More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0018 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_0018  glutathione peroxidase  100 
 
 		 208 aa  432  1e-120  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0042  glutathione peroxidase  79.05 
 
 		 212 aa  316  2e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.490429  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0162  glutathione peroxidase  65.36 
 
 		 231 aa  246  2e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.520461 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0169  glutathione peroxidase  64.8 
 
 		 231 aa  245  4e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5165  Peroxiredoxin  68.35 
 
 		 202 aa  238  4e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.648504  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0307  putative glutathione peroxidase transmembrane protein  66.67 
 
 		 233 aa  233  2.0000000000000002e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0237  putative glutathione peroxidase transmembrane protein  65.88 
 
 		 205 aa  232  3e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4659  glutathione peroxidase  63.41 
 
 		 208 aa  229  2e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1970  glutathione peroxidase  63.69 
 
 		 193 aa  228  6e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3912  glutathione peroxidase  62.07 
 
 		 189 aa  228  6e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.295477  normal  0.0278841 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4024  glutathione peroxidase  63.52 
 
 		 213 aa  220  9.999999999999999e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4667  glutathione peroxidase  58.51 
 
 		 199 aa  217  1e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3374  glutathione peroxidase  63.23 
 
 		 195 aa  214  5.9999999999999996e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.479812  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0488  glutathione peroxidase  61.64 
 
 		 185 aa  209  3e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.642227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0461  glutathione peroxidase  55.62 
 
 		 191 aa  201  8e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1677  glutathione peroxidase  69.83 
 
 		 151 aa  182  4.0000000000000006e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2526  glutathione peroxidase  52.5 
 
 		 180 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.327392  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1686  glutathione peroxidase  53.12 
 
 		 202 aa  179  2e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.677668  normal  0.86735 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02196  Glutathione peroxidase  52.76 
 
 		 184 aa  180  2e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0197549  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4033  glutathione peroxidase  51.53 
 
 		 183 aa  178  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.475849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3180  glutathione peroxidase  48.86 
 
 		 179 aa  178  4.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000271589  normal  0.0170233 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01222  ABC transporter vitamin B12 uptake permease  56.41 
 
 		 185 aa  178  5.999999999999999e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.039958  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3037  glutathione peroxidase  48.86 
 
 		 230 aa  177  8e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000026286  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3022  glutathione peroxidase  52.5 
 
 		 230 aa  177  1e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00278721  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1341  glutathione peroxidase  48.86 
 
 		 179 aa  177  1e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0267656  hitchhiker  0.0000000425712 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1284  glutathione peroxidase  51.53 
 
 		 183 aa  176  3e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.604655  normal  0.560913 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47550  putative glutathione peroxidase  47.85 
 
 		 184 aa  176  3e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.532704 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4103  putative glutathione peroxidase  47.85 
 
 		 184 aa  176  3e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1244  glutathione peroxidase  48.81 
 
 		 176 aa  175  4e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.247052  normal  0.300123 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1409  glutathione peroxidase  56.76 
 
 		 184 aa  171  5e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1654  glutathione peroxidase  48.47 
 
 		 186 aa  171  7.999999999999999e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.323621  hitchhiker  0.0047837 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2684  glutathione peroxidase  48.26 
 
 		 179 aa  171  9e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.553323  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1762  glutathione peroxidase  47.85 
 
 		 183 aa  171  9e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.533866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2618  glutathione peroxidase  62.12 
 
 		 195 aa  167  7e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.137836  normal  0.142472 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3670  glutathione peroxidase  45.83 
 
 		 184 aa  167  9e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.174884  normal  0.0808268 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1246  glutathione peroxidase  57.78 
 
 		 192 aa  167  1e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.281187  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1719  glutathione peroxidase family protein  45.4 
 
 		 183 aa  165  4e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00731943  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1267  glutathione peroxidase  48.75 
 
 		 203 aa  164  5.9999999999999996e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0133013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1196  glutathione peroxidase  48.75 
 
 		 203 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0218447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2474  glutathione peroxidase, putative  50 
 
 		 180 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2853  glutathione peroxidase  48.12 
 
 		 177 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.154923  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3349  glutathione peroxidase, putative  48.12 
 
 		 177 aa  162  3e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1197  glutathione peroxidase  48.12 
 
 		 203 aa  162  3e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00644229  normal  0.718028 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1801  glutathione peroxidase  50.62 
 
 		 199 aa  160  1e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.740072  hitchhiker  0.00000253639 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2679  glutathione peroxidase  47.24 
 
 		 192 aa  156  2e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.241309  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1863  glutathione peroxidase  47.34 
 
 		 195 aa  154  6e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000573  glutathione peroxidase  46.25 
 
 		 181 aa  154  1e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0297  glutathione peroxidase  47.4 
 
