More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3995 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_3995  Peroxiredoxin  100 
 
 		 164 aa  342  2e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.083987 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2478  glutathione peroxidase  59.38 
 
 		 164 aa  221  4.9999999999999996e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.290642 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1247  Glutathione peroxidase  58.02 
 
 		 163 aa  189  1e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0148462  normal  0.0739839 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0671  glutathione peroxidase  55.9 
 
 		 164 aa  188  2.9999999999999997e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.131867  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1619  glutathione peroxidase  55.62 
 
 		 164 aa  182  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3617  Peroxiredoxin  53.7 
 
 		 163 aa  181  3e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.78044  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0845  Peroxiredoxin  54.04 
 
 		 179 aa  180  8.000000000000001e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.494379  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2558  Peroxiredoxin  55.41 
 
 		 162 aa  177  8e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.177554  normal  0.095865 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5134  glutathione peroxidase  53.66 
 
 		 165 aa  177  8e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4940  glutathione peroxidase  54.04 
 
 		 165 aa  176  2e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.232541 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4557  glutathione peroxidase  54.04 
 
 		 165 aa  176  2e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1015  Glutathione peroxidase  53.46 
 
 		 162 aa  176  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0150707 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4645  glutathione peroxidase  54.04 
 
 		 165 aa  176  2e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5382  Peroxiredoxin  54.14 
 
 		 179 aa  173  8e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.0000126467  normal  0.555193 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1812  Peroxiredoxin  53.5 
 
 		 162 aa  173  9.999999999999999e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00250469  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4894  Peroxiredoxin  56.79 
 
 		 164 aa  172  9.999999999999999e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6245  Glutathione peroxidase  52.2 
 
 		 163 aa  171  2.9999999999999996e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.479243  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0559  glutathione peroxidase  55.9 
 
 		 161 aa  171  2.9999999999999996e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6518  Peroxiredoxin  54.49 
 
 		 161 aa  169  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14340  glutathione peroxidase  54.43 
 
 		 166 aa  166  1e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4682  glutathione peroxidase  50.31 
 
 		 160 aa  156  1e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53420  glutathione peroxidase  50.93 
 
 		 160 aa  156  1e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.31883  normal  0.0505345 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0137  glutathione peroxidase  50.62 
 
 		 162 aa  156  1e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.167473  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3641  peroxiredoxin  51.55 
 
 		 161 aa  155  2e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1201  Glutathione peroxidase  53.33 
 
 		 160 aa  155  3e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0952342  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0697  Glutathione peroxidase  53.42 
 
 		 170 aa  154  6e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1452  putative glutathione peroxidase  48.26 
 
 		 183 aa  154  7e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1199  glutathione peroxidase  46.63 
 
 		 182 aa  152  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0894577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1469  putative glutathione peroxidase  48.26 
 
 		 183 aa  152  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1832  putative glutathione peroxidase  48.26 
 
 		 183 aa  152  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2759  glutathione peroxidase  52.9 
 
 		 210 aa  152  2e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2004  putative glutathione peroxidase  48.26 
 
 		 183 aa  152  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.375271 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4413  glutathione peroxidase  49.07 
 
 		 160 aa  152  2e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.312074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2428  putative glutathione peroxidase  47.93 
 
 		 183 aa  150  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.182778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0883  glutathione peroxidase  48.45 
 
 		 160 aa  150  7e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.961514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1480  putative glutathione peroxidase  47.34 
 
 		 183 aa  149  1e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.854221 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1436  putative glutathione peroxidase  47.67 
 
 		 183 aa  150  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0293827 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1790  putative glutathione peroxidase  47.34 
 
 		 183 aa  149  1e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.799217  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1929  putative glutathione peroxidase  47.34 
 
 		 183 aa  149  1e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000186844  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1921  putative glutathione peroxidase  47.93 
 
 		 183 aa  149  2e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.449589 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0777  glutathione peroxidase, putative  48.45 
 
 		 160 aa  148  3e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1655  Peroxiredoxin  45.81 
 
 		 183 aa  148  3e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.401167  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01679  predicted glutathione peroxidase  47.34 
 
 		 183 aa  148  4e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0313558  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1932  Glutathione peroxidase  47.34 
 
 		 183 aa  148  4e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0263246  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02660  glutathione peroxidase  50.31 
 
 		 158 aa  148  4e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0816  glutathione peroxidase  48.45 
 
 		 160 aa  148  4e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01668  hypothetical protein  47.34 
 
 		 183 aa  148  4e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0174889  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0802  peroxiredoxin  48.45 
 
 		 160 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.033017 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41100  Glutathione peroxidase  49.07 
 
 		 160 aa  146  1.0000000000000001e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.341833  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1914  putative glutathione peroxidase  46.75 
 
 		 183 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2152  putative glutathione peroxidase  45.14 
 
