More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000573 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_000573  glutathione peroxidase  100 
 
 		 181 aa  372  1e-102  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05309  glutathione peroxidase  79.01 
 
 		 181 aa  288  2e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02196  Glutathione peroxidase  53.12 
 
 		 184 aa  181  6e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0197549  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0359  glutathione peroxidase  48.31 
 
 		 182 aa  181  7e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2853  glutathione peroxidase  46.07 
 
 		 177 aa  179  2e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.154923  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47550  putative glutathione peroxidase  48.12 
 
 		 184 aa  177  8e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.532704 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4103  putative glutathione peroxidase  48.12 
 
 		 184 aa  177  8e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3180  glutathione peroxidase  48.07 
 
 		 179 aa  176  1e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000271589  normal  0.0170233 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3022  glutathione peroxidase  48.07 
 
 		 230 aa  176  1e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00278721  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3037  glutathione peroxidase  48.07 
 
 		 230 aa  176  2e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000026286  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1341  glutathione peroxidase  48.07 
 
 		 179 aa  176  2e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0267656  hitchhiker  0.0000000425712 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1267  glutathione peroxidase  47.51 
 
 		 203 aa  174  6e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0133013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1196  glutathione peroxidase  47.51 
 
 		 203 aa  174  7e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0218447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2526  glutathione peroxidase  45.3 
 
 		 180 aa  173  9.999999999999999e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.327392  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1197  glutathione peroxidase  46.96 
 
 		 203 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00644229  normal  0.718028 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1686  glutathione peroxidase  45.86 
 
 		 202 aa  171  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.677668  normal  0.86735 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4033  glutathione peroxidase  45.86 
 
 		 183 aa  170  7.999999999999999e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.475849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3670  glutathione peroxidase  47.93 
 
 		 184 aa  170  9e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.174884  normal  0.0808268 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1719  glutathione peroxidase family protein  47.34 
 
 		 183 aa  169  3e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00731943  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1244  glutathione peroxidase  49.38 
 
 		 176 aa  167  9e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.247052  normal  0.300123 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2474  glutathione peroxidase, putative  50.96 
 
 		 180 aa  167  9e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3349  glutathione peroxidase, putative  47.59 
 
 		 177 aa  167  1e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2684  glutathione peroxidase  48.15 
 
 		 179 aa  166  1e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.553323  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1654  glutathione peroxidase  46.75 
 
 		 186 aa  166  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.323621  hitchhiker  0.0047837 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1284  glutathione peroxidase  44.75 
 
 		 183 aa  166  2e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.604655  normal  0.560913 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2679  glutathione peroxidase  49.35 
 
 		 192 aa  166  2e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.241309  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1762  glutathione peroxidase  48.77 
 
 		 183 aa  160  1e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.533866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0018  glutathione peroxidase  46.25 
 
 		 208 aa  158  4e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4667  glutathione peroxidase  51.08 
 
 		 199 aa  157  1e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01222  ABC transporter vitamin B12 uptake permease  40.45 
 
 		 185 aa  156  2e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.039958  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0169  glutathione peroxidase  43.75 
 
 		 231 aa  156  2e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0162  glutathione peroxidase  43.95 
 
 		 231 aa  155  3e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.520461 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4659  glutathione peroxidase  45.68 
 
 		 208 aa  154  8e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5165  Peroxiredoxin  46.5 
 
 		 202 aa  153  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.648504  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1427  GMP synthase-like  44 
 
 		 190 aa  153  1e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0042  glutathione peroxidase  45.86 
 
 		 212 aa  152  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.490429  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1409  glutathione peroxidase  44.19 
 
 		 184 aa  152  2e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4024  glutathione peroxidase  47.2 
 
 		 213 aa  152  2e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0307  putative glutathione peroxidase transmembrane protein  42.68 
 
 		 233 aa  149  2e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3912  glutathione peroxidase  40.35 
 
 		 189 aa  148  4e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.295477  normal  0.0278841 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3374  glutathione peroxidase  50.36 
 
 		 195 aa  147  8e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.479812  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1246  glutathione peroxidase  40.66 
 
 		 192 aa  145  2.0000000000000003e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.281187  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1970  glutathione peroxidase  44.97 
 
 		 193 aa  145  2.0000000000000003e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2618  glutathione peroxidase  45.07 
 
 		 195 aa  145  4.0000000000000006e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.137836  normal  0.142472 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2515  glutathione peroxidase  41.86 
 
 		 185 aa  144  1e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0297  glutathione peroxidase  47.55 
 
 		 161 aa  139  1.9999999999999998e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0981226  normal  0.609333 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0237  putative glutathione peroxidase transmembrane protein  37.43 
 
 		 205 aa  137  6e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01902  probable glutathione peroxidase  46.81 
 
 		 165 aa  137  1e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.101099  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1801  glutathione peroxidase  43.12 
 
