More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_0392 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_0392  glutathione peroxidase  100 
 
 
188 aa  380  1e-105  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0773128  normal  0.361866 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0360  glutathione peroxidase  90.96 
 
 
184 aa  330  1e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.495486  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0316  glutathione peroxidase  90.96 
 
 
184 aa  330  1e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.282271  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3929  glutathione peroxidase  68.09 
 
 
188 aa  252  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.592022 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1782  glutathione peroxidase  66.49 
 
 
193 aa  241  5e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5475  glutathione peroxidase  68.83 
 
 
189 aa  227  9e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.416682  normal  0.0282506 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3880  putative glutathione peroxidase  49.21 
 
 
191 aa  179  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.41902 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1863  glutathione peroxidase  48.21 
 
 
195 aa  153  1e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0270  glutathione peroxidase  48.34 
 
 
158 aa  153  1e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0297  glutathione peroxidase  49.01 
 
 
161 aa  150  1e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0981226  normal  0.609333 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2453  glutathione peroxidase  48.03 
 
 
158 aa  149  3e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.70182 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0307  putative glutathione peroxidase transmembrane protein  49.65 
 
 
233 aa  142  4e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0488  glutathione peroxidase  47.14 
 
 
185 aa  140  8e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.642227  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1571  glutathione peroxidase  46.72 
 
 
159 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.154895  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3238  glutathione peroxidase  46.72 
 
 
159 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.400465  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2599  glutathione peroxidase  46.72 
 
 
159 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.391635  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2074  glutathione peroxidase  46.72 
 
 
159 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.895406  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2011  glutathione peroxidase  46.72 
 
 
159 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0261647  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2510  glutathione peroxidase  46.72 
 
 
159 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2454  glutathione peroxidase  46.72 
 
 
159 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0273  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1346  glutathione peroxidase  46.72 
 
 
159 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.909183  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2389  putative glutathione peroxidase  46.47 
 
 
176 aa  138  6e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.401751  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01222  ABC transporter vitamin B12 uptake permease  46.98 
 
 
185 aa  137  7e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.039958  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2249  glutathione peroxidase  44.59 
 
 
162 aa  137  1e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.487328  normal  0.155268 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0169  glutathione peroxidase  47.52 
 
 
231 aa  135  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1053  glutathione peroxidase  47.68 
 
 
176 aa  134  8e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.281088  normal  0.469721 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0162  glutathione peroxidase  47.52 
 
 
231 aa  134  8e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.520461 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0237  putative glutathione peroxidase transmembrane protein  48.15 
 
 
205 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2674  putative glutathione peroxidase protein  42.07 
 
 
165 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.552039 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4103  putative glutathione peroxidase  49.24 
 
 
184 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47550  putative glutathione peroxidase  49.24 
 
 
184 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.532704 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1242  glutathione peroxidase  42.76 
 
 
159 aa  132  3e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3685  glutathione peroxidase  45.58 
 
 
163 aa  132  3e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2472  Glutathione peroxidase  43.75 
 
 
159 aa  132  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.161656  decreased coverage  0.0000149935 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2910  Glutathione peroxidase  42.76 
 
 
165 aa  130  7.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00658  glutathione peroxidase  42.66 
 
 
161 aa  130  9e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0965068  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1207  glutathione peroxidase  41.56 
 
 
158 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.205921 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2055  putative glutathione peroxidase  44.57 
 
 
177 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.265735 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1665  glutathione peroxidase  42.36 
 
 
159 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0389024 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2504  Glutathione peroxidase  42.76 
 
 
165 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.718008 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1883  glutathione peroxidase  46.05 
 
 
152 aa  129  3e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.255404  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3641  peroxiredoxin  45.27 
 
 
161 aa  128  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0018  glutathione peroxidase  44.29 
 
 
208 aa  128  5.0000000000000004e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0191  Glutathione peroxidase  45.21 
 
 
161 aa  128  6e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0250  glutathione peroxidase  42.5 
 
 
164 aa  127  7.000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0190  glutathione peroxidase  41.38 
 
 
161 aa  127  7.000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.926255  normal  0.776204 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0173  glutathione peroxidase  45.21 
 
 
161 aa  127  8.000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.790659  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2067  glutathione peroxidase  42.07 
 
 
159 aa  127  8.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0889  glutathione peroxidase  43.62 
 
 
168 aa  127  9.000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.50899 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1214  glutathione peroxidase  40.4 
 
