More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_4024 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_4024  glutathione peroxidase  100 
 
 		 213 aa  438  9.999999999999999e-123  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3374  glutathione peroxidase  98.46 
 
 		 195 aa  391  1e-108  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.479812  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4667  glutathione peroxidase  66.84 
 
 		 199 aa  249  3e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4659  glutathione peroxidase  67.47 
 
 		 208 aa  244  6e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5165  Peroxiredoxin  68.55 
 
 		 202 aa  234  7e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.648504  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0042  glutathione peroxidase  65.84 
 
 		 212 aa  230  1e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.490429  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3912  glutathione peroxidase  58.76 
 
 		 189 aa  222  3e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.295477  normal  0.0278841 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0018  glutathione peroxidase  62.96 
 
 		 208 aa  221  7e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0237  putative glutathione peroxidase transmembrane protein  57.71 
 
 		 205 aa  221  8e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0169  glutathione peroxidase  63.03 
 
 		 231 aa  215  4e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1970  glutathione peroxidase  60.36 
 
 		 193 aa  215  5e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0162  glutathione peroxidase  60.8 
 
 		 231 aa  214  5.9999999999999996e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.520461 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0307  putative glutathione peroxidase transmembrane protein  63.75 
 
 		 233 aa  211  9e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0461  glutathione peroxidase  59.34 
 
 		 191 aa  205  3e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0488  glutathione peroxidase  58.86 
 
 		 185 aa  191  6e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.642227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1409  glutathione peroxidase  56.44 
 
 		 184 aa  185  5e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2526  glutathione peroxidase  51.27 
 
 		 180 aa  171  7.999999999999999e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.327392  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1677  glutathione peroxidase  63.16 
 
 		 151 aa  170  1e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4103  putative glutathione peroxidase  52.15 
 
 		 184 aa  168  7e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01222  ABC transporter vitamin B12 uptake permease  46.63 
 
 		 185 aa  168  7e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.039958  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47550  putative glutathione peroxidase  52.15 
 
 		 184 aa  168  7e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.532704 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1762  glutathione peroxidase  51.52 
 
 		 183 aa  166  2e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.533866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02196  Glutathione peroxidase  49.08 
 
 		 184 aa  165  4e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0197549  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1686  glutathione peroxidase  43.98 
 
 		 202 aa  158  5e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.677668  normal  0.86735 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1214  glutathione peroxidase  53.06 
 
 		 167 aa  157  1e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1284  glutathione peroxidase  43.98 
 
 		 183 aa  156  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.604655  normal  0.560913 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4033  glutathione peroxidase  43.46 
 
 		 183 aa  156  2e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.475849  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1719  glutathione peroxidase family protein  45.03 
 
 		 183 aa  156  3e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00731943  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3670  glutathione peroxidase  45.03 
 
 		 184 aa  154  7e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.174884  normal  0.0808268 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1246  glutathione peroxidase  44.74 
 
 		 192 aa  154  7e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.281187  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2909  Peroxiredoxin  45.31 
 
 		 198 aa  153  2e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2618  glutathione peroxidase  57.36 
 
 		 195 aa  150  1e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.137836  normal  0.142472 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1244  glutathione peroxidase  44.79 
 
 		 176 aa  150  1e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.247052  normal  0.300123 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0697  Glutathione peroxidase  49.01 
 
 		 170 aa  150  2e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0559  glutathione peroxidase  49.04 
 
 		 161 aa  149  2e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0359  glutathione peroxidase  47.59 
 
 		 182 aa  149  3e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2515  glutathione peroxidase  46.74 
 
 		 185 aa  149  4e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1801  glutathione peroxidase  50.31 
 
 		 199 aa  149  4e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.740072  hitchhiker  0.00000253639 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1654  glutathione peroxidase  43.27 
 
 		 186 aa  148  7e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.323621  hitchhiker  0.0047837 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3022  glutathione peroxidase  39.22 
 
 		 230 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00278721  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05309  glutathione peroxidase  44.97 
 
 		 181 aa  147  1.0000000000000001e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0250  glutathione peroxidase  54.11 
 
 		 164 aa  146  2.0000000000000003e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02770  glutathione peroxidase  55.33 
 
 		 160 aa  147  2.0000000000000003e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.359164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2684  glutathione peroxidase  40.62 
 
 		 179 aa  146  3e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.553323  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3180  glutathione peroxidase  40.1 
 
 		 179 aa  146  3e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000271589  normal  0.0170233 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3037  glutathione peroxidase  39.22 
 
 		 230 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000026286  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1197  glutathione peroxidase  40.74 
 
 		 203 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00644229  normal  0.718028 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1267  glutathione peroxidase  40.74 
 
 		 203 aa  144  8.000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0133013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000573  glutathione peroxidase  47.2 
 
