More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5165 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_5165  Peroxiredoxin  100 
 
 		 202 aa  412  1e-114  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.648504  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4659  glutathione peroxidase  73.75 
 
 		 208 aa  255  3e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3912  glutathione peroxidase  72.78 
 
 		 189 aa  247  9e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.295477  normal  0.0278841 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0042  glutathione peroxidase  69.62 
 
 		 212 aa  239  1e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.490429  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0018  glutathione peroxidase  67.7 
 
 		 208 aa  239  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4024  glutathione peroxidase  68.52 
 
 		 213 aa  237  9e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0237  putative glutathione peroxidase transmembrane protein  69.62 
 
 		 205 aa  235  4e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3374  glutathione peroxidase  69.03 
 
 		 195 aa  230  9e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.479812  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1970  glutathione peroxidase  67.08 
 
 		 193 aa  225  4e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4667  glutathione peroxidase  62.75 
 
 		 199 aa  222  2e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0169  glutathione peroxidase  59.26 
 
 		 231 aa  209  3e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0162  glutathione peroxidase  58.64 
 
 		 231 aa  207  9e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.520461 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0461  glutathione peroxidase  57.06 
 
 		 191 aa  206  1e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0307  putative glutathione peroxidase transmembrane protein  58.6 
 
 		 233 aa  201  6e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0488  glutathione peroxidase  58.6 
 
 		 185 aa  197  1.0000000000000001e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.642227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1409  glutathione peroxidase  58.18 
 
 		 184 aa  186  2e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2526  glutathione peroxidase  53.12 
 
 		 180 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.327392  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1677  glutathione peroxidase  71.3 
 
 		 151 aa  176  2e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01222  ABC transporter vitamin B12 uptake permease  52.73 
 
 		 185 aa  172  2.9999999999999996e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.039958  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4103  putative glutathione peroxidase  50.62 
 
 		 184 aa  166  1e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47550  putative glutathione peroxidase  50.62 
 
 		 184 aa  166  1e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.532704 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2618  glutathione peroxidase  59.52 
 
 		 195 aa  167  1e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.137836  normal  0.142472 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1654  glutathione peroxidase  50.62 
 
 		 186 aa  166  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.323621  hitchhiker  0.0047837 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1762  glutathione peroxidase  51.23 
 
 		 183 aa  165  5e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.533866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02196  Glutathione peroxidase  47.53 
 
 		 184 aa  164  1.0000000000000001e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0197549  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3670  glutathione peroxidase  50 
 
 		 184 aa  163  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.174884  normal  0.0808268 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1719  glutathione peroxidase family protein  50 
 
 		 183 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00731943  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1341  glutathione peroxidase  49.08 
 
 		 179 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0267656  hitchhiker  0.0000000425712 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3022  glutathione peroxidase  49.08 
 
 		 230 aa  162  3e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00278721  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3037  glutathione peroxidase  49.08 
 
 		 230 aa  162  3e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000026286  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3180  glutathione peroxidase  49.38 
 
 		 179 aa  161  7e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000271589  normal  0.0170233 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1246  glutathione peroxidase  55.15 
 
 		 192 aa  160  1e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.281187  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2684  glutathione peroxidase  48.47 
 
 		 179 aa  159  3e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.553323  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2474  glutathione peroxidase, putative  49.37 
 
 		 180 aa  158  5e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1686  glutathione peroxidase  47.53 
 
 		 202 aa  157  7e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.677668  normal  0.86735 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1284  glutathione peroxidase  47.53 
 
 		 183 aa  157  7e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.604655  normal  0.560913 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4033  glutathione peroxidase  47.53 
 
 		 183 aa  157  7e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.475849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1267  glutathione peroxidase  48.75 
 
 		 203 aa  157  9e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0133013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02770  glutathione peroxidase  57.78 
 
 		 160 aa  156  2e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.359164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1196  glutathione peroxidase  48.75 
 
 		 203 aa  156  2e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0218447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05309  glutathione peroxidase  48.12 
 
 		 181 aa  155  3e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1197  glutathione peroxidase  48.12 
 
 		 203 aa  155  3e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00644229  normal  0.718028 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2679  glutathione peroxidase  46.59 
 
 		 192 aa  154  1e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.241309  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1244  glutathione peroxidase  46.91 
 
 		 176 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.247052  normal  0.300123 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2249  glutathione peroxidase  56.03 
 
 		 162 aa  151  5e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.487328  normal  0.155268 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2853  glutathione peroxidase  48.77 
 
 		 177 aa  151  7e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.154923  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3349  glutathione peroxidase, putative  46.88 
 
 		 177 aa  150  8.999999999999999e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2329  putative glutathione peroxidase  56.72 
 
 		 161 aa  150  1e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.509466  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27520  putative glutathione peroxidase  55.97 
 
