More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_14340 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_14340  glutathione peroxidase  100 
 
 		 166 aa  342  1e-93  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6245  Glutathione peroxidase  68.52 
 
 		 163 aa  239  9e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.479243  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2558  Peroxiredoxin  66.04 
 
 		 162 aa  234  5.0000000000000005e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.177554  normal  0.095865 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1015  Glutathione peroxidase  66.04 
 
 		 162 aa  227  4e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0150707 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4940  glutathione peroxidase  62.42 
 
 		 165 aa  221  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.232541 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4557  glutathione peroxidase  62.42 
 
 		 165 aa  221  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4645  glutathione peroxidase  62.42 
 
 		 165 aa  221  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6518  Peroxiredoxin  64.74 
 
 		 161 aa  215  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3617  Peroxiredoxin  62.73 
 
 		 163 aa  214  5.9999999999999996e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.78044  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5134  glutathione peroxidase  61.82 
 
 		 165 aa  213  9.999999999999999e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5382  Peroxiredoxin  62.09 
 
 		 179 aa  213  9.999999999999999e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.0000126467  normal  0.555193 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2759  glutathione peroxidase  64.71 
 
 		 210 aa  207  6e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4894  Peroxiredoxin  62.58 
 
 		 164 aa  206  9e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1812  Peroxiredoxin  59.01 
 
 		 162 aa  204  6e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00250469  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0845  Peroxiredoxin  67.41 
 
 		 179 aa  202  2e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.494379  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1619  glutathione peroxidase  60.62 
 
 		 164 aa  201  3e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0137  glutathione peroxidase  58.39 
 
 		 162 aa  199  9.999999999999999e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.167473  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1247  Glutathione peroxidase  56.88 
 
 		 163 aa  194  3e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0148462  normal  0.0739839 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3641  peroxiredoxin  56.36 
 
 		 161 aa  189  1e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4682  glutathione peroxidase  57.93 
 
 		 160 aa  189  2e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0777  glutathione peroxidase, putative  55.76 
 
 		 160 aa  187  4e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1201  Glutathione peroxidase  58.33 
 
 		 160 aa  187  4e-47  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0952342  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0816  glutathione peroxidase  55.76 
 
 		 160 aa  186  1e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53420  glutathione peroxidase  57.32 
 
 		 160 aa  186  1e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.31883  normal  0.0505345 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02660  glutathione peroxidase  54.04 
 
 		 158 aa  184  4e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1334  Peroxiredoxin  54.61 
 
 		 169 aa  184  4e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0131674  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4413  glutathione peroxidase  54.27 
 
 		 160 aa  184  5e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.312074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0802  peroxiredoxin  54.88 
 
 		 160 aa  183  8e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.033017 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0883  glutathione peroxidase  54.55 
 
 		 160 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.961514  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1010  glutathione peroxidase  52.69 
 
 		 162 aa  181  3e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1732  putative glutathione peroxidase  49.45 
 
 		 183 aa  181  5.0000000000000004e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.305422 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1655  Peroxiredoxin  54.55 
 
 		 183 aa  179  1e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.401167  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41100  Glutathione peroxidase  54.27 
 
 		 160 aa  179  1e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.341833  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2004  putative glutathione peroxidase  47.25 
 
 		 183 aa  179  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.375271 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1469  putative glutathione peroxidase  47.25 
 
 		 183 aa  179  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2774  putative glutathione peroxidase  49.17 
 
 		 183 aa  177  4e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.956503  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01679  predicted glutathione peroxidase  47.83 
 
 		 183 aa  177  4.999999999999999e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0313558  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1932  Glutathione peroxidase  47.83 
 
 		 183 aa  177  4.999999999999999e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0263246  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01668  hypothetical protein  47.83 
 
 		 183 aa  177  4.999999999999999e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0174889  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1452  putative glutathione peroxidase  46.7 
 
 		 183 aa  177  5.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1832  putative glutathione peroxidase  46.7 
 
 		 183 aa  177  8e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1214  glutathione peroxidase  52.2 
 
 		 167 aa  176  1e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1436  putative glutathione peroxidase  46.7 
 
 		 183 aa  176  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0293827 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1921  putative glutathione peroxidase  47.28 
 
 		 183 aa  175  2e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.449589 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1790  putative glutathione peroxidase  47.28 
 
 		 183 aa  175  2e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.799217  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0020  glutathione peroxidase  56.95 
 
 		 168 aa  174  3e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2756  glutathione peroxidase  53.46 
 
 		 158 aa  174  4e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.447473  hitchhiker  0.0000941143 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0559  glutathione peroxidase  52.8 
 
 		 161 aa  174  5e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2428  putative glutathione peroxidase  47.28 
 
 		 183 aa  174  6e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.182778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2152  putative glutathione peroxidase  49.46 
 
 		 183 aa  174  6e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1929  putative glutathione peroxidase  47.28 
 
