More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1801 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_1801  glutathione peroxidase  100 
 
 		 199 aa  407  1e-113  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.740072  hitchhiker  0.00000253639 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1246  glutathione peroxidase  50 
 
 		 192 aa  179  2e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.281187  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2618  glutathione peroxidase  58.04 
 
 		 195 aa  179  2.9999999999999997e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.137836  normal  0.142472 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01222  ABC transporter vitamin B12 uptake permease  54.49 
 
 		 185 aa  178  4e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.039958  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1409  glutathione peroxidase  52.15 
 
 		 184 aa  165  4e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0461  glutathione peroxidase  46.59 
 
 		 191 aa  160  9e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0018  glutathione peroxidase  50.62 
 
 		 208 aa  160  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0169  glutathione peroxidase  48.28 
 
 		 231 aa  159  3e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0162  glutathione peroxidase  47.7 
 
 		 231 aa  156  2e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.520461 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02196  Glutathione peroxidase  47.5 
 
 		 184 aa  154  7e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0197549  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0237  putative glutathione peroxidase transmembrane protein  48.45 
 
 		 205 aa  154  9e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4667  glutathione peroxidase  52.23 
 
 		 199 aa  154  1e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0307  putative glutathione peroxidase transmembrane protein  49.38 
 
 		 233 aa  153  1e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0042  glutathione peroxidase  48.12 
 
 		 212 aa  153  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.490429  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1267  glutathione peroxidase  41.21 
 
 		 203 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0133013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4103  putative glutathione peroxidase  46.3 
 
 		 184 aa  152  4e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47550  putative glutathione peroxidase  46.3 
 
 		 184 aa  152  4e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.532704 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5165  Peroxiredoxin  46.88 
 
 		 202 aa  151  5.9999999999999996e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.648504  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2684  glutathione peroxidase  41.01 
 
 		 179 aa  151  8e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.553323  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3022  glutathione peroxidase  40 
 
 		 230 aa  150  1e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00278721  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2474  glutathione peroxidase, putative  48.12 
 
 		 180 aa  149  2e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3037  glutathione peroxidase  40.45 
 
 		 230 aa  149  3e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000026286  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1197  glutathione peroxidase  40.11 
 
 		 203 aa  149  3e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00644229  normal  0.718028 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1341  glutathione peroxidase  40.45 
 
 		 179 aa  149  4e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0267656  hitchhiker  0.0000000425712 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4024  glutathione peroxidase  50.31 
 
 		 213 aa  148  4e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1196  glutathione peroxidase  40.11 
 
 		 203 aa  147  7e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0218447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3180  glutathione peroxidase  39.89 
 
 		 179 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000271589  normal  0.0170233 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2853  glutathione peroxidase  40 
 
 		 177 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.154923  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0488  glutathione peroxidase  45.62 
 
 		 185 aa  146  2.0000000000000003e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.642227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1391  glutathione peroxidase  50 
 
 		 153 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3349  glutathione peroxidase, putative  41.04 
 
 		 177 aa  145  3e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2526  glutathione peroxidase  42.94 
 
 		 180 aa  145  5e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.327392  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3912  glutathione peroxidase  43.02 
 
 		 189 aa  144  9e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.295477  normal  0.0278841 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3374  glutathione peroxidase  51.33 
 
 		 195 aa  144  1e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.479812  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41100  Glutathione peroxidase  53.24 
 
 		 160 aa  141  7e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.341833  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1970  glutathione peroxidase  39.7 
 
 		 193 aa  140  8e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1686  glutathione peroxidase  41.36 
 
 		 202 aa  139  3e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.677668  normal  0.86735 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53420  glutathione peroxidase  53.57 
 
 		 160 aa  137  7.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.31883  normal  0.0505345 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1654  glutathione peroxidase  42.02 
 
 		 186 aa  137  8.999999999999999e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.323621  hitchhiker  0.0047837 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4033  glutathione peroxidase  43.35 
 
 		 183 aa  137  1e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.475849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4659  glutathione peroxidase  42.6 
 
 		 208 aa  137  1e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4413  glutathione peroxidase  50 
 
 		 160 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.312074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2453  glutathione peroxidase  50.35 
 
 		 158 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.70182 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4682  glutathione peroxidase  52.86 
 
 		 160 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4022  Glutathione peroxidase  44.91 
 
 		 181 aa  135  3.0000000000000003e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.350366 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1284  glutathione peroxidase  43.35 
 
 		 183 aa  135  4e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.604655  normal  0.560913 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3641  peroxiredoxin  47.83 
 
 		 161 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3670  glutathione peroxidase  43.33 
 
 		 184 aa  134  7.000000000000001e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.174884  normal  0.0808268 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000573  glutathione peroxidase  40 
 
