More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2679 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_2679  glutathione peroxidase  100 
 
 		 192 aa  401  1e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.241309  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2853  glutathione peroxidase  75.95 
 
 		 177 aa  260  8e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.154923  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1196  glutathione peroxidase  72.39 
 
 		 203 aa  258  3e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0218447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1267  glutathione peroxidase  72.39 
 
 		 203 aa  258  3e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0133013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1197  glutathione peroxidase  72.39 
 
 		 203 aa  258  4e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00644229  normal  0.718028 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3022  glutathione peroxidase  68.82 
 
 		 230 aa  254  6e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00278721  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3180  glutathione peroxidase  72.15 
 
 		 179 aa  254  6e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000271589  normal  0.0170233 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3037  glutathione peroxidase  68.82 
 
 		 230 aa  253  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000026286  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1341  glutathione peroxidase  71.52 
 
 		 179 aa  252  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0267656  hitchhiker  0.0000000425712 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2684  glutathione peroxidase  71.52 
 
 		 179 aa  251  4.0000000000000004e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.553323  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3349  glutathione peroxidase, putative  70.89 
 
 		 177 aa  250  1e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2474  glutathione peroxidase, putative  63.16 
 
 		 180 aa  233  1.0000000000000001e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0359  glutathione peroxidase  50.64 
 
 		 182 aa  183  1.0000000000000001e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1427  GMP synthase-like  50 
 
 		 190 aa  176  2e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2526  glutathione peroxidase  50.93 
 
 		 180 aa  176  2e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.327392  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4103  putative glutathione peroxidase  49.38 
 
 		 184 aa  166  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47550  putative glutathione peroxidase  49.38 
 
 		 184 aa  166  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.532704 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1654  glutathione peroxidase  46.63 
 
 		 186 aa  164  8e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.323621  hitchhiker  0.0047837 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1686  glutathione peroxidase  45.4 
 
 		 202 aa  164  9e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.677668  normal  0.86735 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3670  glutathione peroxidase  47.02 
 
 		 184 aa  163  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.174884  normal  0.0808268 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4033  glutathione peroxidase  45.4 
 
 		 183 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.475849  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1284  glutathione peroxidase  44.83 
 
 		 183 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.604655  normal  0.560913 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1719  glutathione peroxidase family protein  49.03 
 
 		 183 aa  162  3e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00731943  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000573  glutathione peroxidase  49.35 
 
 		 181 aa  159  3e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05309  glutathione peroxidase  48.05 
 
 		 181 aa  157  1e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1244  glutathione peroxidase  45.34 
 
 		 176 aa  157  1e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.247052  normal  0.300123 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02196  Glutathione peroxidase  43.75 
 
 		 184 aa  155  3e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0197549  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0018  glutathione peroxidase  47.2 
 
 		 208 aa  154  5.0000000000000005e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1762  glutathione peroxidase  45.06 
 
 		 183 aa  151  4e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.533866  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5165  Peroxiredoxin  47.83 
 
 		 202 aa  150  1e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.648504  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3912  glutathione peroxidase  45.91 
 
 		 189 aa  150  1e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.295477  normal  0.0278841 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0042  glutathione peroxidase  46.5 
 
 		 212 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.490429  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2515  glutathione peroxidase  48.98 
 
 		 185 aa  145  3e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4659  glutathione peroxidase  43.03 
 
 		 208 aa  139  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0237  putative glutathione peroxidase transmembrane protein  44.51 
 
 		 205 aa  138  6e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1970  glutathione peroxidase  44.1 
 
 		 193 aa  135  5e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0162  glutathione peroxidase  38.64 
 
 		 231 aa  134  6.0000000000000005e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.520461 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4024  glutathione peroxidase  44.94 
 
 		 213 aa  134  6.0000000000000005e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4667  glutathione peroxidase  43.51 
 
 		 199 aa  134  7.000000000000001e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0169  glutathione peroxidase  38.17 
 
 		 231 aa  134  9e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1246  glutathione peroxidase  43.05 
 
 		 192 aa  133  1.9999999999999998e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.281187  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1409  glutathione peroxidase  43.24 
 
 		 184 aa  132  3e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3374  glutathione peroxidase  45.95 
 
 		 195 aa  130  1.0000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.479812  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01222  ABC transporter vitamin B12 uptake permease  42.58 
 
 		 185 aa  130  1.0000000000000001e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.039958  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1801  glutathione peroxidase  41.61 
 
 		 199 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.740072  hitchhiker  0.00000253639 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2618  glutathione peroxidase  43.66 
 
 		 195 aa  128  4.0000000000000003e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.137836  normal  0.142472 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0307  putative glutathione peroxidase transmembrane protein  38.36 
 
 		 233 aa  125  3e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0461  glutathione peroxidase  41.77 
 
 		 191 aa  124  6e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE00580  glutathione peroxidase, putative  41.46 
 
