More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2249 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2249  glutathione peroxidase  100 
 
 		 162 aa  334  2.9999999999999997e-91  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.487328  normal  0.155268 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0297  glutathione peroxidase  55.13 
 
 		 161 aa  196  7.999999999999999e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0981226  normal  0.609333 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1863  glutathione peroxidase  56.86 
 
 		 195 aa  184  4e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0270  glutathione peroxidase  51.3 
 
 		 158 aa  178  2e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2453  glutathione peroxidase  51.28 
 
 		 158 aa  168  2e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.70182 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0238  Peroxiredoxin  49.06 
 
 		 170 aa  166  1e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3880  putative glutathione peroxidase  48.73 
 
 		 191 aa  163  9e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.41902 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00658  glutathione peroxidase  50.65 
 
 		 161 aa  162  1.0000000000000001e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0965068  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2660  Glutathione peroxidase  51.97 
 
 		 159 aa  162  2.0000000000000002e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0609505 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1909  peroxiredoxin  55.56 
 
 		 161 aa  158  3e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.154084  normal  0.204796 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02770  glutathione peroxidase  50 
 
 		 160 aa  158  3e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.359164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3981  glutathione peroxidase  53.95 
 
 		 161 aa  158  4e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.890862  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3685  glutathione peroxidase  49.08 
 
 		 163 aa  157  4e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1080  glutathione peroxidase  53.25 
 
 		 164 aa  158  4e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000852506  normal  0.679739 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3613  glutathione peroxidase  56.52 
 
 		 161 aa  157  5e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.374005  normal  0.319321 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2329  putative glutathione peroxidase  55.24 
 
 		 161 aa  157  5e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.509466  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53420  glutathione peroxidase  50.32 
 
 		 160 aa  157  5e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.31883  normal  0.0505345 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1781  glutathione peroxidase family protein  57.97 
 
 		 161 aa  157  6e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0250  glutathione peroxidase  51.35 
 
 		 164 aa  157  6e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27520  putative glutathione peroxidase  53.33 
 
 		 161 aa  157  6e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.78279  normal  0.0357307 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1965  glutathione peroxidase  49.69 
 
 		 160 aa  157  8e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0718131  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2131  glutathione peroxidase  50.31 
 
 		 160 aa  156  1e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4682  glutathione peroxidase  49.68 
 
 		 160 aa  156  1e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1570  Glutathione peroxidase  50.68 
 
 		 158 aa  155  2e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0889  glutathione peroxidase  48.75 
 
 		 168 aa  155  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.50899 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3184  glutathione peroxidase  49.69 
 
 		 160 aa  154  3e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2202  glutathione peroxidase  49.06 
 
 		 161 aa  154  4e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0177431  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2699  glutathione peroxidase  51.92 
 
 		 160 aa  154  4e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3298  glutathione peroxidase  49.03 
 
 		 161 aa  154  6e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.40101  decreased coverage  0.0000000224321 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1971  glutathione peroxidase  49.06 
 
 		 160 aa  154  6e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.775227  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2119  glutathione peroxidase  49.06 
 
 		 160 aa  154  6e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2271  glutathione peroxidase  49.06 
 
 		 160 aa  154  6e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3641  peroxiredoxin  48.39 
 
 		 161 aa  153  7e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0488  glutathione peroxidase  47.74 
 
 		 185 aa  153  7e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.642227  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0226  Peroxiredoxin  49.06 
 
 		 163 aa  153  8e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2454  Peroxiredoxin  52.98 
 
 		 160 aa  153  9e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0184161  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0851  glutathione peroxidase  49.68 
 
 		 161 aa  152  1e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.425919  decreased coverage  0.00020946 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0484  glutathione peroxidase  47.77 
 
 		 161 aa  153  1e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4659  glutathione peroxidase  53.29 
 
 		 208 aa  152  1e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1950  glutathione peroxidase  48.43 
 
 		 160 aa  152  2e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.210596  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1926  glutathione peroxidase  49.06 
 
 		 160 aa  152  2e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2597  Peroxiredoxin  47.8 
 
 		 158 aa  152  2e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2154  glutathione peroxidase  48.43 
 
 		 160 aa  152  2e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4117  Peroxiredoxin  52.41 
 
 		 182 aa  152  2e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0956  glutathione peroxidase  48.03 
 
 		 168 aa  152  2e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5165  Peroxiredoxin  56.03 
 
 		 202 aa  151  2.9999999999999998e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.648504  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1075  glutathione peroxidase  48.03 
 
 		 168 aa  151  4e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.364498  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0191  Glutathione peroxidase  47.8 
 
 		 161 aa  150  7e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3925  Glutathione peroxidase  50 
 
 		 165 aa  150  8e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0128  glutathione peroxidase  47.17 
 
