More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_02660 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_02660  glutathione peroxidase  100 
 
 
158 aa  328  2e-89  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02770  glutathione peroxidase  65.19 
 
 
160 aa  224  3e-58  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.359164  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30390  glutathione peroxidase  59.52 
 
 
173 aa  209  1e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0128  glutathione peroxidase  61.49 
 
 
161 aa  207  4e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.594559  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0191  Glutathione peroxidase  60.87 
 
 
161 aa  206  1e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1570  Glutathione peroxidase  57.96 
 
 
158 aa  204  4e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0173  glutathione peroxidase  60.25 
 
 
161 aa  204  5e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.790659  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0250  glutathione peroxidase  61.01 
 
 
164 aa  204  5e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0190  glutathione peroxidase  58.39 
 
 
161 aa  201  4e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.926255  normal  0.776204 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0694  glutathione peroxidase  56.25 
 
 
161 aa  201  4e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000130339  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2683  Peroxiredoxin  58.86 
 
 
160 aa  199  9e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.299838  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2597  Peroxiredoxin  56.69 
 
 
158 aa  197  3e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2472  Glutathione peroxidase  57.86 
 
 
159 aa  197  3e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.161656  decreased coverage  0.0000149935 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0484  glutathione peroxidase  57.14 
 
 
161 aa  196  7.999999999999999e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1080  glutathione peroxidase  58.49 
 
 
164 aa  196  1.0000000000000001e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000852506  normal  0.679739 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3685  glutathione peroxidase  56.88 
 
 
163 aa  194  3e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0889  glutathione peroxidase  58.71 
 
 
168 aa  194  4.0000000000000005e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.50899 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1936  glutathione peroxidase  57.23 
 
 
159 aa  194  5.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.634874 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2067  glutathione peroxidase  57.23 
 
 
159 aa  194  5.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1354  glutathione peroxidase  59.49 
 
 
162 aa  193  7e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.525114 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5344  glutathione peroxidase  57.23 
 
 
159 aa  192  1e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.213102 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1665  glutathione peroxidase  55.97 
 
 
159 aa  192  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0389024 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1346  glutathione peroxidase  56.6 
 
 
159 aa  192  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.909183  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1571  glutathione peroxidase  56.6 
 
 
159 aa  192  2e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.154895  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2599  glutathione peroxidase  56.6 
 
 
159 aa  192  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.391635  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2510  glutathione peroxidase  56.6 
 
 
159 aa  192  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2011  glutathione peroxidase  55.35 
 
 
159 aa  192  2e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0261647  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3238  glutathione peroxidase  56.6 
 
 
159 aa  192  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.400465  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2454  glutathione peroxidase  56.6 
 
 
159 aa  192  2e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0273  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0226  Peroxiredoxin  56.25 
 
 
163 aa  192  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2074  glutathione peroxidase  56.6 
 
 
159 aa  192  2e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.895406  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1781  glutathione peroxidase family protein  57.32 
 
 
161 aa  191  3e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1242  glutathione peroxidase  54.72 
 
 
159 aa  191  3e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1872  glutathione peroxidase  54.19 
 
 
159 aa  191  3e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0683727  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6042  glutathione peroxidase  56.6 
 
 
159 aa  191  3e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2035  glutathione peroxidase  56.6 
 
 
159 aa  191  3e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2054  glutathione peroxidase  56.6 
 
 
159 aa  191  3e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0265  Peroxiredoxin  56.69 
 
 
165 aa  190  6e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000231119  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4148  Glutathione peroxidase  56.33 
 
 
158 aa  190  7e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.784559  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3613  glutathione peroxidase  57.69 
 
 
161 aa  189  1e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.374005  normal  0.319321 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1090  glutathione peroxidase  56.69 
 
 
160 aa  189  1e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.37333 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4077  glutathione peroxidase  55.35 
 
 
162 aa  189  1e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.629032 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2329  putative glutathione peroxidase  56.69 
 
 
161 aa  188  2e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.509466  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6295  glutathione peroxidase  57.32 
 
 
162 aa  188  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2756  glutathione peroxidase  57.32 
 
 
158 aa  188  2e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.447473  hitchhiker  0.0000941143 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4117  Peroxiredoxin  53.8 
 
 
182 aa  188  2.9999999999999997e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3981  glutathione peroxidase  55.77 
 
 
161 aa  187  4e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.890862  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1897  glutathione peroxidase  55.06 
 
 
158 aa  187  4e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3665  glutathione peroxidase  56.96 
 
 
158 aa  187  7e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3470  glutathione peroxidase  56.96 
 
 
158 aa  186  7e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2910  Glutathione peroxidase  54.09 
 
 
165 aa  187  7e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1909  peroxiredoxin  54.43 
 