 		 161 aa  151  5e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0981226  normal  0.609333 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02770  glutathione peroxidase  54.07 
 
 		 160 aa  151  8e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.359164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1178  glutathione peroxidase  50.69 
 
 		 158 aa  149  2e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.375161  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1571  glutathione peroxidase  51.75 
 
 		 159 aa  149  3e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.154895  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2454  glutathione peroxidase  51.75 
 
 		 159 aa  149  3e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0273  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2453  glutathione peroxidase  51.01 
 
 		 158 aa  149  3e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.70182 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2599  glutathione peroxidase  51.75 
 
 		 159 aa  149  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.391635  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2510  glutathione peroxidase  51.75 
 
 		 159 aa  149  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1346  glutathione peroxidase  51.75 
 
 		 159 aa  149  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.909183  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2074  glutathione peroxidase  51.75 
 
 		 159 aa  149  3e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.895406  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3238  glutathione peroxidase  51.75 
 
 		 159 aa  149  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.400465  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05309  glutathione peroxidase  43.75 
 
 		 181 aa  148  4e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2389  putative glutathione peroxidase  50.39 
 
 		 176 aa  148  5e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.401751  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1053  glutathione peroxidase  51.16 
 
 		 176 aa  148  5e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.281088  normal  0.469721 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0359  glutathione peroxidase  43.11 
 
 		 182 aa  147  1.0000000000000001e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0697  Glutathione peroxidase  47.33 
 
 		 170 aa  147  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1570  Glutathione peroxidase  47.13 
 
 		 158 aa  146  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE00580  glutathione peroxidase, putative  52.11 
 
 		 185 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.256439  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1214  glutathione peroxidase  46.94 
 
 		 167 aa  146  2.0000000000000003e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1427  GMP synthase-like  43.45 
 
 		 190 aa  146  2.0000000000000003e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2011  glutathione peroxidase  50.35 
 
 		 159 aa  145  3e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0261647  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3880  putative glutathione peroxidase  41.84 
 
 		 191 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.41902 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0270  glutathione peroxidase  44.59 
 
 		 158 aa  145  4.0000000000000006e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01902  probable glutathione peroxidase  51.75 
 
 		 165 aa  145  5e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.101099  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0559  glutathione peroxidase  46 
 
 		 161 aa  145  5e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27520  putative glutathione peroxidase  50.68 
 
 		 161 aa  144  9e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.78279  normal  0.0357307 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2674  putative glutathione peroxidase protein  53.15 
 
 		 165 aa  144  1e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.552039 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3053  peroxiredoxin  53.9 
 
 		 164 aa  144  1e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.508134 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0191  Glutathione peroxidase  51.66 
 
 		 161 aa  144  1e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4117  Peroxiredoxin  47.3 
 
 		 182 aa  143  1e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0851  glutathione peroxidase  50.99 
 
 		 161 aa  143  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.425919  decreased coverage  0.00020946 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0020  glutathione peroxidase  49.67 
 
 		 168 aa  143  2e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3685  glutathione peroxidase  52.14 
 
 		 163 aa  143  2e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0694  glutathione peroxidase  44.65 
 
 		 161 aa  143  2e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000130339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3277  Peroxiredoxin  53.9 
 
 		 164 aa  143  2e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1090  glutathione peroxidase  50 
 
 		 160 aa  142  3e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.37333 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2909  Peroxiredoxin  40.4 
 
 		 198 aa  142  3e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5025  peroxiredoxin  52.14 
 
 		 171 aa  142  4e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0652457 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0173  glutathione peroxidase  50.99 
 
 		 161 aa  142  4e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.790659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02660  glutathione peroxidase  47.97 
 
 		 158 aa  142  5e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1665  glutathione peroxidase  51.02 
 
 		 159 aa  142  5e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0389024 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1075  glutathione peroxidase  48.97 
 
 		 168 aa  142  5e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.364498  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0118  glutathione peroxidase  52.59 
 
 		 160 aa  141  6e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0250  glutathione peroxidase  56.15 
 
 		 164 aa  141  7e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2910  Glutathione peroxidase  51.75 
 
 		 165 aa  141  7e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2329  putative glutathione peroxidase  50 
 
 		 161 aa  141  8e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.509466  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2515  glutathione peroxidase  46.15 
 
 		 185 aa  141  8e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0123  glutathione peroxidase  52.27 
 
 		 161 aa  141  9e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1563  glutathione peroxidase, putative  48.65 
 
 		 162 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0889  glutathione peroxidase  57.26 
 
 		 168 aa  140  9.999999999999999e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.50899 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1883  glutathione peroxidase  48.84 
 
 		 152 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.255404  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2756  glutathione peroxidase  49.66 
 
 		 158 aa  140  9.999999999999999e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.447473  hitchhiker  0.0000941143 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1242  glutathione peroxidase  49.32 
 
 		 159 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>