More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4894 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4894  Peroxiredoxin  100 
 
 		 164 aa  335  9.999999999999999e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4557  glutathione peroxidase  68.1 
 
 		 165 aa  222  2e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4940  glutathione peroxidase  68.1 
 
 		 165 aa  222  2e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.232541 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4645  glutathione peroxidase  68.1 
 
 		 165 aa  222  2e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0845  Peroxiredoxin  64.81 
 
 		 179 aa  211  2.9999999999999995e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.494379  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2558  Peroxiredoxin  64.78 
 
 		 162 aa  211  4.9999999999999996e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.177554  normal  0.095865 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1619  glutathione peroxidase  65.84 
 
 		 164 aa  209  9e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6245  Glutathione peroxidase  64.15 
 
 		 163 aa  209  1e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.479243  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5134  glutathione peroxidase  64.46 
 
 		 165 aa  208  3e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14340  glutathione peroxidase  62.58 
 
 		 166 aa  206  8e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1015  Glutathione peroxidase  62.26 
 
 		 162 aa  205  3e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0150707 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1247  Glutathione peroxidase  64.2 
 
 		 163 aa  202  2e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0148462  normal  0.0739839 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3617  Peroxiredoxin  62.96 
 
 		 163 aa  201  5e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.78044  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6518  Peroxiredoxin  63.82 
 
 		 161 aa  200  6e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5382  Peroxiredoxin  59.49 
 
 		 179 aa  199  9.999999999999999e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.0000126467  normal  0.555193 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0137  glutathione peroxidase  59.62 
 
 		 162 aa  197  5e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.167473  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1812  Peroxiredoxin  59.63 
 
 		 162 aa  196  1.0000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00250469  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2759  glutathione peroxidase  55.97 
 
 		 210 aa  187  5e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3641  peroxiredoxin  55.56 
 
 		 161 aa  175  3e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0883  glutathione peroxidase  54.32 
 
 		 160 aa  174  6e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.961514  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3995  Peroxiredoxin  56.79 
 
 		 164 aa  172  9.999999999999999e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.083987 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4413  glutathione peroxidase  53.7 
 
 		 160 aa  172  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.312074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1732  putative glutathione peroxidase  48.89 
 
 		 183 aa  172  9.999999999999999e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.305422 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1832  putative glutathione peroxidase  47.8 
 
 		 183 aa  171  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2004  putative glutathione peroxidase  47.8 
 
 		 183 aa  171  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.375271 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1469  putative glutathione peroxidase  47.8 
 
 		 183 aa  171  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1010  glutathione peroxidase  54.94 
 
 		 162 aa  170  9e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0802  peroxiredoxin  54.32 
 
 		 160 aa  170  9e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.033017 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4682  glutathione peroxidase  53.7 
 
 		 160 aa  170  9e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1436  putative glutathione peroxidase  47.25 
 
 		 183 aa  168  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0293827 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53420  glutathione peroxidase  53.7 
 
 		 160 aa  169  2e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.31883  normal  0.0505345 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1452  putative glutathione peroxidase  47.8 
 
 		 183 aa  169  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0777  glutathione peroxidase, putative  53.7 
 
 		 160 aa  168  3e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2597  Peroxiredoxin  56.21 
 
 		 158 aa  168  3e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1201  Glutathione peroxidase  55.41 
 
 		 160 aa  167  4e-41  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0952342  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0816  glutathione peroxidase  53.7 
 
 		 160 aa  167  5e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2909  Peroxiredoxin  52.23 
 
 		 198 aa  164  4e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0559  glutathione peroxidase  52.47 
 
 		 161 aa  164  4e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41100  Glutathione peroxidase  53.09 
 
 		 160 aa  164  5e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.341833  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0020  glutathione peroxidase  54.27 
 
 		 168 aa  164  5.9999999999999996e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1334  Peroxiredoxin  50 
 
 		 169 aa  162  2.0000000000000002e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0131674  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1570  Glutathione peroxidase  53.74 
 
 		 158 aa  162  3e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1921  putative glutathione peroxidase  45.05 
 
 		 183 aa  162  3e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.449589 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2329  putative glutathione peroxidase  54.04 
 
 		 161 aa  161  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.509466  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1790  putative glutathione peroxidase  45.05 
 
 		 183 aa  161  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.799217  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02660  glutathione peroxidase  53.09 
 
 		 158 aa  161  4.0000000000000004e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01679  predicted glutathione peroxidase  45.05 
 
 		 183 aa  160  7e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0313558  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1932  Glutathione peroxidase  45.05 
 
 		 183 aa  160  7e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0263246  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01668  hypothetical protein  45.05 
 
 		 183 aa  160  7e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0174889  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0697  Glutathione peroxidase  53.95 
 