 		 183 aa  173  7e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000186844  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1480  putative glutathione peroxidase  47.28 
 
 		 183 aa  173  7e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.854221 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2329  putative glutathione peroxidase  55 
 
 		 161 aa  173  9e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.509466  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1315  glutathione peroxidase  50 
 
 		 173 aa  173  9e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1570  Glutathione peroxidase  49.69 
 
 		 158 aa  173  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2468  putative glutathione peroxidase  48.07 
 
 		 183 aa  172  9.999999999999999e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.157307  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0265  Peroxiredoxin  50.31 
 
 		 165 aa  173  9.999999999999999e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000231119  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1721  putative glutathione peroxidase  51.43 
 
 		 184 aa  172  1.9999999999999998e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.326937  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1829  putative glutathione peroxidase  51.43 
 
 		 184 aa  172  1.9999999999999998e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2615  putative glutathione peroxidase  51.43 
 
 		 184 aa  172  1.9999999999999998e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1626  Peroxiredoxin  49.16 
 
 		 183 aa  172  1.9999999999999998e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4022  Glutathione peroxidase  50 
 
 		 181 aa  171  3.9999999999999995e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.350366 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1199  glutathione peroxidase  48.89 
 
 		 182 aa  171  5e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0894577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3470  glutathione peroxidase  53.42 
 
 		 158 aa  170  6.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1914  putative glutathione peroxidase  46.74 
 
 		 183 aa  170  6.999999999999999e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3507  glutathione peroxidase  51.43 
 
 		 204 aa  169  1e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.721934  normal  0.622585 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30390  glutathione peroxidase  50.6 
 
 		 173 aa  170  1e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1242  glutathione peroxidase  50.31 
 
 		 159 aa  169  1e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0697  Glutathione peroxidase  57.66 
 
 		 170 aa  168  4e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1909  peroxiredoxin  52.26 
 
 		 161 aa  168  4e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.154084  normal  0.204796 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2683  Peroxiredoxin  49.69 
 
 		 160 aa  168  4e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.299838  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1172  glutathione peroxidase family protein  53.61 
 
 		 162 aa  167  5e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1897  glutathione peroxidase  52.5 
 
 		 158 aa  167  5e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27520  putative glutathione peroxidase  50.94 
 
 		 161 aa  167  5e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.78279  normal  0.0357307 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1090  glutathione peroxidase  51.52 
 
 		 160 aa  167  8e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.37333 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4077  glutathione peroxidase  50.93 
 
 		 162 aa  166  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.629032 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3995  Peroxiredoxin  54.43 
 
 		 164 aa  166  1e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.083987 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2909  Peroxiredoxin  48.08 
 
 		 198 aa  165  2e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2472  Glutathione peroxidase  50.62 
 
 		 159 aa  165  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.161656  decreased coverage  0.0000149935 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1449  glutathione peroxidase  50.31 
 
 		 162 aa  165  2e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00937829  normal  0.354884 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0238  Peroxiredoxin  48 
 
 		 170 aa  166  2e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0841  glutathione peroxidase  54.86 
 
 		 164 aa  165  2.9999999999999998e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0436995  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3267  glutathione peroxidase  51.27 
 
 		 158 aa  164  2.9999999999999998e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2764  glutathione peroxidase  46.94 
 
 		 161 aa  165  2.9999999999999998e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0187221  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2067  glutathione peroxidase  50 
 
 		 159 aa  164  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1874  glutathione peroxidase  49.38 
 
 		 162 aa  164  4e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0631469  normal  0.307231 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1936  glutathione peroxidase  50 
 
 		 159 aa  164  5e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.634874 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6295  glutathione peroxidase  52.35 
 
 		 162 aa  164  5.9999999999999996e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03223  glutathione peroxidase  50 
 
 		 181 aa  164  5.9999999999999996e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2597  Peroxiredoxin  48.75 
 
 		 158 aa  164  5.9999999999999996e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1965  glutathione peroxidase  48.37 
 
 		 160 aa  163  8e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0718131  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4148  Glutathione peroxidase  51.25 
 
 		 158 aa  163  8e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.784559  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3841  glutathione peroxidase  48.12 
 
 		 162 aa  163  9e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0688357  normal  0.342172 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3973  Peroxiredoxin  46.15 
 
 		 165 aa  163  9e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000360978 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01902  probable glutathione peroxidase  50.34 
 
 		 165 aa  163  9e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.101099  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2131  glutathione peroxidase  48.37 
 
 		 160 aa  163  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1971  glutathione peroxidase  49.02 
 
 		 160 aa  163  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.775227  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1483  glutathione peroxidase  48.45 
 
 		 162 aa  163  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2119  glutathione peroxidase  49.02 
 
 		 160 aa  163  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3925  Glutathione peroxidase  46.15 
 
 		 165 aa  163  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>