More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_2478 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_2478  glutathione peroxidase  100 
 
 		 164 aa  344  4e-94  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.290642 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3995  Peroxiredoxin  59.38 
 
 		 164 aa  221  4.9999999999999996e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.083987 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0671  glutathione peroxidase  55.63 
 
 		 164 aa  173  8e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.131867  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1247  Glutathione peroxidase  50.62 
 
 		 163 aa  165  2.9999999999999998e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0148462  normal  0.0739839 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1619  glutathione peroxidase  49.38 
 
 		 164 aa  164  4e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3617  Peroxiredoxin  49.08 
 
 		 163 aa  164  4e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.78044  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5134  glutathione peroxidase  48.48 
 
 		 165 aa  164  4e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1812  Peroxiredoxin  47.83 
 
 		 162 aa  162  1.0000000000000001e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00250469  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6245  Glutathione peroxidase  45.62 
 
 		 163 aa  160  5.0000000000000005e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.479243  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0845  Peroxiredoxin  48.15 
 
 		 179 aa  160  1e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.494379  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4557  glutathione peroxidase  47.27 
 
 		 165 aa  156  1e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4940  glutathione peroxidase  47.27 
 
 		 165 aa  156  1e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.232541 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4645  glutathione peroxidase  47.27 
 
 		 165 aa  156  1e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2558  Peroxiredoxin  46.88 
 
 		 162 aa  154  5.0000000000000005e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.177554  normal  0.095865 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5382  Peroxiredoxin  45.57 
 
 		 179 aa  153  1e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.0000126467  normal  0.555193 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14340  glutathione peroxidase  47.24 
 
 		 166 aa  149  1e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2759  glutathione peroxidase  52.9 
 
 		 210 aa  149  2e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4894  Peroxiredoxin  48.15 
 
 		 164 aa  149  2e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6518  Peroxiredoxin  45.62 
 
 		 161 aa  148  4e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1452  putative glutathione peroxidase  45.51 
 
 		 183 aa  148  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1832  putative glutathione peroxidase  45.51 
 
 		 183 aa  147  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1469  putative glutathione peroxidase  45.51 
 
 		 183 aa  147  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2004  putative glutathione peroxidase  45.51 
 
 		 183 aa  147  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.375271 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0137  glutathione peroxidase  44.59 
 
 		 162 aa  145  2.0000000000000003e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.167473  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0559  glutathione peroxidase  47.53 
 
 		 161 aa  145  3e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1436  putative glutathione peroxidase  44.94 
 
 		 183 aa  144  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0293827 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1015  Glutathione peroxidase  45 
 
 		 162 aa  144  7.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0150707 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4682  glutathione peroxidase  44.72 
 
 		 160 aa  142  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1201  Glutathione peroxidase  47.44 
 
 		 160 aa  142  2e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0952342  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53420  glutathione peroxidase  44.72 
 
 		 160 aa  142  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.31883  normal  0.0505345 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3641  peroxiredoxin  45.34 
 
 		 161 aa  142  3e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0883  glutathione peroxidase  44.72 
 
 		 160 aa  142  3e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.961514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4413  glutathione peroxidase  44.1 
 
 		 160 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.312074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1199  glutathione peroxidase  45 
 
 		 182 aa  139  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0894577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1790  putative glutathione peroxidase  43.1 
 
 		 183 aa  139  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.799217  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1921  putative glutathione peroxidase  43.68 
 
 		 183 aa  138  3e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.449589 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2428  putative glutathione peroxidase  43.1 
 
 		 183 aa  138  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.182778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02660  glutathione peroxidase  44.1 
 
 		 158 aa  137  4.999999999999999e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1929  putative glutathione peroxidase  42.61 
 
 		 183 aa  137  6e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000186844  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1480  putative glutathione peroxidase  42.61 
 
 		 183 aa  137  6e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.854221 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01679  predicted glutathione peroxidase  43.1 
 
 		 183 aa  137  7e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0313558  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1932  Glutathione peroxidase  43.1 
 
 		 183 aa  137  7e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0263246  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01668  hypothetical protein  43.1 
 
 		 183 aa  137  7e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0174889  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0777  glutathione peroxidase, putative  43.48 
 
 		 160 aa  137  8.999999999999999e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0697  Glutathione peroxidase  47.06 
 
 		 170 aa  137  8.999999999999999e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0816  glutathione peroxidase  43.48 
 
 		 160 aa  136  1e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0324  Glutathione peroxidase  48.65 
 
 		 165 aa  135  2e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.324106  normal  0.0807721 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02770  glutathione peroxidase  46.58 
 
 		 160 aa  135  3.0000000000000003e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.359164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0802  peroxiredoxin  43.48 
 
 		 160 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.033017 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1732  putative glutathione peroxidase  42.86 
 
 		 183 aa  134  4e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.305422 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1914  putative glutathione peroxidase  42.05 
 
