More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0297 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_0297  glutathione peroxidase  100 
 
 		 161 aa  334  2.9999999999999997e-91  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0981226  normal  0.609333 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2249  glutathione peroxidase  55.13 
 
 		 162 aa  196  7.999999999999999e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.487328  normal  0.155268 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0270  glutathione peroxidase  53.21 
 
 		 158 aa  179  1e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1863  glutathione peroxidase  49.02 
 
 		 195 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2453  glutathione peroxidase  49.36 
 
 		 158 aa  171  3.9999999999999995e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.70182 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3880  putative glutathione peroxidase  50.94 
 
 		 191 aa  169  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.41902 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3685  glutathione peroxidase  53.02 
 
 		 163 aa  161  3e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0265  Peroxiredoxin  47.5 
 
 		 165 aa  158  3e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000231119  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0694  glutathione peroxidase  46.88 
 
 		 161 aa  157  4e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000130339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47550  putative glutathione peroxidase  52.59 
 
 		 184 aa  156  1e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.532704 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4103  putative glutathione peroxidase  52.59 
 
 		 184 aa  156  1e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4117  Peroxiredoxin  46.25 
 
 		 182 aa  156  1e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2472  Glutathione peroxidase  48.67 
 
 		 159 aa  155  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.161656  decreased coverage  0.0000149935 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0042  glutathione peroxidase  48.7 
 
 		 212 aa  154  4e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.490429  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0876  Peroxiredoxin  46.15 
 
 		 177 aa  154  5.0000000000000005e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0128  glutathione peroxidase  48.67 
 
 		 161 aa  153  1e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.594559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02770  glutathione peroxidase  48.12 
 
 		 160 aa  152  2e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.359164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0173  glutathione peroxidase  47.2 
 
 		 161 aa  152  2e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.790659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0191  Glutathione peroxidase  47.2 
 
 		 161 aa  152  2e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0226  Peroxiredoxin  46.98 
 
 		 163 aa  151  2.9999999999999998e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0040  Peroxiredoxin  45.1 
 
 		 206 aa  151  4e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0496109 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0018  glutathione peroxidase  47.4 
 
 		 208 aa  151  5e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0392  glutathione peroxidase  49.01 
 
 		 188 aa  150  7e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0773128  normal  0.361866 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1926  glutathione peroxidase  45.28 
 
 		 160 aa  150  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2756  glutathione peroxidase  45.75 
 
 		 158 aa  150  1e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.447473  hitchhiker  0.0000941143 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1390  glutathione peroxidase  46.25 
 
 		 158 aa  149  1e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0360  glutathione peroxidase  48.37 
 
 		 184 aa  150  1e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.495486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0316  glutathione peroxidase  48.37 
 
 		 184 aa  150  1e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.282271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1364  glutathione peroxidase  46.25 
 
 		 158 aa  149  1e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00178793  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3641  peroxiredoxin  43.4 
 
 		 161 aa  149  2e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2011  glutathione peroxidase  45.7 
 
 		 159 aa  148  2e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0261647  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1965  glutathione peroxidase  44.65 
 
 		 160 aa  148  2e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0718131  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0238  Peroxiredoxin  43.95 
 
 		 170 aa  148  3e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1970  glutathione peroxidase  47.26 
 
 		 193 aa  148  3e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2131  glutathione peroxidase  44.65 
 
 		 160 aa  148  3e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02660  glutathione peroxidase  44.94 
 
 		 158 aa  148  4e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0250  glutathione peroxidase  46.88 
 
 		 164 aa  147  4e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2202  glutathione peroxidase  44.65 
 
 		 161 aa  147  5e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0177431  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2944  glutathione peroxidase  47.45 
 
 		 195 aa  147  5e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0986023  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4682  glutathione peroxidase  43.4 
 
 		 160 aa  147  5e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1971  glutathione peroxidase  44.65 
 
 		 160 aa  147  6e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.775227  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2271  glutathione peroxidase  44.65 
 
 		 160 aa  147  6e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2119  glutathione peroxidase  44.65 
 
 		 160 aa  147  6e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1579  glutathione peroxidase  45.22 
 
 		 164 aa  147  6e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0189646  normal  0.0451688 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2067  glutathione peroxidase  47.02 
 
 		 159 aa  147  6e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1571  glutathione peroxidase  45.03 
 
 		 159 aa  147  7e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.154895  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3238  glutathione peroxidase  45.03 
 
 		 159 aa  147  7e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.400465  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2599  glutathione peroxidase  45.03 
 
 		 159 aa  147  7e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.391635  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2510  glutathione peroxidase  45.03 
 
 		 159 aa  147  7e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1812  Peroxiredoxin  45.28 
 
