
 
 		 212 aa  226  1e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.490429  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0018  glutathione peroxidase  64.38 
 
 		 208 aa  224  8e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3912  glutathione peroxidase  60.34 
 
 		 189 aa  222  2e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.295477  normal  0.0278841 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5165  Peroxiredoxin  66.88 
 
 		 202 aa  219  9.999999999999999e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.648504  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0169  glutathione peroxidase  57.8 
 
 		 231 aa  214  5e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4024  glutathione peroxidase  60.98 
 
 		 213 aa  212  2.9999999999999995e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0488  glutathione peroxidase  60.76 
 
 		 185 aa  211  3.9999999999999995e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.642227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4667  glutathione peroxidase  59.74 
 
 		 199 aa  210  1e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0162  glutathione peroxidase  58.75 
 
 		 231 aa  209  2e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.520461 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3374  glutathione peroxidase  61.94 
 
 		 195 aa  207  1e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.479812  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0307  putative glutathione peroxidase transmembrane protein  57.23 
 
 		 233 aa  201  6e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0461  glutathione peroxidase  50.61 
 
 		 191 aa  187  5e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01222  ABC transporter vitamin B12 uptake permease  52.5 
 
 		 185 aa  168  5e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.039958  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1409  glutathione peroxidase  55.03 
 
 		 184 aa  167  1e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2526  glutathione peroxidase  49.38 
 
 		 180 aa  164  5e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.327392  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1246  glutathione peroxidase  55 
 
 		 192 aa  162  4.0000000000000004e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.281187  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2618  glutathione peroxidase  57.14 
 
 		 195 aa  160  1e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.137836  normal  0.142472 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1570  Glutathione peroxidase  54.48 
 
 		 158 aa  156  2e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3670  glutathione peroxidase  43.62 
 
 		 184 aa  155  3e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.174884  normal  0.0808268 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02770  glutathione peroxidase  50 
 
 		 160 aa  155  4e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.359164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1178  glutathione peroxidase  51.39 
 
 		 158 aa  155  5.0000000000000005e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.375161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1863  glutathione peroxidase  48.59 
 
 		 195 aa  154  8e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1719  glutathione peroxidase family protein  44.13 
 
 		 183 aa  154  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00731943  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2453  glutathione peroxidase  47.33 
 
 		 158 aa  154  1e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.70182 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02660  glutathione peroxidase  50 
 
 		 158 aa  152  2e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02196  Glutathione peroxidase  45.73 
 
 		 184 aa  152  2.9999999999999998e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0197549  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1315  glutathione peroxidase  49.67 
 
 		 173 aa  152  2.9999999999999998e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2597  Peroxiredoxin  53.79 
 
 		 158 aa  152  4e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1762  glutathione peroxidase  46.11 
 
 		 183 aa  152  4e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.533866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0020  glutathione peroxidase  50.34 
 
 		 168 aa  152  4e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0697  Glutathione peroxidase  49.34 
 
 		 170 aa  151  4e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0265  Peroxiredoxin  51.01 
 
 		 165 aa  151  5.9999999999999996e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000231119  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2472  Glutathione peroxidase  52.38 
 
 		 159 aa  150  7e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.161656  decreased coverage  0.0000149935 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4117  Peroxiredoxin  49.32 
 
 		 182 aa  149  2e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1665  glutathione peroxidase  52.38 
 
 		 159 aa  149  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0389024 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4077  glutathione peroxidase  50 
 
 		 162 aa  149  3e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.629032 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0297  glutathione peroxidase  47.26 
 
 		 161 aa  148  5e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0981226  normal  0.609333 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2910  Glutathione peroxidase  51.03 
 
 		 165 aa  147  7e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2684  glutathione peroxidase  49.09 
 
 		 179 aa  147  7e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.553323  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2875  glutathione peroxidase  50 
 
 		 161 aa  147  7e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000745159  hitchhiker  0.0000749041 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0250  glutathione peroxidase  51.05 
 
 		 164 aa  147  7e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2773  glutathione peroxidase  50 
 
 		 161 aa  147  9e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000478947  hitchhiker  0.00587193 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2454  glutathione peroxidase  48.95 
 
 		 159 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0273  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1571  glutathione peroxidase  48.95 
 
 		 159 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.154895  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1346  glutathione peroxidase  48.95 
 
 		 159 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.909183  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1090  glutathione peroxidase  52.52 
 
 		 160 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.37333 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4103  putative glutathione peroxidase  43.64 
 
