More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2931 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2931  glutathione peroxidase  100 
 
 		 159 aa  328  2e-89  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.953337 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2454  Peroxiredoxin  59.49 
 
 		 160 aa  211  1.9999999999999998e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0184161  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2699  glutathione peroxidase  59.12 
 
 		 160 aa  210  7e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0128  glutathione peroxidase  53.75 
 
 		 161 aa  193  1e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.594559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2472  Glutathione peroxidase  55.97 
 
 		 159 aa  192  2e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.161656  decreased coverage  0.0000149935 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3925  Glutathione peroxidase  55.7 
 
 		 165 aa  191  4e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1909  peroxiredoxin  56.05 
 
 		 161 aa  191  4e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.154084  normal  0.204796 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1354  glutathione peroxidase  54.43 
 
 		 162 aa  189  1e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.525114 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3973  Peroxiredoxin  54.43 
 
 		 165 aa  188  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000360978 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1665  glutathione peroxidase  54.72 
 
 		 159 aa  188  2.9999999999999997e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0389024 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1571  glutathione peroxidase  55.97 
 
 		 159 aa  187  5.999999999999999e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.154895  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1346  glutathione peroxidase  55.97 
 
 		 159 aa  187  5.999999999999999e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.909183  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2454  glutathione peroxidase  55.97 
 
 		 159 aa  187  5.999999999999999e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0273  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2599  glutathione peroxidase  55.97 
 
 		 159 aa  187  5.999999999999999e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.391635  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0889  glutathione peroxidase  55.06 
 
 		 168 aa  187  5.999999999999999e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.50899 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3238  glutathione peroxidase  55.97 
 
 		 159 aa  187  5.999999999999999e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.400465  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2074  glutathione peroxidase  55.97 
 
 		 159 aa  187  5.999999999999999e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.895406  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2510  glutathione peroxidase  55.97 
 
 		 159 aa  187  5.999999999999999e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0250  glutathione peroxidase  53.46 
 
 		 164 aa  186  9e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2011  glutathione peroxidase  55.35 
 
 		 159 aa  186  1e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0261647  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0226  Peroxiredoxin  54.78 
 
 		 163 aa  186  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2964  glutathione peroxidase  54.43 
 
 		 160 aa  186  1e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1570  Glutathione peroxidase  52.23 
 
 		 158 aa  184  3e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3613  glutathione peroxidase  55.41 
 
 		 161 aa  184  4e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.374005  normal  0.319321 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2764  glutathione peroxidase  54.09 
 
 		 161 aa  184  4e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0187221  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2329  putative glutathione peroxidase  55.41 
 
 		 161 aa  183  7e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.509466  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0484  glutathione peroxidase  51.88 
 
 		 161 aa  183  9e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1781  glutathione peroxidase family protein  54.14 
 
 		 161 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3981  glutathione peroxidase  55.41 
 
 		 161 aa  181  3e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.890862  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3665  glutathione peroxidase  51.9 
 
 		 158 aa  181  3e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3253  Peroxiredoxin  54.09 
 
 		 164 aa  181  3e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.350236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0118  glutathione peroxidase  51.57 
 
 		 160 aa  181  3e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00658  glutathione peroxidase  51.57 
 
 		 161 aa  181  4.0000000000000006e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0965068  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2067  glutathione peroxidase  52.2 
 
 		 159 aa  181  4.0000000000000006e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0190  glutathione peroxidase  52.2 
 
 		 161 aa  181  5.0000000000000004e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.926255  normal  0.776204 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1936  glutathione peroxidase  51.57 
 
 		 159 aa  180  6e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.634874 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1242  glutathione peroxidase  54.72 
 
 		 159 aa  180  8.000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27520  putative glutathione peroxidase  54.78 
 
 		 161 aa  180  8.000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.78279  normal  0.0357307 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6042  glutathione peroxidase  52.83 
 
 		 159 aa  179  1e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2271  glutathione peroxidase  53.16 
 
 		 160 aa  179  1e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2054  glutathione peroxidase  52.83 
 
 		 159 aa  179  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2035  glutathione peroxidase  52.83 
 
 		 159 aa  179  1e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2756  glutathione peroxidase  52.87 
 
 		 158 aa  179  2e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.447473  hitchhiker  0.0000941143 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2674  putative glutathione peroxidase protein  53.12 
 
 		 165 aa  178  2e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.552039 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2202  glutathione peroxidase  52.53 
 
 		 161 aa  179  2e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0177431  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1965  glutathione peroxidase  52.53 
 
 		 160 aa  178  2e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0718131  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2131  glutathione peroxidase  51.9 
 
 		 160 aa  178  2e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0694  glutathione peroxidase  50.94 
 
 		 161 aa  179  2e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000130339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1872  glutathione peroxidase  52.9 
 
 		 159 aa  178  2.9999999999999997e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0683727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1771  glutathione peroxidase  49.68 
 
