More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1762 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_1762  glutathione peroxidase  100 
 
 		 183 aa  373  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.533866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3670  glutathione peroxidase  73.91 
 
 		 184 aa  276  9e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.174884  normal  0.0808268 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1719  glutathione peroxidase family protein  73.91 
 
 		 183 aa  276  1e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00731943  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4103  putative glutathione peroxidase  77.58 
 
 		 184 aa  258  4e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47550  putative glutathione peroxidase  77.58 
 
 		 184 aa  258  4e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.532704 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1244  glutathione peroxidase  70.29 
 
 		 176 aa  253  9e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.247052  normal  0.300123 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1654  glutathione peroxidase  71.68 
 
 		 186 aa  253  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.323621  hitchhiker  0.0047837 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1284  glutathione peroxidase  66.3 
 
 		 183 aa  248  4e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.604655  normal  0.560913 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1686  glutathione peroxidase  65.76 
 
 		 202 aa  247  5e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.677668  normal  0.86735 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4033  glutathione peroxidase  65.03 
 
 		 183 aa  243  8e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.475849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0359  glutathione peroxidase  54.97 
 
 		 182 aa  192  2e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3180  glutathione peroxidase  50.58 
 
 		 179 aa  181  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000271589  normal  0.0170233 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3022  glutathione peroxidase  51.79 
 
 		 230 aa  181  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00278721  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3037  glutathione peroxidase  51.79 
 
 		 230 aa  181  6e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000026286  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1341  glutathione peroxidase  50.58 
 
 		 179 aa  181  7e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0267656  hitchhiker  0.0000000425712 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0042  glutathione peroxidase  52.17 
 
 		 212 aa  178  2.9999999999999997e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.490429  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1197  glutathione peroxidase  47.75 
 
 		 203 aa  178  4e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00644229  normal  0.718028 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2515  glutathione peroxidase  56.07 
 
 		 185 aa  177  5.999999999999999e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1267  glutathione peroxidase  48.3 
 
 		 203 aa  177  9e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0133013  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3349  glutathione peroxidase, putative  49.12 
 
 		 177 aa  176  1e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1196  glutathione peroxidase  47.75 
 
 		 203 aa  176  1e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0218447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2684  glutathione peroxidase  47.78 
 
 		 179 aa  176  2e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.553323  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2853  glutathione peroxidase  50.3 
 
 		 177 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.154923  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0018  glutathione peroxidase  47.85 
 
 		 208 aa  171  6.999999999999999e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2474  glutathione peroxidase, putative  52.87 
 
 		 180 aa  168  4e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3912  glutathione peroxidase  50.3 
 
 		 189 aa  167  1e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.295477  normal  0.0278841 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4024  glutathione peroxidase  51.52 
 
 		 213 aa  166  1e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1427  GMP synthase-like  46.86 
 
 		 190 aa  166  2e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2526  glutathione peroxidase  46.59 
 
 		 180 aa  165  2.9999999999999998e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.327392  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5165  Peroxiredoxin  50.94 
 
 		 202 aa  162  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.648504  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4659  glutathione peroxidase  50.93 
 
 		 208 aa  161  4.0000000000000004e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4667  glutathione peroxidase  50.98 
 
 		 199 aa  160  9e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3374  glutathione peroxidase  50.96 
 
 		 195 aa  159  2e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.479812  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0169  glutathione peroxidase  46.95 
 
 		 231 aa  159  3e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1970  glutathione peroxidase  44.86 
 
 		 193 aa  158  3e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02196  Glutathione peroxidase  47.56 
 
 		 184 aa  157  8e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0197549  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0162  glutathione peroxidase  45.73 
 
 		 231 aa  156  2e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.520461 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0237  putative glutathione peroxidase transmembrane protein  47.54 
 
 		 205 aa  155  2e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05309  glutathione peroxidase  47.37 
 
 		 181 aa  155  3e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000573  glutathione peroxidase  46.96 
 
 		 181 aa  154  5.0000000000000005e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2679  glutathione peroxidase  45.06 
 
 		 192 aa  151  4e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.241309  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0307  putative glutathione peroxidase transmembrane protein  45.57 
 
 		 233 aa  149  2e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0297  glutathione peroxidase  46.71 
 
 		 161 aa  147  1.0000000000000001e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0981226  normal  0.609333 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0488  glutathione peroxidase  47.13 
 
 		 185 aa  146  1.0000000000000001e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.642227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2249  glutathione peroxidase  50.34 
 
 		 162 aa  145  3e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.487328  normal  0.155268 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2389  putative glutathione peroxidase  42.78 
 
 		 176 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.401751  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01222  ABC transporter vitamin B12 uptake permease  42.08 
 
 		 185 aa  137  7e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.039958  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1409  glutathione peroxidase  43.26 
 
 		 184 aa  137  1e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1053  glutathione peroxidase  49.61 
 
