More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2006 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2006  glutathione peroxidase family protein  100 
 
 		 160 aa  328  1e-89  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1665  glutathione peroxidase  59.75 
 
 		 159 aa  220  4.9999999999999996e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0389024 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2472  Glutathione peroxidase  60.38 
 
 		 159 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.161656  decreased coverage  0.0000149935 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2074  glutathione peroxidase  61.01 
 
 		 159 aa  218  3.9999999999999997e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.895406  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3238  glutathione peroxidase  61.01 
 
 		 159 aa  218  3.9999999999999997e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.400465  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1346  glutathione peroxidase  61.01 
 
 		 159 aa  218  3.9999999999999997e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.909183  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1571  glutathione peroxidase  61.01 
 
 		 159 aa  218  3.9999999999999997e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.154895  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2599  glutathione peroxidase  61.01 
 
 		 159 aa  218  3.9999999999999997e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.391635  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2510  glutathione peroxidase  61.01 
 
 		 159 aa  218  3.9999999999999997e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2454  glutathione peroxidase  61.01 
 
 		 159 aa  218  3.9999999999999997e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0273  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1771  glutathione peroxidase  60.9 
 
 		 161 aa  217  6e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2011  glutathione peroxidase  60.38 
 
 		 159 aa  217  7e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0261647  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0265  Peroxiredoxin  62.03 
 
 		 165 aa  215  2e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000231119  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3973  Peroxiredoxin  60.13 
 
 		 165 aa  214  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000360978 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1354  glutathione peroxidase  60.13 
 
 		 162 aa  214  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.525114 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3925  Glutathione peroxidase  59.49 
 
 		 165 aa  213  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2798  glutathione peroxidase  58.75 
 
 		 164 aa  211  2.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3447  glutathione peroxidase  62.03 
 
 		 161 aa  210  5.999999999999999e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0243575 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2054  glutathione peroxidase  56.6 
 
 		 159 aa  209  1e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1300  glutathione peroxidase  60.13 
 
 		 161 aa  209  1e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.448702  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5344  glutathione peroxidase  57.23 
 
 		 159 aa  209  1e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.213102 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6042  glutathione peroxidase  56.6 
 
 		 159 aa  209  1e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2035  glutathione peroxidase  56.6 
 
 		 159 aa  209  1e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1080  glutathione peroxidase  59.75 
 
 		 164 aa  209  1e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000852506  normal  0.679739 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2067  glutathione peroxidase  57.23 
 
 		 159 aa  208  2e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1936  glutathione peroxidase  56.6 
 
 		 159 aa  207  3e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.634874 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2597  Peroxiredoxin  59.24 
 
 		 158 aa  206  9e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2176  glutathione peroxidase  66.67 
 
 		 143 aa  206  9e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0884553  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1769  glutathione peroxidase  58.97 
 
 		 162 aa  206  1e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0182367  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1570  Glutathione peroxidase  57.96 
 
 		 158 aa  205  2e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1242  glutathione peroxidase  57.23 
 
 		 159 aa  204  3e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1897  glutathione peroxidase  56.6 
 
 		 158 aa  204  4e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2934  glutathione peroxidase  58.13 
 
 		 164 aa  204  4e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0465616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2964  glutathione peroxidase  58.23 
 
 		 160 aa  204  5e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2764  glutathione peroxidase  58.23 
 
 		 161 aa  203  6e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0187221  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3470  glutathione peroxidase  59.12 
 
 		 158 aa  203  7e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3298  glutathione peroxidase  56.96 
 
 		 161 aa  202  1e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.40101  decreased coverage  0.0000000224321 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2910  Glutathione peroxidase  55.62 
 
 		 165 aa  203  1e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2674  putative glutathione peroxidase protein  55.62 
 
 		 165 aa  202  2e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.552039 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6295  glutathione peroxidase  58.23 
 
 		 162 aa  201  2e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0889  glutathione peroxidase  54.43 
 
 		 168 aa  202  2e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.50899 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0118  glutathione peroxidase  57.86 
 
 		 160 aa  202  2e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4148  Glutathione peroxidase  57.23 
 
 		 158 aa  201  3e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.784559  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2504  Glutathione peroxidase  55 
 
 		 165 aa  201  3e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.718008 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01902  probable glutathione peroxidase  58.33 
 
 		 165 aa  201  3e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.101099  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2705  glutathione peroxidase  56.96 
 
 		 161 aa  201  4e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000249576  hitchhiker  0.0000800256 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2875  glutathione peroxidase  56.33 
 
 		 161 aa  201  4e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000745159  hitchhiker  0.0000749041 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0484  glutathione peroxidase  53.75 
 
 		 161 aa  201  5e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2773  glutathione peroxidase  56.33 
 
 		 161 aa  200  6e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000478947  hitchhiker  0.00587193 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0841  glutathione peroxidase  55.41 
 
 		 164 aa  198  1.9999999999999998e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0436995  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4077  glutathione peroxidase  54.09 
 