 		 184 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2599  glutathione peroxidase  48.95 
 
 		 159 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.391635  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2074  glutathione peroxidase  48.95 
 
 		 159 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.895406  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2011  glutathione peroxidase  48.95 
 
 		 159 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0261647  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2934  glutathione peroxidase  49.33 
 
 		 164 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0465616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3238  glutathione peroxidase  48.95 
 
 		 159 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.400465  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2510  glutathione peroxidase  48.95 
 
 		 159 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47550  putative glutathione peroxidase  43.64 
 
 		 184 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.532704 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0559  glutathione peroxidase  48.68 
 
 		 161 aa  147  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2756  glutathione peroxidase  52.35 
 
 		 158 aa  147  1.0000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.447473  hitchhiker  0.0000941143 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2054  glutathione peroxidase  49.33 
 
 		 159 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2504  Glutathione peroxidase  50.34 
 
 		 165 aa  146  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.718008 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5344  glutathione peroxidase  48.67 
 
 		 159 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.213102 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2249  glutathione peroxidase  47.37 
 
 		 162 aa  146  2.0000000000000003e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.487328  normal  0.155268 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1936  glutathione peroxidase  48.32 
 
 		 159 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.634874 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3267  glutathione peroxidase  51.72 
 
 		 158 aa  146  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1242  glutathione peroxidase  49.66 
 
 		 159 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6042  glutathione peroxidase  49.33 
 
 		 159 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2705  glutathione peroxidase  49.38 
 
 		 161 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000249576  hitchhiker  0.0000800256 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2067  glutathione peroxidase  48.32 
 
 		 159 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2035  glutathione peroxidase  49.33 
 
 		 159 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3022  glutathione peroxidase  46.67 
 
 		 230 aa  145  3e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00278721  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3665  glutathione peroxidase  51.41 
 
 		 158 aa  145  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3037  glutathione peroxidase  46.67 
 
 		 230 aa  145  3e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000026286  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0118  glutathione peroxidase  50.34 
 
 		 160 aa  145  3e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1341  glutathione peroxidase  46.67 
 
 		 179 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0267656  hitchhiker  0.0000000425712 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1872  glutathione peroxidase  47.33 
 
 		 159 aa  145  4.0000000000000006e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0683727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6295  glutathione peroxidase  49.32 
 
 		 162 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0123  glutathione peroxidase  50.34 
 
 		 161 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3180  glutathione peroxidase  43.68 
 
 		 179 aa  145  5e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000271589  normal  0.0170233 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01902  probable glutathione peroxidase  46.34 
 
 		 165 aa  144  6e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.101099  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1334  Peroxiredoxin  53.33 
 
 		 169 aa  144  6e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0131674  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1214  glutathione peroxidase  43.12 
 
 		 167 aa  144  7.0000000000000006e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1563  glutathione peroxidase, putative  49.07 
 
 		 162 aa  144  8.000000000000001e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0904  glutathione peroxidase  50 
 
 		 158 aa  144  8.000000000000001e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000826936  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0324  Glutathione peroxidase  47.06 
 
 		 165 aa  144  9e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.324106  normal  0.0807721 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15450  Glutathione peroxidase  48 
 
 		 158 aa  144  1e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0674744  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05309  glutathione peroxidase  46.75 
 
 		 181 aa  144  1e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3685  glutathione peroxidase  47.37 
 
 		 163 aa  144  1e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0851  glutathione peroxidase  49.28 
 
 		 161 aa  143  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.425919  decreased coverage  0.00020946 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0876  Peroxiredoxin  49.32 
 
 		 177 aa  143  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1427  GMP synthase-like  40.43 
 
 		 190 aa  143  2e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1390  glutathione peroxidase  52.82 
 
 		 158 aa  142  3e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2674  putative glutathione peroxidase protein  49.66 
 
 		 165 aa  142  3e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.552039 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3349  glutathione peroxidase, putative  43.68 
 
 		 177 aa  142  3e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1364  glutathione peroxidase  52.82 
 
 		 158 aa  142  3e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00178793  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0867  glutathione peroxidase  51.08 
 
 		 159 aa  142  3e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000118287  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2683  Peroxiredoxin  47.83 
 
 		 160 aa  142  3e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.299838  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0191  Glutathione peroxidase  45.39 
 
 		 161 aa  142  4e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1300  glutathione peroxidase  46.3 
 
 		 161 aa  142  4e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.448702  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>