More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3912 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_3912  glutathione peroxidase  100 
 
 		 189 aa  390  1e-108  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.295477  normal  0.0278841 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4659  glutathione peroxidase  81.88 
 
 		 208 aa  283  1.0000000000000001e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5165  Peroxiredoxin  73.25 
 
 		 202 aa  245  2e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.648504  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0042  glutathione peroxidase  66.25 
 
 		 212 aa  231  4.0000000000000004e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.490429  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0237  putative glutathione peroxidase transmembrane protein  62.78 
 
 		 205 aa  228  4e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0018  glutathione peroxidase  65.61 
 
 		 208 aa  227  9e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1970  glutathione peroxidase  59.78 
 
 		 193 aa  226  2e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4024  glutathione peroxidase  62.11 
 
 		 213 aa  221  4.9999999999999996e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3374  glutathione peroxidase  61.78 
 
 		 195 aa  214  7e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.479812  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0162  glutathione peroxidase  57.31 
 
 		 231 aa  212  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.520461 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0169  glutathione peroxidase  56.73 
 
 		 231 aa  209  2e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4667  glutathione peroxidase  61.18 
 
 		 199 aa  208  5e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0307  putative glutathione peroxidase transmembrane protein  57.23 
 
 		 233 aa  202  3e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0461  glutathione peroxidase  52.33 
 
 		 191 aa  195  3e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0488  glutathione peroxidase  56.96 
 
 		 185 aa  191  6e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.642227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1409  glutathione peroxidase  56.4 
 
 		 184 aa  184  5e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4103  putative glutathione peroxidase  52.2 
 
 		 184 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47550  putative glutathione peroxidase  52.2 
 
 		 184 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.532704 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1677  glutathione peroxidase  68.14 
 
 		 151 aa  170  1e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2526  glutathione peroxidase  49.69 
 
 		 180 aa  170  1e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.327392  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01222  ABC transporter vitamin B12 uptake permease  57.25 
 
 		 185 aa  166  2e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.039958  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1762  glutathione peroxidase  51.57 
 
 		 183 aa  164  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.533866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1246  glutathione peroxidase  56.2 
 
 		 192 aa  164  8e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.281187  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3670  glutathione peroxidase  50.94 
 
 		 184 aa  162  3e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.174884  normal  0.0808268 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1719  glutathione peroxidase family protein  47.43 
 
 		 183 aa  161  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00731943  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3022  glutathione peroxidase  44.2 
 
 		 230 aa  161  5.0000000000000005e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00278721  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3037  glutathione peroxidase  44.2 
 
 		 230 aa  160  1e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000026286  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3180  glutathione peroxidase  44.63 
 
 		 179 aa  160  1e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000271589  normal  0.0170233 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2618  glutathione peroxidase  58.54 
 
 		 195 aa  160  1e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.137836  normal  0.142472 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1341  glutathione peroxidase  44.63 
 
 		 179 aa  159  2e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0267656  hitchhiker  0.0000000425712 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02196  Glutathione peroxidase  45.86 
 
 		 184 aa  159  2e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0197549  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1654  glutathione peroxidase  46.24 
 
 		 186 aa  159  3e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.323621  hitchhiker  0.0047837 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1284  glutathione peroxidase  45.71 
 
 		 183 aa  155  3e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.604655  normal  0.560913 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2684  glutathione peroxidase  45.03 
 
 		 179 aa  154  1e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.553323  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1686  glutathione peroxidase  45.14 
 
 		 202 aa  153  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.677668  normal  0.86735 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1267  glutathione peroxidase  44.38 
 
 		 203 aa  152  2e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0133013  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1244  glutathione peroxidase  47.47 
 
 		 176 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.247052  normal  0.300123 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1196  glutathione peroxidase  44.38 
 
 		 203 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0218447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4033  glutathione peroxidase  44.57 
 
 		 183 aa  151  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.475849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1197  glutathione peroxidase  45.57 
 
 		 203 aa  150  8.999999999999999e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00644229  normal  0.718028 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2679  glutathione peroxidase  45.91 
 
 		 192 aa  150  1e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.241309  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3349  glutathione peroxidase, putative  45.57 
 
 		 177 aa  149  2e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05309  glutathione peroxidase  42.31 
 
 		 181 aa  148  4e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2453  glutathione peroxidase  49.67 
 
 		 158 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.70182 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2474  glutathione peroxidase, putative  41.9 
 
 		 180 aa  145  3e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2249  glutathione peroxidase  54.23 
 
 		 162 aa  144  6e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.487328  normal  0.155268 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02660  glutathione peroxidase  48.98 
 
 		 158 aa  144  7.0000000000000006e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2515  glutathione peroxidase  45.2 
 
 		 185 aa  144  1e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1801  glutathione peroxidase  44.38 
 
