More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0461 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_0461  glutathione peroxidase  100 
 
 		 191 aa  392  1e-108  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0237  putative glutathione peroxidase transmembrane protein  57.3 
 
 		 205 aa  222  3e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4024  glutathione peroxidase  62.11 
 
 		 213 aa  203  1e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5165  Peroxiredoxin  57.23 
 
 		 202 aa  202  2e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.648504  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0018  glutathione peroxidase  58.13 
 
 		 208 aa  198  5e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3374  glutathione peroxidase  61.15 
 
 		 195 aa  195  3e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.479812  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4659  glutathione peroxidase  53.37 
 
 		 208 aa  195  4.0000000000000005e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3912  glutathione peroxidase  52.05 
 
 		 189 aa  193  1e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.295477  normal  0.0278841 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0042  glutathione peroxidase  55.35 
 
 		 212 aa  190  9e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.490429  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4667  glutathione peroxidase  58 
 
 		 199 aa  190  1e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0169  glutathione peroxidase  53.67 
 
 		 231 aa  189  2e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1970  glutathione peroxidase  50.61 
 
 		 193 aa  187  5e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0488  glutathione peroxidase  48.04 
 
 		 185 aa  185  3e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.642227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0162  glutathione peroxidase  52.94 
 
 		 231 aa  185  3e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.520461 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0307  putative glutathione peroxidase transmembrane protein  55.41 
 
 		 233 aa  181  5.0000000000000004e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01222  ABC transporter vitamin B12 uptake permease  55.47 
 
 		 185 aa  166  2e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.039958  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2618  glutathione peroxidase  55.71 
 
 		 195 aa  166  2e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.137836  normal  0.142472 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1246  glutathione peroxidase  50.65 
 
 		 192 aa  160  1e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.281187  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1801  glutathione peroxidase  48.75 
 
 		 199 aa  155  3e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.740072  hitchhiker  0.00000253639 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02196  Glutathione peroxidase  43.48 
 
 		 184 aa  153  2e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0197549  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2798  glutathione peroxidase  54.42 
 
 		 164 aa  152  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1677  glutathione peroxidase  51.45 
 
 		 151 aa  152  2e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0889  glutathione peroxidase  54 
 
 		 168 aa  152  4e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.50899 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1409  glutathione peroxidase  46.51 
 
 		 184 aa  151  7e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15450  Glutathione peroxidase  50 
 
 		 158 aa  150  8.999999999999999e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0674744  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3022  glutathione peroxidase  41.71 
 
 		 230 aa  149  3e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00278721  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0265  Peroxiredoxin  50.34 
 
 		 165 aa  149  3e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000231119  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2329  putative glutathione peroxidase  48.99 
 
 		 161 aa  148  5e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.509466  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3037  glutathione peroxidase  41.71 
 
 		 230 aa  147  7e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000026286  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1242  glutathione peroxidase  51.75 
 
 		 159 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1863  glutathione peroxidase  46.2 
 
 		 195 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0484  glutathione peroxidase  49.34 
 
 		 161 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1936  glutathione peroxidase  52.38 
 
 		 159 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.634874 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0191  Glutathione peroxidase  50.65 
 
 		 161 aa  146  1.0000000000000001e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2472  Glutathione peroxidase  51.7 
 
 		 159 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.161656  decreased coverage  0.0000149935 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3238  glutathione peroxidase  52.05 
 
 		 159 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.400465  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2074  glutathione peroxidase  52.05 
 
 		 159 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.895406  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1571  glutathione peroxidase  52.05 
 
 		 159 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.154895  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2599  glutathione peroxidase  52.05 
 
 		 159 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.391635  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2510  glutathione peroxidase  52.05 
 
 		 159 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1346  glutathione peroxidase  52.05 
 
 		 159 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.909183  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2454  glutathione peroxidase  52.05 
 
 		 159 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0273  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2067  glutathione peroxidase  51.7 
 
 		 159 aa  145  3e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27520  putative glutathione peroxidase  47.65 
 
 		 161 aa  145  3e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.78279  normal  0.0357307 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1909  peroxiredoxin  44.38 
 
 		 161 aa  145  5e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.154084  normal  0.204796 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0173  glutathione peroxidase  50 
 
 		 161 aa  145  5e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.790659  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3349  glutathione peroxidase, putative  39.66 
 
 		 177 aa  144  6e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2909  Peroxiredoxin  44.12 
 
 		 198 aa  144  6e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3180  glutathione peroxidase  41.24 
 
 		 179 aa  144  6e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000271589  normal  0.0170233 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2011  glutathione peroxidase  50.68 
 
 		 159 aa  144  6e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0261647  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1665  glutathione peroxidase  51.7 
 
