More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_47550 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_4103  putative glutathione peroxidase  100 
 
 		 184 aa  380  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47550  putative glutathione peroxidase  100 
 
 		 184 aa  380  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.532704 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3670  glutathione peroxidase  73.37 
 
 		 184 aa  275  2e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.174884  normal  0.0808268 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1719  glutathione peroxidase family protein  72.83 
 
 		 183 aa  272  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00731943  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1654  glutathione peroxidase  73.56 
 
 		 186 aa  265  2e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.323621  hitchhiker  0.0047837 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1762  glutathione peroxidase  77.58 
 
 		 183 aa  257  7e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.533866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1244  glutathione peroxidase  70.66 
 
 		 176 aa  256  1e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.247052  normal  0.300123 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1284  glutathione peroxidase  70.66 
 
 		 183 aa  255  2e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.604655  normal  0.560913 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1686  glutathione peroxidase  70.66 
 
 		 202 aa  254  6e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.677668  normal  0.86735 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4033  glutathione peroxidase  70.48 
 
 		 183 aa  251  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.475849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3180  glutathione peroxidase  51.67 
 
 		 179 aa  200  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000271589  normal  0.0170233 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3022  glutathione peroxidase  51.11 
 
 		 230 aa  199  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00278721  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1341  glutathione peroxidase  51.11 
 
 		 179 aa  198  3.9999999999999996e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0267656  hitchhiker  0.0000000425712 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3037  glutathione peroxidase  51.11 
 
 		 230 aa  197  5e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000026286  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2515  glutathione peroxidase  59.32 
 
 		 185 aa  194  5.000000000000001e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2853  glutathione peroxidase  51.15 
 
 		 177 aa  192  3e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.154923  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1267  glutathione peroxidase  50.56 
 
 		 203 aa  188  2.9999999999999997e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0133013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0359  glutathione peroxidase  50.57 
 
 		 182 aa  187  5.999999999999999e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1196  glutathione peroxidase  50.56 
 
 		 203 aa  187  5.999999999999999e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0218447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2684  glutathione peroxidase  49.44 
 
 		 179 aa  186  1e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.553323  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1197  glutathione peroxidase  50 
 
 		 203 aa  186  2e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00644229  normal  0.718028 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3349  glutathione peroxidase, putative  48.31 
 
 		 177 aa  183  1.0000000000000001e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2526  glutathione peroxidase  48 
 
 		 180 aa  182  3e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.327392  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0042  glutathione peroxidase  50.93 
 
 		 212 aa  180  1e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.490429  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02196  Glutathione peroxidase  48.17 
 
 		 184 aa  178  4e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0197549  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2474  glutathione peroxidase, putative  50.92 
 
 		 180 aa  176  1e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1427  GMP synthase-like  45.56 
 
 		 190 aa  176  2e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0018  glutathione peroxidase  47.85 
 
 		 208 aa  175  3e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3912  glutathione peroxidase  52.53 
 
 		 189 aa  172  2.9999999999999996e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.295477  normal  0.0278841 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000573  glutathione peroxidase  45.56 
 
 		 181 aa  171  6.999999999999999e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1246  glutathione peroxidase  50.57 
 
 		 192 aa  169  3e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.281187  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4667  glutathione peroxidase  50.98 
 
 		 199 aa  167  7e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4024  glutathione peroxidase  52.15 
 
 		 213 aa  167  7e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2679  glutathione peroxidase  49.38 
 
 		 192 aa  166  1e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.241309  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05309  glutathione peroxidase  48.45 
 
 		 181 aa  165  2.9999999999999998e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5165  Peroxiredoxin  50.31 
 
 		 202 aa  164  5.9999999999999996e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.648504  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4659  glutathione peroxidase  50.93 
 
 		 208 aa  164  9e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3374  glutathione peroxidase  52.23 
 
 		 195 aa  162  2.0000000000000002e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.479812  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0169  glutathione peroxidase  48.45 
 
 		 231 aa  161  5.0000000000000005e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0237  putative glutathione peroxidase transmembrane protein  47.28 
 
 		 205 aa  160  1e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0162  glutathione peroxidase  48.73 
 
 		 231 aa  160  1e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.520461 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1409  glutathione peroxidase  45.7 
 
 		 184 aa  160  1e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0307  putative glutathione peroxidase transmembrane protein  48.73 
 
 		 233 aa  159  2e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01222  ABC transporter vitamin B12 uptake permease  46.59 
 
 		 185 aa  157  1e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.039958  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2618  glutathione peroxidase  53.96 
 
 		 195 aa  157  1e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.137836  normal  0.142472 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0297  glutathione peroxidase  52.59 
 
 		 161 aa  156  2e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0981226  normal  0.609333 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1801  glutathione peroxidase  46.25 
 