 		 199 aa  144  1e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.740072  hitchhiker  0.00000253639 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2853  glutathione peroxidase  42.35 
 
 		 177 aa  144  1e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.154923  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02770  glutathione peroxidase  48.32 
 
 		 160 aa  142  2e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.359164  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1570  Glutathione peroxidase  49.66 
 
 		 158 aa  143  2e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1863  glutathione peroxidase  50.7 
 
 		 195 aa  142  2e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2558  Peroxiredoxin  47.71 
 
 		 162 aa  143  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.177554  normal  0.095865 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000573  glutathione peroxidase  40.35 
 
 		 181 aa  142  3e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2798  glutathione peroxidase  50.67 
 
 		 164 aa  142  3e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0250  glutathione peroxidase  48.68 
 
 		 164 aa  141  6e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0191  Glutathione peroxidase  47.06 
 
 		 161 aa  140  9.999999999999999e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0359  glutathione peroxidase  37.97 
 
 		 182 aa  140  9.999999999999999e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1812  Peroxiredoxin  45.57 
 
 		 162 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00250469  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2934  glutathione peroxidase  50.34 
 
 		 164 aa  139  3e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0465616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0173  glutathione peroxidase  46.41 
 
 		 161 aa  138  4.999999999999999e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.790659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2773  glutathione peroxidase  52.63 
 
 		 161 aa  138  4.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000478947  hitchhiker  0.00587193 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2875  glutathione peroxidase  52.63 
 
 		 161 aa  138  6e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000745159  hitchhiker  0.0000749041 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2910  Glutathione peroxidase  49.32 
 
 		 165 aa  137  7e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0297  glutathione peroxidase  48.15 
 
 		 161 aa  137  7e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0981226  normal  0.609333 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0889  glutathione peroxidase  50 
 
 		 168 aa  137  7.999999999999999e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.50899 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2705  glutathione peroxidase  51.88 
 
 		 161 aa  137  8.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000249576  hitchhiker  0.0000800256 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1563  glutathione peroxidase, putative  48.63 
 
 		 162 aa  137  1e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0697  Glutathione peroxidase  46.41 
 
 		 170 aa  136  1e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1384  glutathione peroxidase  51.91 
 
 		 165 aa  137  1e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2674  putative glutathione peroxidase protein  48.63 
 
 		 165 aa  136  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.552039 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2472  Glutathione peroxidase  49.66 
 
 		 159 aa  136  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.161656  decreased coverage  0.0000149935 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0226  Peroxiredoxin  48.67 
 
 		 163 aa  136  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2504  Glutathione peroxidase  48.63 
 
 		 165 aa  135  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.718008 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0559  glutathione peroxidase  45.75 
 
 		 161 aa  135  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1080  glutathione peroxidase  48.28 
 
 		 164 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000852506  normal  0.679739 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1665  glutathione peroxidase  49.66 
 
 		 159 aa  135  4e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0389024 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0484  glutathione peroxidase  45.27 
 
 		 161 aa  134  5e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0270  glutathione peroxidase  43.97 
 
 		 158 aa  134  6.0000000000000005e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0123  glutathione peroxidase  51.91 
 
 		 161 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14340  glutathione peroxidase  44.97 
 
 		 166 aa  134  8e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2389  putative glutathione peroxidase  48.84 
 
 		 176 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.401751  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1354  glutathione peroxidase  48.92 
 
 		 162 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.525114 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2454  Peroxiredoxin  51.54 
 
 		 160 aa  132  1.9999999999999998e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0184161  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1214  glutathione peroxidase  45.64 
 
 		 167 aa  133  1.9999999999999998e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1427  GMP synthase-like  39.55 
 
 		 190 aa  133  1.9999999999999998e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3665  glutathione peroxidase  50.7 
 
 		 158 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1872  glutathione peroxidase  44.37 
 
 		 159 aa  133  1.9999999999999998e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0683727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0118  glutathione peroxidase  51.15 
 
 		 160 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2699  glutathione peroxidase  52.31 
 
 		 160 aa  133  1.9999999999999998e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3617  Peroxiredoxin  46.84 
 
 		 163 aa  132  3e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.78044  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1368  glutathione peroxidase  50.38 
 
 		 165 aa  132  3e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2975  Glutathione peroxidase  50.38 
 
 		 161 aa  132  3e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.36322  normal  0.036622 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1053  glutathione peroxidase  48.84 
 
 		 176 aa  132  3e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.281088  normal  0.469721 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2597  Peroxiredoxin  48.28 
 
 		 158 aa  132  3e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3880  putative glutathione peroxidase  44.37 
 
 		 191 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.41902 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0020  glutathione peroxidase  49.26 
 
 		 168 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1407  glutathione peroxidase  50.38 
 
 		 165 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0308338  normal  0.103968 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2461  glutathione peroxidase  42.29 
 
 		 177 aa  132  3.9999999999999996e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>