More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3617 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3617  Peroxiredoxin  100 
 
 		 163 aa  332  1e-90  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.78044  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4940  glutathione peroxidase  73.75 
 
 		 165 aa  243  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.232541 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4557  glutathione peroxidase  73.75 
 
 		 165 aa  243  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4645  glutathione peroxidase  73.75 
 
 		 165 aa  243  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5134  glutathione peroxidase  69.57 
 
 		 165 aa  229  1e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1015  Glutathione peroxidase  66.46 
 
 		 162 aa  227  4e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0150707 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0845  Peroxiredoxin  67.7 
 
 		 179 aa  226  2e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.494379  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1619  glutathione peroxidase  68.75 
 
 		 164 aa  222  1e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6245  Glutathione peroxidase  60.87 
 
 		 163 aa  215  2e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.479243  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2558  Peroxiredoxin  63.06 
 
 		 162 aa  215  2e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.177554  normal  0.095865 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14340  glutathione peroxidase  62.73 
 
 		 166 aa  214  5.9999999999999996e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1812  Peroxiredoxin  61.73 
 
 		 162 aa  213  9.999999999999999e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00250469  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6518  Peroxiredoxin  63.12 
 
 		 161 aa  208  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4894  Peroxiredoxin  62.96 
 
 		 164 aa  201  5e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5382  Peroxiredoxin  58.06 
 
 		 179 aa  199  1.9999999999999998e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.0000126467  normal  0.555193 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1247  Glutathione peroxidase  58.28 
 
 		 163 aa  198  3e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0148462  normal  0.0739839 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2759  glutathione peroxidase  58.71 
 
 		 210 aa  197  7e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0137  glutathione peroxidase  58.75 
 
 		 162 aa  192  1e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.167473  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3641  peroxiredoxin  60.12 
 
 		 161 aa  191  3e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1201  Glutathione peroxidase  55.77 
 
 		 160 aa  191  4e-48  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0952342  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4682  glutathione peroxidase  57.67 
 
 		 160 aa  190  7e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53420  glutathione peroxidase  57.67 
 
 		 160 aa  189  2e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.31883  normal  0.0505345 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0883  glutathione peroxidase  57.06 
 
 		 160 aa  186  1e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.961514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0559  glutathione peroxidase  56.52 
 
 		 161 aa  186  1e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02660  glutathione peroxidase  58.11 
 
 		 158 aa  185  2e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0802  peroxiredoxin  57.06 
 
 		 160 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.033017 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3995  Peroxiredoxin  53.7 
 
 		 164 aa  181  3e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.083987 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0777  glutathione peroxidase, putative  56.44 
 
 		 160 aa  180  8.000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1832  putative glutathione peroxidase  49.16 
 
 		 183 aa  179  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2004  putative glutathione peroxidase  49.16 
 
 		 183 aa  179  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.375271 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1469  putative glutathione peroxidase  49.16 
 
 		 183 aa  179  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2909  Peroxiredoxin  56.49 
 
 		 198 aa  179  1e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0816  glutathione peroxidase  56.44 
 
 		 160 aa  179  1e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1010  glutathione peroxidase  56.44 
 
 		 162 aa  179  2e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4413  glutathione peroxidase  55.21 
 
 		 160 aa  178  2e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.312074  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41100  Glutathione peroxidase  55.21 
 
 		 160 aa  178  2e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.341833  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1452  putative glutathione peroxidase  49.16 
 
 		 183 aa  178  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1436  putative glutathione peroxidase  48.6 
 
 		 183 aa  177  5.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0293827 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0020  glutathione peroxidase  54.55 
 
 		 168 aa  177  7e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1732  putative glutathione peroxidase  51.74 
 
 		 183 aa  176  1e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.305422 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0697  Glutathione peroxidase  56.96 
 
 		 170 aa  175  2e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0671  glutathione peroxidase  56.6 
 
 		 164 aa  172  9.999999999999999e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.131867  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2428  putative glutathione peroxidase  50.28 
 
 		 183 aa  172  9.999999999999999e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.182778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1929  putative glutathione peroxidase  50.28 
 
 		 183 aa  172  9.999999999999999e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000186844  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1480  putative glutathione peroxidase  50.28 
 
 		 183 aa  172  9.999999999999999e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.854221 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1921  putative glutathione peroxidase  50.28 
 
 		 183 aa  172  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.449589 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1790  putative glutathione peroxidase  50.28 
 
 		 183 aa  171  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.799217  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1781  glutathione peroxidase family protein  53.16 
 
 		 161 aa  171  5e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1214  glutathione peroxidase  52.26 
 
 		 167 aa  170  6.999999999999999e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2756  glutathione peroxidase  55.28 
 
 		 158 aa  170  6.999999999999999e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.447473  hitchhiker  0.0000941143 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2683  Peroxiredoxin  53.12 
 
