More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3880 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3880  putative glutathione peroxidase  100 
 
 		 191 aa  395  1e-109  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.41902 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1782  glutathione peroxidase  56.02 
 
 		 193 aa  200  9.999999999999999e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5475  glutathione peroxidase  58.18 
 
 		 189 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.416682  normal  0.0282506 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3929  glutathione peroxidase  56.17 
 
 		 188 aa  180  1e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.592022 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0392  glutathione peroxidase  49.21 
 
 		 188 aa  179  2e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0773128  normal  0.361866 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0360  glutathione peroxidase  54.97 
 
 		 184 aa  175  4e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.495486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0316  glutathione peroxidase  54.97 
 
 		 184 aa  175  4e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.282271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0270  glutathione peroxidase  50.32 
 
 		 158 aa  171  5.999999999999999e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0297  glutathione peroxidase  50.94 
 
 		 161 aa  169  2e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0981226  normal  0.609333 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1863  glutathione peroxidase  45.36 
 
 		 195 aa  163  1.0000000000000001e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2249  glutathione peroxidase  48.73 
 
 		 162 aa  163  1.0000000000000001e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.487328  normal  0.155268 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2011  glutathione peroxidase  47.65 
 
 		 159 aa  148  5e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0261647  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2389  putative glutathione peroxidase  51.41 
 
 		 176 aa  147  8e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.401751  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2453  glutathione peroxidase  45.86 
 
 		 158 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.70182 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1053  glutathione peroxidase  50.7 
 
 		 176 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.281088  normal  0.469721 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1571  glutathione peroxidase  46.98 
 
 		 159 aa  145  3e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.154895  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2599  glutathione peroxidase  46.98 
 
 		 159 aa  145  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.391635  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2510  glutathione peroxidase  46.98 
 
 		 159 aa  145  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1346  glutathione peroxidase  46.98 
 
 		 159 aa  145  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.909183  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2454  glutathione peroxidase  46.98 
 
 		 159 aa  145  3e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0273  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2074  glutathione peroxidase  46.98 
 
 		 159 aa  145  3e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.895406  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3238  glutathione peroxidase  46.98 
 
 		 159 aa  145  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.400465  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0169  glutathione peroxidase  43.5 
 
 		 231 aa  145  5e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3374  glutathione peroxidase  47.89 
 
 		 195 aa  144  8.000000000000001e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.479812  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0162  glutathione peroxidase  43.5 
 
 		 231 aa  144  9e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.520461 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0018  glutathione peroxidase  46.36 
 
 		 208 aa  144  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4024  glutathione peroxidase  47.89 
 
 		 213 aa  142  3e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5165  Peroxiredoxin  45.57 
 
 		 202 aa  142  4e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.648504  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0307  putative glutathione peroxidase transmembrane protein  45.22 
 
 		 233 aa  140  9.999999999999999e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2472  Glutathione peroxidase  44.22 
 
 		 159 aa  139  3e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.161656  decreased coverage  0.0000149935 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2202  glutathione peroxidase  42.11 
 
 		 161 aa  138  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0177431  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2271  glutathione peroxidase  42.11 
 
 		 160 aa  137  7e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1812  Peroxiredoxin  45 
 
 		 162 aa  137  7e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00250469  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1971  glutathione peroxidase  42.11 
 
 		 160 aa  137  7e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.775227  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2119  glutathione peroxidase  42.11 
 
 		 160 aa  137  7e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3184  glutathione peroxidase  41.45 
 
 		 160 aa  137  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0042  glutathione peroxidase  43.42 
 
 		 212 aa  137  8.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.490429  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1965  glutathione peroxidase  42.11 
 
 		 160 aa  137  8.999999999999999e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0718131  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2131  glutathione peroxidase  41.45 
 
 		 160 aa  137  1e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4667  glutathione peroxidase  44.74 
 
 		 199 aa  137  1e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0237  putative glutathione peroxidase transmembrane protein  50.71 
 
 		 205 aa  137  1e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3685  glutathione peroxidase  44.9 
 
 		 163 aa  137  1e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1936  glutathione peroxidase  43.62 
 
 		 159 aa  136  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.634874 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2067  glutathione peroxidase  43.62 
 
 		 159 aa  136  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1950  glutathione peroxidase  42.11 
 
 		 160 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.210596  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2154  glutathione peroxidase  42.11 
 
 		 160 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0559  glutathione peroxidase  46.31 
 
 		 161 aa  135  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0488  glutathione peroxidase  45.03 
 
 		 185 aa  135  4e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.642227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2054  glutathione peroxidase  43.62 
 
 		 159 aa  135  4e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6042  glutathione peroxidase  43.62 
 
 		 159 aa  135  4e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2035  glutathione peroxidase  43.62 
 
