More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0488 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_0488  glutathione peroxidase  100 
 
 		 185 aa  382  1e-105  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.642227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0237  putative glutathione peroxidase transmembrane protein  57.69 
 
 		 205 aa  218  3e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1970  glutathione peroxidase  57.56 
 
 		 193 aa  215  4e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0042  glutathione peroxidase  62.26 
 
 		 212 aa  209  2e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.490429  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0018  glutathione peroxidase  61.49 
 
 		 208 aa  209  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4659  glutathione peroxidase  59.51 
 
 		 208 aa  209  3e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0162  glutathione peroxidase  57.47 
 
 		 231 aa  205  3e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.520461 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0169  glutathione peroxidase  57.8 
 
 		 231 aa  203  9e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0307  putative glutathione peroxidase transmembrane protein  61.78 
 
 		 233 aa  199  1.9999999999999998e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5165  Peroxiredoxin  58.6 
 
 		 202 aa  196  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.648504  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4024  glutathione peroxidase  57.23 
 
 		 213 aa  193  1e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3912  glutathione peroxidase  57.32 
 
 		 189 aa  190  9e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.295477  normal  0.0278841 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4667  glutathione peroxidase  55.84 
 
 		 199 aa  187  5.999999999999999e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3374  glutathione peroxidase  58.71 
 
 		 195 aa  186  1e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.479812  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0461  glutathione peroxidase  48.04 
 
 		 191 aa  186  1e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1863  glutathione peroxidase  50 
 
 		 195 aa  171  7.999999999999999e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01222  ABC transporter vitamin B12 uptake permease  49.71 
 
 		 185 aa  169  1e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.039958  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1677  glutathione peroxidase  55.48 
 
 		 151 aa  164  5e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1246  glutathione peroxidase  57.78 
 
 		 192 aa  162  2.0000000000000002e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.281187  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1409  glutathione peroxidase  55.7 
 
 		 184 aa  160  1e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2526  glutathione peroxidase  46.15 
 
 		 180 aa  160  1e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.327392  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0270  glutathione peroxidase  48.97 
 
 		 158 aa  158  4e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2453  glutathione peroxidase  50.68 
 
 		 158 aa  158  5e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.70182 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2618  glutathione peroxidase  56.25 
 
 		 195 aa  155  2e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.137836  normal  0.142472 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02196  Glutathione peroxidase  49.38 
 
 		 184 aa  155  3e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0197549  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2249  glutathione peroxidase  47.74 
 
 		 162 aa  154  1e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.487328  normal  0.155268 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3929  glutathione peroxidase  50.34 
 
 		 188 aa  151  4e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.592022 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0250  glutathione peroxidase  53.47 
 
 		 164 aa  151  4e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02770  glutathione peroxidase  53.24 
 
 		 160 aa  150  1e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.359164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1346  glutathione peroxidase  53.42 
 
 		 159 aa  149  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.909183  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2910  Glutathione peroxidase  55 
 
 		 165 aa  149  2e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1571  glutathione peroxidase  53.42 
 
 		 159 aa  149  2e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.154895  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2599  glutathione peroxidase  53.42 
 
 		 159 aa  149  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.391635  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2454  glutathione peroxidase  53.42 
 
 		 159 aa  149  2e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0273  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1762  glutathione peroxidase  47.8 
 
 		 183 aa  149  2e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.533866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2510  glutathione peroxidase  53.42 
 
 		 159 aa  149  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3238  glutathione peroxidase  53.42 
 
 		 159 aa  149  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.400465  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2074  glutathione peroxidase  53.42 
 
 		 159 aa  149  2e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.895406  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1391  glutathione peroxidase  53.85 
 
 		 153 aa  148  3e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3981  glutathione peroxidase  49.38 
 
 		 161 aa  149  3e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.890862  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02660  glutathione peroxidase  50 
 
 		 158 aa  148  3e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2011  glutathione peroxidase  52.74 
 
 		 159 aa  148  4e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0261647  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2674  putative glutathione peroxidase protein  51.66 
 
 		 165 aa  148  5e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.552039 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2683  Peroxiredoxin  51.35 
 
 		 160 aa  147  6e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.299838  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0851  glutathione peroxidase  50 
 
 		 161 aa  147  7e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.425919  decreased coverage  0.00020946 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2558  Peroxiredoxin  50.34 
 
 		 162 aa  147  9e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.177554  normal  0.095865 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2504  Glutathione peroxidase  54.29 
 
 		 165 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.718008 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1563  glutathione peroxidase, putative  47.8 
 
 		 162 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27520  putative glutathione peroxidase  51.82 
 
 		 161 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.78279  normal  0.0357307 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5332  glutathione peroxidase  53.68 
 
 		 163 aa  145  3e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0814545  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0697  Glutathione peroxidase  45.03 
 
 		 170 aa  145  3e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4103  putative glutathione peroxidase  45.96 
 