 		 162 aa  147  7e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00250469  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2454  glutathione peroxidase  45.03 
 
 		 159 aa  147  7e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0273  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1346  glutathione peroxidase  45.03 
 
 		 159 aa  147  7e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.909183  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2074  glutathione peroxidase  45.03 
 
 		 159 aa  147  7e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.895406  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1950  glutathione peroxidase  44.65 
 
 		 160 aa  147  8e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.210596  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1936  glutathione peroxidase  47.02 
 
 		 159 aa  147  8e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.634874 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2154  glutathione peroxidase  44.65 
 
 		 160 aa  147  8e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6042  glutathione peroxidase  46.36 
 
 		 159 aa  146  9e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2054  glutathione peroxidase  46.36 
 
 		 159 aa  146  9e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2035  glutathione peroxidase  46.36 
 
 		 159 aa  146  9e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0851  glutathione peroxidase  47.1 
 
 		 161 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.425919  decreased coverage  0.00020946 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2798  glutathione peroxidase  45.4 
 
 		 164 aa  146  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1762  glutathione peroxidase  46.71 
 
 		 183 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.533866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3665  glutathione peroxidase  46.31 
 
 		 158 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1284  glutathione peroxidase  49.02 
 
 		 183 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.604655  normal  0.560913 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3184  glutathione peroxidase  44.03 
 
 		 160 aa  146  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1686  glutathione peroxidase  49.02 
 
 		 202 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.677668  normal  0.86735 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2699  glutathione peroxidase  46.25 
 
 		 160 aa  145  2.0000000000000003e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5165  Peroxiredoxin  49.34 
 
 		 202 aa  145  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.648504  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2660  Glutathione peroxidase  44.52 
 
 		 159 aa  145  2.0000000000000003e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0609505 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1665  glutathione peroxidase  46.36 
 
 		 159 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0389024 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4033  glutathione peroxidase  49.02 
 
 		 183 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.475849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53420  glutathione peroxidase  43.4 
 
 		 160 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.31883  normal  0.0505345 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5344  glutathione peroxidase  45.7 
 
 		 159 aa  145  3e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.213102 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00658  glutathione peroxidase  44.1 
 
 		 161 aa  144  4.0000000000000006e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0965068  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2931  glutathione peroxidase  46.25 
 
 		 159 aa  144  6e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.953337 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4148  Glutathione peroxidase  46.98 
 
 		 158 aa  144  6e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.784559  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5475  glutathione peroxidase  45.22 
 
 		 189 aa  143  8.000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.416682  normal  0.0282506 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1244  glutathione peroxidase  47.06 
 
 		 176 aa  143  8.000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.247052  normal  0.300123 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5025  peroxiredoxin  51.35 
 
 		 171 aa  143  8.000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0652457 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0559  glutathione peroxidase  41.88 
 
 		 161 aa  143  8.000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0841  glutathione peroxidase  45.89 
 
 		 164 aa  143  1e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0436995  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0883  glutathione peroxidase  40.25 
 
 		 160 aa  143  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.961514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01222  ABC transporter vitamin B12 uptake permease  48.89 
 
 		 185 aa  143  1e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.039958  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2454  Peroxiredoxin  45 
 
 		 160 aa  142  2e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0184161  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1570  Glutathione peroxidase  45.21 
 
 		 158 aa  142  2e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1075  glutathione peroxidase  46.58 
 
 		 168 aa  142  2e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.364498  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0020  glutathione peroxidase  45.16 
 
 		 168 aa  142  2e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0956  glutathione peroxidase  45.96 
 
 		 168 aa  141  3e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1178  glutathione peroxidase  45.33 
 
 		 158 aa  141  3e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.375161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1782  glutathione peroxidase  45.57 
 
 		 193 aa  141  3e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2504  Glutathione peroxidase  44.67 
 
 		 165 aa  141  4e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.718008 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1242  glutathione peroxidase  45.7 
 
 		 159 aa  141  4e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0484  glutathione peroxidase  43.33 
 
 		 161 aa  141  4e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1080  glutathione peroxidase  44.67 
 
 		 164 aa  140  5e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000852506  normal  0.679739 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0777  glutathione peroxidase, putative  38.99 
 
 		 160 aa  140  6e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0123  glutathione peroxidase  44.1 
 
 		 161 aa  140  7e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1499  glutathione peroxidase  43.97 
 
 		 157 aa  140  8e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.278578  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0889  glutathione peroxidase  44.03 
 
 		 168 aa  140  9.999999999999999e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.50899 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3613  glutathione peroxidase  47.86 
 
 		 161 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.374005  normal  0.319321 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0816  glutathione peroxidase  38.99 
 
 		 160 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>