 		 162 aa  198  1.9999999999999998e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.629032 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0190  glutathione peroxidase  53.12 
 
 		 161 aa  198  1.9999999999999998e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.926255  normal  0.776204 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1407  glutathione peroxidase  54.43 
 
 		 165 aa  199  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0308338  normal  0.103968 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1368  glutathione peroxidase  54.43 
 
 		 165 aa  198  3e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0128  glutathione peroxidase  53.12 
 
 		 161 aa  198  3e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.594559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0123  glutathione peroxidase  55.97 
 
 		 161 aa  197  3.9999999999999996e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3665  glutathione peroxidase  55.35 
 
 		 158 aa  197  5e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2756  glutathione peroxidase  54.78 
 
 		 158 aa  197  6e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.447473  hitchhiker  0.0000941143 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2975  Glutathione peroxidase  53.8 
 
 		 161 aa  196  9e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.36322  normal  0.036622 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1384  glutathione peroxidase  53.8 
 
 		 165 aa  196  9e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27520  putative glutathione peroxidase  60.54 
 
 		 161 aa  196  9e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.78279  normal  0.0357307 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0250  glutathione peroxidase  52.5 
 
 		 164 aa  196  9e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1563  glutathione peroxidase, putative  55.7 
 
 		 162 aa  196  1.0000000000000001e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2329  putative glutathione peroxidase  59.86 
 
 		 161 aa  196  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.509466  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2741  glutathione peroxidase  56.69 
 
 		 162 aa  194  4.0000000000000005e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000260986  hitchhiker  0.0000615291 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00658  glutathione peroxidase  52.83 
 
 		 161 aa  194  5.000000000000001e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0965068  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1874  glutathione peroxidase  63.12 
 
 		 162 aa  194  6e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0631469  normal  0.307231 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2552  glutathione peroxidase  56.05 
 
 		 161 aa  193  6e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.40006  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0191  Glutathione peroxidase  52.5 
 
 		 161 aa  193  9e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0173  glutathione peroxidase  52.5 
 
 		 161 aa  192  1e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.790659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1909  peroxiredoxin  55 
 
 		 161 aa  192  1e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.154084  normal  0.204796 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2639  glutathione peroxidase  54.72 
 
 		 158 aa  192  2e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.833403 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0904  glutathione peroxidase  56.41 
 
 		 158 aa  192  2e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000826936  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1971  glutathione peroxidase  51.59 
 
 		 160 aa  191  3e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.775227  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1926  glutathione peroxidase  51.59 
 
 		 160 aa  191  3e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2119  glutathione peroxidase  51.59 
 
 		 160 aa  191  3e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4117  Peroxiredoxin  51.57 
 
 		 182 aa  191  3e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0867  glutathione peroxidase  56.05 
 
 		 159 aa  191  5e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000118287  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3613  glutathione peroxidase  56.05 
 
 		 161 aa  190  6e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.374005  normal  0.319321 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2271  glutathione peroxidase  51.59 
 
 		 160 aa  190  7e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3267  glutathione peroxidase  54.72 
 
 		 158 aa  190  7e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3685  glutathione peroxidase  50.94 
 
 		 163 aa  189  9e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1334  Peroxiredoxin  53.5 
 
 		 169 aa  189  1e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0131674  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2202  glutathione peroxidase  50.96 
 
 		 161 aa  189  1e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0177431  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1950  glutathione peroxidase  51.59 
 
 		 160 aa  189  1e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.210596  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2154  glutathione peroxidase  51.59 
 
 		 160 aa  189  1e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1090  glutathione peroxidase  52.87 
 
 		 160 aa  189  1e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.37333 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1178  glutathione peroxidase  55.41 
 
 		 158 aa  189  1e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.375161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1965  glutathione peroxidase  50.32 
 
 		 160 aa  189  1e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0718131  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2131  glutathione peroxidase  50.32 
 
 		 160 aa  189  1e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3184  glutathione peroxidase  50.32 
 
 		 160 aa  189  2e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3841  glutathione peroxidase  60.99 
 
 		 162 aa  189  2e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0688357  normal  0.342172 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0020  glutathione peroxidase  53.46 
 
 		 168 aa  188  2.9999999999999997e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1449  glutathione peroxidase  59.57 
 
 		 162 aa  187  5.999999999999999e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00937829  normal  0.354884 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1483  glutathione peroxidase  60.28 
 
 		 162 aa  187  7e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2663  glutathione peroxidase  56.69 
 
 		 157 aa  186  8e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.190046  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2683  Peroxiredoxin  51.9 
 
 		 160 aa  186  9e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.299838  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3981  glutathione peroxidase  52.87 
 
 		 161 aa  186  1e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.890862  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1781  glutathione peroxidase family protein  54.14 
 
 		 161 aa  185  2e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1597  glutathione peroxidase  55.06 
 
 		 159 aa  184  4e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00235323  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>