More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4659 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_4659  glutathione peroxidase  100 
 
 
208 aa  430  1e-120  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3912  glutathione peroxidase  78.03 
 
 
189 aa  284  7e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.295477  normal  0.0278841 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5165  Peroxiredoxin  73.89 
 
 
202 aa  250  9.000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.648504  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1970  glutathione peroxidase  70.83 
 
 
193 aa  248  6e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4024  glutathione peroxidase  67.47 
 
 
213 aa  244  9e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0042  glutathione peroxidase  66.04 
 
 
212 aa  232  3e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.490429  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3374  glutathione peroxidase  67.52 
 
 
195 aa  232  3e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.479812  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0018  glutathione peroxidase  64.78 
 
 
208 aa  228  4e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0237  putative glutathione peroxidase transmembrane protein  69.43 
 
 
205 aa  228  5e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4667  glutathione peroxidase  62.5 
 
 
199 aa  216  2.9999999999999998e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0169  glutathione peroxidase  56.5 
 
 
231 aa  209  2e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0488  glutathione peroxidase  60.51 
 
 
185 aa  207  1e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.642227  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0162  glutathione peroxidase  58.13 
 
 
231 aa  206  2e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.520461 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0307  putative glutathione peroxidase transmembrane protein  57.86 
 
 
233 aa  204  5e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0461  glutathione peroxidase  52.07 
 
 
191 aa  196  2.0000000000000003e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1677  glutathione peroxidase  62.42 
 
 
151 aa  191  8e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1409  glutathione peroxidase  52.91 
 
 
184 aa  174  9.999999999999999e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2526  glutathione peroxidase  49.39 
 
 
180 aa  171  5e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.327392  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4103  putative glutathione peroxidase  50.93 
 
 
184 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47550  putative glutathione peroxidase  50.93 
 
 
184 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.532704 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1762  glutathione peroxidase  50.93 
 
 
183 aa  160  1e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.533866  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3180  glutathione peroxidase  47.88 
 
 
179 aa  158  6e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000271589  normal  0.0170233 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1341  glutathione peroxidase  47.88 
 
 
179 aa  158  7e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0267656  hitchhiker  0.0000000425712 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2684  glutathione peroxidase  47.98 
 
 
179 aa  157  9e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.553323  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02196  Glutathione peroxidase  45.62 
 
 
184 aa  157  9e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0197549  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3037  glutathione peroxidase  47.88 
 
 
230 aa  157  1e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000026286  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3022  glutathione peroxidase  47.88 
 
 
230 aa  157  1e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00278721  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1246  glutathione peroxidase  46.82 
 
 
192 aa  153  1e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.281187  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01222  ABC transporter vitamin B12 uptake permease  48.5 
 
 
185 aa  154  1e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.039958  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05309  glutathione peroxidase  47.5 
 
 
181 aa  153  1e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1719  glutathione peroxidase family protein  47.06 
 
 
183 aa  153  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00731943  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2249  glutathione peroxidase  53.29 
 
 
162 aa  153  2e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.487328  normal  0.155268 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2618  glutathione peroxidase  54.69 
 
 
195 aa  152  2.9999999999999998e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.137836  normal  0.142472 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1654  glutathione peroxidase  45.66 
 
 
186 aa  152  4e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.323621  hitchhiker  0.0047837 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1267  glutathione peroxidase  46.06 
 
 
203 aa  152  4e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0133013  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3349  glutathione peroxidase, putative  45.45 
 
 
177 aa  152  5e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3670  glutathione peroxidase  46.24 
 
 
184 aa  151  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.174884  normal  0.0808268 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1196  glutathione peroxidase  46.06 
 
 
203 aa  151  7e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0218447  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2453  glutathione peroxidase  50.33 
 
 
158 aa  150  1e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.70182 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1686  glutathione peroxidase  43.35 
 
 
202 aa  149  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.677668  normal  0.86735 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1244  glutathione peroxidase  46.34 
 
 
176 aa  149  2e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.247052  normal  0.300123 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1197  glutathione peroxidase  45.45 
 
 
203 aa  149  2e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00644229  normal  0.718028 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4033  glutathione peroxidase  43.35 
 
 
183 aa  149  4e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.475849  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02770  glutathione peroxidase  50.34 
 
 
160 aa  148  5e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.359164  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1284  glutathione peroxidase  43.35 
 
 
183 aa  148  5e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.604655  normal  0.560913 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1427  GMP synthase-like  44.38 
 
 
190 aa  147  9e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000573  glutathione peroxidase  45.68 
 
 
181 aa  146  2.0000000000000003e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1863  glutathione peroxidase  51.41 
 
 
195 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2474  glutathione peroxidase, putative  43.27 
 
