More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0270 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0270  glutathione peroxidase  100 
 
 		 158 aa  325  2.0000000000000001e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1863  glutathione peroxidase  52.9 
 
 		 195 aa  189  1e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2453  glutathione peroxidase  53.8 
 
 		 158 aa  187  5.999999999999999e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.70182 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0297  glutathione peroxidase  53.21 
 
 		 161 aa  179  1e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0981226  normal  0.609333 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2249  glutathione peroxidase  51.3 
 
 		 162 aa  178  2e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.487328  normal  0.155268 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3880  putative glutathione peroxidase  50.32 
 
 		 191 aa  171  3.9999999999999995e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.41902 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2597  Peroxiredoxin  50.93 
 
 		 158 aa  162  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1570  Glutathione peroxidase  49.07 
 
 		 158 aa  162  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1782  glutathione peroxidase  49.37 
 
 		 193 aa  159  1e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1812  Peroxiredoxin  48.75 
 
 		 162 aa  159  1e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00250469  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1965  glutathione peroxidase  46.3 
 
 		 160 aa  159  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0718131  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0488  glutathione peroxidase  48.97 
 
 		 185 aa  158  2e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.642227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2131  glutathione peroxidase  46.3 
 
 		 160 aa  158  3e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2202  glutathione peroxidase  46.3 
 
 		 161 aa  157  4e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0177431  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1926  glutathione peroxidase  46.3 
 
 		 160 aa  157  4e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1971  glutathione peroxidase  46.3 
 
 		 160 aa  157  6e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.775227  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3184  glutathione peroxidase  46.3 
 
 		 160 aa  157  6e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2119  glutathione peroxidase  46.3 
 
 		 160 aa  157  6e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2271  glutathione peroxidase  46.3 
 
 		 160 aa  157  6e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2154  glutathione peroxidase  46.3 
 
 		 160 aa  155  2e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1950  glutathione peroxidase  46.3 
 
 		 160 aa  155  2e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.210596  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3685  glutathione peroxidase  48.75 
 
 		 163 aa  155  2e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0360  glutathione peroxidase  49.01 
 
 		 184 aa  154  6e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.495486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0316  glutathione peroxidase  49.01 
 
 		 184 aa  154  6e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.282271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5475  glutathione peroxidase  48.73 
 
 		 189 aa  153  8e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.416682  normal  0.0282506 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0392  glutathione peroxidase  48.34 
 
 		 188 aa  153  9e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0773128  normal  0.361866 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0889  glutathione peroxidase  49.07 
 
 		 168 aa  151  2.9999999999999998e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.50899 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0238  Peroxiredoxin  41.4 
 
 		 170 aa  151  4e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1897  glutathione peroxidase  46.2 
 
 		 158 aa  151  4e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4682  glutathione peroxidase  45 
 
 		 160 aa  150  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0307  putative glutathione peroxidase transmembrane protein  45.57 
 
 		 233 aa  149  1e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1781  glutathione peroxidase family protein  49.34 
 
 		 161 aa  149  1e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0484  glutathione peroxidase  47.17 
 
 		 161 aa  149  1e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0190  glutathione peroxidase  46.88 
 
 		 161 aa  149  1e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.926255  normal  0.776204 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01222  ABC transporter vitamin B12 uptake permease  44.87 
 
 		 185 aa  149  1e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.039958  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0128  glutathione peroxidase  47.85 
 
 		 161 aa  149  2e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.594559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3641  peroxiredoxin  44.38 
 
 		 161 aa  148  2e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27520  putative glutathione peroxidase  50 
 
 		 161 aa  149  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.78279  normal  0.0357307 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53420  glutathione peroxidase  45 
 
 		 160 aa  149  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.31883  normal  0.0505345 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0169  glutathione peroxidase  43.67 
 
 		 231 aa  148  3e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0237  putative glutathione peroxidase transmembrane protein  46.43 
 
 		 205 aa  148  4e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3981  glutathione peroxidase  48.68 
 
 		 161 aa  147  4e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.890862  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1080  glutathione peroxidase  48.1 
 
 		 164 aa  147  5e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000852506  normal  0.679739 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0162  glutathione peroxidase  43.67 
 
 		 231 aa  147  6e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.520461 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2660  Glutathione peroxidase  47.17 
 
 		 159 aa  147  8e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0609505 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2389  putative glutathione peroxidase  48.34 
 
 		 176 aa  146  9e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.401751  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3929  glutathione peroxidase  46.79 
 
 		 188 aa  146  9e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.592022 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3613  glutathione peroxidase  50 
 
 		 161 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.374005  normal  0.319321 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2329  putative glutathione peroxidase  50 
 
 		 161 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.509466  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2910  Glutathione peroxidase  45.96 
 
