More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0137 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0137  glutathione peroxidase  100 
 
 		 162 aa  332  2e-90  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.167473  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2558  Peroxiredoxin  62.73 
 
 		 162 aa  217  6e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.177554  normal  0.095865 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6518  Peroxiredoxin  61.49 
 
 		 161 aa  214  2.9999999999999998e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1812  Peroxiredoxin  63.29 
 
 		 162 aa  212  9.999999999999999e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00250469  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1015  Glutathione peroxidase  61.49 
 
 		 162 aa  207  6e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0150707 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6245  Glutathione peroxidase  59.63 
 
 		 163 aa  201  3e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.479243  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0845  Peroxiredoxin  60.76 
 
 		 179 aa  201  3e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.494379  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14340  glutathione peroxidase  58.39 
 
 		 166 aa  199  9.999999999999999e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4894  Peroxiredoxin  59.62 
 
 		 164 aa  197  5e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3617  Peroxiredoxin  58.75 
 
 		 163 aa  192  1e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.78044  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4940  glutathione peroxidase  56.69 
 
 		 165 aa  191  3e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.232541 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4557  glutathione peroxidase  56.69 
 
 		 165 aa  191  3e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4645  glutathione peroxidase  56.69 
 
 		 165 aa  191  3e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1247  Glutathione peroxidase  56.88 
 
 		 163 aa  190  9e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0148462  normal  0.0739839 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1619  glutathione peroxidase  56.13 
 
 		 164 aa  187  5e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5382  Peroxiredoxin  54.49 
 
 		 179 aa  187  5.999999999999999e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.0000126467  normal  0.555193 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5134  glutathione peroxidase  54.09 
 
 		 165 aa  184  4e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2759  glutathione peroxidase  52.8 
 
 		 210 aa  180  7e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3641  peroxiredoxin  57.59 
 
 		 161 aa  180  7e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0883  glutathione peroxidase  55.48 
 
 		 160 aa  179  2e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.961514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1201  Glutathione peroxidase  54.72 
 
 		 160 aa  177  7e-44  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0952342  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0802  peroxiredoxin  55.41 
 
 		 160 aa  174  4e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.033017 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1010  glutathione peroxidase  55.48 
 
 		 162 aa  174  5e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4682  glutathione peroxidase  55.7 
 
 		 160 aa  173  9e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0777  glutathione peroxidase, putative  54.78 
 
 		 160 aa  172  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4413  glutathione peroxidase  53.8 
 
 		 160 aa  173  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.312074  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41100  Glutathione peroxidase  55.7 
 
 		 160 aa  172  9.999999999999999e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.341833  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0816  glutathione peroxidase  54.78 
 
 		 160 aa  171  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53420  glutathione peroxidase  55.06 
 
 		 160 aa  171  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.31883  normal  0.0505345 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1172  glutathione peroxidase family protein  60.47 
 
 		 162 aa  168  3e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0559  glutathione peroxidase  54.42 
 
 		 161 aa  166  1e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3507  glutathione peroxidase  50.29 
 
 		 204 aa  166  2e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.721934  normal  0.622585 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1469  putative glutathione peroxidase  46.02 
 
 		 183 aa  161  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2004  putative glutathione peroxidase  46.02 
 
 		 183 aa  161  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.375271 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1832  putative glutathione peroxidase  46.02 
 
 		 183 aa  161  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1452  putative glutathione peroxidase  46.02 
 
 		 183 aa  160  8.000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0020  glutathione peroxidase  54.11 
 
 		 168 aa  160  1e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1436  putative glutathione peroxidase  45.45 
 
 		 183 aa  159  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0293827 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1921  putative glutathione peroxidase  47.16 
 
 		 183 aa  159  2e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.449589 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2152  putative glutathione peroxidase  45.56 
 
 		 183 aa  159  2e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1732  putative glutathione peroxidase  46.29 
 
 		 183 aa  159  2e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.305422 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2428  putative glutathione peroxidase  47.16 
 
 		 183 aa  158  3e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.182778  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1570  Glutathione peroxidase  47.17 
 
 		 158 aa  158  4e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1790  putative glutathione peroxidase  47.16 
 
 		 183 aa  158  4e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.799217  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1480  putative glutathione peroxidase  47.16 
 
 		 183 aa  157  5e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.854221 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1929  putative glutathione peroxidase  47.16 
 
 		 183 aa  157  5e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000186844  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1334  Peroxiredoxin  52 
 
 		 169 aa  157  8e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0131674  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3995  Peroxiredoxin  50.62 
 
 		 164 aa  156  1e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.083987 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01679  predicted glutathione peroxidase  46.59 
 
 		 183 aa  155  2e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0313558  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1932  Glutathione peroxidase  46.59 
 
 		 183 aa  155  2e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0263246  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01668  hypothetical protein  46.59 
 