 		 176 aa  135  4e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.281088  normal  0.469721 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2453  glutathione peroxidase  44.52 
 
 		 158 aa  134  6.0000000000000005e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.70182 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1246  glutathione peroxidase  42.39 
 
 		 192 aa  134  9.999999999999999e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.281187  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1812  Peroxiredoxin  45.64 
 
 		 162 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00250469  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1570  Glutathione peroxidase  46.98 
 
 		 158 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0270  glutathione peroxidase  44.22 
 
 		 158 aa  132  3e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0007  glutathione peroxidase  44.93 
 
 		 157 aa  132  3e-30  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0559  glutathione peroxidase  43.87 
 
 		 161 aa  132  3e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2055  putative glutathione peroxidase  45.45 
 
 		 177 aa  131  6.999999999999999e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.265735 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1010  glutathione peroxidase  47.71 
 
 		 162 aa  130  7.999999999999999e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0226  Peroxiredoxin  44.44 
 
 		 163 aa  129  3e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0461  glutathione peroxidase  40.7 
 
 		 191 aa  129  3e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1863  glutathione peroxidase  47.92 
 
 		 195 aa  128  4.0000000000000003e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2909  Peroxiredoxin  46.31 
 
 		 198 aa  127  6e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1499  glutathione peroxidase  42.86 
 
 		 157 aa  128  6e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.278578  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1883  glutathione peroxidase  43.54 
 
 		 152 aa  127  7.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.255404  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01902  probable glutathione peroxidase  42.57 
 
 		 165 aa  126  1.0000000000000001e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.101099  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1781  glutathione peroxidase family protein  46.05 
 
 		 161 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2011  glutathione peroxidase  44.59 
 
 		 159 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0261647  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2964  glutathione peroxidase  46.32 
 
 		 160 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0694  glutathione peroxidase  41.83 
 
 		 161 aa  127  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000130339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3880  putative glutathione peroxidase  36.72 
 
 		 191 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.41902 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1872  glutathione peroxidase  44.3 
 
 		 159 aa  127  1.0000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0683727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0392  glutathione peroxidase  39.67 
 
 		 188 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0773128  normal  0.361866 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0904  glutathione peroxidase  45.58 
 
 		 158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000826936  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2764  glutathione peroxidase  42 
 
 		 161 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0187221  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0872  glutathione peroxidase  43.33 
 
 		 158 aa  125  3e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2674  putative glutathione peroxidase protein  44.3 
 
 		 165 aa  125  3e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.552039 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2329  putative glutathione peroxidase  43.14 
 
 		 161 aa  125  3e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.509466  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3685  glutathione peroxidase  42.67 
 
 		 163 aa  125  3e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1665  glutathione peroxidase  46.32 
 
 		 159 aa  125  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0389024 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0888  glutathione peroxidase  40.94 
 
 		 160 aa  125  3e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.919035  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2597  Peroxiredoxin  46.31 
 
 		 158 aa  125  3e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1368  glutathione peroxidase  43.71 
 
 		 165 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2454  Peroxiredoxin  43.84 
 
 		 160 aa  125  4.0000000000000003e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0184161  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0565  glutathione peroxidase  40.8 
 
 		 182 aa  125  4.0000000000000003e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27520  putative glutathione peroxidase  43.42 
 
 		 161 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.78279  normal  0.0357307 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53420  glutathione peroxidase  45.16 
 
 		 160 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.31883  normal  0.0505345 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2975  Glutathione peroxidase  43.71 
 
 		 161 aa  124  5e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.36322  normal  0.036622 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4682  glutathione peroxidase  46.26 
 
 		 160 aa  125  5e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2074  glutathione peroxidase  43.92 
 
 		 159 aa  124  6e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.895406  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1571  glutathione peroxidase  43.92 
 
 		 159 aa  124  6e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.154895  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2454  glutathione peroxidase  43.92 
 
 		 159 aa  124  6e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0273  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2599  glutathione peroxidase  43.92 
 
 		 159 aa  124  6e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.391635  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3238  glutathione peroxidase  43.92 
 
 		 159 aa  124  6e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.400465  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2504  Glutathione peroxidase  44.3 
 
 		 165 aa  124  6e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.718008 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2510  glutathione peroxidase  43.92 
 
 		 159 aa  124  6e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1346  glutathione peroxidase  43.92 
 
 		 159 aa  124  6e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.909183  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0867  glutathione peroxidase  45.58 
 
 		 159 aa  124  7e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000118287  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2618  glutathione peroxidase  48.2 
 
 		 195 aa  124  7e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.137836  normal  0.142472 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3613  glutathione peroxidase  44.08 
 
 		 161 aa  124  8.000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.374005  normal  0.319321 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0697  Glutathione peroxidase  43.24 
 
 		 170 aa  124  8.000000000000001e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>