 
180 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0250  glutathione peroxidase  49.38 
 
 
164 aa  143  1e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0697  Glutathione peroxidase  47.71 
 
 
170 aa  143  2e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1570  Glutathione peroxidase  51.03 
 
 
158 aa  142  2e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0359  glutathione peroxidase  43.64 
 
 
182 aa  142  5e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2679  glutathione peroxidase  42.53 
 
 
192 aa  141  6e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.241309  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2853  glutathione peroxidase  40.74 
 
 
177 aa  141  7e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.154923  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02660  glutathione peroxidase  47.62 
 
 
158 aa  141  9e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1214  glutathione peroxidase  48.32 
 
 
167 aa  140  1.9999999999999998e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2515  glutathione peroxidase  44.71 
 
 
185 aa  139  3e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0559  glutathione peroxidase  47.06 
 
 
161 aa  139  3e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1178  glutathione peroxidase  48.28 
 
 
158 aa  138  4.999999999999999e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.375161  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2909  Peroxiredoxin  42.94 
 
 
198 aa  136  2e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2472  Glutathione peroxidase  50.34 
 
 
159 aa  137  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.161656  decreased coverage  0.0000149935 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1801  glutathione peroxidase  43.12 
 
 
199 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.740072  hitchhiker  0.00000253639 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1812  Peroxiredoxin  44.59 
 
 
162 aa  135  4e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00250469  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1563  glutathione peroxidase, putative  48.63 
 
 
162 aa  135  5e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2798  glutathione peroxidase  48.67 
 
 
164 aa  135  5e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0484  glutathione peroxidase  44.3 
 
 
161 aa  135  5e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0297  glutathione peroxidase  46.58 
 
 
161 aa  135  5e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0981226  normal  0.609333 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1080  glutathione peroxidase  48.97 
 
 
164 aa  135  5e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000852506  normal  0.679739 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2389  putative glutathione peroxidase  48.06 
 
 
176 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.401751  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2597  Peroxiredoxin  49.66 
 
 
158 aa  135  6.0000000000000005e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0867  glutathione peroxidase  48.28 
 
 
159 aa  135  6.0000000000000005e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000118287  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2875  glutathione peroxidase  52.63 
 
 
161 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000745159  hitchhiker  0.0000749041 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2683  Peroxiredoxin  48.61 
 
 
160 aa  134  7.000000000000001e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.299838  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1391  glutathione peroxidase  50.76 
 
 
153 aa  134  8e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2910  Glutathione peroxidase  47.26 
 
 
165 aa  134  9e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3685  glutathione peroxidase  46.41 
 
 
163 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1053  glutathione peroxidase  48.06 
 
 
176 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.281088  normal  0.469721 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0904  glutathione peroxidase  48.25 
 
 
158 aa  134  9.999999999999999e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000826936  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2773  glutathione peroxidase  52.63 
 
 
161 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000478947  hitchhiker  0.00587193 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2504  Glutathione peroxidase  47.95 
 
 
165 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.718008 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2674  putative glutathione peroxidase protein  47.26 
 
 
165 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.552039 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2558  Peroxiredoxin  44.44 
 
 
162 aa  133  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.177554  normal  0.095865 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0191  Glutathione peroxidase  45.1 
 
 
161 aa  133  1.9999999999999998e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2705  glutathione peroxidase  51.88 
 
 
161 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000249576  hitchhiker  0.0000800256 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2699  glutathione peroxidase  52.31 
 
 
160 aa  132  3e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0238  Peroxiredoxin  46.21 
 
 
170 aa  132  3e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15450  Glutathione peroxidase  44.3 
 
 
158 aa  132  3e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0674744  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1665  glutathione peroxidase  49.66 
 
 
159 aa  132  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0389024 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0889  glutathione peroxidase  47.92 
 
 
168 aa  132  3e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.50899 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3880  putative glutathione peroxidase  45.07 
 
 
191 aa  132  3e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.41902 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0020  glutathione peroxidase  47.83 
 
 
168 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0123  glutathione peroxidase  50.69 
 
 
161 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1199  glutathione peroxidase  44.51 
 
 
182 aa  132  5e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0894577  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1909  peroxiredoxin  47.59 
 
 
161 aa  132  5e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.154084  normal  0.204796 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1075  glutathione peroxidase  41.67 
 
 
168 aa  131  6e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.364498  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1781  glutathione peroxidase family protein  48.97 
 
 
161 aa  131  6e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1315  glutathione peroxidase  42.86 
 
 
173 aa  131  6.999999999999999e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0173  glutathione peroxidase  44.44 
 
 
161 aa  131  6.999999999999999e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.790659  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4022  Glutathione peroxidase  42.05 
 
 
181 aa  131  6.999999999999999e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.350366 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>