More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_3349 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_3349  glutathione peroxidase, putative  100 
 
 		 177 aa  367  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1267  glutathione peroxidase  90.4 
 
 		 203 aa  340  4e-93  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0133013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1196  glutathione peroxidase  90.4 
 
 		 203 aa  340  8e-93  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0218447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1197  glutathione peroxidase  90.4 
 
 		 203 aa  339  1e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00644229  normal  0.718028 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3180  glutathione peroxidase  83.24 
 
 		 179 aa  310  7.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000271589  normal  0.0170233 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2684  glutathione peroxidase  81.56 
 
 		 179 aa  309  1e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.553323  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3037  glutathione peroxidase  82.68 
 
 		 230 aa  308  2.9999999999999997e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000026286  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3022  glutathione peroxidase  83.82 
 
 		 230 aa  306  9e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00278721  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1341  glutathione peroxidase  82.12 
 
 		 179 aa  306  9e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0267656  hitchhiker  0.0000000425712 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2853  glutathione peroxidase  72.88 
 
 		 177 aa  272  2.0000000000000002e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.154923  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2474  glutathione peroxidase, putative  75.16 
 
 		 180 aa  258  3e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2679  glutathione peroxidase  70.89 
 
 		 192 aa  250  9.000000000000001e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.241309  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0359  glutathione peroxidase  50.55 
 
 		 182 aa  206  1e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1427  GMP synthase-like  50.28 
 
 		 190 aa  190  1e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1719  glutathione peroxidase family protein  50 
 
 		 183 aa  186  2e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00731943  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3670  glutathione peroxidase  48.89 
 
 		 184 aa  186  2e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.174884  normal  0.0808268 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4103  putative glutathione peroxidase  50.93 
 
 		 184 aa  180  9.000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47550  putative glutathione peroxidase  50.93 
 
 		 184 aa  180  9.000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.532704 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1686  glutathione peroxidase  48.82 
 
 		 202 aa  176  1e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.677668  normal  0.86735 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4033  glutathione peroxidase  48.82 
 
 		 183 aa  176  2e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.475849  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1284  glutathione peroxidase  48.82 
 
 		 183 aa  174  4e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.604655  normal  0.560913 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1762  glutathione peroxidase  50.62 
 
 		 183 aa  173  9.999999999999999e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.533866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1244  glutathione peroxidase  47.4 
 
 		 176 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.247052  normal  0.300123 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1654  glutathione peroxidase  47.09 
 
 		 186 aa  169  2e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.323621  hitchhiker  0.0047837 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2526  glutathione peroxidase  47.43 
 
 		 180 aa  169  2e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.327392  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05309  glutathione peroxidase  46.24 
 
 		 181 aa  162  2.0000000000000002e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0042  glutathione peroxidase  48.43 
 
 		 212 aa  161  4.0000000000000004e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.490429  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0018  glutathione peroxidase  48.12 
 
 		 208 aa  161  4.0000000000000004e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2515  glutathione peroxidase  49.01 
 
 		 185 aa  159  2e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000573  glutathione peroxidase  47.59 
 
 		 181 aa  157  8e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02196  Glutathione peroxidase  44.72 
 
 		 184 aa  152  2.9999999999999998e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0197549  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4659  glutathione peroxidase  45.45 
 
 		 208 aa  151  4e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3912  glutathione peroxidase  45.57 
 
 		 189 aa  149  2e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.295477  normal  0.0278841 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5165  Peroxiredoxin  46.5 
 
 		 202 aa  147  8e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.648504  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1246  glutathione peroxidase  40.22 
 
 		 192 aa  145  3e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.281187  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0461  glutathione peroxidase  39.66 
 
 		 191 aa  144  5e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0237  putative glutathione peroxidase transmembrane protein  44.38 
 
 		 205 aa  144  8.000000000000001e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1801  glutathione peroxidase  42.5 
 
 		 199 aa  143  1e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.740072  hitchhiker  0.00000253639 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0307  putative glutathione peroxidase transmembrane protein  43.31 
 
 		 233 aa  142  2e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1970  glutathione peroxidase  43.68 
 
 		 193 aa  142  2e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0169  glutathione peroxidase  40.36 
 
 		 231 aa  142  2e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0162  glutathione peroxidase  40.24 
 
 		 231 aa  140  9e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.520461 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01222  ABC transporter vitamin B12 uptake permease  40.8 
 
 		 185 aa  139  1.9999999999999998e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.039958  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4024  glutathione peroxidase  41.57 
 
 		 213 aa  138  3.9999999999999997e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1409  glutathione peroxidase  42.51 
 
 		 184 aa  137  6e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2618  glutathione peroxidase  46.1 
 
 		 195 aa  133  9.999999999999999e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.137836  normal  0.142472 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4667  glutathione peroxidase  41.5 
 
 		 199 aa  130  9e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3374  glutathione peroxidase  42.21 
 
