More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1207 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1207  glutathione peroxidase  100 
 
 		 158 aa  327  5.0000000000000004e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.205921 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5344  glutathione peroxidase  47.17 
 
 		 159 aa  157  7e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.213102 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1971  glutathione peroxidase  47.17 
 
 		 160 aa  155  2e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.775227  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1926  glutathione peroxidase  47.17 
 
 		 160 aa  155  2e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2119  glutathione peroxidase  47.17 
 
 		 160 aa  155  2e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2054  glutathione peroxidase  46.54 
 
 		 159 aa  155  3e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1665  glutathione peroxidase  47.17 
 
 		 159 aa  154  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0389024 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6042  glutathione peroxidase  46.54 
 
 		 159 aa  155  3e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2035  glutathione peroxidase  46.54 
 
 		 159 aa  155  3e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1570  Glutathione peroxidase  50.31 
 
 		 158 aa  154  3e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1965  glutathione peroxidase  45.91 
 
 		 160 aa  154  4e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0718131  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2271  glutathione peroxidase  47.17 
 
 		 160 aa  154  4e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2202  glutathione peroxidase  46.54 
 
 		 161 aa  154  6e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0177431  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2131  glutathione peroxidase  45.91 
 
 		 160 aa  154  7e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3184  glutathione peroxidase  45.91 
 
 		 160 aa  153  9e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1936  glutathione peroxidase  45.91 
 
 		 159 aa  152  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.634874 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2067  glutathione peroxidase  45.91 
 
 		 159 aa  152  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1950  glutathione peroxidase  46.54 
 
 		 160 aa  152  2e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.210596  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2154  glutathione peroxidase  46.54 
 
 		 160 aa  152  2e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3925  Glutathione peroxidase  48.75 
 
 		 165 aa  152  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3665  glutathione peroxidase  48.1 
 
 		 158 aa  151  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2597  Peroxiredoxin  48.43 
 
 		 158 aa  150  5e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2472  Glutathione peroxidase  45.91 
 
 		 159 aa  150  5.9999999999999996e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.161656  decreased coverage  0.0000149935 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3447  glutathione peroxidase  47.83 
 
 		 161 aa  150  7e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0243575 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3973  Peroxiredoxin  48.12 
 
 		 165 aa  150  8e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000360978 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1872  glutathione peroxidase  46.84 
 
 		 159 aa  150  8e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0683727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1354  glutathione peroxidase  46.06 
 
 		 162 aa  149  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.525114 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1771  glutathione peroxidase  46.58 
 
 		 161 aa  149  1e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1571  glutathione peroxidase  46.2 
 
 		 159 aa  149  2e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.154895  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3298  glutathione peroxidase  47.2 
 
 		 161 aa  149  2e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.40101  decreased coverage  0.0000000224321 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2599  glutathione peroxidase  46.2 
 
 		 159 aa  149  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.391635  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2510  glutathione peroxidase  46.2 
 
 		 159 aa  149  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1346  glutathione peroxidase  46.2 
 
 		 159 aa  149  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.909183  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2011  glutathione peroxidase  45.57 
 
 		 159 aa  149  2e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0261647  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3238  glutathione peroxidase  46.2 
 
 		 159 aa  149  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.400465  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2074  glutathione peroxidase  46.2 
 
 		 159 aa  149  2e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.895406  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2454  glutathione peroxidase  46.2 
 
 		 159 aa  149  2e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0273  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2741  glutathione peroxidase  47.8 
 
 		 162 aa  147  4e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000260986  hitchhiker  0.0000615291 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1242  glutathione peroxidase  44.03 
 
 		 159 aa  146  9e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4148  Glutathione peroxidase  47.47 
 
 		 158 aa  144  6e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.784559  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1579  glutathione peroxidase  44.1 
 
 		 164 aa  142  1e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0189646  normal  0.0451688 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3685  glutathione peroxidase  44 
 
 		 163 aa  140  5e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2552  glutathione peroxidase  47.17 
 
 		 161 aa  140  7e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.40006  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1970  glutathione peroxidase  46.05 
 
 		 193 aa  140  7e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3613  glutathione peroxidase  44.72 
 
 		 161 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.374005  normal  0.319321 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1769  glutathione peroxidase  44.38 
 
 		 162 aa  139  9.999999999999999e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0182367  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1318  Peroxiredoxin  47.17 
 
 		 167 aa  139  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0872  glutathione peroxidase  44.03 
 
 		 158 aa  139  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1080  glutathione peroxidase  45.28 
 
 		 164 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000852506  normal  0.679739 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1300  glutathione peroxidase  46.45 
 
 		 161 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.448702  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2249  glutathione peroxidase  41.77 
 
 		 162 aa  138  3e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.487328  normal  0.155268 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2756  glutathione peroxidase  44.03 
 
