More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2453 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_2453  glutathione peroxidase  100 
 
 		 158 aa  322  1e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.70182 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0270  glutathione peroxidase  53.8 
 
 		 158 aa  187  5.999999999999999e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53420  glutathione peroxidase  53.85 
 
 		 160 aa  177  4e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.31883  normal  0.0505345 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4682  glutathione peroxidase  52.56 
 
 		 160 aa  176  8e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3641  peroxiredoxin  52.56 
 
 		 161 aa  176  1e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1863  glutathione peroxidase  53.21 
 
 		 195 aa  174  5e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0777  glutathione peroxidase, putative  52.56 
 
 		 160 aa  171  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0297  glutathione peroxidase  49.36 
 
 		 161 aa  171  3.9999999999999995e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0981226  normal  0.609333 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0883  glutathione peroxidase  50.64 
 
 		 160 aa  170  7.999999999999999e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.961514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0816  glutathione peroxidase  51.92 
 
 		 160 aa  169  1e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41100  Glutathione peroxidase  51.28 
 
 		 160 aa  169  1e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.341833  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2249  glutathione peroxidase  51.28 
 
 		 162 aa  168  2e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.487328  normal  0.155268 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0802  peroxiredoxin  51.28 
 
 		 160 aa  168  3e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.033017 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1315  glutathione peroxidase  47.88 
 
 		 173 aa  167  5e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1010  glutathione peroxidase  50 
 
 		 162 aa  166  1e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4413  glutathione peroxidase  48.72 
 
 		 160 aa  164  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.312074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2597  Peroxiredoxin  49.07 
 
 		 158 aa  162  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1015  Glutathione peroxidase  49.69 
 
 		 162 aa  161  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0150707 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1965  glutathione peroxidase  48.77 
 
 		 160 aa  160  6e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0718131  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0876  Peroxiredoxin  48.39 
 
 		 177 aa  160  6e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01222  ABC transporter vitamin B12 uptake permease  54.35 
 
 		 185 aa  160  6e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.039958  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2131  glutathione peroxidase  48.77 
 
 		 160 aa  160  7e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1570  Glutathione peroxidase  46.58 
 
 		 158 aa  159  2e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0488  glutathione peroxidase  50.68 
 
 		 185 aa  158  2e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.642227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3184  glutathione peroxidase  48.15 
 
 		 160 aa  159  2e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2202  glutathione peroxidase  48.15 
 
 		 161 aa  158  3e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0177431  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3507  glutathione peroxidase  46.15 
 
 		 204 aa  158  3e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.721934  normal  0.622585 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3685  glutathione peroxidase  49.06 
 
 		 163 aa  157  4e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2271  glutathione peroxidase  48.15 
 
 		 160 aa  157  4e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2774  putative glutathione peroxidase  47.46 
 
 		 183 aa  158  4e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.956503  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1971  glutathione peroxidase  47.53 
 
 		 160 aa  157  6e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.775227  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2119  glutathione peroxidase  47.53 
 
 		 160 aa  157  6e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0889  glutathione peroxidase  49.07 
 
 		 168 aa  157  7e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.50899 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1080  glutathione peroxidase  49.04 
 
 		 164 aa  156  8e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000852506  normal  0.679739 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1172  glutathione peroxidase family protein  51.92 
 
 		 162 aa  156  9e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1926  glutathione peroxidase  47.53 
 
 		 160 aa  155  1e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0238  Peroxiredoxin  44.16 
 
 		 170 aa  156  1e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1812  Peroxiredoxin  46.25 
 
 		 162 aa  155  2e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00250469  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1950  glutathione peroxidase  46.91 
 
 		 160 aa  155  3e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.210596  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4940  glutathione peroxidase  49.36 
 
 		 165 aa  154  3e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.232541 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4557  glutathione peroxidase  49.36 
 
 		 165 aa  154  3e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2154  glutathione peroxidase  46.91 
 
 		 160 aa  155  3e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4645  glutathione peroxidase  49.36 
 
 		 165 aa  154  3e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0237  putative glutathione peroxidase transmembrane protein  54.01 
 
 		 205 aa  154  4e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1090  glutathione peroxidase  49.37 
 
 		 160 aa  154  6e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.37333 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2558  Peroxiredoxin  46.25 
 
 		 162 aa  153  7e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.177554  normal  0.095865 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1970  glutathione peroxidase  47.33 
 
 		 193 aa  154  7e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4077  glutathione peroxidase  48.75 
 
 		 162 aa  153  8e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.629032 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1214  glutathione peroxidase  48.05 
 
 		 167 aa  153  8e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0841  glutathione peroxidase  44.37 
 
 		 164 aa  153  9e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0436995  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2756  glutathione peroxidase  47.2 
 
 		 158 aa  153  1e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.447473  hitchhiker  0.0000941143 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3053  peroxiredoxin  49.38 
 