 		 160 aa  170  7.999999999999999e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.299838  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2329  putative glutathione peroxidase  53.75 
 
 		 161 aa  169  1e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.509466  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1914  putative glutathione peroxidase  49.72 
 
 		 183 aa  169  1e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27520  putative glutathione peroxidase  52.2 
 
 		 161 aa  169  1e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.78279  normal  0.0357307 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01679  predicted glutathione peroxidase  49.16 
 
 		 183 aa  169  2e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0313558  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1932  Glutathione peroxidase  49.16 
 
 		 183 aa  169  2e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0263246  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3613  glutathione peroxidase  51.9 
 
 		 161 aa  169  2e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.374005  normal  0.319321 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01668  hypothetical protein  49.16 
 
 		 183 aa  169  2e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0174889  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1909  peroxiredoxin  52.17 
 
 		 161 aa  168  2e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.154084  normal  0.204796 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1172  glutathione peroxidase family protein  57.06 
 
 		 162 aa  168  3e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2454  Peroxiredoxin  52.17 
 
 		 160 aa  167  5e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0184161  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30390  glutathione peroxidase  50.97 
 
 		 173 aa  167  6e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02770  glutathione peroxidase  53.38 
 
 		 160 aa  165  2e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.359164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3981  glutathione peroxidase  52.2 
 
 		 161 aa  166  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.890862  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2152  putative glutathione peroxidase  47.75 
 
 		 183 aa  165  2e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2774  putative glutathione peroxidase  46.93 
 
 		 183 aa  165  2e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.956503  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2478  glutathione peroxidase  49.08 
 
 		 164 aa  164  2.9999999999999998e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.290642 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1334  Peroxiredoxin  50.67 
 
 		 169 aa  164  4e-40  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0131674  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2699  glutathione peroxidase  54.25 
 
 		 160 aa  164  4e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1199  glutathione peroxidase  46.63 
 
 		 182 aa  163  1.0000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0894577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0265  Peroxiredoxin  52.15 
 
 		 165 aa  162  1.0000000000000001e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000231119  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2472  Glutathione peroxidase  52.63 
 
 		 159 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.161656  decreased coverage  0.0000149935 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2131  glutathione peroxidase  50.92 
 
 		 160 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2504  Glutathione peroxidase  49.07 
 
 		 165 aa  162  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.718008 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1965  glutathione peroxidase  50.92 
 
 		 160 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0718131  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00658  glutathione peroxidase  50 
 
 		 161 aa  161  4.0000000000000004e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0965068  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2461  glutathione peroxidase  47.4 
 
 		 177 aa  160  6e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0250  glutathione peroxidase  52.15 
 
 		 164 aa  160  6e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3184  glutathione peroxidase  49.37 
 
 		 160 aa  160  6e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3507  glutathione peroxidase  48.84 
 
 		 204 aa  160  7e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.721934  normal  0.622585 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2202  glutathione peroxidase  50.31 
 
 		 161 aa  160  9e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0177431  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2271  glutathione peroxidase  50.31 
 
 		 160 aa  159  1e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2910  Glutathione peroxidase  47.83 
 
 		 165 aa  160  1e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1665  glutathione peroxidase  51.32 
 
 		 159 aa  159  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0389024 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1449  glutathione peroxidase  50.67 
 
 		 162 aa  159  1e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00937829  normal  0.354884 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1080  glutathione peroxidase  49.08 
 
 		 164 aa  159  1e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000852506  normal  0.679739 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1721  putative glutathione peroxidase  46.33 
 
 		 184 aa  159  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.326937  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1829  putative glutathione peroxidase  46.33 
 
 		 184 aa  159  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2615  putative glutathione peroxidase  46.33 
 
 		 184 aa  159  2e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1874  glutathione peroxidase  49.66 
 
 		 162 aa  158  3e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0631469  normal  0.307231 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1971  glutathione peroxidase  49.69 
 
 		 160 aa  158  3e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.775227  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15450  Glutathione peroxidase  50.32 
 
 		 158 aa  158  3e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0674744  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2119  glutathione peroxidase  49.69 
 
 		 160 aa  158  3e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2468  putative glutathione peroxidase  45.25 
 
 		 183 aa  158  3e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.157307  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1950  glutathione peroxidase  49.69 
 
 		 160 aa  158  4e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.210596  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0137  glutathione peroxidase  48.1 
 
 		 169 aa  157  4e-38  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2154  glutathione peroxidase  49.69 
 
 		 160 aa  158  4e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2674  putative glutathione peroxidase protein  47.2 
 
 		 165 aa  157  5e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.552039 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1926  glutathione peroxidase  49.69 
 
 		 160 aa  157  5e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2067  glutathione peroxidase  49.69 
 
 		 159 aa  157  5e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>