 		 183 aa  145  2.0000000000000003e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0020  glutathione peroxidase  47.59 
 
 		 168 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3507  glutathione peroxidase  48.57 
 
 		 204 aa  145  3e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.721934  normal  0.622585 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1626  Peroxiredoxin  45.25 
 
 		 183 aa  142  2e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2756  glutathione peroxidase  50.36 
 
 		 158 aa  141  4e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.447473  hitchhiker  0.0000941143 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1732  putative glutathione peroxidase  44.94 
 
 		 183 aa  141  4e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.305422 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1334  Peroxiredoxin  50 
 
 		 169 aa  140  5e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0131674  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2774  putative glutathione peroxidase  44.69 
 
 		 183 aa  140  6e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.956503  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1010  glutathione peroxidase  46.58 
 
 		 162 aa  140  9e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1214  glutathione peroxidase  48.08 
 
 		 167 aa  140  9.999999999999999e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0324  Glutathione peroxidase  50 
 
 		 165 aa  137  6e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.324106  normal  0.0807721 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1080  glutathione peroxidase  44.44 
 
 		 164 aa  137  7.999999999999999e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000852506  normal  0.679739 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1897  glutathione peroxidase  46.71 
 
 		 158 aa  135  2e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0565  glutathione peroxidase  46.02 
 
 		 182 aa  135  2e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02770  glutathione peroxidase  46.63 
 
 		 160 aa  135  2e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.359164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1315  glutathione peroxidase  46.15 
 
 		 173 aa  135  3.0000000000000003e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2468  putative glutathione peroxidase  43.02 
 
 		 183 aa  134  4e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.157307  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1570  Glutathione peroxidase  45.75 
 
 		 158 aa  134  6.0000000000000005e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2453  glutathione peroxidase  48.67 
 
 		 158 aa  134  7.000000000000001e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.70182 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3613  glutathione peroxidase  45.91 
 
 		 161 aa  133  8e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.374005  normal  0.319321 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20841  glutathione peroxidase  44.65 
 
 		 158 aa  134  8e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3981  glutathione peroxidase  46.36 
 
 		 161 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.890862  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2461  glutathione peroxidase  41.81 
 
 		 177 aa  132  9.999999999999999e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2329  putative glutathione peroxidase  44.72 
 
 		 161 aa  132  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.509466  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1781  glutathione peroxidase family protein  46.58 
 
 		 161 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01222  ABC transporter vitamin B12 uptake permease  51.43 
 
 		 185 aa  132  1.9999999999999998e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.039958  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0956  glutathione peroxidase  45.33 
 
 		 168 aa  132  1.9999999999999998e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1771  glutathione peroxidase  46 
 
 		 161 aa  132  1.9999999999999998e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4148  Glutathione peroxidase  47.68 
 
 		 158 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.784559  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1209  glutathione peroxidase  43.4 
 
 		 158 aa  132  3e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01902  probable glutathione peroxidase  42.77 
 
 		 165 aa  132  3e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.101099  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2764  glutathione peroxidase  42.58 
 
 		 161 aa  132  3e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0187221  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3841  glutathione peroxidase  44.38 
 
 		 162 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0688357  normal  0.342172 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3470  glutathione peroxidase  45.7 
 
 		 158 aa  131  5e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27520  putative glutathione peroxidase  44.1 
 
 		 161 aa  130  6e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.78279  normal  0.0357307 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30390  glutathione peroxidase  42.26 
 
 		 173 aa  130  6.999999999999999e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1909  peroxiredoxin  45.03 
 
 		 161 aa  130  6.999999999999999e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.154084  normal  0.204796 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1874  glutathione peroxidase  43.75 
 
 		 162 aa  130  7.999999999999999e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0631469  normal  0.307231 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1242  glutathione peroxidase  45.96 
 
 		 159 aa  130  9e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1172  glutathione peroxidase family protein  47.2 
 
 		 162 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0238  Peroxiredoxin  42.57 
 
 		 170 aa  129  1.0000000000000001e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7246  glutathione peroxidase  43.26 
 
 		 182 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.156193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0270  glutathione peroxidase  45.33 
 
 		 158 aa  129  1.0000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2683  Peroxiredoxin  45.64 
 
 		 160 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.299838  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1257  glutathione peroxidase  41.24 
 
 		 182 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2011  glutathione peroxidase  45.4 
 
 		 159 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0261647  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0484  glutathione peroxidase  43.24 
 
 		 161 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03223  glutathione peroxidase  45.14 
 
 		 181 aa  129  2.0000000000000002e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1075  glutathione peroxidase  44 
 
 		 168 aa  129  2.0000000000000002e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.364498  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0446  Glutathione peroxidase  47.01 
 
 		 157 aa  128  3e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000054357  normal  0.0344695 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>