 		 170 aa  160  8.000000000000001e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2756  glutathione peroxidase  50.94 
 
 		 158 aa  160  9e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.447473  hitchhiker  0.0000941143 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1480  putative glutathione peroxidase  45.05 
 
 		 183 aa  159  1e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.854221 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1929  putative glutathione peroxidase  45.05 
 
 		 183 aa  159  1e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000186844  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2428  putative glutathione peroxidase  46.41 
 
 		 183 aa  159  1e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.182778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0118  glutathione peroxidase  50.31 
 
 		 160 aa  159  1e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1781  glutathione peroxidase family protein  50.93 
 
 		 161 aa  159  2e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30390  glutathione peroxidase  49.7 
 
 		 173 aa  158  2e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0123  glutathione peroxidase  50.31 
 
 		 161 aa  159  2e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1172  glutathione peroxidase family protein  54.32 
 
 		 162 aa  158  3e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1242  glutathione peroxidase  49.08 
 
 		 159 aa  158  3e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27520  putative glutathione peroxidase  51.25 
 
 		 161 aa  158  3e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.78279  normal  0.0357307 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2774  putative glutathione peroxidase  47.73 
 
 		 183 aa  158  4e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.956503  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2468  putative glutathione peroxidase  47.16 
 
 		 183 aa  157  4e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.157307  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0671  glutathione peroxidase  53.12 
 
 		 164 aa  157  5e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.131867  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1665  glutathione peroxidase  50 
 
 		 159 aa  157  8e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0389024 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1914  putative glutathione peroxidase  44.51 
 
 		 183 aa  156  1e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1909  peroxiredoxin  49.69 
 
 		 161 aa  156  1e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.154084  normal  0.204796 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2067  glutathione peroxidase  49.69 
 
 		 159 aa  156  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1936  glutathione peroxidase  49.69 
 
 		 159 aa  155  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.634874 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3981  glutathione peroxidase  49.69 
 
 		 161 aa  155  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.890862  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2171  glutathione peroxidase  52.98 
 
 		 161 aa  155  2e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0779752 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2472  Glutathione peroxidase  50.61 
 
 		 159 aa  155  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.161656  decreased coverage  0.0000149935 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3613  glutathione peroxidase  50.31 
 
 		 161 aa  155  3e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.374005  normal  0.319321 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6042  glutathione peroxidase  49.08 
 
 		 159 aa  155  3e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2054  glutathione peroxidase  49.08 
 
 		 159 aa  155  3e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2035  glutathione peroxidase  49.08 
 
 		 159 aa  155  3e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1354  glutathione peroxidase  50.67 
 
 		 162 aa  154  4e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.525114 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3507  glutathione peroxidase  48.84 
 
 		 204 aa  154  4e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.721934  normal  0.622585 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5344  glutathione peroxidase  49.08 
 
 		 159 aa  154  4e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.213102 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4148  Glutathione peroxidase  50.66 
 
 		 158 aa  154  6e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.784559  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1655  Peroxiredoxin  47.22 
 
 		 183 aa  153  9e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.401167  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3925  Glutathione peroxidase  45.64 
 
 		 165 aa  153  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3470  glutathione peroxidase  50.66 
 
 		 158 aa  153  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4117  Peroxiredoxin  53.42 
 
 		 182 aa  152  1e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3973  Peroxiredoxin  44.97 
 
 		 165 aa  152  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000360978 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1483  glutathione peroxidase  51.85 
 
 		 162 aa  152  2e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3253  Peroxiredoxin  52.15 
 
 		 164 aa  152  2e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.350236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2152  putative glutathione peroxidase  43.89 
 
 		 183 aa  152  2e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2660  Glutathione peroxidase  48.77 
 
 		 159 aa  152  2e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0609505 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1829  putative glutathione peroxidase  48.45 
 
 		 184 aa  152  2.9999999999999998e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1897  glutathione peroxidase  49.34 
 
 		 158 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2615  putative glutathione peroxidase  48.45 
 
 		 184 aa  152  2.9999999999999998e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1721  putative glutathione peroxidase  48.45 
 
 		 184 aa  152  2.9999999999999998e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.326937  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0238  Peroxiredoxin  44.97 
 
 		 170 aa  151  2.9999999999999998e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4022  Glutathione peroxidase  48.85 
 
 		 181 aa  151  2.9999999999999998e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.350366 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2639  glutathione peroxidase  50 
 
 		 158 aa  151  4e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.833403 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00658  glutathione peroxidase  48.15 
 
 		 161 aa  151  5e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0965068  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2798  glutathione peroxidase  46.91 
 
 		 164 aa  150  5e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1626  Peroxiredoxin  46.11 
 
 		 183 aa  151  5e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2934  glutathione peroxidase  47.53 
 
 		 164 aa  151  5e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0465616  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>