 		 199 aa  151  5e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.740072  hitchhiker  0.00000253639 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1970  glutathione peroxidase  41.34 
 
 		 193 aa  148  5e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2249  glutathione peroxidase  52.55 
 
 		 162 aa  146  2.0000000000000003e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.487328  normal  0.155268 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0461  glutathione peroxidase  44.38 
 
 		 191 aa  144  5e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0488  glutathione peroxidase  45.28 
 
 		 185 aa  142  2e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.642227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0316  glutathione peroxidase  50.76 
 
 		 184 aa  137  7.999999999999999e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.282271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0360  glutathione peroxidase  50.76 
 
 		 184 aa  137  7.999999999999999e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.495486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2389  putative glutathione peroxidase  50 
 
 		 176 aa  134  5e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.401751  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0392  glutathione peroxidase  49.24 
 
 		 188 aa  133  9.999999999999999e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0773128  normal  0.361866 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3641  peroxiredoxin  49.64 
 
 		 161 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1053  glutathione peroxidase  49.24 
 
 		 176 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.281088  normal  0.469721 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0270  glutathione peroxidase  44.6 
 
 		 158 aa  130  6.999999999999999e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0559  glutathione peroxidase  46.81 
 
 		 161 aa  131  6.999999999999999e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2453  glutathione peroxidase  44.29 
 
 		 158 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.70182 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4682  glutathione peroxidase  47.48 
 
 		 160 aa  128  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1883  glutathione peroxidase  45.99 
 
 		 152 aa  128  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.255404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2055  putative glutathione peroxidase  47.76 
 
 		 177 aa  128  4.0000000000000003e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.265735 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0904  glutathione peroxidase  45.58 
 
 		 158 aa  128  5.0000000000000004e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000826936  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53420  glutathione peroxidase  47.48 
 
 		 160 aa  127  6e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.31883  normal  0.0505345 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3665  glutathione peroxidase  53.12 
 
 		 158 aa  127  7.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2454  Peroxiredoxin  44.52 
 
 		 160 aa  127  8.000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0184161  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5344  glutathione peroxidase  45.71 
 
 		 159 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.213102 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1812  Peroxiredoxin  46.58 
 
 		 162 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00250469  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1926  glutathione peroxidase  43.75 
 
 		 160 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1010  glutathione peroxidase  47.14 
 
 		 162 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1384  glutathione peroxidase  41.98 
 
 		 165 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2054  glutathione peroxidase  45 
 
 		 159 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6042  glutathione peroxidase  45 
 
 		 159 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0867  glutathione peroxidase  45 
 
 		 159 aa  125  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000118287  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1499  glutathione peroxidase  49.19 
 
 		 157 aa  126  2.0000000000000002e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.278578  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2035  glutathione peroxidase  45 
 
 		 159 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0694  glutathione peroxidase  44.37 
 
 		 161 aa  125  4.0000000000000003e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000130339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2067  glutathione peroxidase  45 
 
 		 159 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0883  glutathione peroxidase  43.88 
 
 		 160 aa  125  5e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.961514  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2011  glutathione peroxidase  44.37 
 
 		 159 aa  125  5e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0261647  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1936  glutathione peroxidase  45 
 
 		 159 aa  124  5e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.634874 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1354  glutathione peroxidase  46.15 
 
 		 162 aa  124  7e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.525114 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2202  glutathione peroxidase  42.76 
 
 		 161 aa  124  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0177431  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1242  glutathione peroxidase  45 
 
 		 159 aa  124  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3184  glutathione peroxidase  43.06 
 
 		 160 aa  123  1e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2131  glutathione peroxidase  43.06 
 
 		 160 aa  123  1e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3880  putative glutathione peroxidase  40.41 
 
 		 191 aa  123  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.41902 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1665  glutathione peroxidase  46.04 
 
 		 159 aa  123  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0389024 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2271  glutathione peroxidase  43.06 
 
 		 160 aa  123  1e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2975  Glutathione peroxidase  41.36 
 
 		 161 aa  123  2e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.36322  normal  0.036622 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1346  glutathione peroxidase  43.66 
 
 		 159 aa  122  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.909183  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1971  glutathione peroxidase  43.06 
 
 		 160 aa  122  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.775227  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1571  glutathione peroxidase  43.66 
 
 		 159 aa  122  2e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.154895  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7246  glutathione peroxidase  43.67 
 
 		 182 aa  122  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.156193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2119  glutathione peroxidase  43.06 
 
 		 160 aa  122  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2510  glutathione peroxidase  43.66 
 
 		 159 aa  122  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2454  glutathione peroxidase  43.66 
 
 		 159 aa  122  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0273  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0007  glutathione peroxidase  42.38 
 
 		 157 aa  122  2e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1965  glutathione peroxidase  42.36 
 
 		 160 aa  123  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0718131  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>