 		 159 aa  135  4e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2504  Glutathione peroxidase  40.12 
 
 		 165 aa  135  5e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.718008 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1926  glutathione peroxidase  41.45 
 
 		 160 aa  134  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1665  glutathione peroxidase  42.86 
 
 		 159 aa  134  8e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0389024 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2674  putative glutathione peroxidase protein  41.78 
 
 		 165 aa  134  9e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.552039 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01222  ABC transporter vitamin B12 uptake permease  42.11 
 
 		 185 aa  134  9.999999999999999e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.039958  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0238  Peroxiredoxin  38.55 
 
 		 170 aa  134  9.999999999999999e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2660  Glutathione peroxidase  43.05 
 
 		 159 aa  134  9.999999999999999e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0609505 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0697  Glutathione peroxidase  45.64 
 
 		 170 aa  134  9.999999999999999e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1970  glutathione peroxidase  42.36 
 
 		 193 aa  134  9.999999999999999e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2798  glutathione peroxidase  40.88 
 
 		 164 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5344  glutathione peroxidase  42.95 
 
 		 159 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.213102 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3273  glutathione peroxidase  42.08 
 
 		 174 aa  133  1.9999999999999998e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1354  glutathione peroxidase  41.61 
 
 		 162 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.525114 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2910  Glutathione peroxidase  38.89 
 
 		 165 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4659  glutathione peroxidase  45.07 
 
 		 208 aa  132  3e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0461  glutathione peroxidase  46.36 
 
 		 191 aa  132  3e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1242  glutathione peroxidase  44.3 
 
 		 159 aa  132  3e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30390  glutathione peroxidase  42.95 
 
 		 173 aa  132  3.9999999999999996e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0889  glutathione peroxidase  40 
 
 		 168 aa  132  3.9999999999999996e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.50899 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3912  glutathione peroxidase  44.37 
 
 		 189 aa  131  5e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.295477  normal  0.0278841 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03223  glutathione peroxidase  41.86 
 
 		 181 aa  131  5e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2934  glutathione peroxidase  43.05 
 
 		 164 aa  131  5e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0465616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1883  glutathione peroxidase  48.55 
 
 		 152 aa  131  6e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.255404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1080  glutathione peroxidase  42.18 
 
 		 164 aa  131  7.999999999999999e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000852506  normal  0.679739 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1570  Glutathione peroxidase  39.86 
 
 		 158 aa  130  9e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0173  glutathione peroxidase  42.04 
 
 		 161 aa  130  1.0000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.790659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0190  glutathione peroxidase  40.27 
 
 		 161 aa  130  1.0000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.926255  normal  0.776204 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1801  glutathione peroxidase  45.58 
 
 		 199 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.740072  hitchhiker  0.00000253639 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2756  glutathione peroxidase  41.06 
 
 		 158 aa  129  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.447473  hitchhiker  0.0000941143 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02770  glutathione peroxidase  41.25 
 
 		 160 aa  130  2.0000000000000002e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.359164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0250  glutathione peroxidase  42.18 
 
 		 164 aa  129  2.0000000000000002e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0876  Peroxiredoxin  39.49 
 
 		 177 aa  129  3e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0226  Peroxiredoxin  40 
 
 		 163 aa  129  3e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3925  Glutathione peroxidase  39.86 
 
 		 165 aa  129  3e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4117  Peroxiredoxin  37.72 
 
 		 182 aa  128  4.0000000000000003e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0191  Glutathione peroxidase  42.04 
 
 		 161 aa  128  4.0000000000000003e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0845  Peroxiredoxin  43.71 
 
 		 179 aa  128  4.0000000000000003e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.494379  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3981  glutathione peroxidase  43.17 
 
 		 161 aa  128  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.890862  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1579  glutathione peroxidase  41.36 
 
 		 164 aa  128  5.0000000000000004e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0189646  normal  0.0451688 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4022  Glutathione peroxidase  38.73 
 
 		 181 aa  128  6e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.350366 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1769  glutathione peroxidase  44.85 
 
 		 162 aa  127  7.000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0182367  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1909  peroxiredoxin  42.45 
 
 		 161 aa  127  9.000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.154084  normal  0.204796 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0484  glutathione peroxidase  37.82 
 
 		 161 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00658  glutathione peroxidase  41.55 
 
 		 161 aa  127  1.0000000000000001e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0965068  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27520  putative glutathione peroxidase  42.45 
 
 		 161 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.78279  normal  0.0357307 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3973  Peroxiredoxin  39.19 
 
 		 165 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000360978 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2329  putative glutathione peroxidase  42.45 
 
 		 161 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.509466  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1090  glutathione peroxidase  42.57 
 
 		 160 aa  126  2.0000000000000002e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.37333 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2597  Peroxiredoxin  38.67 
 
 		 158 aa  126  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>