 		 158 aa  138  3e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.447473  hitchhiker  0.0000941143 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0173  glutathione peroxidase  44.52 
 
 		 161 aa  138  3.9999999999999997e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.790659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0128  glutathione peroxidase  43.62 
 
 		 161 aa  137  3.9999999999999997e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.594559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1897  glutathione peroxidase  44.94 
 
 		 158 aa  137  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1090  glutathione peroxidase  43.92 
 
 		 160 aa  137  7e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.37333 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0484  glutathione peroxidase  44.3 
 
 		 161 aa  137  7e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6295  glutathione peroxidase  43.9 
 
 		 162 aa  137  7e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1597  glutathione peroxidase  46.54 
 
 		 159 aa  137  8.999999999999999e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00235323  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0191  Glutathione peroxidase  44.52 
 
 		 161 aa  136  8.999999999999999e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0904  glutathione peroxidase  45.86 
 
 		 158 aa  136  8.999999999999999e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000826936  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2964  glutathione peroxidase  43.48 
 
 		 160 aa  136  1e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3470  glutathione peroxidase  46.2 
 
 		 158 aa  136  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2934  glutathione peroxidase  42.77 
 
 		 164 aa  136  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0465616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0867  glutathione peroxidase  45.86 
 
 		 159 aa  136  1e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000118287  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2504  Glutathione peroxidase  43.4 
 
 		 165 aa  136  1e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.718008 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2910  Glutathione peroxidase  44.24 
 
 		 165 aa  136  1e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2674  putative glutathione peroxidase protein  46.05 
 
 		 165 aa  135  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.552039 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2006  glutathione peroxidase family protein  45.91 
 
 		 160 aa  135  2e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1781  glutathione peroxidase family protein  42.24 
 
 		 161 aa  135  2e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0226  Peroxiredoxin  41.61 
 
 		 163 aa  135  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2798  glutathione peroxidase  42.14 
 
 		 164 aa  135  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2705  glutathione peroxidase  43.48 
 
 		 161 aa  135  2e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000249576  hitchhiker  0.0000800256 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2875  glutathione peroxidase  42.86 
 
 		 161 aa  135  2e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000745159  hitchhiker  0.0000749041 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0694  glutathione peroxidase  41.14 
 
 		 161 aa  135  3.0000000000000003e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000130339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2773  glutathione peroxidase  42.86 
 
 		 161 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000478947  hitchhiker  0.00587193 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3106  glutathione peroxidase  44.03 
 
 		 167 aa  134  4e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.422985  normal  0.284005 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0265  Peroxiredoxin  44.03 
 
 		 165 aa  134  4e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000231119  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1563  glutathione peroxidase, putative  42.86 
 
 		 162 aa  134  5e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1909  peroxiredoxin  43.59 
 
 		 161 aa  133  8e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.154084  normal  0.204796 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0190  glutathione peroxidase  41.51 
 
 		 161 aa  133  8e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.926255  normal  0.776204 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02770  glutathione peroxidase  39.24 
 
 		 160 aa  133  8e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.359164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1178  glutathione peroxidase  42.41 
 
 		 158 aa  133  9e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.375161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0889  glutathione peroxidase  42.5 
 
 		 168 aa  133  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.50899 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5475  glutathione peroxidase  41.25 
 
 		 189 aa  132  9.999999999999999e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.416682  normal  0.0282506 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0040  Peroxiredoxin  41.03 
 
 		 206 aa  132  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0496109 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2639  glutathione peroxidase  43.67 
 
 		 158 aa  132  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.833403 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3981  glutathione peroxidase  42.86 
 
 		 161 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.890862  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3267  glutathione peroxidase  44.3 
 
 		 158 aa  132  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5382  Peroxiredoxin  40.52 
 
 		 179 aa  132  1.9999999999999998e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.0000126467  normal  0.555193 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0250  glutathione peroxidase  40.88 
 
 		 164 aa  131  3e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0020  glutathione peroxidase  41.77 
 
 		 168 aa  131  3.9999999999999996e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3198  Glutathione peroxidase protein  40.51 
 
 		 159 aa  131  3.9999999999999996e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.246451  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1812  Peroxiredoxin  40.25 
 
 		 162 aa  130  5e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00250469  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27520  putative glutathione peroxidase  42.5 
 
 		 161 aa  131  5e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.78279  normal  0.0357307 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0297  glutathione peroxidase  37.82 
 
 		 161 aa  130  6e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0981226  normal  0.609333 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0392  glutathione peroxidase  41.56 
 
 		 188 aa  130  6.999999999999999e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0773128  normal  0.361866 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02660  glutathione peroxidase  39.49 
 
 		 158 aa  130  6.999999999999999e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1384  glutathione peroxidase  42.07 
 
 		 165 aa  130  6.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0118  glutathione peroxidase  43.4 
 
 		 160 aa  130  7.999999999999999e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>