 		 181 aa  133  9.999999999999999e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0565  glutathione peroxidase  47.5 
 
 		 182 aa  133  9.999999999999999e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0883  glutathione peroxidase  50 
 
 		 160 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.961514  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0777  glutathione peroxidase, putative  48.57 
 
 		 160 aa  132  3e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1563  glutathione peroxidase, putative  46.85 
 
 		 162 aa  132  3e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1719  glutathione peroxidase family protein  42.08 
 
 		 183 aa  132  3e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00731943  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0802  peroxiredoxin  48.57 
 
 		 160 aa  132  3e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.033017 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1971  glutathione peroxidase  42.5 
 
 		 160 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.775227  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2119  glutathione peroxidase  42.5 
 
 		 160 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05309  glutathione peroxidase  39.66 
 
 		 181 aa  132  3.9999999999999996e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0816  glutathione peroxidase  48.57 
 
 		 160 aa  132  5e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1244  glutathione peroxidase  42.35 
 
 		 176 aa  132  5e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.247052  normal  0.300123 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3880  putative glutathione peroxidase  39.89 
 
 		 191 aa  131  6e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.41902 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2679  glutathione peroxidase  41.98 
 
 		 192 aa  131  6e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.241309  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3507  glutathione peroxidase  45.45 
 
 		 204 aa  130  1.0000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.721934  normal  0.622585 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0359  glutathione peroxidase  41.05 
 
 		 182 aa  130  1.0000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2875  glutathione peroxidase  46.85 
 
 		 161 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000745159  hitchhiker  0.0000749041 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2202  glutathione peroxidase  41.88 
 
 		 161 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0177431  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1368  glutathione peroxidase  45.14 
 
 		 165 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1897  glutathione peroxidase  46.25 
 
 		 158 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03223  glutathione peroxidase  43.68 
 
 		 181 aa  129  2.0000000000000002e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2773  glutathione peroxidase  46.85 
 
 		 161 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000478947  hitchhiker  0.00587193 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2271  glutathione peroxidase  41.88 
 
 		 160 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1926  glutathione peroxidase  41.88 
 
 		 160 aa  129  3e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0091  glutathione peroxidase  48.18 
 
 		 174 aa  129  3e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2975  Glutathione peroxidase  46.21 
 
 		 161 aa  129  3e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.36322  normal  0.036622 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30390  glutathione peroxidase  44.31 
 
 		 173 aa  129  3e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2131  glutathione peroxidase  41.88 
 
 		 160 aa  129  3e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2705  glutathione peroxidase  46.15 
 
 		 161 aa  129  3e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000249576  hitchhiker  0.0000800256 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1950  glutathione peroxidase  41.25 
 
 		 160 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.210596  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1407  glutathione peroxidase  46.21 
 
 		 165 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0308338  normal  0.103968 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3470  glutathione peroxidase  45 
 
 		 158 aa  128  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1965  glutathione peroxidase  40.62 
 
 		 160 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0718131  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2249  glutathione peroxidase  44.59 
 
 		 162 aa  129  4.0000000000000003e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.487328  normal  0.155268 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2154  glutathione peroxidase  41.25 
 
 		 160 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1427  GMP synthase-like  38.2 
 
 		 190 aa  128  6e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3184  glutathione peroxidase  41.25 
 
 		 160 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4077  glutathione peroxidase  46.25 
 
 		 162 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.629032 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2558  Peroxiredoxin  45.03 
 
 		 162 aa  127  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.177554  normal  0.095865 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1384  glutathione peroxidase  44.44 
 
 		 165 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6245  Glutathione peroxidase  49.64 
 
 		 163 aa  127  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.479243  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27520  putative glutathione peroxidase  46.76 
 
 		 161 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.78279  normal  0.0357307 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1300  glutathione peroxidase  44.76 
 
 		 161 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.448702  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0137  glutathione peroxidase  47.48 
 
 		 169 aa  126  2.0000000000000002e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2515  glutathione peroxidase  46.11 
 
 		 185 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2552  glutathione peroxidase  49.22 
 
 		 161 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.40006  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0559  glutathione peroxidase  45.71 
 
 		 161 aa  126  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1010  glutathione peroxidase  47.48 
 
 		 162 aa  126  3e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2615  putative glutathione peroxidase  44.44 
 
 		 184 aa  125  3e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1721  putative glutathione peroxidase  44.44 
 
 		 184 aa  125  3e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.326937  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0123  glutathione peroxidase  42.68 
 
 		 161 aa  125  3e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1080  glutathione peroxidase  44.06 
 
 		 164 aa  126  3e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000852506  normal  0.679739 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>