More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_1626 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_1626  Peroxiredoxin  100 
 
 
183 aa  381  1e-105  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1655  Peroxiredoxin  84.15 
 
 
183 aa  333  9e-91  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.401167  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2468  putative glutathione peroxidase  67.21 
 
 
183 aa  264  5.999999999999999e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.157307  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2152  putative glutathione peroxidase  67.21 
 
 
183 aa  264  7e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2774  putative glutathione peroxidase  67.21 
 
 
183 aa  263  1e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.956503  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1829  putative glutathione peroxidase  64.29 
 
 
184 aa  255  3e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1721  putative glutathione peroxidase  64.29 
 
 
184 aa  255  3e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.326937  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2615  putative glutathione peroxidase  64.29 
 
 
184 aa  255  3e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2004  putative glutathione peroxidase  60.11 
 
 
183 aa  236  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.375271 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1469  putative glutathione peroxidase  60.11 
 
 
183 aa  236  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1790  putative glutathione peroxidase  60.11 
 
 
183 aa  236  2e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.799217  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1732  putative glutathione peroxidase  59.02 
 
 
183 aa  234  5.0000000000000005e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.305422 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1832  putative glutathione peroxidase  59.56 
 
 
183 aa  234  7e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01679  predicted glutathione peroxidase  59.56 
 
 
183 aa  233  8e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0313558  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1932  Glutathione peroxidase  59.56 
 
 
183 aa  233  8e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0263246  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01668  hypothetical protein  59.56 
 
 
183 aa  233  8e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0174889  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1436  putative glutathione peroxidase  59.56 
 
 
183 aa  233  9e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0293827 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1929  putative glutathione peroxidase  59.56 
 
 
183 aa  233  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000186844  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1480  putative glutathione peroxidase  59.56 
 
 
183 aa  233  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.854221 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2428  putative glutathione peroxidase  59.02 
 
 
183 aa  232  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.182778  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1452  putative glutathione peroxidase  59.02 
 
 
183 aa  232  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1921  putative glutathione peroxidase  59.02 
 
 
183 aa  231  5e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.449589 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1914  putative glutathione peroxidase  59.02 
 
 
183 aa  230  9e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1199  glutathione peroxidase  51.37 
 
 
182 aa  198  3e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0894577  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1315  glutathione peroxidase  52.51 
 
 
173 aa  196  1.0000000000000001e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1348  glutathione peroxidase  51.09 
 
 
182 aa  196  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0565  glutathione peroxidase  51.91 
 
 
182 aa  196  2.0000000000000003e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1257  glutathione peroxidase  50.54 
 
 
182 aa  194  5.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3507  glutathione peroxidase  53.04 
 
 
204 aa  194  6e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.721934  normal  0.622585 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7246  glutathione peroxidase  52.49 
 
 
182 aa  194  7e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.156193  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4022  Glutathione peroxidase  50.82 
 
 
181 aa  184  7e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.350366 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03223  glutathione peroxidase  49.72 
 
 
181 aa  180  1e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4682  glutathione peroxidase  50 
 
 
160 aa  176  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2558  Peroxiredoxin  49.15 
 
 
162 aa  174  5e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.177554  normal  0.095865 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14340  glutathione peroxidase  49.16 
 
 
166 aa  172  2.9999999999999996e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53420  glutathione peroxidase  48.88 
 
 
160 aa  171  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.31883  normal  0.0505345 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2461  glutathione peroxidase  48.85 
 
 
177 aa  171  5e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1619  glutathione peroxidase  48.07 
 
 
164 aa  169  2e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1334  Peroxiredoxin  49.7 
 
 
169 aa  167  6e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0131674  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1914  glutathione peroxidase  45.36 
 
 
182 aa  167  1e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0816  glutathione peroxidase  48.31 
 
 
160 aa  166  2e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1201  Glutathione peroxidase  48.3 
 
 
160 aa  166  2e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0952342  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6245  Glutathione peroxidase  44.38 
 
 
163 aa  165  2.9999999999999998e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.479243  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0777  glutathione peroxidase, putative  47.75 
 
 
160 aa  164  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2683  Peroxiredoxin  47.51 
 
 
160 aa  164  6.9999999999999995e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.299838  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3641  peroxiredoxin  47.98 
 
 
161 aa  164  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1015  Glutathione peroxidase  46.33 
 
 
162 aa  164  9e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0150707 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5382  Peroxiredoxin  47.16 
 
 
179 aa  164  1.0000000000000001e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.0000126467  normal  0.555193 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2597  Peroxiredoxin  46.63 
 
 
158 aa  163  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0802  peroxiredoxin  48.02 
 
 
160 aa  163  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.033017 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2764  glutathione peroxidase  43.96 
 