 		 185 aa  122  2e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.256439  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2705  glutathione peroxidase  46.48 
 
 		 161 aa  122  2e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000249576  hitchhiker  0.0000800256 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0128  glutathione peroxidase  44.23 
 
 		 161 aa  122  3e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.594559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2773  glutathione peroxidase  45.77 
 
 		 161 aa  122  3e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000478947  hitchhiker  0.00587193 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0297  glutathione peroxidase  45.71 
 
 		 161 aa  122  4e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0981226  normal  0.609333 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2875  glutathione peroxidase  45.07 
 
 		 161 aa  121  7e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000745159  hitchhiker  0.0000749041 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0488  glutathione peroxidase  40.25 
 
 		 185 aa  120  9.999999999999999e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.642227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1909  peroxiredoxin  46.04 
 
 		 161 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.154084  normal  0.204796 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27520  putative glutathione peroxidase  45.32 
 
 		 161 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.78279  normal  0.0357307 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0270  glutathione peroxidase  42.96 
 
 		 158 aa  119  1.9999999999999998e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2329  putative glutathione peroxidase  45.32 
 
 		 161 aa  119  3e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.509466  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0238  Peroxiredoxin  42.65 
 
 		 170 aa  119  3e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1384  glutathione peroxidase  43.05 
 
 		 165 aa  119  3e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2249  glutathione peroxidase  45.11 
 
 		 162 aa  119  3e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.487328  normal  0.155268 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0190  glutathione peroxidase  42.95 
 
 		 161 aa  119  3e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.926255  normal  0.776204 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1781  glutathione peroxidase family protein  46.1 
 
 		 161 aa  118  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2453  glutathione peroxidase  42.45 
 
 		 158 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.70182 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1368  glutathione peroxidase  43.05 
 
 		 165 aa  118  6e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3981  glutathione peroxidase  46.04 
 
 		 161 aa  117  7e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.890862  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1407  glutathione peroxidase  43.05 
 
 		 165 aa  118  7e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0308338  normal  0.103968 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2975  Glutathione peroxidase  43.45 
 
 		 161 aa  117  7.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.36322  normal  0.036622 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3613  glutathione peroxidase  45.39 
 
 		 161 aa  117  9e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.374005  normal  0.319321 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2699  glutathione peroxidase  45.99 
 
 		 160 aa  115  3e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2389  putative glutathione peroxidase  40 
 
 		 176 aa  115  5e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.401751  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1563  glutathione peroxidase, putative  40.12 
 
 		 162 aa  114  6e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1053  glutathione peroxidase  40 
 
 		 176 aa  115  6e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.281088  normal  0.469721 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1570  Glutathione peroxidase  39.62 
 
 		 158 aa  114  6e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1354  glutathione peroxidase  43.31 
 
 		 162 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.525114 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2454  Peroxiredoxin  46.77 
 
 		 160 aa  114  8.999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0184161  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4117  Peroxiredoxin  42.86 
 
 		 182 aa  113  2.0000000000000002e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01902  probable glutathione peroxidase  42.42 
 
 		 165 aa  113  2.0000000000000002e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.101099  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2171  glutathione peroxidase  43.97 
 
 		 161 aa  113  2.0000000000000002e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0779752 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1080  glutathione peroxidase  41.84 
 
 		 164 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000852506  normal  0.679739 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0889  glutathione peroxidase  41.01 
 
 		 168 aa  112  3e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.50899 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2472  Glutathione peroxidase  41.73 
 
 		 159 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.161656  decreased coverage  0.0000149935 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2552  glutathione peroxidase  46.03 
 
 		 161 aa  112  5e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.40006  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0226  Peroxiredoxin  47.5 
 
 		 163 aa  111  6e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1665  glutathione peroxidase  40 
 
 		 159 aa  111  6e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0389024 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0484  glutathione peroxidase  43.88 
 
 		 161 aa  111  7.000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2271  glutathione peroxidase  42.06 
 
 		 160 aa  111  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3184  glutathione peroxidase  42.06 
 
 		 160 aa  110  9e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2131  glutathione peroxidase  42.06 
 
 		 160 aa  110  9e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3273  glutathione peroxidase  41.35 
 
 		 174 aa  110  9e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2764  glutathione peroxidase  42.65 
 
 		 161 aa  110  9e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0187221  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2202  glutathione peroxidase  42.06 
 
 		 161 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0177431  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1926  glutathione peroxidase  41.27 
 
 		 160 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0020  glutathione peroxidase  42.75 
 
 		 168 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1300  glutathione peroxidase  39.6 
 
 		 161 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.448702  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1965  glutathione peroxidase  40.43 
 
 		 160 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0718131  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0191  Glutathione peroxidase  42.45 
 
 		 161 aa  110  1.0000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1936  glutathione peroxidase  41.01 
 
 		 159 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.634874 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1863  glutathione peroxidase  41.04 
 
 		 195 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>