 		 199 aa  136  1e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.740072  hitchhiker  0.00000253639 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0270  glutathione peroxidase  41.61 
 
 		 158 aa  134  7.000000000000001e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0694  glutathione peroxidase  50.71 
 
 		 161 aa  134  8e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000130339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0488  glutathione peroxidase  42.14 
 
 		 185 aa  134  9.999999999999999e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.642227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2453  glutathione peroxidase  42.45 
 
 		 158 aa  130  6.999999999999999e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.70182 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3685  glutathione peroxidase  46.43 
 
 		 163 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE00580  glutathione peroxidase, putative  43.75 
 
 		 185 aa  129  2.0000000000000002e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.256439  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53420  glutathione peroxidase  45.65 
 
 		 160 aa  129  3e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.31883  normal  0.0505345 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4682  glutathione peroxidase  45.65 
 
 		 160 aa  128  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0461  glutathione peroxidase  35.75 
 
 		 191 aa  127  6e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1570  Glutathione peroxidase  45.99 
 
 		 158 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2249  glutathione peroxidase  40.58 
 
 		 162 aa  126  2.0000000000000002e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.487328  normal  0.155268 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0484  glutathione peroxidase  47.29 
 
 		 161 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0559  glutathione peroxidase  43.88 
 
 		 161 aa  126  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02846  phospholipid hydroperoxide glutathione peroxidase (Eurofung)  49.23 
 
 		 282 aa  125  3e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.440988 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1971  glutathione peroxidase  45.8 
 
 		 160 aa  125  3e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.775227  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1950  glutathione peroxidase  45.8 
 
 		 160 aa  125  3e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.210596  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2119  glutathione peroxidase  45.8 
 
 		 160 aa  125  3e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0238  Peroxiredoxin  43.17 
 
 		 170 aa  125  3e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2271  glutathione peroxidase  45.8 
 
 		 160 aa  125  3e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2154  glutathione peroxidase  45.8 
 
 		 160 aa  125  3e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2202  glutathione peroxidase  44.93 
 
 		 161 aa  125  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0177431  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0904  glutathione peroxidase  47.69 
 
 		 158 aa  125  4.0000000000000003e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000826936  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1080  glutathione peroxidase  46.09 
 
 		 164 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000852506  normal  0.679739 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0872  glutathione peroxidase  49.22 
 
 		 158 aa  125  5e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0128  glutathione peroxidase  43.59 
 
 		 161 aa  125  5e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.594559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3613  glutathione peroxidase  46.38 
 
 		 161 aa  124  7e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.374005  normal  0.319321 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2597  Peroxiredoxin  45 
 
 		 158 aa  124  7e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2131  glutathione peroxidase  45.04 
 
 		 160 aa  124  7e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3184  glutathione peroxidase  44.2 
 
 		 160 aa  124  7e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0867  glutathione peroxidase  47.69 
 
 		 159 aa  124  7e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000118287  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1909  peroxiredoxin  44.06 
 
 		 161 aa  123  1e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.154084  normal  0.204796 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1781  glutathione peroxidase family protein  46.1 
 
 		 161 aa  124  1e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3981  glutathione peroxidase  46.15 
 
 		 161 aa  124  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.890862  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1965  glutathione peroxidase  44.12 
 
 		 160 aa  123  1e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0718131  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2764  glutathione peroxidase  42.96 
 
 		 161 aa  123  1e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0187221  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2054  glutathione peroxidase  44.96 
 
 		 159 aa  123  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1926  glutathione peroxidase  44.2 
 
 		 160 aa  122  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5344  glutathione peroxidase  44.19 
 
 		 159 aa  123  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.213102 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2011  glutathione peroxidase  43.8 
 
 		 159 aa  122  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0261647  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2552  glutathione peroxidase  46.15 
 
 		 161 aa  123  2e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.40006  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6042  glutathione peroxidase  44.96 
 
 		 159 aa  123  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2454  Peroxiredoxin  46.46 
 
 		 160 aa  122  2e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0184161  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2035  glutathione peroxidase  44.96 
 
 		 159 aa  123  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2510  glutathione peroxidase  43.8 
 
 		 159 aa  122  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1571  glutathione peroxidase  43.8 
 
 		 159 aa  122  3e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.154895  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1936  glutathione peroxidase  43.41 
 
 		 159 aa  122  3e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.634874 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3238  glutathione peroxidase  43.8 
 
 		 159 aa  122  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.400465  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1769  glutathione peroxidase  44.53 
 
 		 162 aa  122  3e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0182367  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1665  glutathione peroxidase  45.32 
 
 		 159 aa  122  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0389024 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2074  glutathione peroxidase  43.8 
 
 		 159 aa  122  3e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.895406  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2067  glutathione peroxidase  43.41 
 
 		 159 aa  122  3e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>