 		 161 aa  177  4.999999999999999e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1971  glutathione peroxidase  51.9 
 
 		 160 aa  177  4.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.775227  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5344  glutathione peroxidase  52.2 
 
 		 159 aa  177  4.999999999999999e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.213102 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2119  glutathione peroxidase  51.9 
 
 		 160 aa  177  4.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1368  glutathione peroxidase  51.9 
 
 		 165 aa  177  4.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1407  glutathione peroxidase  51.9 
 
 		 165 aa  177  5.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0308338  normal  0.103968 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1384  glutathione peroxidase  51.9 
 
 		 165 aa  177  5.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0956  glutathione peroxidase  50.62 
 
 		 168 aa  177  5.999999999999999e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2975  Glutathione peroxidase  52.23 
 
 		 161 aa  177  7e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.36322  normal  0.036622 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1926  glutathione peroxidase  51.9 
 
 		 160 aa  177  7e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2875  glutathione peroxidase  51.9 
 
 		 161 aa  177  7e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000745159  hitchhiker  0.0000749041 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1449  glutathione peroxidase  53.8 
 
 		 162 aa  177  8e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00937829  normal  0.354884 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4148  Glutathione peroxidase  51.27 
 
 		 158 aa  176  9e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.784559  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1950  glutathione peroxidase  51.9 
 
 		 160 aa  176  1e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.210596  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2154  glutathione peroxidase  51.9 
 
 		 160 aa  176  1e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3184  glutathione peroxidase  51.27 
 
 		 160 aa  176  1e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3053  peroxiredoxin  52.2 
 
 		 164 aa  176  1e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.508134 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2773  glutathione peroxidase  51.27 
 
 		 161 aa  176  1e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000478947  hitchhiker  0.00587193 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0123  glutathione peroxidase  49.69 
 
 		 161 aa  176  1e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3298  glutathione peroxidase  52.6 
 
 		 161 aa  176  1e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.40101  decreased coverage  0.0000000224321 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0191  Glutathione peroxidase  51.57 
 
 		 161 aa  176  2e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1075  glutathione peroxidase  50.62 
 
 		 168 aa  175  2e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.364498  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2552  glutathione peroxidase  52.87 
 
 		 161 aa  175  2e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.40006  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2705  glutathione peroxidase  50.63 
 
 		 161 aa  175  2e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000249576  hitchhiker  0.0000800256 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1812  Peroxiredoxin  51.25 
 
 		 162 aa  176  2e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00250469  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3277  Peroxiredoxin  51.57 
 
 		 164 aa  175  2e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4117  Peroxiredoxin  47.47 
 
 		 182 aa  174  3e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2504  Glutathione peroxidase  52.2 
 
 		 165 aa  175  3e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.718008 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0872  glutathione peroxidase  50 
 
 		 158 aa  174  5e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2910  Glutathione peroxidase  52.2 
 
 		 165 aa  174  5e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3685  glutathione peroxidase  49.68 
 
 		 163 aa  174  5e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0173  glutathione peroxidase  50.94 
 
 		 161 aa  174  6e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.790659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2798  glutathione peroxidase  51.25 
 
 		 164 aa  173  8e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0841  glutathione peroxidase  52 
 
 		 164 aa  173  9e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0436995  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1334  Peroxiredoxin  51.59 
 
 		 169 aa  173  9.999999999999999e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0131674  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2639  glutathione peroxidase  49.37 
 
 		 158 aa  172  9.999999999999999e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.833403 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2934  glutathione peroxidase  51.25 
 
 		 164 aa  172  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0465616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0851  glutathione peroxidase  48.75 
 
 		 161 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.425919  decreased coverage  0.00020946 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1300  glutathione peroxidase  50 
 
 		 161 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.448702  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2597  Peroxiredoxin  49.04 
 
 		 158 aa  172  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2741  glutathione peroxidase  54.36 
 
 		 162 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000260986  hitchhiker  0.0000615291 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5332  glutathione peroxidase  50.98 
 
 		 163 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0814545  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02770  glutathione peroxidase  46.84 
 
 		 160 aa  171  2.9999999999999996e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.359164  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1015  Glutathione peroxidase  51.57 
 
 		 162 aa  171  2.9999999999999996e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0150707 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0020  glutathione peroxidase  50.31 
 
 		 168 aa  171  2.9999999999999996e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1874  glutathione peroxidase  51.27 
 
 		 162 aa  171  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0631469  normal  0.307231 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1563  glutathione peroxidase, putative  50 
 
 		 162 aa  171  3.9999999999999995e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0904  glutathione peroxidase  48.72 
 
 		 158 aa  171  5e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000826936  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6295  glutathione peroxidase  50.32 
 
 		 162 aa  170  6.999999999999999e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1769  glutathione peroxidase  49.68 
 
 		 162 aa  170  6.999999999999999e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0182367  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0867  glutathione peroxidase  48.41 
 
 		 159 aa  170  9e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000118287  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>