More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_4667 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_4667  glutathione peroxidase  100 
 
 
199 aa  407  1e-113  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4024  glutathione peroxidase  73.17 
 
 
213 aa  254  7e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3374  glutathione peroxidase  73.86 
 
 
195 aa  244  4e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.479812  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0162  glutathione peroxidase  60.11 
 
 
231 aa  230  1e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.520461 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5165  Peroxiredoxin  62.82 
 
 
202 aa  228  6e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.648504  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0169  glutathione peroxidase  64.15 
 
 
231 aa  225  3e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0018  glutathione peroxidase  58.1 
 
 
208 aa  225  4e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4659  glutathione peroxidase  61.73 
 
 
208 aa  224  6e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0042  glutathione peroxidase  62.82 
 
 
212 aa  221  7e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.490429  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0237  putative glutathione peroxidase transmembrane protein  64.74 
 
 
205 aa  219  3e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1970  glutathione peroxidase  59.04 
 
 
193 aa  218  3e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3912  glutathione peroxidase  58.29 
 
 
189 aa  219  3e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.295477  normal  0.0278841 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0307  putative glutathione peroxidase transmembrane protein  62.82 
 
 
233 aa  216  2e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0461  glutathione peroxidase  53.67 
 
 
191 aa  200  9.999999999999999e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0488  glutathione peroxidase  55.7 
 
 
185 aa  192  2e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.642227  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4103  putative glutathione peroxidase  50.62 
 
 
184 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01222  ABC transporter vitamin B12 uptake permease  56.08 
 
 
185 aa  172  2.9999999999999996e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.039958  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47550  putative glutathione peroxidase  50.62 
 
 
184 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.532704 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1677  glutathione peroxidase  65.22 
 
 
151 aa  171  6.999999999999999e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2618  glutathione peroxidase  62.5 
 
 
195 aa  170  1e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.137836  normal  0.142472 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1409  glutathione peroxidase  55.41 
 
 
184 aa  170  1e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1246  glutathione peroxidase  59.26 
 
 
192 aa  168  4e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.281187  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1762  glutathione peroxidase  51.25 
 
 
183 aa  166  2e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.533866  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02196  Glutathione peroxidase  48.45 
 
 
184 aa  166  2e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0197549  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2526  glutathione peroxidase  46.84 
 
 
180 aa  165  4e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.327392  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1801  glutathione peroxidase  53.12 
 
 
199 aa  160  9e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.740072  hitchhiker  0.00000253639 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1654  glutathione peroxidase  46.25 
 
 
186 aa  159  3e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.323621  hitchhiker  0.0047837 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3670  glutathione peroxidase  46.25 
 
 
184 aa  156  1e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.174884  normal  0.0808268 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1686  glutathione peroxidase  46.25 
 
 
202 aa  156  2e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.677668  normal  0.86735 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1719  glutathione peroxidase family protein  46.25 
 
 
183 aa  156  2e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00731943  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1244  glutathione peroxidase  46.25 
 
 
176 aa  156  2e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.247052  normal  0.300123 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05309  glutathione peroxidase  48.12 
 
 
181 aa  155  3e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4033  glutathione peroxidase  45.62 
 
 
183 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.475849  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000573  glutathione peroxidase  47.5 
 
 
181 aa  154  8e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1284  glutathione peroxidase  45.62 
 
 
183 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.604655  normal  0.560913 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2515  glutathione peroxidase  51.66 
 
 
185 aa  153  2e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0359  glutathione peroxidase  46.88 
 
 
182 aa  149  3e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2453  glutathione peroxidase  50.71 
 
 
158 aa  147  8e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.70182 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0559  glutathione peroxidase  47.44 
 
 
161 aa  147  8e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2909  Peroxiredoxin  41.15 
 
 
198 aa  145  3e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4682  glutathione peroxidase  52.32 
 
 
160 aa  144  1e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1655  Peroxiredoxin  46.91 
 
 
183 aa  144  1e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.401167  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41100  Glutathione peroxidase  51.06 
 
 
160 aa  143  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.341833  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2558  Peroxiredoxin  50 
 
 
162 aa  143  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.177554  normal  0.095865 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1341  glutathione peroxidase  38.78 
 
 
179 aa  142  3e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0267656  hitchhiker  0.0000000425712 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0697  Glutathione peroxidase  46 
 
 
170 aa  142  3e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2679  glutathione peroxidase  43.29 
 
 
192 aa  142  3e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.241309  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53420  glutathione peroxidase  53.19 
 