 		 183 aa  134  5e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41100  Glutathione peroxidase  43.48 
 
 		 160 aa  134  6.0000000000000005e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.341833  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3507  glutathione peroxidase  42.69 
 
 		 204 aa  132  1.9999999999999998e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.721934  normal  0.622585 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2152  putative glutathione peroxidase  41.01 
 
 		 183 aa  130  1.0000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0484  glutathione peroxidase  46.76 
 
 		 161 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1563  glutathione peroxidase, putative  46.05 
 
 		 162 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1655  Peroxiredoxin  43.68 
 
 		 183 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.401167  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4148  Glutathione peroxidase  48.92 
 
 		 158 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.784559  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1626  Peroxiredoxin  43.17 
 
 		 183 aa  128  3e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3470  glutathione peroxidase  46 
 
 		 158 aa  128  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1334  Peroxiredoxin  46.36 
 
 		 169 aa  127  5.0000000000000004e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0131674  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0020  glutathione peroxidase  43.21 
 
 		 168 aa  127  6e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3298  glutathione peroxidase  42.5 
 
 		 161 aa  127  8.000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.40101  decreased coverage  0.0000000224321 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30390  glutathione peroxidase  42.04 
 
 		 173 aa  126  1.0000000000000001e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1010  glutathione peroxidase  40.49 
 
 		 162 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1897  glutathione peroxidase  44 
 
 		 158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2683  Peroxiredoxin  43.05 
 
 		 160 aa  125  3e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.299838  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0238  Peroxiredoxin  40.54 
 
 		 170 aa  125  4.0000000000000003e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0270  glutathione peroxidase  42.67 
 
 		 158 aa  124  4.0000000000000003e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2774  putative glutathione peroxidase  41.44 
 
 		 183 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.956503  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0446  Glutathione peroxidase  44.59 
 
 		 157 aa  124  4.0000000000000003e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000054357  normal  0.0344695 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01902  probable glutathione peroxidase  42.58 
 
 		 165 aa  124  4.0000000000000003e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.101099  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1570  Glutathione peroxidase  43.14 
 
 		 158 aa  124  8.000000000000001e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2468  putative glutathione peroxidase  41.44 
 
 		 183 aa  124  8.000000000000001e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.157307  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2773  glutathione peroxidase  45.33 
 
 		 161 aa  124  8.000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000478947  hitchhiker  0.00587193 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2875  glutathione peroxidase  45.33 
 
 		 161 aa  123  9e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000745159  hitchhiker  0.0000749041 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2552  glutathione peroxidase  46.81 
 
 		 161 aa  123  1e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.40006  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2705  glutathione peroxidase  44.67 
 
 		 161 aa  123  1e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000249576  hitchhiker  0.0000800256 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0956  glutathione peroxidase  41.89 
 
 		 168 aa  122  2e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1300  glutathione peroxidase  45.27 
 
 		 161 aa  122  2e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.448702  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2910  Glutathione peroxidase  42.68 
 
 		 165 aa  122  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2741  glutathione peroxidase  43.24 
 
 		 162 aa  122  2e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000260986  hitchhiker  0.0000615291 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2461  glutathione peroxidase  38.37 
 
 		 177 aa  122  3e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1315  glutathione peroxidase  39.64 
 
 		 173 aa  122  3e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0190  glutathione peroxidase  43.17 
 
 		 161 aa  122  3e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.926255  normal  0.776204 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4117  Peroxiredoxin  47.97 
 
 		 182 aa  122  3e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3447  glutathione peroxidase  41.25 
 
 		 161 aa  121  3e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0243575 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2756  glutathione peroxidase  46.04 
 
 		 158 aa  121  4e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.447473  hitchhiker  0.0000941143 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1075  glutathione peroxidase  41.89 
 
 		 168 aa  121  4e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.364498  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1242  glutathione peroxidase  42.24 
 
 		 159 aa  121  5e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1771  glutathione peroxidase  41.45 
 
 		 161 aa  120  6e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2472  Glutathione peroxidase  41.61 
 
 		 159 aa  120  7e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.161656  decreased coverage  0.0000149935 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1318  Peroxiredoxin  40 
 
 		 167 aa  120  8e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1214  glutathione peroxidase  41.77 
 
 		 167 aa  120  8e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0173  glutathione peroxidase  41.88 
 
 		 161 aa  120  8e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.790659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0191  Glutathione peroxidase  41.88 
 
 		 161 aa  120  9e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0565  glutathione peroxidase  40.91 
 
 		 182 aa  120  9.999999999999999e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2975  Glutathione peroxidase  42.86 
 
 		 161 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.36322  normal  0.036622 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2504  Glutathione peroxidase  42.07 
 
 		 165 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.718008 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0250  glutathione peroxidase  43.92 
 
 		 164 aa  118  3e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>