More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1209 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1209  glutathione peroxidase  100 
 
 
158 aa  324  3e-88  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20841  glutathione peroxidase  97.47 
 
 
158 aa  318  1.9999999999999998e-86  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01621  glutathione peroxidase  63.29 
 
 
159 aa  217  7e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0091  glutathione peroxidase  60.51 
 
 
174 aa  209  2e-53  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0137  glutathione peroxidase  61.64 
 
 
169 aa  200  6e-51  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1016  glutathione peroxidase  56.96 
 
 
159 aa  194  4.0000000000000005e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0391982  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11881  glutathione peroxidase  56.33 
 
 
159 aa  189  1e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.431432  normal  0.0622646 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10951  glutathione peroxidase  53.8 
 
 
159 aa  188  2.9999999999999997e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.960114  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10951  glutathione peroxidase  54.43 
 
 
159 aa  187  4e-47  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10911  glutathione peroxidase  51.9 
 
 
159 aa  177  4.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.604809  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1214  glutathione peroxidase  50 
 
 
167 aa  173  8e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2558  Peroxiredoxin  46.25 
 
 
162 aa  158  2e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.177554  normal  0.095865 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6245  Glutathione peroxidase  44.38 
 
 
163 aa  155  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.479243  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2909  Peroxiredoxin  45.22 
 
 
198 aa  152  1e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14340  glutathione peroxidase  44.3 
 
 
166 aa  152  2e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0697  Glutathione peroxidase  51.41 
 
 
170 aa  151  4e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6518  Peroxiredoxin  45.34 
 
 
161 aa  151  4e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1812  Peroxiredoxin  43.12 
 
 
162 aa  150  7e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00250469  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5382  Peroxiredoxin  50 
 
 
179 aa  150  8.999999999999999e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.0000126467  normal  0.555193 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4894  Peroxiredoxin  48.92 
 
 
164 aa  149  1e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3617  Peroxiredoxin  44.3 
 
 
163 aa  148  2e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.78044  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0559  glutathione peroxidase  50 
 
 
161 aa  148  3e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1015  Glutathione peroxidase  41.25 
 
 
162 aa  147  8e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0150707 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0020  glutathione peroxidase  46.79 
 
 
168 aa  146  9e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1655  Peroxiredoxin  39.23 
 
 
183 aa  146  1.0000000000000001e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.401167  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3641  peroxiredoxin  46.98 
 
 
161 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1570  Glutathione peroxidase  46.88 
 
 
158 aa  145  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2597  Peroxiredoxin  52.86 
 
 
158 aa  144  3e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2759  glutathione peroxidase  48.53 
 
 
210 aa  145  3e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3507  glutathione peroxidase  40.57 
 
 
204 aa  145  3e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.721934  normal  0.622585 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1199  glutathione peroxidase  42.78 
 
 
182 aa  145  3e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0894577  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4413  glutathione peroxidase  46.98 
 
 
160 aa  145  3e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.312074  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4682  glutathione peroxidase  46.31 
 
 
160 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4940  glutathione peroxidase  45.16 
 
 
165 aa  144  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.232541 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4557  glutathione peroxidase  45.16 
 
 
165 aa  144  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4645  glutathione peroxidase  45.16 
 
 
165 aa  144  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53420  glutathione peroxidase  44.44 
 
 
160 aa  144  6e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.31883  normal  0.0505345 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0883  glutathione peroxidase  45.75 
 
 
160 aa  143  9e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.961514  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1619  glutathione peroxidase  41.98 
 
 
164 aa  143  1e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01222  ABC transporter vitamin B12 uptake permease  48.92 
 
 
185 aa  143  1e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.039958  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0845  Peroxiredoxin  42.77 
 
 
179 aa  143  1e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.494379  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6042  glutathione peroxidase  46.36 
 
 
159 aa  142  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2035  glutathione peroxidase  46.36 
 
 
159 aa  142  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2054  glutathione peroxidase  46.36 
 
 
159 aa  142  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1247  Glutathione peroxidase  42.58 
 
 
163 aa  142  2e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0148462  normal  0.0739839 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1732  putative glutathione peroxidase  41.44 
 
 
183 aa  142  2e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.305422 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0802  peroxiredoxin  46.98 
 
 
160 aa  142  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.033017 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0777  glutathione peroxidase, putative  46.98 
 
 
160 aa  142  3e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0816  glutathione peroxidase  46.98 
 
 
160 aa  141  3e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1246  glutathione peroxidase  50.36 
 
