More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2468 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_2468  putative glutathione peroxidase  100 
 
 		 183 aa  382  1e-105  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.157307  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2774  putative glutathione peroxidase  94.54 
 
 		 183 aa  364  1e-100  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.956503  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1655  Peroxiredoxin  67.21 
 
 		 183 aa  265  2.9999999999999995e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.401167  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1626  Peroxiredoxin  67.21 
 
 		 183 aa  264  5.999999999999999e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2152  putative glutathione peroxidase  63.93 
 
 		 183 aa  249  2e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1829  putative glutathione peroxidase  63.74 
 
 		 184 aa  246  1e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1721  putative glutathione peroxidase  63.74 
 
 		 184 aa  246  1e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.326937  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2615  putative glutathione peroxidase  63.74 
 
 		 184 aa  246  1e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1732  putative glutathione peroxidase  56.83 
 
 		 183 aa  226  2e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.305422 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1452  putative glutathione peroxidase  55.74 
 
 		 183 aa  223  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1469  putative glutathione peroxidase  56.28 
 
 		 183 aa  223  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2004  putative glutathione peroxidase  56.28 
 
 		 183 aa  223  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.375271 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1832  putative glutathione peroxidase  55.74 
 
 		 183 aa  221  6e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1436  putative glutathione peroxidase  55.74 
 
 		 183 aa  219  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0293827 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1790  putative glutathione peroxidase  56.28 
 
 		 183 aa  217  6e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.799217  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2428  putative glutathione peroxidase  56.28 
 
 		 183 aa  217  6e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.182778  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01679  predicted glutathione peroxidase  56.28 
 
 		 183 aa  217  7e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0313558  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1932  Glutathione peroxidase  56.28 
 
 		 183 aa  217  7e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0263246  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1929  putative glutathione peroxidase  56.28 
 
 		 183 aa  217  7e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000186844  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1480  putative glutathione peroxidase  56.28 
 
 		 183 aa  217  7e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.854221 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01668  hypothetical protein  56.28 
 
 		 183 aa  217  7e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0174889  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1914  putative glutathione peroxidase  55.74 
 
 		 183 aa  214  7e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1921  putative glutathione peroxidase  55.19 
 
 		 183 aa  212  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.449589 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7246  glutathione peroxidase  56.28 
 
 		 182 aa  206  1e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.156193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1315  glutathione peroxidase  53.33 
 
 		 173 aa  198  3.9999999999999996e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1199  glutathione peroxidase  52.72 
 
 		 182 aa  196  1.0000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0894577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3507  glutathione peroxidase  51.35 
 
 		 204 aa  192  2e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.721934  normal  0.622585 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03223  glutathione peroxidase  51.93 
 
 		 181 aa  191  4e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4022  Glutathione peroxidase  54.64 
 
 		 181 aa  190  8e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.350366 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1257  glutathione peroxidase  49.18 
 
 		 182 aa  188  4e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1348  glutathione peroxidase  49.73 
 
 		 182 aa  188  5e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1334  Peroxiredoxin  53.94 
 
 		 169 aa  182  2.0000000000000003e-45  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0131674  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0565  glutathione peroxidase  48.63 
 
 		 182 aa  181  6e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4682  glutathione peroxidase  50 
 
 		 160 aa  179  1e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53420  glutathione peroxidase  49.44 
 
 		 160 aa  178  4e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.31883  normal  0.0505345 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0777  glutathione peroxidase, putative  50.56 
 
 		 160 aa  176  1e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0883  glutathione peroxidase  48.89 
 
 		 160 aa  176  2e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.961514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0816  glutathione peroxidase  50 
 
 		 160 aa  175  4e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14340  glutathione peroxidase  48.07 
 
 		 166 aa  172  1.9999999999999998e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0802  peroxiredoxin  49.16 
 
 		 160 aa  171  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.033017 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2558  Peroxiredoxin  48.59 
 
 		 162 aa  171  6.999999999999999e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.177554  normal  0.095865 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3641  peroxiredoxin  49.71 
 
 		 161 aa  170  1e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4413  glutathione peroxidase  48.33 
 
 		 160 aa  169  2e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.312074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0559  glutathione peroxidase  48.88 
 
 		 161 aa  169  2e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1914  glutathione peroxidase  46.45 
 
 		 182 aa  168  4e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2975  Glutathione peroxidase  48.52 
 
 		 161 aa  168  4e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.36322  normal  0.036622 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0867  glutathione peroxidase  49.44 
 
 		 159 aa  168  5e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000118287  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1619  glutathione peroxidase  45.86 
 
 		 164 aa  167  9e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1368  glutathione peroxidase  47.93 
 
 		 165 aa  167  9e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1201  Glutathione peroxidase  48.86 
 
 		 160 aa  167  9e-41  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0952342  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2764  glutathione peroxidase  49.7 
 