 		 183 aa  155  2e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0174889  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1242  glutathione peroxidase  53.19 
 
 		 159 aa  155  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02660  glutathione peroxidase  49.69 
 
 		 158 aa  155  2e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2756  glutathione peroxidase  50.31 
 
 		 158 aa  155  2e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.447473  hitchhiker  0.0000941143 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2639  glutathione peroxidase  52.7 
 
 		 158 aa  154  4e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.833403 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1914  putative glutathione peroxidase  46.59 
 
 		 183 aa  154  5.0000000000000005e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4117  Peroxiredoxin  55.4 
 
 		 182 aa  154  5.0000000000000005e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0265  Peroxiredoxin  48.03 
 
 		 165 aa  154  6e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000231119  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0697  Glutathione peroxidase  50.66 
 
 		 170 aa  154  7e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2909  Peroxiredoxin  49.07 
 
 		 198 aa  153  1e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1257  glutathione peroxidase  44.63 
 
 		 182 aa  152  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30390  glutathione peroxidase  48.08 
 
 		 173 aa  152  2.9999999999999998e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0867  glutathione peroxidase  50.34 
 
 		 159 aa  151  2.9999999999999998e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000118287  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2461  glutathione peroxidase  48.39 
 
 		 177 aa  150  5.9999999999999996e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1348  glutathione peroxidase  44.07 
 
 		 182 aa  150  7e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02770  glutathione peroxidase  48.41 
 
 		 160 aa  150  7e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.359164  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0671  glutathione peroxidase  50 
 
 		 164 aa  150  8e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.131867  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1090  glutathione peroxidase  46.25 
 
 		 160 aa  149  2e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.37333 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1354  glutathione peroxidase  51.35 
 
 		 162 aa  149  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.525114 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2597  Peroxiredoxin  46.05 
 
 		 158 aa  148  2e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0565  glutathione peroxidase  44.19 
 
 		 182 aa  149  2e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0484  glutathione peroxidase  48.32 
 
 		 161 aa  149  2e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7246  glutathione peroxidase  43.82 
 
 		 182 aa  148  3e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.156193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0904  glutathione peroxidase  49.66 
 
 		 158 aa  148  3e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000826936  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1315  glutathione peroxidase  44.38 
 
 		 173 aa  148  4e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3925  Glutathione peroxidase  47.33 
 
 		 165 aa  147  4e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0956  glutathione peroxidase  50.34 
 
 		 168 aa  147  7e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1199  glutathione peroxidase  43.02 
 
 		 182 aa  147  7e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0894577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1214  glutathione peroxidase  43.12 
 
 		 167 aa  147  9e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3973  Peroxiredoxin  46.67 
 
 		 165 aa  147  9e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000360978 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6295  glutathione peroxidase  52.03 
 
 		 162 aa  146  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2774  putative glutathione peroxidase  43.68 
 
 		 183 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.956503  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1075  glutathione peroxidase  50.34 
 
 		 168 aa  146  1.0000000000000001e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.364498  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1655  Peroxiredoxin  45.83 
 
 		 183 aa  145  2.0000000000000003e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.401167  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1829  putative glutathione peroxidase  47.06 
 
 		 184 aa  145  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0190  glutathione peroxidase  49.3 
 
 		 161 aa  145  2.0000000000000003e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.926255  normal  0.776204 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1626  Peroxiredoxin  45.24 
 
 		 183 aa  145  2.0000000000000003e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2615  putative glutathione peroxidase  47.06 
 
 		 184 aa  145  2.0000000000000003e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0694  glutathione peroxidase  45.64 
 
 		 161 aa  145  2.0000000000000003e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000130339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2478  glutathione peroxidase  44.59 
 
 		 164 aa  145  2.0000000000000003e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.290642 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1721  putative glutathione peroxidase  47.06 
 
 		 184 aa  145  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.326937  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01222  ABC transporter vitamin B12 uptake permease  45 
 
 		 185 aa  144  4.0000000000000006e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.039958  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4077  glutathione peroxidase  47.62 
 
 		 162 aa  144  4.0000000000000006e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.629032 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5344  glutathione peroxidase  51.08 
 
 		 159 aa  144  5e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.213102 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2683  Peroxiredoxin  45.28 
 
 		 160 aa  144  5e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.299838  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2011  glutathione peroxidase  51.56 
 
 		 159 aa  144  6e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0261647  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2067  glutathione peroxidase  51.08 
 
 		 159 aa  144  6e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1771  glutathione peroxidase  49.61 
 
 		 161 aa  144  7.0000000000000006e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11881  glutathione peroxidase  44.3 
 
 		 159 aa  144  7.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.431432  normal  0.0622646 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1936  glutathione peroxidase  51.08 
 
 		 159 aa  143  8.000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.634874 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>