 		 164 aa  152  1e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.508134 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2468  putative glutathione peroxidase  46.33 
 
 		 183 aa  152  1e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.157307  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1334  Peroxiredoxin  47.37 
 
 		 169 aa  152  2e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0131674  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3277  Peroxiredoxin  48.75 
 
 		 164 aa  152  2e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2639  glutathione peroxidase  48.12 
 
 		 158 aa  152  2e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.833403 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0042  glutathione peroxidase  53.19 
 
 		 212 aa  151  2.9999999999999998e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.490429  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1246  glutathione peroxidase  52.17 
 
 		 192 aa  151  2.9999999999999998e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.281187  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27520  putative glutathione peroxidase  50.99 
 
 		 161 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.78279  normal  0.0357307 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3617  Peroxiredoxin  49.07 
 
 		 163 aa  151  4e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.78044  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2618  glutathione peroxidase  50.76 
 
 		 195 aa  151  4e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.137836  normal  0.142472 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0851  glutathione peroxidase  48.45 
 
 		 161 aa  150  5e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.425919  decreased coverage  0.00020946 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4659  glutathione peroxidase  50.33 
 
 		 208 aa  150  5.9999999999999996e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4022  Glutathione peroxidase  46.55 
 
 		 181 aa  150  5.9999999999999996e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.350366 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02660  glutathione peroxidase  46.75 
 
 		 158 aa  150  5.9999999999999996e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0559  glutathione peroxidase  46.91 
 
 		 161 aa  150  5.9999999999999996e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1897  glutathione peroxidase  48.97 
 
 		 158 aa  150  7e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2329  putative glutathione peroxidase  50 
 
 		 161 aa  150  8.999999999999999e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.509466  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1909  peroxiredoxin  49.04 
 
 		 161 aa  149  1e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.154084  normal  0.204796 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0018  glutathione peroxidase  51.01 
 
 		 208 aa  149  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0250  glutathione peroxidase  45.96 
 
 		 164 aa  149  2e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3665  glutathione peroxidase  48.12 
 
 		 158 aa  149  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0191  Glutathione peroxidase  46.58 
 
 		 161 aa  149  2e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6295  glutathione peroxidase  48.3 
 
 		 162 aa  149  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4667  glutathione peroxidase  50.71 
 
 		 199 aa  149  2e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0128  glutathione peroxidase  46.2 
 
 		 161 aa  149  2e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.594559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0392  glutathione peroxidase  48.03 
 
 		 188 aa  149  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0773128  normal  0.361866 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3198  Glutathione peroxidase protein  47.83 
 
 		 159 aa  148  3e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.246451  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3253  Peroxiredoxin  48.75 
 
 		 164 aa  148  3e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.350236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2764  glutathione peroxidase  45.57 
 
 		 161 aa  148  3e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0187221  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3298  glutathione peroxidase  47.13 
 
 		 161 aa  147  4e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.40101  decreased coverage  0.0000000224321 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0173  glutathione peroxidase  45.96 
 
 		 161 aa  147  5e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.790659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3880  putative glutathione peroxidase  45.86 
 
 		 191 aa  147  6e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.41902 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0226  Peroxiredoxin  46.2 
 
 		 163 aa  147  7e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6245  Glutathione peroxidase  45.62 
 
 		 163 aa  147  7e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.479243  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1655  Peroxiredoxin  42.37 
 
 		 183 aa  146  1.0000000000000001e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.401167  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1626  Peroxiredoxin  43.5 
 
 		 183 aa  146  1.0000000000000001e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5165  Peroxiredoxin  50 
 
 		 202 aa  145  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.648504  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3981  glutathione peroxidase  48.12 
 
 		 161 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.890862  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0845  Peroxiredoxin  46.54 
 
 		 179 aa  146  1.0000000000000001e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.494379  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3912  glutathione peroxidase  49.67 
 
 		 189 aa  146  1.0000000000000001e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.295477  normal  0.0278841 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0190  glutathione peroxidase  44.44 
 
 		 161 aa  146  1.0000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.926255  normal  0.776204 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2461  glutathione peroxidase  41.62 
 
 		 177 aa  145  1.0000000000000001e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1436  putative glutathione peroxidase  41.62 
 
 		 183 aa  146  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0293827 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14340  glutathione peroxidase  45.22 
 
 		 166 aa  146  1.0000000000000001e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1732  putative glutathione peroxidase  42.2 
 
 		 183 aa  145  2.0000000000000003e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.305422 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2798  glutathione peroxidase  47.2 
 
 		 164 aa  145  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2975  Glutathione peroxidase  47.1 
 
 		 161 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.36322  normal  0.036622 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2004  putative glutathione peroxidase  41.62 
 
 		 183 aa  145  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.375271 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0123  glutathione peroxidase  46.2 
 
 		 161 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>