 
167 aa  127  9.000000000000001e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1936  glutathione peroxidase  42.07 
 
 
159 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.634874 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0876  Peroxiredoxin  33.33 
 
 
177 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2054  glutathione peroxidase  40.69 
 
 
159 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6042  glutathione peroxidase  40.69 
 
 
159 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3277  Peroxiredoxin  47.79 
 
 
164 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2035  glutathione peroxidase  40.69 
 
 
159 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0042  glutathione peroxidase  43.7 
 
 
212 aa  126  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.490429  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3981  glutathione peroxidase  42.28 
 
 
161 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.890862  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3374  glutathione peroxidase  43.17 
 
 
195 aa  126  2.0000000000000002e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.479812  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0559  glutathione peroxidase  42.66 
 
 
161 aa  126  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5344  glutathione peroxidase  41.38 
 
 
159 aa  125  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.213102 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1965  glutathione peroxidase  38.06 
 
 
160 aa  125  3e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0718131  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3665  glutathione peroxidase  43.36 
 
 
158 aa  125  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0697  Glutathione peroxidase  41.89 
 
 
170 aa  125  3e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2526  glutathione peroxidase  42.14 
 
 
180 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.327392  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1570  Glutathione peroxidase  41.67 
 
 
158 aa  125  4.0000000000000003e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3053  peroxiredoxin  47.06 
 
 
164 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.508134 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2131  glutathione peroxidase  38.06 
 
 
160 aa  125  5e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3184  glutathione peroxidase  38.06 
 
 
160 aa  125  5e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2597  Peroxiredoxin  41.78 
 
 
158 aa  124  6e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0461  glutathione peroxidase  47.33 
 
 
191 aa  124  6e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1812  Peroxiredoxin  43.75 
 
 
162 aa  124  7e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00250469  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1246  glutathione peroxidase  43.17 
 
 
192 aa  124  8.000000000000001e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.281187  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1781  glutathione peroxidase family protein  43.57 
 
 
161 aa  124  9e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4024  glutathione peroxidase  43.17 
 
 
213 aa  124  9e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2618  glutathione peroxidase  46.09 
 
 
195 aa  124  1e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.137836  normal  0.142472 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0265  Peroxiredoxin  40.41 
 
 
165 aa  124  1e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000231119  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1801  glutathione peroxidase  44.2 
 
 
199 aa  124  1e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.740072  hitchhiker  0.00000253639 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2202  glutathione peroxidase  38.78 
 
 
161 aa  122  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0177431  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1971  glutathione peroxidase  37.42 
 
 
160 aa  123  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.775227  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1010  glutathione peroxidase  41.06 
 
 
162 aa  123  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3670  glutathione peroxidase  45.45 
 
 
184 aa  122  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.174884  normal  0.0808268 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2119  glutathione peroxidase  37.42 
 
 
160 aa  123  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2271  glutathione peroxidase  37.42 
 
 
160 aa  123  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1909  peroxiredoxin  41.1 
 
 
161 aa  122  3e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.154084  normal  0.204796 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1354  glutathione peroxidase  40.4 
 
 
162 aa  122  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.525114 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41100  Glutathione peroxidase  43.92 
 
 
160 aa  122  3e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.341833  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4682  glutathione peroxidase  43.24 
 
 
160 aa  122  3e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53420  glutathione peroxidase  43.92 
 
 
160 aa  122  3e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.31883  normal  0.0505345 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1762  glutathione peroxidase  42.86 
 
 
183 aa  122  4e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.533866  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30390  glutathione peroxidase  41.06 
 
 
173 aa  121  5e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2699  glutathione peroxidase  41.61 
 
 
160 aa  121  5e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1719  glutathione peroxidase family protein  44.7 
 
 
183 aa  121  7e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00731943  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1950  glutathione peroxidase  36.77 
 
 
160 aa  121  7e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.210596  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1926  glutathione peroxidase  37.42 
 
 
160 aa  121  7e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2154  glutathione peroxidase  36.77 
 
 
160 aa  121  7e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1080  glutathione peroxidase  39.35 
 
 
164 aa  121  7e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000852506  normal  0.679739 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2756  glutathione peroxidase  40.14 
 
 
158 aa  120  8e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.447473  hitchhiker  0.0000941143 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2934  glutathione peroxidase  39.35 
 
 
164 aa  120  9e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0465616  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4667  glutathione peroxidase  43.88 
 
 
199 aa  120  9.999999999999999e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>