More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_1719 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1719  glutathione peroxidase family protein  100 
 
 		 183 aa  378  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00731943  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3670  glutathione peroxidase  96.17 
 
 		 184 aa  368  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.174884  normal  0.0808268 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1654  glutathione peroxidase  77.47 
 
 		 186 aa  310  9e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.323621  hitchhiker  0.0047837 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1284  glutathione peroxidase  69.4 
 
 		 183 aa  272  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.604655  normal  0.560913 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1686  glutathione peroxidase  69.4 
 
 		 202 aa  271  5.000000000000001e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.677668  normal  0.86735 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1244  glutathione peroxidase  71.59 
 
 		 176 aa  270  7e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.247052  normal  0.300123 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1762  glutathione peroxidase  78.92 
 
 		 183 aa  268  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.533866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4033  glutathione peroxidase  69.23 
 
 		 183 aa  268  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.475849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4103  putative glutathione peroxidase  78.66 
 
 		 184 aa  268  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47550  putative glutathione peroxidase  78.66 
 
 		 184 aa  268  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.532704 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3022  glutathione peroxidase  55.76 
 
 		 230 aa  197  7.999999999999999e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00278721  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3180  glutathione peroxidase  55.76 
 
 		 179 aa  197  9e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000271589  normal  0.0170233 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3037  glutathione peroxidase  55.76 
 
 		 230 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000026286  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1341  glutathione peroxidase  55.76 
 
 		 179 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0267656  hitchhiker  0.0000000425712 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2684  glutathione peroxidase  53.33 
 
 		 179 aa  189  2e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.553323  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0359  glutathione peroxidase  50.85 
 
 		 182 aa  187  5e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2853  glutathione peroxidase  49.72 
 
 		 177 aa  187  5e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.154923  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1267  glutathione peroxidase  50 
 
 		 203 aa  187  8e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0133013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1197  glutathione peroxidase  50.57 
 
 		 203 aa  187  1e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00644229  normal  0.718028 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3349  glutathione peroxidase, putative  50 
 
 		 177 aa  186  2e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1196  glutathione peroxidase  50.57 
 
 		 203 aa  185  2e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0218447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2515  glutathione peroxidase  54.07 
 
 		 185 aa  177  4.999999999999999e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2474  glutathione peroxidase, putative  53.85 
 
 		 180 aa  177  7e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2526  glutathione peroxidase  47.34 
 
 		 180 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.327392  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0042  glutathione peroxidase  48.45 
 
 		 212 aa  167  6e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.490429  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0018  glutathione peroxidase  45.4 
 
 		 208 aa  165  4e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1427  GMP synthase-like  45.18 
 
 		 190 aa  163  1.0000000000000001e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05309  glutathione peroxidase  47.93 
 
 		 181 aa  162  2.0000000000000002e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2679  glutathione peroxidase  49.03 
 
 		 192 aa  162  3e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.241309  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3912  glutathione peroxidase  47.43 
 
 		 189 aa  161  5.0000000000000005e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.295477  normal  0.0278841 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02196  Glutathione peroxidase  46.63 
 
 		 184 aa  161  5.0000000000000005e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0197549  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000573  glutathione peroxidase  47.34 
 
 		 181 aa  161  6e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5165  Peroxiredoxin  49.69 
 
 		 202 aa  160  8.000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.648504  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4024  glutathione peroxidase  48.8 
 
 		 213 aa  155  3e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1970  glutathione peroxidase  44.13 
 
 		 193 aa  154  1e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4659  glutathione peroxidase  47.59 
 
 		 208 aa  152  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4667  glutathione peroxidase  46.41 
 
 		 199 aa  151  5.9999999999999996e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0237  putative glutathione peroxidase transmembrane protein  45.09 
 
 		 205 aa  151  7e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1246  glutathione peroxidase  44.44 
 
 		 192 aa  149  2e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.281187  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3374  glutathione peroxidase  48.41 
 
 		 195 aa  148  4e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.479812  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0169  glutathione peroxidase  43.45 
 
 		 231 aa  145  4.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1409  glutathione peroxidase  44.77 
 
 		 184 aa  144  6e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0162  glutathione peroxidase  44.94 
 
 		 231 aa  143  2e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.520461 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0307  putative glutathione peroxidase transmembrane protein  44.3 
 
 		 233 aa  141  5e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01222  ABC transporter vitamin B12 uptake permease  45.51 
 
 		 185 aa  139  1.9999999999999998e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.039958  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2618  glutathione peroxidase  49.64 
 
 		 195 aa  136  1e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.137836  normal  0.142472 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0297  glutathione peroxidase  46.71 
 