 
161 aa  186  1e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.154084  normal  0.204796 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27520  putative glutathione peroxidase  55.41 
 
 
161 aa  186  1e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.78279  normal  0.0357307 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1965  glutathione peroxidase  49.37 
 
 
160 aa  185  2e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0718131  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1971  glutathione peroxidase  49.37 
 
 
160 aa  185  2e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.775227  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2119  glutathione peroxidase  49.37 
 
 
160 aa  185  2e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3617  Peroxiredoxin  58.11 
 
 
163 aa  185  2e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.78044  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2131  glutathione peroxidase  48.73 
 
 
160 aa  184  3e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1950  glutathione peroxidase  49.37 
 
 
160 aa  184  3e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.210596  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3641  peroxiredoxin  56.25 
 
 
161 aa  185  3e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2154  glutathione peroxidase  49.37 
 
 
160 aa  184  3e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1926  glutathione peroxidase  49.37 
 
 
160 aa  184  4e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2271  glutathione peroxidase  48.73 
 
 
160 aa  184  4e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14340  glutathione peroxidase  54.04 
 
 
166 aa  184  4e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1563  glutathione peroxidase, putative  53.16 
 
 
162 aa  184  5e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2504  Glutathione peroxidase  53.46 
 
 
165 aa  184  5e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.718008 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2202  glutathione peroxidase  48.73 
 
 
161 aa  184  6e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0177431  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3841  glutathione peroxidase  54.43 
 
 
162 aa  183  7e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0688357  normal  0.342172 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0851  glutathione peroxidase  54.04 
 
 
161 aa  183  8e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.425919  decreased coverage  0.00020946 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3973  Peroxiredoxin  51.27 
 
 
165 aa  183  8e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000360978 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3184  glutathione peroxidase  48.1 
 
 
160 aa  183  9e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00658  glutathione peroxidase  54.66 
 
 
161 aa  182  1.0000000000000001e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0965068  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1015  Glutathione peroxidase  55.28 
 
 
162 aa  182  1.0000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0150707 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2705  glutathione peroxidase  53.16 
 
 
161 aa  182  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000249576  hitchhiker  0.0000800256 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2875  glutathione peroxidase  52.53 
 
 
161 aa  182  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000745159  hitchhiker  0.0000749041 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3925  Glutathione peroxidase  51.27 
 
 
165 aa  183  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1874  glutathione peroxidase  54.43 
 
 
162 aa  181  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0631469  normal  0.307231 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0020  glutathione peroxidase  55.28 
 
 
168 aa  182  2.0000000000000003e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2773  glutathione peroxidase  52.53 
 
 
161 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000478947  hitchhiker  0.00587193 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1334  Peroxiredoxin  54.78 
 
 
169 aa  181  3e-45  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0131674  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1771  glutathione peroxidase  52.23 
 
 
161 aa  181  3e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2674  putative glutathione peroxidase protein  53.46 
 
 
165 aa  181  4.0000000000000006e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.552039 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1449  glutathione peroxidase  53.8 
 
 
162 aa  181  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00937829  normal  0.354884 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1300  glutathione peroxidase  53.8 
 
 
161 aa  181  4.0000000000000006e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.448702  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0118  glutathione peroxidase  55.35 
 
 
160 aa  181  5.0000000000000004e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0123  glutathione peroxidase  55.35 
 
 
161 aa  181  5.0000000000000004e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2454  Peroxiredoxin  55.06 
 
 
160 aa  180  6e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0184161  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1812  Peroxiredoxin  54.72 
 
 
162 aa  180  6e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00250469  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3198  Glutathione peroxidase protein  53.85 
 
 
159 aa  180  6e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.246451  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1318  Peroxiredoxin  54.66 
 
 
167 aa  179  1e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1483  glutathione peroxidase  53.5 
 
 
162 aa  179  1e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1769  glutathione peroxidase  53.5 
 
 
162 aa  179  2e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0182367  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2699  glutathione peroxidase  54.09 
 
 
160 aa  178  2.9999999999999997e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1368  glutathione peroxidase  54.61 
 
 
165 aa  177  4.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1407  glutathione peroxidase  54.61 
 
 
165 aa  177  5.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0308338  normal  0.103968 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2975  Glutathione peroxidase  54.61 
 
 
161 aa  177  5.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.36322  normal  0.036622 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4682  glutathione peroxidase  52.5 
 
 
160 aa  176  8e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2558  Peroxiredoxin  54.11 
 
 
162 aa  176  9e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.177554  normal  0.095865 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5332  glutathione peroxidase  54.97 
 
 
163 aa  176  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0814545  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2934  glutathione peroxidase  52.5 
 
 
164 aa  176  1e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0465616  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>