 		 159 aa  144  7.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0389024 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0250  glutathione peroxidase  51.32 
 
 		 164 aa  144  8.000000000000001e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5344  glutathione peroxidase  51.02 
 
 		 159 aa  144  8.000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.213102 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2054  glutathione peroxidase  50.34 
 
 		 159 aa  144  9e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6042  glutathione peroxidase  50.34 
 
 		 159 aa  144  9e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02660  glutathione peroxidase  50 
 
 		 158 aa  144  9e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2035  glutathione peroxidase  50.34 
 
 		 159 aa  144  9e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1214  glutathione peroxidase  45.91 
 
 		 167 aa  143  1e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1341  glutathione peroxidase  44.12 
 
 		 179 aa  144  1e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0267656  hitchhiker  0.0000000425712 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3613  glutathione peroxidase  46.91 
 
 		 161 aa  142  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.374005  normal  0.319321 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3685  glutathione peroxidase  51.3 
 
 		 163 aa  142  2e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2756  glutathione peroxidase  47.65 
 
 		 158 aa  143  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.447473  hitchhiker  0.0000941143 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1449  glutathione peroxidase  47.83 
 
 		 162 aa  143  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00937829  normal  0.354884 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2934  glutathione peroxidase  53.06 
 
 		 164 aa  142  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0465616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1080  glutathione peroxidase  47.97 
 
 		 164 aa  142  3e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000852506  normal  0.679739 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1090  glutathione peroxidase  48.99 
 
 		 160 aa  141  5e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.37333 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4103  putative glutathione peroxidase  44.38 
 
 		 184 aa  141  5e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47550  putative glutathione peroxidase  44.38 
 
 		 184 aa  141  5e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.532704 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2684  glutathione peroxidase  39.89 
 
 		 179 aa  141  6e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.553323  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02770  glutathione peroxidase  48.97 
 
 		 160 aa  141  7e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.359164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1354  glutathione peroxidase  50 
 
 		 162 aa  141  7e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.525114 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1971  glutathione peroxidase  46 
 
 		 160 aa  140  9e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.775227  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2119  glutathione peroxidase  46 
 
 		 160 aa  140  9e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1267  glutathione peroxidase  39.66 
 
 		 203 aa  140  9e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0133013  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1874  glutathione peroxidase  48.65 
 
 		 162 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0631469  normal  0.307231 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2154  glutathione peroxidase  46 
 
 		 160 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1950  glutathione peroxidase  46 
 
 		 160 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.210596  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2558  Peroxiredoxin  47.95 
 
 		 162 aa  140  9.999999999999999e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.177554  normal  0.095865 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2526  glutathione peroxidase  44.1 
 
 		 180 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.327392  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1781  glutathione peroxidase family protein  44.44 
 
 		 161 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2453  glutathione peroxidase  47.65 
 
 		 158 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.70182 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3981  glutathione peroxidase  44.03 
 
 		 161 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.890862  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1897  glutathione peroxidase  50.7 
 
 		 158 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0270  glutathione peroxidase  47.92 
 
 		 158 aa  139  1.9999999999999998e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2271  glutathione peroxidase  43.56 
 
 		 160 aa  139  3e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3841  glutathione peroxidase  48.65 
 
 		 162 aa  139  3e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0688357  normal  0.342172 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1197  glutathione peroxidase  39.11 
 
 		 203 aa  139  3e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00644229  normal  0.718028 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2202  glutathione peroxidase  45.33 
 
 		 161 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0177431  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4148  Glutathione peroxidase  51.75 
 
 		 158 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.784559  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0697  Glutathione peroxidase  45.33 
 
 		 170 aa  137  6e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3053  peroxiredoxin  47.89 
 
 		 164 aa  138  6e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.508134 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2006  glutathione peroxidase family protein  45.7 
 
 		 160 aa  137  7e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1563  glutathione peroxidase, putative  46.94 
 
 		 162 aa  137  7e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1926  glutathione peroxidase  45.33 
 
 		 160 aa  137  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2975  Glutathione peroxidase  48.51 
 
 		 161 aa  137  7.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.36322  normal  0.036622 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1570  Glutathione peroxidase  46.31 
 
 		 158 aa  137  7.999999999999999e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1196  glutathione peroxidase  39.11 
 
 		 203 aa  137  7.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0218447  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1686  glutathione peroxidase  41.76 
 
 		 202 aa  137  8.999999999999999e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.677668  normal  0.86735 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2131  glutathione peroxidase  44.67 
 
 		 160 aa  137  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4077  glutathione peroxidase  47.71 
 
 		 162 aa  137  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.629032 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>