More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0307 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0307  putative glutathione peroxidase transmembrane protein  100 
 
 		 233 aa  474  1e-133  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0169  glutathione peroxidase  79.52 
 
 		 231 aa  326  2.0000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0162  glutathione peroxidase  76 
 
 		 231 aa  325  4.0000000000000003e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.520461 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0018  glutathione peroxidase  66.67 
 
 		 208 aa  237  1e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0042  glutathione peroxidase  65.22 
 
 		 212 aa  236  3e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.490429  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0237  putative glutathione peroxidase transmembrane protein  56.91 
 
 		 205 aa  216  2e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4667  glutathione peroxidase  65.07 
 
 		 199 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4024  glutathione peroxidase  63.75 
 
 		 213 aa  211  5.999999999999999e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4659  glutathione peroxidase  57.32 
 
 		 208 aa  208  5e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3374  glutathione peroxidase  64.1 
 
 		 195 aa  208  6e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.479812  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1970  glutathione peroxidase  55.37 
 
 		 193 aa  208  6e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3912  glutathione peroxidase  54.91 
 
 		 189 aa  204  7e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.295477  normal  0.0278841 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5165  Peroxiredoxin  58.6 
 
 		 202 aa  202  3e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.648504  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0488  glutathione peroxidase  56.98 
 
 		 185 aa  202  4e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.642227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01222  ABC transporter vitamin B12 uptake permease  59.49 
 
 		 185 aa  187  2e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.039958  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0461  glutathione peroxidase  54.32 
 
 		 191 aa  183  2.0000000000000003e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02196  Glutathione peroxidase  50.57 
 
 		 184 aa  182  4.0000000000000006e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0197549  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2526  glutathione peroxidase  45.5 
 
 		 180 aa  172  5e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.327392  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1677  glutathione peroxidase  56.34 
 
 		 151 aa  169  4e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2618  glutathione peroxidase  63.64 
 
 		 195 aa  166  2.9999999999999998e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.137836  normal  0.142472 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1246  glutathione peroxidase  53.8 
 
 		 192 aa  163  2.0000000000000002e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.281187  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1409  glutathione peroxidase  55.63 
 
 		 184 aa  163  2.0000000000000002e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0359  glutathione peroxidase  46.01 
 
 		 182 aa  160  2e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4103  putative glutathione peroxidase  48.45 
 
 		 184 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47550  putative glutathione peroxidase  48.45 
 
 		 184 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.532704 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3180  glutathione peroxidase  46.3 
 
 		 179 aa  155  4e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000271589  normal  0.0170233 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3022  glutathione peroxidase  46.3 
 
 		 230 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00278721  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1341  glutathione peroxidase  46.3 
 
 		 179 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0267656  hitchhiker  0.0000000425712 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3037  glutathione peroxidase  46.3 
 
 		 230 aa  155  7e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000026286  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1801  glutathione peroxidase  49.38 
 
 		 199 aa  154  1e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.740072  hitchhiker  0.00000253639 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2684  glutathione peroxidase  44.44 
 
 		 179 aa  154  2e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.553323  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1762  glutathione peroxidase  45.12 
 
 		 183 aa  152  4e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.533866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0270  glutathione peroxidase  45.57 
 
 		 158 aa  150  2e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1267  glutathione peroxidase  45.06 
 
 		 203 aa  149  3e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0133013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02770  glutathione peroxidase  52.05 
 
 		 160 aa  147  1.0000000000000001e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.359164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1197  glutathione peroxidase  44.44 
 
 		 203 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00644229  normal  0.718028 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1053  glutathione peroxidase  52.71 
 
 		 176 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.281088  normal  0.469721 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2389  putative glutathione peroxidase  45.78 
 
 		 176 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.401751  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1196  glutathione peroxidase  44.44 
 
 		 203 aa  146  3e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0218447  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3349  glutathione peroxidase, putative  43.12 
 
 		 177 aa  145  5e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3670  glutathione peroxidase  44.17 
 
 		 184 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.174884  normal  0.0808268 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1719  glutathione peroxidase family protein  44.1 
 
 		 183 aa  143  2e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00731943  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1570  Glutathione peroxidase  45.86 
 
 		 158 aa  143  2e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000573  glutathione peroxidase  42.59 
 
 		 181 aa  143  2e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2453  glutathione peroxidase  47.47 
 
 		 158 aa  143  2e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.70182 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4033  glutathione peroxidase  44.1 
 
 		 183 aa  143  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.475849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3880  putative glutathione peroxidase  43.18 
 
 		 191 aa  142  3e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.41902 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1214  glutathione peroxidase  46.84 
 
 		 167 aa  143  3e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05309  glutathione peroxidase  43.12 
 