 		 184 aa  145  3e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1801  glutathione peroxidase  45.62 
 
 		 199 aa  145  3e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.740072  hitchhiker  0.00000253639 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47550  putative glutathione peroxidase  45.96 
 
 		 184 aa  145  3e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.532704 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4077  glutathione peroxidase  51.33 
 
 		 162 aa  145  3e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.629032 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2875  glutathione peroxidase  48.75 
 
 		 161 aa  145  3e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000745159  hitchhiker  0.0000749041 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3685  glutathione peroxidase  51.09 
 
 		 163 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2773  glutathione peroxidase  48.75 
 
 		 161 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000478947  hitchhiker  0.00587193 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0559  glutathione peroxidase  45.7 
 
 		 161 aa  145  4.0000000000000006e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2329  putative glutathione peroxidase  51.82 
 
 		 161 aa  145  5e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.509466  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1781  glutathione peroxidase family protein  47.5 
 
 		 161 aa  144  5e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2454  Peroxiredoxin  51.05 
 
 		 160 aa  145  5e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0184161  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2705  glutathione peroxidase  48.12 
 
 		 161 aa  144  6e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000249576  hitchhiker  0.0000800256 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0565  glutathione peroxidase  46.11 
 
 		 182 aa  144  8.000000000000001e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1341  glutathione peroxidase  44.83 
 
 		 179 aa  143  1e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0267656  hitchhiker  0.0000000425712 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3022  glutathione peroxidase  44.83 
 
 		 230 aa  143  1e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00278721  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0392  glutathione peroxidase  42.37 
 
 		 188 aa  143  1e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0773128  normal  0.361866 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1570  Glutathione peroxidase  46.62 
 
 		 158 aa  143  1e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0484  glutathione peroxidase  47.77 
 
 		 161 aa  142  2e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1334  Peroxiredoxin  53.28 
 
 		 169 aa  143  2e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0131674  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3277  Peroxiredoxin  52.52 
 
 		 164 aa  143  2e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3037  glutathione peroxidase  44.83 
 
 		 230 aa  143  2e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000026286  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2699  glutathione peroxidase  50.34 
 
 		 160 aa  142  3e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3198  Glutathione peroxidase protein  50 
 
 		 159 aa  142  3e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.246451  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1449  glutathione peroxidase  50.74 
 
 		 162 aa  142  3e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00937829  normal  0.354884 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5025  peroxiredoxin  51.39 
 
 		 171 aa  141  4e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0652457 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2756  glutathione peroxidase  50.34 
 
 		 158 aa  142  4e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.447473  hitchhiker  0.0000941143 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1812  Peroxiredoxin  45.45 
 
 		 162 aa  141  4e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00250469  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3641  peroxiredoxin  48.3 
 
 		 161 aa  142  4e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3613  glutathione peroxidase  46.98 
 
 		 161 aa  141  5e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.374005  normal  0.319321 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1214  glutathione peroxidase  45.52 
 
 		 167 aa  141  5e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2597  Peroxiredoxin  48.65 
 
 		 158 aa  141  5e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1874  glutathione peroxidase  52.21 
 
 		 162 aa  141  6e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0631469  normal  0.307231 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0190  glutathione peroxidase  46.5 
 
 		 161 aa  141  6e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.926255  normal  0.776204 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3180  glutathione peroxidase  44.19 
 
 		 179 aa  141  7e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000271589  normal  0.0170233 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3053  peroxiredoxin  51.8 
 
 		 164 aa  140  7e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.508134 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3841  glutathione peroxidase  49.66 
 
 		 162 aa  140  8e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0688357  normal  0.342172 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0904  glutathione peroxidase  47.97 
 
 		 158 aa  140  8e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000826936  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15450  Glutathione peroxidase  45.33 
 
 		 158 aa  140  9e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0674744  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2774  putative glutathione peroxidase  44.64 
 
 		 183 aa  140  9e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.956503  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1427  GMP synthase-like  42.37 
 
 		 190 aa  140  9e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3670  glutathione peroxidase  42.94 
 
 		 184 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.174884  normal  0.0808268 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1300  glutathione peroxidase  45.62 
 
 		 161 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.448702  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0191  Glutathione peroxidase  48.61 
 
 		 161 aa  140  9.999999999999999e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03223  glutathione peroxidase  46.39 
 
 		 181 aa  140  9.999999999999999e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4117  Peroxiredoxin  47.97 
 
 		 182 aa  140  9.999999999999999e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2468  putative glutathione peroxidase  45.24 
 
 		 183 aa  140  9.999999999999999e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.157307  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3253  Peroxiredoxin  52.59 
 
 		 164 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.350236  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1936  glutathione peroxidase  50 
 
 		 159 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.634874 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1244  glutathione peroxidase  44.1 
 
 		 176 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.247052  normal  0.300123 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>