More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_2853 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_2853  glutathione peroxidase  100 
 
 		 177 aa  369  1e-101  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.154923  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1267  glutathione peroxidase  75.71 
 
 		 203 aa  280  8.000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0133013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1196  glutathione peroxidase  75.14 
 
 		 203 aa  278  2e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0218447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1197  glutathione peroxidase  75.14 
 
 		 203 aa  278  4e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00644229  normal  0.718028 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3180  glutathione peroxidase  75.14 
 
 		 179 aa  275  2e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000271589  normal  0.0170233 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3022  glutathione peroxidase  73.3 
 
 		 230 aa  274  5e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00278721  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3037  glutathione peroxidase  74.57 
 
 		 230 aa  273  7e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000026286  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1341  glutathione peroxidase  74.57 
 
 		 179 aa  273  8e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0267656  hitchhiker  0.0000000425712 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3349  glutathione peroxidase, putative  72.88 
 
 		 177 aa  272  2.0000000000000002e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2684  glutathione peroxidase  73.94 
 
 		 179 aa  265  2e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.553323  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2679  glutathione peroxidase  75.95 
 
 		 192 aa  260  6.999999999999999e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.241309  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2474  glutathione peroxidase, putative  68.59 
 
 		 180 aa  234  5.0000000000000005e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0359  glutathione peroxidase  51.41 
 
 		 182 aa  207  8e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3670  glutathione peroxidase  52.38 
 
 		 184 aa  190  1e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.174884  normal  0.0808268 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1719  glutathione peroxidase family protein  49.72 
 
 		 183 aa  187  5e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00731943  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1427  GMP synthase-like  51.57 
 
 		 190 aa  185  3e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4103  putative glutathione peroxidase  53.12 
 
 		 184 aa  184  7e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47550  putative glutathione peroxidase  53.12 
 
 		 184 aa  184  7e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.532704 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1654  glutathione peroxidase  49.16 
 
 		 186 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.323621  hitchhiker  0.0047837 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2526  glutathione peroxidase  48.31 
 
 		 180 aa  176  1e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.327392  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1686  glutathione peroxidase  49.13 
 
 		 202 aa  174  5e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.677668  normal  0.86735 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4033  glutathione peroxidase  49.13 
 
 		 183 aa  174  6e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.475849  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1284  glutathione peroxidase  49.13 
 
 		 183 aa  173  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.604655  normal  0.560913 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1244  glutathione peroxidase  48.81 
 
 		 176 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.247052  normal  0.300123 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000573  glutathione peroxidase  46.07 
 
 		 181 aa  171  5e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05309  glutathione peroxidase  47.51 
 
 		 181 aa  169  2e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1762  glutathione peroxidase  51.55 
 
 		 183 aa  168  3e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.533866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0018  glutathione peroxidase  48.12 
 
 		 208 aa  162  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2515  glutathione peroxidase  55.1 
 
 		 185 aa  159  2e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02196  Glutathione peroxidase  46.25 
 
 		 184 aa  158  5e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0197549  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0042  glutathione peroxidase  47.17 
 
 		 212 aa  157  5e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.490429  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1409  glutathione peroxidase  43.93 
 
 		 184 aa  148  3e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1246  glutathione peroxidase  44.44 
 
 		 192 aa  147  6e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.281187  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5165  Peroxiredoxin  48.41 
 
 		 202 aa  147  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.648504  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3912  glutathione peroxidase  42.35 
 
 		 189 aa  143  1e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.295477  normal  0.0278841 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1801  glutathione peroxidase  40 
 
 		 199 aa  142  2e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.740072  hitchhiker  0.00000253639 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4659  glutathione peroxidase  44.38 
 
 		 208 aa  140  8e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1970  glutathione peroxidase  43.79 
 
 		 193 aa  139  9.999999999999999e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2618  glutathione peroxidase  46.81 
 
 		 195 aa  139  1.9999999999999998e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.137836  normal  0.142472 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01222  ABC transporter vitamin B12 uptake permease  42.86 
 
 		 185 aa  138  3e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.039958  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0162  glutathione peroxidase  39.66 
 
 		 231 aa  137  8.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.520461 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0169  glutathione peroxidase  41.25 
 
 		 231 aa  137  1e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0307  putative glutathione peroxidase transmembrane protein  41.4 
 
 		 233 aa  136  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0461  glutathione peroxidase  42.07 
 
 		 191 aa  135  3.0000000000000003e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4024  glutathione peroxidase  44.1 
 
 		 213 aa  135  3.0000000000000003e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0237  putative glutathione peroxidase transmembrane protein  38.76 
 
 		 205 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3374  glutathione peroxidase  47.48 
 
 		 195 aa  131  3.9999999999999996e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.479812  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4667  glutathione peroxidase  42.86 
 
 		 199 aa  131  5e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0488  glutathione peroxidase  42.41 
 
 		 185 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.642227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0297  glutathione peroxidase  45.59 
 