 		 161 aa  150  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.78279  normal  0.0357307 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1801  glutathione peroxidase  46.88 
 
 		 199 aa  150  1e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.740072  hitchhiker  0.00000253639 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02660  glutathione peroxidase  52.2 
 
 		 158 aa  150  2e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0484  glutathione peroxidase  49.06 
 
 		 161 aa  149  4e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000573  glutathione peroxidase  46.25 
 
 		 181 aa  147  7e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2472  Glutathione peroxidase  54.17 
 
 		 159 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.161656  decreased coverage  0.0000149935 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0226  Peroxiredoxin  49.34 
 
 		 163 aa  146  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2773  glutathione peroxidase  55.97 
 
 		 161 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000478947  hitchhiker  0.00587193 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2515  glutathione peroxidase  47.34 
 
 		 185 aa  145  3e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0297  glutathione peroxidase  49.34 
 
 		 161 aa  145  4.0000000000000006e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0981226  normal  0.609333 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2705  glutathione peroxidase  55.22 
 
 		 161 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000249576  hitchhiker  0.0000800256 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2875  glutathione peroxidase  55.22 
 
 		 161 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000745159  hitchhiker  0.0000749041 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2798  glutathione peroxidase  55.15 
 
 		 164 aa  145  5e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1214  glutathione peroxidase  48.67 
 
 		 167 aa  145  5e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2453  glutathione peroxidase  50 
 
 		 158 aa  145  5e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.70182 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0889  glutathione peroxidase  54.62 
 
 		 168 aa  144  6e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.50899 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2699  glutathione peroxidase  54.48 
 
 		 160 aa  144  6e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3685  glutathione peroxidase  47.53 
 
 		 163 aa  144  7.0000000000000006e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1863  glutathione peroxidase  49.4 
 
 		 195 aa  144  7.0000000000000006e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0191  Glutathione peroxidase  48.05 
 
 		 161 aa  144  9e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0697  Glutathione peroxidase  49.01 
 
 		 170 aa  144  1e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15450  Glutathione peroxidase  50.72 
 
 		 158 aa  144  1e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0674744  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0250  glutathione peroxidase  49.07 
 
 		 164 aa  143  2e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1909  peroxiredoxin  53.73 
 
 		 161 aa  143  2e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.154084  normal  0.204796 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1080  glutathione peroxidase  52.41 
 
 		 164 aa  143  2e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000852506  normal  0.679739 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0359  glutathione peroxidase  45.34 
 
 		 182 aa  143  2e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2454  Peroxiredoxin  55.3 
 
 		 160 aa  142  3e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0184161  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0173  glutathione peroxidase  47.4 
 
 		 161 aa  142  3e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.790659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3880  putative glutathione peroxidase  44.79 
 
 		 191 aa  142  4e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.41902 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1665  glutathione peroxidase  52.38 
 
 		 159 aa  142  4e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0389024 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3470  glutathione peroxidase  54.23 
 
 		 158 aa  142  4e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4022  Glutathione peroxidase  45.83 
 
 		 181 aa  142  4e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.350366 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0559  glutathione peroxidase  47.77 
 
 		 161 aa  142  4e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1570  Glutathione peroxidase  52.21 
 
 		 158 aa  142  4e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3053  peroxiredoxin  50 
 
 		 164 aa  142  5e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.508134 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1897  glutathione peroxidase  53.52 
 
 		 158 aa  141  6e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1563  glutathione peroxidase, putative  53.33 
 
 		 162 aa  141  7e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1781  glutathione peroxidase family protein  53.73 
 
 		 161 aa  141  7e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0324  Glutathione peroxidase  46.06 
 
 		 165 aa  141  7e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.324106  normal  0.0807721 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2558  Peroxiredoxin  46.98 
 
 		 162 aa  141  8e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.177554  normal  0.095865 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2934  glutathione peroxidase  51.35 
 
 		 164 aa  141  8e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0465616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0270  glutathione peroxidase  47.52 
 
 		 158 aa  140  9e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1384  glutathione peroxidase  50 
 
 		 165 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3613  glutathione peroxidase  52.24 
 
 		 161 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.374005  normal  0.319321 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2074  glutathione peroxidase  50.75 
 
 		 159 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.895406  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1368  glutathione peroxidase  50 
 
 		 165 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2910  Glutathione peroxidase  53.33 
 
 		 165 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2011  glutathione peroxidase  50.75 
 
 		 159 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0261647  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1936  glutathione peroxidase  50 
 
 		 159 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.634874 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2510  glutathione peroxidase  50.75 
 
 		 159 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2035  glutathione peroxidase  51.09 
 
 		 159 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3238  glutathione peroxidase  50.75 
 
 		 159 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.400465  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>