More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0565 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0565  glutathione peroxidase  100 
 
 		 182 aa  369  1e-101  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1914  glutathione peroxidase  59.34 
 
 		 182 aa  223  2e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7246  glutathione peroxidase  61.88 
 
 		 182 aa  221  4e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.156193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1199  glutathione peroxidase  58.79 
 
 		 182 aa  220  7e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0894577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03223  glutathione peroxidase  61.54 
 
 		 181 aa  219  1.9999999999999999e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3507  glutathione peroxidase  60.56 
 
 		 204 aa  209  1e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.721934  normal  0.622585 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2004  putative glutathione peroxidase  51.37 
 
 		 183 aa  199  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.375271 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1469  putative glutathione peroxidase  51.37 
 
 		 183 aa  199  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2152  putative glutathione peroxidase  51.91 
 
 		 183 aa  199  1.9999999999999998e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1348  glutathione peroxidase  52.17 
 
 		 182 aa  197  5e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1832  putative glutathione peroxidase  50.82 
 
 		 183 aa  197  7e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1732  putative glutathione peroxidase  51.91 
 
 		 183 aa  197  7.999999999999999e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.305422 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1257  glutathione peroxidase  51.63 
 
 		 182 aa  197  7.999999999999999e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4022  Glutathione peroxidase  56.28 
 
 		 181 aa  196  1.0000000000000001e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.350366 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1436  putative glutathione peroxidase  50.82 
 
 		 183 aa  197  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0293827 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1655  Peroxiredoxin  51.37 
 
 		 183 aa  196  1.0000000000000001e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.401167  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1626  Peroxiredoxin  51.91 
 
 		 183 aa  196  2.0000000000000003e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1452  putative glutathione peroxidase  50.27 
 
 		 183 aa  195  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1721  putative glutathione peroxidase  52.2 
 
 		 184 aa  193  1e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.326937  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2615  putative glutathione peroxidase  52.2 
 
 		 184 aa  193  1e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1829  putative glutathione peroxidase  52.2 
 
 		 184 aa  193  1e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2461  glutathione peroxidase  55.17 
 
 		 177 aa  193  1e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1790  putative glutathione peroxidase  50.27 
 
 		 183 aa  191  4e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.799217  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2428  putative glutathione peroxidase  50.27 
 
 		 183 aa  190  8e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.182778  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01679  predicted glutathione peroxidase  50.27 
 
 		 183 aa  190  1e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0313558  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1932  Glutathione peroxidase  50.27 
 
 		 183 aa  190  1e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0263246  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01668  hypothetical protein  50.27 
 
 		 183 aa  190  1e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0174889  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1929  putative glutathione peroxidase  50.27 
 
 		 183 aa  190  1e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000186844  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1480  putative glutathione peroxidase  50.27 
 
 		 183 aa  190  1e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.854221 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2774  putative glutathione peroxidase  49.73 
 
 		 183 aa  188  4e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.956503  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1914  putative glutathione peroxidase  49.73 
 
 		 183 aa  186  1e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1921  putative glutathione peroxidase  49.18 
 
 		 183 aa  186  2e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.449589 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2468  putative glutathione peroxidase  48.63 
 
 		 183 aa  181  6e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.157307  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2558  Peroxiredoxin  51.98 
 
 		 162 aa  181  7e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.177554  normal  0.095865 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1214  glutathione peroxidase  51.72 
 
 		 167 aa  180  1e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0559  glutathione peroxidase  53.07 
 
 		 161 aa  178  4e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1201  Glutathione peroxidase  52.6 
 
 		 160 aa  176  1e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0952342  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5485  glutathione peroxidase  50.54 
 
 		 178 aa  173  9e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.219921  normal  0.973287 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27520  putative glutathione peroxidase  48.89 
 
 		 161 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.78279  normal  0.0357307 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3981  glutathione peroxidase  50.3 
 
 		 161 aa  171  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.890862  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2329  putative glutathione peroxidase  49.44 
 
 		 161 aa  171  5.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.509466  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5382  Peroxiredoxin  51.16 
 
 		 179 aa  169  1e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.0000126467  normal  0.555193 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1010  glutathione peroxidase  50.29 
 
 		 162 aa  169  2e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3641  peroxiredoxin  50.57 
 
 		 161 aa  167  7e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1781  glutathione peroxidase family protein  50.3 
 
 		 161 aa  166  1e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2756  glutathione peroxidase  52.98 
 
 		 158 aa  166  1e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.447473  hitchhiker  0.0000941143 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0851  glutathione peroxidase  51.69 
 
 		 161 aa  165  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.425919  decreased coverage  0.00020946 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3613  glutathione peroxidase  47.78 
 
 		 161 aa  164  5e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.374005  normal  0.319321 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1026  glutathione peroxidase  51.52 
 