 		 161 aa  150  8e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.594559  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0777  glutathione peroxidase, putative  49.03 
 
 		 160 aa  150  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0190  glutathione peroxidase  45.62 
 
 		 161 aa  150  8.999999999999999e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.926255  normal  0.776204 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0883  glutathione peroxidase  47.74 
 
 		 160 aa  149  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.961514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0237  putative glutathione peroxidase transmembrane protein  52.78 
 
 		 205 aa  149  1e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0802  peroxiredoxin  49.03 
 
 		 160 aa  149  1e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.033017 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0816  glutathione peroxidase  49.03 
 
 		 160 aa  149  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1812  Peroxiredoxin  45.28 
 
 		 162 aa  149  2e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00250469  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0173  glutathione peroxidase  47.17 
 
 		 161 aa  149  2e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.790659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2931  glutathione peroxidase  47.47 
 
 		 159 aa  148  3e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.953337 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3665  glutathione peroxidase  50.99 
 
 		 158 aa  148  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3973  Peroxiredoxin  49.32 
 
 		 165 aa  148  3e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000360978 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0697  Glutathione peroxidase  51.02 
 
 		 170 aa  148  3e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0020  glutathione peroxidase  49.37 
 
 		 168 aa  147  4e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0694  glutathione peroxidase  46.2 
 
 		 161 aa  148  4e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000130339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1010  glutathione peroxidase  48.39 
 
 		 162 aa  147  6e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1874  glutathione peroxidase  50.94 
 
 		 162 aa  147  7e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0631469  normal  0.307231 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2875  glutathione peroxidase  50.68 
 
 		 161 aa  147  7e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000745159  hitchhiker  0.0000749041 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15450  Glutathione peroxidase  53.24 
 
 		 158 aa  147  9e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0674744  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1483  glutathione peroxidase  50.62 
 
 		 162 aa  146  9e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2756  glutathione peroxidase  49.01 
 
 		 158 aa  146  1.0000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.447473  hitchhiker  0.0000941143 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1563  glutathione peroxidase, putative  47.17 
 
 		 162 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3198  Glutathione peroxidase protein  47.83 
 
 		 159 aa  146  1.0000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.246451  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1970  glutathione peroxidase  47.37 
 
 		 193 aa  146  1.0000000000000001e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1897  glutathione peroxidase  51.7 
 
 		 158 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4413  glutathione peroxidase  47.74 
 
 		 160 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.312074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02660  glutathione peroxidase  45.22 
 
 		 158 aa  146  1.0000000000000001e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2773  glutathione peroxidase  50.68 
 
 		 161 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000478947  hitchhiker  0.00587193 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4103  putative glutathione peroxidase  52.55 
 
 		 184 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6295  glutathione peroxidase  51.01 
 
 		 162 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2705  glutathione peroxidase  50 
 
 		 161 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000249576  hitchhiker  0.0000800256 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47550  putative glutathione peroxidase  52.55 
 
 		 184 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.532704 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0876  Peroxiredoxin  45.06 
 
 		 177 aa  145  3e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3912  glutathione peroxidase  53.47 
 
 		 189 aa  145  3e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.295477  normal  0.0278841 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3841  glutathione peroxidase  49.69 
 
 		 162 aa  145  3e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0688357  normal  0.342172 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2934  glutathione peroxidase  48.03 
 
 		 164 aa  145  3e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0465616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1334  Peroxiredoxin  44.1 
 
 		 169 aa  145  3e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0131674  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1762  glutathione peroxidase  50.34 
 
 		 183 aa  145  3e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.533866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2964  glutathione peroxidase  49.32 
 
 		 160 aa  144  4.0000000000000006e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5332  glutathione peroxidase  50.68 
 
 		 163 aa  144  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0814545  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1449  glutathione peroxidase  49.06 
 
 		 162 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00937829  normal  0.354884 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1499  glutathione peroxidase  43.97 
 
 		 157 aa  144  5e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.278578  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1172  glutathione peroxidase family protein  50.32 
 
 		 162 aa  144  6e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3929  glutathione peroxidase  47.68 
 
 		 188 aa  144  6e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.592022 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3374  glutathione peroxidase  51.75 
 
 		 195 aa  144  6e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.479812  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4148  Glutathione peroxidase  52.41 
 
 		 158 aa  144  6e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.784559  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0042  glutathione peroxidase  48.68 
 
 		 212 aa  143  8.000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.490429  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1872  glutathione peroxidase  44.87 
 
 		 159 aa  143  9e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0683727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2741  glutathione peroxidase  47.3 
 
 		 162 aa  142  1e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000260986  hitchhiker  0.0000615291 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1346  glutathione peroxidase  45.16 
 
 		 159 aa  142  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.909183  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2074  glutathione peroxidase  45.16 
 
 		 159 aa  142  2e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.895406  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>