 
161 aa  163  1.0000000000000001e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0187221  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1010  glutathione peroxidase  46.93 
 
 
162 aa  162  3e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1214  glutathione peroxidase  44.51 
 
 
167 aa  162  3e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0883  glutathione peroxidase  46.63 
 
 
160 aa  161  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.961514  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0559  glutathione peroxidase  45.56 
 
 
161 aa  160  1e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4940  glutathione peroxidase  46.37 
 
 
165 aa  159  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.232541 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1570  Glutathione peroxidase  44.38 
 
 
158 aa  159  2e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4557  glutathione peroxidase  46.37 
 
 
165 aa  159  2e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4645  glutathione peroxidase  46.37 
 
 
165 aa  159  2e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1812  Peroxiredoxin  46.33 
 
 
162 aa  158  4e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00250469  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0697  Glutathione peroxidase  45.51 
 
 
170 aa  158  4e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41100  Glutathione peroxidase  46.07 
 
 
160 aa  158  5e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.341833  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0867  glutathione peroxidase  44.44 
 
 
159 aa  157  6e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000118287  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3617  Peroxiredoxin  48.02 
 
 
163 aa  157  7e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.78044  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0265  Peroxiredoxin  45.45 
 
 
165 aa  155  2e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000231119  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0904  glutathione peroxidase  44.38 
 
 
158 aa  155  2e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000826936  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3973  Peroxiredoxin  42.94 
 
 
165 aa  155  3e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000360978 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1090  glutathione peroxidase  45.3 
 
 
160 aa  154  5.0000000000000005e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.37333 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6518  Peroxiredoxin  46.07 
 
 
161 aa  154  5.0000000000000005e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27520  putative glutathione peroxidase  44.75 
 
 
161 aa  154  6e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.78279  normal  0.0357307 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02660  glutathione peroxidase  45.61 
 
 
158 aa  154  7e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3925  Glutathione peroxidase  42.94 
 
 
165 aa  154  9e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0845  Peroxiredoxin  45.98 
 
 
179 aa  154  9e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.494379  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2454  glutathione peroxidase  43.45 
 
 
159 aa  154  1e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0273  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1346  glutathione peroxidase  43.45 
 
 
159 aa  154  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.909183  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1571  glutathione peroxidase  43.45 
 
 
159 aa  154  1e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.154895  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4077  glutathione peroxidase  46.67 
 
 
162 aa  153  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.629032 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2599  glutathione peroxidase  43.45 
 
 
159 aa  154  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.391635  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2074  glutathione peroxidase  43.45 
 
 
159 aa  154  1e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.895406  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2510  glutathione peroxidase  43.45 
 
 
159 aa  154  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3238  glutathione peroxidase  43.45 
 
 
159 aa  154  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.400465  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0841  glutathione peroxidase  44.91 
 
 
164 aa  152  2e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0436995  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2329  putative glutathione peroxidase  44.2 
 
 
161 aa  152  2e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.509466  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1563  glutathione peroxidase, putative  45.29 
 
 
162 aa  152  2e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3685  glutathione peroxidase  42.31 
 
 
163 aa  152  2e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0020  glutathione peroxidase  49.7 
 
 
168 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5485  glutathione peroxidase  45.51 
 
 
178 aa  152  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.219921  normal  0.973287 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2875  glutathione peroxidase  44.38 
 
 
161 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000745159  hitchhiker  0.0000749041 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5134  glutathione peroxidase  45.2 
 
 
165 aa  151  5e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4413  glutathione peroxidase  43.82 
 
 
160 aa  151  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.312074  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4894  Peroxiredoxin  46.11 
 
 
164 aa  151  5.9999999999999996e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2773  glutathione peroxidase  44.38 
 
 
161 aa  151  5.9999999999999996e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000478947  hitchhiker  0.00587193 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1172  glutathione peroxidase family protein  48.04 
 
 
162 aa  150  7e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1909  peroxiredoxin  43.09 
 
 
161 aa  150  8e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.154084  normal  0.204796 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2756  glutathione peroxidase  45.78 
 
 
158 aa  150  8e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.447473  hitchhiker  0.0000941143 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2705  glutathione peroxidase  43.79 
 
 
161 aa  150  8e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000249576  hitchhiker  0.0000800256 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1407  glutathione peroxidase  42.6 
 
 
165 aa  149  1e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0308338  normal  0.103968 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2011  glutathione peroxidase  42.26 
 
 
159 aa  150  1e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0261647  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3981  glutathione peroxidase  42.54 
 
 
161 aa  149  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.890862  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2975  Glutathione peroxidase  42.6 
 
 
161 aa  149  2e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.36322  normal  0.036622 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>