 		 161 aa  135  2e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0981226  normal  0.609333 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0488  glutathione peroxidase  44.59 
 
 		 185 aa  136  2e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.642227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2249  glutathione peroxidase  51.82 
 
 		 162 aa  133  9.999999999999999e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.487328  normal  0.155268 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0461  glutathione peroxidase  38.89 
 
 		 191 aa  131  6.999999999999999e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1801  glutathione peroxidase  45 
 
 		 199 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.740072  hitchhiker  0.00000253639 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2389  putative glutathione peroxidase  40.59 
 
 		 176 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.401751  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1812  Peroxiredoxin  45.39 
 
 		 162 aa  125  3e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00250469  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1010  glutathione peroxidase  49.29 
 
 		 162 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0316  glutathione peroxidase  46.21 
 
 		 184 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.282271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0360  glutathione peroxidase  46.21 
 
 		 184 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.495486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0883  glutathione peroxidase  45.32 
 
 		 160 aa  123  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.961514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1053  glutathione peroxidase  46.21 
 
 		 176 aa  122  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.281088  normal  0.469721 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0007  glutathione peroxidase  45.8 
 
 		 157 aa  122  2e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0270  glutathione peroxidase  43.17 
 
 		 158 aa  122  3e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2453  glutathione peroxidase  42.75 
 
 		 158 aa  122  3e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.70182 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0904  glutathione peroxidase  45.58 
 
 		 158 aa  122  4e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000826936  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0559  glutathione peroxidase  45.39 
 
 		 161 aa  122  4e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1883  glutathione peroxidase  42.31 
 
 		 152 aa  121  7e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.255404  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0392  glutathione peroxidase  44.7 
 
 		 188 aa  121  7e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0773128  normal  0.361866 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1570  Glutathione peroxidase  46.43 
 
 		 158 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3665  glutathione peroxidase  49.23 
 
 		 158 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2055  putative glutathione peroxidase  44.03 
 
 		 177 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.265735 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1354  glutathione peroxidase  45.38 
 
 		 162 aa  119  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.525114 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3641  peroxiredoxin  44.44 
 
 		 161 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0867  glutathione peroxidase  44.9 
 
 		 159 aa  118  3.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000118287  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1926  glutathione peroxidase  44.06 
 
 		 160 aa  117  6e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0137  glutathione peroxidase  42.14 
 
 		 162 aa  117  6e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.167473  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1782  glutathione peroxidase  41.79 
 
 		 193 aa  117  7e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1863  glutathione peroxidase  46.32 
 
 		 195 aa  117  7.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41100  Glutathione peroxidase  43.42 
 
 		 160 aa  117  9.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.341833  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1207  glutathione peroxidase  44.03 
 
 		 158 aa  117  9.999999999999999e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.205921 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2454  Peroxiredoxin  44.2 
 
 		 160 aa  117  9.999999999999999e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0184161  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1781  glutathione peroxidase family protein  48.18 
 
 		 161 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4894  Peroxiredoxin  44.03 
 
 		 164 aa  116  1.9999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2597  Peroxiredoxin  46.43 
 
 		 158 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2202  glutathione peroxidase  43.06 
 
 		 161 aa  115  3e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0177431  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2131  glutathione peroxidase  43.36 
 
 		 160 aa  115  3e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5344  glutathione peroxidase  42.86 
 
 		 159 aa  115  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.213102 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3184  glutathione peroxidase  43.36 
 
 		 160 aa  115  3e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1242  glutathione peroxidase  42.86 
 
 		 159 aa  115  3e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0777  glutathione peroxidase, putative  45.32 
 
 		 160 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2271  glutathione peroxidase  43.36 
 
 		 160 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2011  glutathione peroxidase  42.25 
 
 		 159 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0261647  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5475  glutathione peroxidase  41.79 
 
 		 189 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.416682  normal  0.0282506 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1965  glutathione peroxidase  42.66 
 
 		 160 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0718131  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0816  glutathione peroxidase  45.32 
 
 		 160 aa  114  5e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4413  glutathione peroxidase  43.17 
 
 		 160 aa  114  5e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.312074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0694  glutathione peroxidase  44.53 
 
 		 161 aa  115  5e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000130339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2699  glutathione peroxidase  43.57 
 
 		 160 aa  115  5e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4682  glutathione peroxidase  45.32 
 
 		 160 aa  114  6e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1971  glutathione peroxidase  43.36 
 
 		 160 aa  114  6e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.775227  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2119  glutathione peroxidase  43.36 
 
 		 160 aa  114  6e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2054  glutathione peroxidase  42.14 
 
 		 159 aa  114  6e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2035  glutathione peroxidase  42.14 
 
 		 159 aa  114  6e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>