 		 181 aa  144  9e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3053  peroxiredoxin  51.55 
 
 		 164 aa  144  1e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.508134 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3253  Peroxiredoxin  53.85 
 
 		 164 aa  144  1e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.350236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1090  glutathione peroxidase  49.69 
 
 		 160 aa  143  2e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.37333 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1341  glutathione peroxidase  39.58 
 
 		 179 aa  143  2e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0267656  hitchhiker  0.0000000425712 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1315  glutathione peroxidase  47.4 
 
 		 173 aa  143  2e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1196  glutathione peroxidase  40.74 
 
 		 203 aa  143  2e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0218447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2453  glutathione peroxidase  49.65 
 
 		 158 aa  143  2e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.70182 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3880  putative glutathione peroxidase  40.76 
 
 		 191 aa  143  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.41902 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2249  glutathione peroxidase  52.48 
 
 		 162 aa  142  3e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.487328  normal  0.155268 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2152  putative glutathione peroxidase  47.85 
 
 		 183 aa  142  4e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0020  glutathione peroxidase  52.05 
 
 		 168 aa  142  5e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2011  glutathione peroxidase  53.73 
 
 		 159 aa  142  5e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0261647  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1427  GMP synthase-like  37.56 
 
 		 190 aa  141  6e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1655  Peroxiredoxin  46.63 
 
 		 183 aa  141  7e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.401167  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3277  Peroxiredoxin  50.31 
 
 		 164 aa  141  8e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1080  glutathione peroxidase  50.34 
 
 		 164 aa  141  8e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000852506  normal  0.679739 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1626  Peroxiredoxin  45.56 
 
 		 183 aa  141  9e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2510  glutathione peroxidase  52.99 
 
 		 159 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2454  glutathione peroxidase  52.99 
 
 		 159 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0273  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3238  glutathione peroxidase  52.99 
 
 		 159 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.400465  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1571  glutathione peroxidase  52.99 
 
 		 159 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.154895  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3685  glutathione peroxidase  50 
 
 		 163 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2599  glutathione peroxidase  52.99 
 
 		 159 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.391635  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0484  glutathione peroxidase  50 
 
 		 161 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0270  glutathione peroxidase  50.35 
 
 		 158 aa  140  9.999999999999999e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1346  glutathione peroxidase  52.99 
 
 		 159 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.909183  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2074  glutathione peroxidase  52.99 
 
 		 159 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.895406  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1570  Glutathione peroxidase  50.34 
 
 		 158 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1829  putative glutathione peroxidase  46.95 
 
 		 184 aa  140  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3349  glutathione peroxidase, putative  38.1 
 
 		 177 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2615  putative glutathione peroxidase  46.95 
 
 		 184 aa  140  1.9999999999999998e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1721  putative glutathione peroxidase  46.95 
 
 		 184 aa  140  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.326937  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1863  glutathione peroxidase  43.62 
 
 		 195 aa  139  3e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1368  glutathione peroxidase  44.32 
 
 		 165 aa  139  3e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2705  glutathione peroxidase  48.65 
 
 		 161 aa  139  3e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000249576  hitchhiker  0.0000800256 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2875  glutathione peroxidase  47.97 
 
 		 161 aa  139  3e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000745159  hitchhiker  0.0000749041 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1407  glutathione peroxidase  44.32 
 
 		 165 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0308338  normal  0.103968 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0565  glutathione peroxidase  45.24 
 
 		 182 aa  139  3.9999999999999997e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2773  glutathione peroxidase  47.97 
 
 		 161 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000478947  hitchhiker  0.00587193 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3973  Peroxiredoxin  52.08 
 
 		 165 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000360978 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2774  putative glutathione peroxidase  45.62 
 
 		 183 aa  138  6e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.956503  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2975  Glutathione peroxidase  50 
 
 		 161 aa  138  6e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.36322  normal  0.036622 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0297  glutathione peroxidase  45.45 
 
 		 161 aa  138  6e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0981226  normal  0.609333 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1199  glutathione peroxidase  43.37 
 
 		 182 aa  138  6e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0894577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3925  Glutathione peroxidase  52.08 
 
 		 165 aa  138  6e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4022  Glutathione peroxidase  46.43 
 
 		 181 aa  138  7.999999999999999e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.350366 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0123  glutathione peroxidase  50.69 
 
 		 161 aa  137  7.999999999999999e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01902  probable glutathione peroxidase  47.3 
 
 		 165 aa  137  8.999999999999999e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.101099  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1965  glutathione peroxidase  48.48 
 
 		 160 aa  137  1e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0718131  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2131  glutathione peroxidase  49.24 
 
 		 160 aa  137  1e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02660  glutathione peroxidase  50.68 
 
 		 158 aa  137  1e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>