 		 161 aa  166  1e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0187221  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1407  glutathione peroxidase  47.93 
 
 		 165 aa  166  2e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0308338  normal  0.103968 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0697  Glutathione peroxidase  47.75 
 
 		 170 aa  166  2e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6245  Glutathione peroxidase  44.07 
 
 		 163 aa  165  2.9999999999999998e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.479243  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2461  glutathione peroxidase  47.73 
 
 		 177 aa  165  2.9999999999999998e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1570  Glutathione peroxidase  48.19 
 
 		 158 aa  165  4e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1384  glutathione peroxidase  47.34 
 
 		 165 aa  164  5.9999999999999996e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2683  Peroxiredoxin  46.41 
 
 		 160 aa  164  6.9999999999999995e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.299838  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0904  glutathione peroxidase  48.88 
 
 		 158 aa  164  6.9999999999999995e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000826936  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2597  Peroxiredoxin  46.99 
 
 		 158 aa  163  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3613  glutathione peroxidase  47.09 
 
 		 161 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.374005  normal  0.319321 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2705  glutathione peroxidase  47.34 
 
 		 161 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000249576  hitchhiker  0.0000800256 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2875  glutathione peroxidase  46.75 
 
 		 161 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000745159  hitchhiker  0.0000749041 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2773  glutathione peroxidase  46.75 
 
 		 161 aa  162  3e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000478947  hitchhiker  0.00587193 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1015  Glutathione peroxidase  43.5 
 
 		 162 aa  161  4.0000000000000004e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0150707 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41100  Glutathione peroxidase  45.56 
 
 		 160 aa  161  4.0000000000000004e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.341833  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1665  glutathione peroxidase  45.88 
 
 		 159 aa  161  6e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0389024 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0841  glutathione peroxidase  46.67 
 
 		 164 aa  160  7e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0436995  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5382  Peroxiredoxin  46.02 
 
 		 179 aa  160  8.000000000000001e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.0000126467  normal  0.555193 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1010  glutathione peroxidase  45.3 
 
 		 162 aa  160  1e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1214  glutathione peroxidase  42.86 
 
 		 167 aa  160  1e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4077  glutathione peroxidase  47.9 
 
 		 162 aa  159  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.629032 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2552  glutathione peroxidase  48.52 
 
 		 161 aa  159  2e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.40006  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0226  Peroxiredoxin  46.15 
 
 		 163 aa  159  3e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3617  Peroxiredoxin  45.25 
 
 		 163 aa  158  4e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.78044  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4940  glutathione peroxidase  45.45 
 
 		 165 aa  158  5e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.232541 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2662  glutathione peroxidase  47.59 
 
 		 181 aa  157  5e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0111206  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4557  glutathione peroxidase  45.45 
 
 		 165 aa  158  5e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3973  Peroxiredoxin  45.78 
 
 		 165 aa  158  5e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000360978 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4645  glutathione peroxidase  45.45 
 
 		 165 aa  158  5e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3925  Glutathione peroxidase  45.78 
 
 		 165 aa  157  6e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4894  Peroxiredoxin  47.16 
 
 		 164 aa  157  6e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2329  putative glutathione peroxidase  45.88 
 
 		 161 aa  157  8e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.509466  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1090  glutathione peroxidase  43.65 
 
 		 160 aa  157  9e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.37333 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3981  glutathione peroxidase  44.97 
 
 		 161 aa  156  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.890862  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1781  glutathione peroxidase family protein  44.77 
 
 		 161 aa  155  2e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5344  glutathione peroxidase  44.2 
 
 		 159 aa  156  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.213102 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02660  glutathione peroxidase  49.37 
 
 		 158 aa  156  2e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1300  glutathione peroxidase  45.56 
 
 		 161 aa  156  2e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.448702  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0265  Peroxiredoxin  44.85 
 
 		 165 aa  156  2e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000231119  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27520  putative glutathione peroxidase  45.29 
 
 		 161 aa  155  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.78279  normal  0.0357307 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1909  peroxiredoxin  43.53 
 
 		 161 aa  155  3e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.154084  normal  0.204796 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2054  glutathione peroxidase  43.65 
 
 		 159 aa  155  3e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6042  glutathione peroxidase  43.65 
 
 		 159 aa  155  3e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2035  glutathione peroxidase  43.65 
 
 		 159 aa  155  3e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1354  glutathione peroxidase  44.69 
 
 		 162 aa  155  4e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.525114 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2510  glutathione peroxidase  43.11 
 
 		 159 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1563  glutathione peroxidase, putative  44.97 
 
 		 162 aa  154  5.0000000000000005e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1346  glutathione peroxidase  43.11 
 
 		 159 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.909183  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2074  glutathione peroxidase  43.11 
 
 		 159 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.895406  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>