 
160 aa  142  3e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.31883  normal  0.0505345 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3180  glutathione peroxidase  38.27 
 
 
179 aa  141  5e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000271589  normal  0.0170233 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02770  glutathione peroxidase  53.33 
 
 
160 aa  141  6e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.359164  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1626  Peroxiredoxin  44.44 
 
 
183 aa  141  7e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1214  glutathione peroxidase  49.32 
 
 
167 aa  141  7e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2152  putative glutathione peroxidase  46.91 
 
 
183 aa  140  9e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1090  glutathione peroxidase  50.66 
 
 
160 aa  140  9.999999999999999e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.37333 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5344  glutathione peroxidase  52.94 
 
 
159 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.213102 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6042  glutathione peroxidase  52.94 
 
 
159 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3022  glutathione peroxidase  41.88 
 
 
230 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00278721  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2054  glutathione peroxidase  52.94 
 
 
159 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2035  glutathione peroxidase  52.94 
 
 
159 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2615  putative glutathione peroxidase  44.64 
 
 
184 aa  140  1.9999999999999998e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1721  putative glutathione peroxidase  44.64 
 
 
184 aa  140  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.326937  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3037  glutathione peroxidase  41.88 
 
 
230 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000026286  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1812  Peroxiredoxin  47.97 
 
 
162 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00250469  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1315  glutathione peroxidase  46.41 
 
 
173 aa  139  1.9999999999999998e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3641  peroxiredoxin  49.65 
 
 
161 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1829  putative glutathione peroxidase  44.64 
 
 
184 aa  140  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2684  glutathione peroxidase  37.97 
 
 
179 aa  139  3e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.553323  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1897  glutathione peroxidase  53.85 
 
 
158 aa  139  3e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3880  putative glutathione peroxidase  42.86 
 
 
191 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.41902 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2389  putative glutathione peroxidase  51.16 
 
 
176 aa  138  4.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.401751  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2774  putative glutathione peroxidase  45.28 
 
 
183 aa  138  4.999999999999999e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.956503  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4148  Glutathione peroxidase  53.85 
 
 
158 aa  138  6e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.784559  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4117  Peroxiredoxin  51.47 
 
 
182 aa  138  6e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1257  glutathione peroxidase  43.12 
 
 
182 aa  138  6e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0123  glutathione peroxidase  51.91 
 
 
161 aa  138  6e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1348  glutathione peroxidase  43.12 
 
 
182 aa  138  7e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3277  Peroxiredoxin  48.45 
 
 
164 aa  138  7e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14340  glutathione peroxidase  50.34 
 
 
166 aa  137  7.999999999999999e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4022  Glutathione peroxidase  44.58 
 
 
181 aa  137  7.999999999999999e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.350366 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2249  glutathione peroxidase  47.92 
 
 
162 aa  137  7.999999999999999e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.487328  normal  0.155268 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0173  glutathione peroxidase  48.99 
 
 
161 aa  137  7.999999999999999e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.790659  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3349  glutathione peroxidase, putative  40.62 
 
 
177 aa  137  8.999999999999999e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1053  glutathione peroxidase  51.16 
 
 
176 aa  137  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.281088  normal  0.469721 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3470  glutathione peroxidase  52.31 
 
 
158 aa  137  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0904  glutathione peroxidase  47.89 
 
 
158 aa  137  1e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000826936  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0867  glutathione peroxidase  48.2 
 
 
159 aa  137  1e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000118287  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2067  glutathione peroxidase  51.85 
 
 
159 aa  137  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0118  glutathione peroxidase  48.32 
 
 
160 aa  137  1e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0777  glutathione peroxidase, putative  49.65 
 
 
160 aa  136  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1242  glutathione peroxidase  48.98 
 
 
159 aa  136  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1199  glutathione peroxidase  45.34 
 
 
182 aa  136  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0894577  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1936  glutathione peroxidase  51.85 
 
 
159 aa  136  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.634874 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1863  glutathione peroxidase  50.35 
 
 
195 aa  136  2e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0191  Glutathione peroxidase  48.32 
 
 
161 aa  136  2e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0883  glutathione peroxidase  48.94 
 
 
160 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.961514  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0020  glutathione peroxidase  50 
 
 
168 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2853  glutathione peroxidase  41.88 
 
 
177 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.154923  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0816  glutathione peroxidase  49.65 
 
 
160 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3053  peroxiredoxin  46.88 
 
 
164 aa  135  4e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.508134 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1267  glutathione peroxidase  40.62 
 
 
203 aa  135  4e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0133013  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>