 		 195 aa  130  1.0000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.479812  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0488  glutathione peroxidase  39.53 
 
 		 185 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.642227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0297  glutathione peroxidase  42.36 
 
 		 161 aa  126  1.0000000000000001e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0981226  normal  0.609333 
 
 
-
 
NC_006687  CNE00580  glutathione peroxidase, putative  40.61 
 
 		 185 aa  124  5e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.256439  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2249  glutathione peroxidase  42.96 
 
 		 162 aa  121  5e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.487328  normal  0.155268 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2453  glutathione peroxidase  41.01 
 
 		 158 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.70182 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1391  glutathione peroxidase  41.79 
 
 		 153 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2389  putative glutathione peroxidase  37.86 
 
 		 176 aa  118  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.401751  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1570  Glutathione peroxidase  39.13 
 
 		 158 aa  117  7e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2975  Glutathione peroxidase  42.45 
 
 		 161 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.36322  normal  0.036622 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1368  glutathione peroxidase  42.45 
 
 		 165 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1407  glutathione peroxidase  42.45 
 
 		 165 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0308338  normal  0.103968 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1053  glutathione peroxidase  37.86 
 
 		 176 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.281088  normal  0.469721 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3880  putative glutathione peroxidase  40 
 
 		 191 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.41902 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0007  glutathione peroxidase  42.96 
 
 		 157 aa  115  3.9999999999999997e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0238  Peroxiredoxin  42.65 
 
 		 170 aa  115  5e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2597  Peroxiredoxin  41.01 
 
 		 158 aa  114  5e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0270  glutathione peroxidase  40 
 
 		 158 aa  114  5e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4940  glutathione peroxidase  39.62 
 
 		 165 aa  114  8.999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.232541 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4557  glutathione peroxidase  39.62 
 
 		 165 aa  114  8.999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4645  glutathione peroxidase  39.62 
 
 		 165 aa  114  8.999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4117  Peroxiredoxin  41.84 
 
 		 182 aa  114  1.0000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1677  glutathione peroxidase  45.07 
 
 		 151 aa  112  2.0000000000000002e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1384  glutathione peroxidase  41.01 
 
 		 165 aa  112  3e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2329  putative glutathione peroxidase  37.89 
 
 		 161 aa  112  3e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.509466  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2705  glutathione peroxidase  41.84 
 
 		 161 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000249576  hitchhiker  0.0000800256 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2875  glutathione peroxidase  41.13 
 
 		 161 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000745159  hitchhiker  0.0000749041 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2773  glutathione peroxidase  41.13 
 
 		 161 aa  111  5e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000478947  hitchhiker  0.00587193 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1563  glutathione peroxidase, putative  39.72 
 
 		 162 aa  111  7.000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1909  peroxiredoxin  38.51 
 
 		 161 aa  110  8.000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.154084  normal  0.204796 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4894  Peroxiredoxin  37.11 
 
 		 164 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27520  putative glutathione peroxidase  39.86 
 
 		 161 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.78279  normal  0.0357307 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2454  Peroxiredoxin  42.19 
 
 		 160 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0184161  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0697  Glutathione peroxidase  39.86 
 
 		 170 aa  109  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01902  probable glutathione peroxidase  38.35 
 
 		 165 aa  109  2.0000000000000002e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.101099  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41100  Glutathione peroxidase  37.74 
 
 		 160 aa  108  3e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.341833  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2699  glutathione peroxidase  42.97 
 
 		 160 aa  109  3e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02660  glutathione peroxidase  41.48 
 
 		 158 aa  108  3e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0137  glutathione peroxidase  36.48 
 
 		 162 aa  108  3e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.167473  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1781  glutathione peroxidase family protein  39.13 
 
 		 161 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2909  Peroxiredoxin  43.17 
 
 		 198 aa  107  6e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0190  glutathione peroxidase  38.61 
 
 		 161 aa  107  6e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.926255  normal  0.776204 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0128  glutathione peroxidase  37.97 
 
 		 161 aa  108  6e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.594559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2764  glutathione peroxidase  38.52 
 
 		 161 aa  107  6e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0187221  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2055  putative glutathione peroxidase  35.61 
 
 		 177 aa  107  7.000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.265735 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0020  glutathione peroxidase  39.86 
 
 		 168 aa  107  8.000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0694  glutathione peroxidase  41.18 
 
 		 161 aa  107  8.000000000000001e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000130339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0118  glutathione peroxidase  39.51 
 
 		 160 aa  107  8.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4148  Glutathione peroxidase  41.3 
 
 		 158 aa  106  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.784559  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3273  glutathione peroxidase  35.34 
 
 		 174 aa  106  1e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0484  glutathione peroxidase  37.65 
 
 		 161 aa  107  1e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3685  glutathione peroxidase  37.34 
 
 		 163 aa  107  1e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2552  glutathione peroxidase  38.81 
 
 		 161 aa  105  2e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.40006  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>