 		 165 aa  146  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1909  peroxiredoxin  44.94 
 
 		 161 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.154084  normal  0.204796 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6295  glutathione peroxidase  48.1 
 
 		 162 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0042  glutathione peroxidase  44.3 
 
 		 212 aa  145  3e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.490429  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2798  glutathione peroxidase  47.2 
 
 		 164 aa  144  3e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1053  glutathione peroxidase  47.02 
 
 		 176 aa  144  3e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.281088  normal  0.469721 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0018  glutathione peroxidase  44.59 
 
 		 208 aa  145  3e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02660  glutathione peroxidase  43.51 
 
 		 158 aa  144  5e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1010  glutathione peroxidase  43.12 
 
 		 162 aa  144  6e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2618  glutathione peroxidase  50 
 
 		 195 aa  144  6e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.137836  normal  0.142472 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0226  Peroxiredoxin  47.24 
 
 		 163 aa  143  8.000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1015  Glutathione peroxidase  44.38 
 
 		 162 aa  143  9e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0150707 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0841  glutathione peroxidase  47.97 
 
 		 164 aa  142  1e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0436995  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4117  Peroxiredoxin  44.23 
 
 		 182 aa  143  1e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0173  glutathione peroxidase  46.58 
 
 		 161 aa  143  1e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.790659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2756  glutathione peroxidase  44.1 
 
 		 158 aa  142  1e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.447473  hitchhiker  0.0000941143 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2504  Glutathione peroxidase  45.34 
 
 		 165 aa  143  1e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.718008 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0191  Glutathione peroxidase  46.58 
 
 		 161 aa  142  2e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3374  glutathione peroxidase  50.35 
 
 		 195 aa  142  2e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.479812  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0883  glutathione peroxidase  40.62 
 
 		 160 aa  142  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.961514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2472  Glutathione peroxidase  45.62 
 
 		 159 aa  142  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.161656  decreased coverage  0.0000149935 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4413  glutathione peroxidase  41.88 
 
 		 160 aa  142  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.312074  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2674  putative glutathione peroxidase protein  45.28 
 
 		 165 aa  141  3e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.552039 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2011  glutathione peroxidase  44.94 
 
 		 159 aa  142  3e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0261647  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3470  glutathione peroxidase  46.2 
 
 		 158 aa  141  3e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0876  Peroxiredoxin  42.95 
 
 		 177 aa  142  3e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3277  Peroxiredoxin  46.54 
 
 		 164 aa  141  3e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0777  glutathione peroxidase, putative  41.88 
 
 		 160 aa  141  4e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4148  Glutathione peroxidase  45.57 
 
 		 158 aa  141  4e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.784559  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5165  Peroxiredoxin  47.52 
 
 		 202 aa  140  5e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.648504  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0816  glutathione peroxidase  41.88 
 
 		 160 aa  141  5e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3298  glutathione peroxidase  45.58 
 
 		 161 aa  140  5e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.40101  decreased coverage  0.0000000224321 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1665  glutathione peroxidase  45.62 
 
 		 159 aa  140  5e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0389024 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4024  glutathione peroxidase  50.35 
 
 		 213 aa  140  6e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1214  glutathione peroxidase  46.36 
 
 		 167 aa  140  6e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02846  phospholipid hydroperoxide glutathione peroxidase (Eurofung)  42.86 
 
 		 282 aa  140  7e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.440988 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00658  glutathione peroxidase  43.59 
 
 		 161 aa  140  7e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0965068  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3925  Glutathione peroxidase  42.5 
 
 		 165 aa  140  7e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1346  glutathione peroxidase  44.3 
 
 		 159 aa  140  7e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.909183  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1571  glutathione peroxidase  44.3 
 
 		 159 aa  140  7e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.154895  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2599  glutathione peroxidase  44.3 
 
 		 159 aa  140  7e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.391635  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2074  glutathione peroxidase  44.3 
 
 		 159 aa  140  7e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.895406  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2454  glutathione peroxidase  44.3 
 
 		 159 aa  140  7e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0273  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1354  glutathione peroxidase  45.62 
 
 		 162 aa  140  7e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.525114 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3238  glutathione peroxidase  44.3 
 
 		 159 aa  140  7e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.400465  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2510  glutathione peroxidase  44.3 
 
 		 159 aa  140  7e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1246  glutathione peroxidase  43.4 
 
 		 192 aa  140  7e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.281187  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30390  glutathione peroxidase  44.58 
 
 		 173 aa  140  8e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0461  glutathione peroxidase  47.92 
 
 		 191 aa  139  9.999999999999999e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3973  Peroxiredoxin  41.88 
 
 		 165 aa  139  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000360978 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0123  glutathione peroxidase  45.52 
 
 		 161 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>