 		 181 aa  142  4e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0565  glutathione peroxidase  46.15 
 
 		 182 aa  142  4e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0392  glutathione peroxidase  49.65 
 
 		 188 aa  142  4e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0773128  normal  0.361866 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2674  putative glutathione peroxidase protein  50 
 
 		 165 aa  142  5e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.552039 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02660  glutathione peroxidase  49.32 
 
 		 158 aa  142  5e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1244  glutathione peroxidase  42.94 
 
 		 176 aa  142  5e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.247052  normal  0.300123 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2515  glutathione peroxidase  44.71 
 
 		 185 aa  142  5e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30390  glutathione peroxidase  46.55 
 
 		 173 aa  142  6e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1686  glutathione peroxidase  43.48 
 
 		 202 aa  141  7e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.677668  normal  0.86735 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4117  Peroxiredoxin  42.7 
 
 		 182 aa  140  9.999999999999999e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1654  glutathione peroxidase  42.94 
 
 		 186 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.323621  hitchhiker  0.0047837 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1334  Peroxiredoxin  46.06 
 
 		 169 aa  140  9.999999999999999e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0131674  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2249  glutathione peroxidase  46.1 
 
 		 162 aa  141  9.999999999999999e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.487328  normal  0.155268 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0360  glutathione peroxidase  49.65 
 
 		 184 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.495486  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1391  glutathione peroxidase  57.14 
 
 		 153 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0316  glutathione peroxidase  49.65 
 
 		 184 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.282271  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2504  Glutathione peroxidase  51.66 
 
 		 165 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.718008 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2910  Glutathione peroxidase  51.66 
 
 		 165 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0265  Peroxiredoxin  45 
 
 		 165 aa  139  3e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000231119  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3925  Glutathione peroxidase  48.99 
 
 		 165 aa  139  3e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1284  glutathione peroxidase  43.48 
 
 		 183 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.604655  normal  0.560913 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1863  glutathione peroxidase  50.7 
 
 		 195 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3973  Peroxiredoxin  48.99 
 
 		 165 aa  139  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000360978 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3929  glutathione peroxidase  48.97 
 
 		 188 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.592022 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0250  glutathione peroxidase  46.67 
 
 		 164 aa  139  4.999999999999999e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2853  glutathione peroxidase  41.25 
 
 		 177 aa  138  6e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.154923  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5475  glutathione peroxidase  45.06 
 
 		 189 aa  138  7e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.416682  normal  0.0282506 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1782  glutathione peroxidase  48.15 
 
 		 193 aa  138  7e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1090  glutathione peroxidase  45 
 
 		 160 aa  138  7.999999999999999e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.37333 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7246  glutathione peroxidase  47.06 
 
 		 182 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.156193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1427  GMP synthase-like  38.17 
 
 		 190 aa  137  1e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0867  glutathione peroxidase  46.43 
 
 		 159 aa  137  1e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000118287  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2011  glutathione peroxidase  50.75 
 
 		 159 aa  136  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0261647  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0191  Glutathione peroxidase  47.56 
 
 		 161 aa  137  2e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0694  glutathione peroxidase  43.12 
 
 		 161 aa  137  2e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000130339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0904  glutathione peroxidase  45.77 
 
 		 158 aa  136  2e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000826936  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0020  glutathione peroxidase  47.77 
 
 		 168 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4077  glutathione peroxidase  45.68 
 
 		 162 aa  136  3.0000000000000003e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.629032 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3507  glutathione peroxidase  44.71 
 
 		 204 aa  135  4e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.721934  normal  0.622585 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6518  Peroxiredoxin  48.7 
 
 		 161 aa  135  4e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3238  glutathione peroxidase  50.75 
 
 		 159 aa  135  5e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.400465  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1571  glutathione peroxidase  50.75 
 
 		 159 aa  135  5e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.154895  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2599  glutathione peroxidase  50.75 
 
 		 159 aa  135  5e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.391635  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2510  glutathione peroxidase  50.75 
 
 		 159 aa  135  5e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2679  glutathione peroxidase  37.7 
 
 		 194 aa  135  5e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2774  putative glutathione peroxidase  44.1 
 
 		 183 aa  135  5e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.956503  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2454  glutathione peroxidase  50.75 
 
 		 159 aa  135  5e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0273  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2074  glutathione peroxidase  50.75 
 
 		 159 aa  135  5e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.895406  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1346  glutathione peroxidase  50.75 
 
 		 159 aa  135  5e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.909183  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2798  glutathione peroxidase  48.67 
 
 		 164 aa  135  6.0000000000000005e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0697  Glutathione peroxidase  46.36 
 
 		 170 aa  135  6.0000000000000005e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2909  Peroxiredoxin  46.58 
 
 		 198 aa  135  7.000000000000001e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>