 		 161 aa  127  9.000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0981226  normal  0.609333 
 
 
-
 
NC_006687  CNE00580  glutathione peroxidase, putative  42.07 
 
 		 185 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.256439  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2453  glutathione peroxidase  44.6 
 
 		 158 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.70182 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0190  glutathione peroxidase  42.95 
 
 		 161 aa  124  9e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.926255  normal  0.776204 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2389  putative glutathione peroxidase  41.13 
 
 		 176 aa  123  1e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.401751  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27520  putative glutathione peroxidase  44.93 
 
 		 161 aa  122  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.78279  normal  0.0357307 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1053  glutathione peroxidase  41.13 
 
 		 176 aa  122  3e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.281088  normal  0.469721 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2975  Glutathione peroxidase  43.88 
 
 		 161 aa  122  3e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.36322  normal  0.036622 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2329  putative glutathione peroxidase  44.93 
 
 		 161 aa  122  3e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.509466  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1368  glutathione peroxidase  43.88 
 
 		 165 aa  122  3e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4117  Peroxiredoxin  44.68 
 
 		 182 aa  121  4e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1407  glutathione peroxidase  43.88 
 
 		 165 aa  122  4e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0308338  normal  0.103968 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1781  glutathione peroxidase family protein  46.43 
 
 		 161 aa  121  5e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1936  glutathione peroxidase  44.6 
 
 		 159 aa  121  5e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.634874 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2454  Peroxiredoxin  45.31 
 
 		 160 aa  121  6e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0184161  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2067  glutathione peroxidase  44.6 
 
 		 159 aa  121  6e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1391  glutathione peroxidase  44.36 
 
 		 153 aa  120  7e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1909  peroxiredoxin  44.93 
 
 		 161 aa  120  9e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.154084  normal  0.204796 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1570  Glutathione peroxidase  43.88 
 
 		 158 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3613  glutathione peroxidase  45 
 
 		 161 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.374005  normal  0.319321 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0270  glutathione peroxidase  42.96 
 
 		 158 aa  119  1.9999999999999998e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1354  glutathione peroxidase  44.37 
 
 		 162 aa  119  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.525114 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5344  glutathione peroxidase  43.88 
 
 		 159 aa  119  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.213102 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2931  glutathione peroxidase  45.04 
 
 		 159 aa  118  3e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.953337 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2054  glutathione peroxidase  43.17 
 
 		 159 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2249  glutathione peroxidase  44.44 
 
 		 162 aa  118  3.9999999999999996e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.487328  normal  0.155268 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2597  Peroxiredoxin  43.17 
 
 		 158 aa  118  3.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0128  glutathione peroxidase  41.14 
 
 		 161 aa  118  3.9999999999999996e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.594559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1384  glutathione peroxidase  42.45 
 
 		 165 aa  118  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6042  glutathione peroxidase  43.17 
 
 		 159 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1075  glutathione peroxidase  43.51 
 
 		 168 aa  118  3.9999999999999996e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.364498  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0238  Peroxiredoxin  43.38 
 
 		 170 aa  118  3.9999999999999996e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2035  glutathione peroxidase  43.17 
 
 		 159 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2699  glutathione peroxidase  46.04 
 
 		 160 aa  118  3.9999999999999996e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1563  glutathione peroxidase, putative  41.84 
 
 		 162 aa  118  4.9999999999999996e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2705  glutathione peroxidase  43.26 
 
 		 161 aa  118  4.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000249576  hitchhiker  0.0000800256 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02660  glutathione peroxidase  45.93 
 
 		 158 aa  118  4.9999999999999996e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2875  glutathione peroxidase  42.55 
 
 		 161 aa  118  4.9999999999999996e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000745159  hitchhiker  0.0000749041 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2773  glutathione peroxidase  42.55 
 
 		 161 aa  117  7.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000478947  hitchhiker  0.00587193 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01902  probable glutathione peroxidase  41.96 
 
 		 165 aa  116  9.999999999999999e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.101099  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0484  glutathione peroxidase  43.17 
 
 		 161 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3617  Peroxiredoxin  42.03 
 
 		 163 aa  117  9.999999999999999e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.78044  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3981  glutathione peroxidase  43.48 
 
 		 161 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.890862  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1300  glutathione peroxidase  41.01 
 
 		 161 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.448702  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1812  Peroxiredoxin  38.85 
 
 		 162 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00250469  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0956  glutathione peroxidase  42.75 
 
 		 168 aa  115  3e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4645  glutathione peroxidase  39.62 
 
 		 165 aa  115  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4940  glutathione peroxidase  39.62 
 
 		 165 aa  115  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.232541 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0694  glutathione peroxidase  44.12 
 
 		 161 aa  115  3.9999999999999997e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000130339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4557  glutathione peroxidase  39.62 
 
 		 165 aa  115  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0889  glutathione peroxidase  40.29 
 
 		 168 aa  115  3.9999999999999997e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.50899 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>