 
192 aa  141  3e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.281187  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1201  Glutathione peroxidase  47.86 
 
 
160 aa  142  3e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0952342  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01902  probable glutathione peroxidase  46.94 
 
 
165 aa  141  4e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.101099  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5344  glutathione peroxidase  47.92 
 
 
159 aa  141  4e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.213102 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1771  glutathione peroxidase  45.64 
 
 
161 aa  140  7e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0841  glutathione peroxidase  43.71 
 
 
164 aa  140  8e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0436995  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1242  glutathione peroxidase  48.61 
 
 
159 aa  140  8e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1926  glutathione peroxidase  47.47 
 
 
160 aa  139  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2329  putative glutathione peroxidase  42.94 
 
 
161 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.509466  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1334  Peroxiredoxin  46.41 
 
 
169 aa  139  9.999999999999999e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0131674  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5134  glutathione peroxidase  41.14 
 
 
165 aa  139  9.999999999999999e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1315  glutathione peroxidase  44.74 
 
 
173 aa  139  1.9999999999999998e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1971  glutathione peroxidase  47.47 
 
 
160 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.775227  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2119  glutathione peroxidase  47.47 
 
 
160 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1626  Peroxiredoxin  39.23 
 
 
183 aa  139  1.9999999999999998e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1721  putative glutathione peroxidase  39.23 
 
 
184 aa  138  3e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.326937  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2011  glutathione peroxidase  42.77 
 
 
159 aa  138  3e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0261647  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2615  putative glutathione peroxidase  39.23 
 
 
184 aa  138  3e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2131  glutathione peroxidase  47.47 
 
 
160 aa  138  3e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1829  putative glutathione peroxidase  39.23 
 
 
184 aa  138  3e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3184  glutathione peroxidase  47.47 
 
 
160 aa  138  3e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0282  Glutathione peroxidase  46.36 
 
 
158 aa  138  3e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0123  glutathione peroxidase  46.9 
 
 
161 aa  138  3e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27520  putative glutathione peroxidase  42.33 
 
 
161 aa  137  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.78279  normal  0.0357307 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2202  glutathione peroxidase  46.84 
 
 
161 aa  137  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0177431  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1965  glutathione peroxidase  46.84 
 
 
160 aa  137  4.999999999999999e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0718131  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2176  glutathione peroxidase  48.59 
 
 
143 aa  137  4.999999999999999e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0884553  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2271  glutathione peroxidase  46.2 
 
 
160 aa  137  6e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1950  glutathione peroxidase  49.31 
 
 
160 aa  137  6e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.210596  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2618  glutathione peroxidase  45.74 
 
 
195 aa  137  6e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.137836  normal  0.142472 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2154  glutathione peroxidase  49.31 
 
 
160 aa  137  6e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1936  glutathione peroxidase  44.37 
 
 
159 aa  136  8.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.634874 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1571  glutathione peroxidase  42.14 
 
 
159 aa  136  1e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.154895  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2510  glutathione peroxidase  42.14 
 
 
159 aa  136  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2472  Glutathione peroxidase  42.77 
 
 
159 aa  135  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.161656  decreased coverage  0.0000149935 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2599  glutathione peroxidase  42.14 
 
 
159 aa  136  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.391635  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2074  glutathione peroxidase  42.14 
 
 
159 aa  136  1e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.895406  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1665  glutathione peroxidase  44.37 
 
 
159 aa  136  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0389024 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2152  putative glutathione peroxidase  38.12 
 
 
183 aa  136  1e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1346  glutathione peroxidase  42.14 
 
 
159 aa  136  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.909183  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1354  glutathione peroxidase  41.61 
 
 
162 aa  136  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.525114 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2454  glutathione peroxidase  42.14 
 
 
159 aa  136  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0273  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2067  glutathione peroxidase  44.37 
 
 
159 aa  136  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3238  glutathione peroxidase  42.14 
 
 
159 aa  136  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.400465  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1563  glutathione peroxidase, putative  41.72 
 
 
162 aa  135  2e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3665  glutathione peroxidase  44.67 
 
 
158 aa  135  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1921  putative glutathione peroxidase  41.1 
 
 
183 aa  135  2e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.449589 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0137  glutathione peroxidase  46.32 
 
 
162 aa  135  2e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.167473  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1790  putative glutathione peroxidase  38.67 
 
 
183 aa  135  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.799217  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1010  glutathione peroxidase  42.48 
 
 
162 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0118  glutathione peroxidase  44 
 
 
160 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>