 		 178 aa  164  5.9999999999999996e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.04413  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1080  glutathione peroxidase  50.96 
 
 		 164 aa  164  5.9999999999999996e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000852506  normal  0.679739 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02770  glutathione peroxidase  51.22 
 
 		 160 aa  164  6.9999999999999995e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.359164  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0697  Glutathione peroxidase  50.57 
 
 		 170 aa  164  9e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1909  peroxiredoxin  47.22 
 
 		 161 aa  164  9e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.154084  normal  0.204796 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02660  glutathione peroxidase  49.39 
 
 		 158 aa  164  9e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1971  glutathione peroxidase  50.96 
 
 		 160 aa  163  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.775227  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3184  glutathione peroxidase  48.8 
 
 		 160 aa  163  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2119  glutathione peroxidase  50.96 
 
 		 160 aa  163  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2131  glutathione peroxidase  50.96 
 
 		 160 aa  163  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1198  glutathione peroxidase  50.91 
 
 		 178 aa  163  1.0000000000000001e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00025984  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1950  glutathione peroxidase  50.96 
 
 		 160 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.210596  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6518  Peroxiredoxin  49.44 
 
 		 161 aa  162  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1965  glutathione peroxidase  50.32 
 
 		 160 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0718131  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1619  glutathione peroxidase  50.85 
 
 		 164 aa  162  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2154  glutathione peroxidase  50.96 
 
 		 160 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1926  glutathione peroxidase  50.96 
 
 		 160 aa  162  3e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01902  probable glutathione peroxidase  47.25 
 
 		 165 aa  162  3e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.101099  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0777  glutathione peroxidase, putative  48.85 
 
 		 160 aa  161  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2202  glutathione peroxidase  50.32 
 
 		 161 aa  161  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0177431  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2271  glutathione peroxidase  48.19 
 
 		 160 aa  161  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0816  glutathione peroxidase  48.85 
 
 		 160 aa  161  6e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0845  Peroxiredoxin  50.29 
 
 		 179 aa  160  7e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.494379  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4682  glutathione peroxidase  49.71 
 
 		 160 aa  160  7e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0802  peroxiredoxin  48.85 
 
 		 160 aa  160  8.000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.033017 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1315  glutathione peroxidase  44.32 
 
 		 173 aa  159  1e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2683  Peroxiredoxin  48.52 
 
 		 160 aa  159  1e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.299838  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1812  Peroxiredoxin  47.43 
 
 		 162 aa  159  2e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00250469  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0883  glutathione peroxidase  48.28 
 
 		 160 aa  159  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.961514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30390  glutathione peroxidase  50.59 
 
 		 173 aa  159  2e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53420  glutathione peroxidase  49.13 
 
 		 160 aa  159  3e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.31883  normal  0.0505345 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2875  glutathione peroxidase  48.21 
 
 		 161 aa  159  3e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000745159  hitchhiker  0.0000749041 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1300  glutathione peroxidase  47.22 
 
 		 161 aa  158  4e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.448702  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2773  glutathione peroxidase  48.21 
 
 		 161 aa  158  4e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000478947  hitchhiker  0.00587193 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1570  Glutathione peroxidase  49.04 
 
 		 158 aa  158  4e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3685  glutathione peroxidase  48.52 
 
 		 163 aa  157  6e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1059  glutathione peroxidase  49.68 
 
 		 178 aa  157  6e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.428642  normal  0.565362 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0091  glutathione peroxidase  47.51 
 
 		 174 aa  157  7e-38  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2705  glutathione peroxidase  47.62 
 
 		 161 aa  157  8e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000249576  hitchhiker  0.0000800256 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41100  Glutathione peroxidase  48.55 
 
 		 160 aa  156  1e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.341833  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0020  glutathione peroxidase  49.43 
 
 		 168 aa  157  1e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2909  Peroxiredoxin  46.24 
 
 		 198 aa  157  1e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3617  Peroxiredoxin  48.3 
 
 		 163 aa  157  1e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.78044  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14340  glutathione peroxidase  47.19 
 
 		 166 aa  156  1e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4413  glutathione peroxidase  49.13 
 
 		 160 aa  156  2e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.312074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0265  Peroxiredoxin  45.45 
 
 		 165 aa  155  2e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000231119  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0841  glutathione peroxidase  49.08 
 
 		 164 aa  155  3e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0436995  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3925  Glutathione peroxidase  45.29 
 
 		 165 aa  155  3e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0190  glutathione peroxidase  46.11 
 
 		 161 aa  155  3e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.926255  normal  0.776204 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1015  Glutathione peroxidase  45.2 
 
 		 162 aa  155  3e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0150707 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1563  glutathione peroxidase, putative  47.34 
 
 		 162 aa  155  4e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3973  Peroxiredoxin  45.29 
 
 		 165 aa  155  4e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000360978 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>