More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_1409 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_1409  glutathione peroxidase  100 
 
 		 184 aa  382  1e-105  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3912  glutathione peroxidase  56.4 
 
 		 189 aa  184  5e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.295477  normal  0.0278841 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4024  glutathione peroxidase  56.44 
 
 		 213 aa  184  6e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3374  glutathione peroxidase  56.69 
 
 		 195 aa  182  2.0000000000000003e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.479812  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5165  Peroxiredoxin  58.13 
 
 		 202 aa  181  6e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.648504  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4659  glutathione peroxidase  54.94 
 
 		 208 aa  172  1.9999999999999998e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0018  glutathione peroxidase  54.27 
 
 		 208 aa  170  7.999999999999999e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01222  ABC transporter vitamin B12 uptake permease  51.48 
 
 		 185 aa  169  2e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.039958  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2618  glutathione peroxidase  59.85 
 
 		 195 aa  169  2e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.137836  normal  0.142472 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2526  glutathione peroxidase  51.85 
 
 		 180 aa  169  2e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.327392  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0237  putative glutathione peroxidase transmembrane protein  56.76 
 
 		 205 aa  168  4e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4667  glutathione peroxidase  56.03 
 
 		 199 aa  168  5e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0042  glutathione peroxidase  53.09 
 
 		 212 aa  167  7e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.490429  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02196  Glutathione peroxidase  51.52 
 
 		 184 aa  167  7e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0197549  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1970  glutathione peroxidase  55.03 
 
 		 193 aa  167  9e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0169  glutathione peroxidase  53.8 
 
 		 231 aa  166  1e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0162  glutathione peroxidase  55.26 
 
 		 231 aa  166  2e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.520461 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1801  glutathione peroxidase  52.17 
 
 		 199 aa  164  9e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.740072  hitchhiker  0.00000253639 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1246  glutathione peroxidase  53.25 
 
 		 192 aa  162  2.0000000000000002e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.281187  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0307  putative glutathione peroxidase transmembrane protein  54.32 
 
 		 233 aa  159  3e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0488  glutathione peroxidase  55.56 
 
 		 185 aa  157  6e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.642227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4103  putative glutathione peroxidase  47.27 
 
 		 184 aa  154  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47550  putative glutathione peroxidase  47.27 
 
 		 184 aa  154  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.532704 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0123  glutathione peroxidase  54.48 
 
 		 161 aa  154  5.0000000000000005e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1391  glutathione peroxidase  54.55 
 
 		 153 aa  154  8e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0461  glutathione peroxidase  46.51 
 
 		 191 aa  151  5.9999999999999996e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1686  glutathione peroxidase  43.17 
 
 		 202 aa  150  7e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.677668  normal  0.86735 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0118  glutathione peroxidase  53.1 
 
 		 160 aa  150  8e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4033  glutathione peroxidase  43.17 
 
 		 183 aa  150  1e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.475849  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1284  glutathione peroxidase  43.17 
 
 		 183 aa  149  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.604655  normal  0.560913 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2853  glutathione peroxidase  43.93 
 
 		 177 aa  148  3e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.154923  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3180  glutathione peroxidase  43.93 
 
 		 179 aa  148  4e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000271589  normal  0.0170233 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02770  glutathione peroxidase  52.14 
 
 		 160 aa  148  5e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.359164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3022  glutathione peroxidase  43.93 
 
 		 230 aa  148  6e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00278721  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05309  glutathione peroxidase  46.67 
 
 		 181 aa  147  6e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3037  glutathione peroxidase  43.93 
 
 		 230 aa  147  7e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000026286  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1341  glutathione peroxidase  43.93 
 
 		 179 aa  147  9e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0267656  hitchhiker  0.0000000425712 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1244  glutathione peroxidase  44.85 
 
 		 176 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.247052  normal  0.300123 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1781  glutathione peroxidase family protein  50 
 
 		 161 aa  145  3e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1267  glutathione peroxidase  44.91 
 
 		 203 aa  145  3e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0133013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1178  glutathione peroxidase  50.71 
 
 		 158 aa  145  4.0000000000000006e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.375161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1196  glutathione peroxidase  44.91 
 
 		 203 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0218447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1197  glutathione peroxidase  44.91 
 
 		 203 aa  145  5e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00644229  normal  0.718028 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1719  glutathione peroxidase family protein  44.77 
 
 		 183 aa  144  6e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00731943  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000573  glutathione peroxidase  45.1 
 
 		 181 aa  144  8.000000000000001e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3670  glutathione peroxidase  43.55 
 
 		 184 aa  143  1e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.174884  normal  0.0808268 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3685  glutathione peroxidase  49.33 
 
 		 163 aa  143  2e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2453  glutathione peroxidase  48.05 
 
 		 158 aa  142  2e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.70182 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2875  glutathione peroxidase  50 
 
 		 161 aa  142  2e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000745159  hitchhiker  0.0000749041 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2773  glutathione peroxidase  49.29 
 
 		 161 aa  141  7e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000478947  hitchhiker  0.00587193 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2684  glutathione peroxidase  41.67 
 
 		 179 aa  140  8e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.553323  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2705  glutathione peroxidase  48.57 
 
 		 161 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000249576  hitchhiker  0.0000800256 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27520  putative glutathione peroxidase  49.66 
 
 		 161 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.78279  normal  0.0357307 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2474  glutathione peroxidase, putative  45.91 
 
 		 180 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2329  putative glutathione peroxidase  49.66 
 
 		 161 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.509466  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3613  glutathione peroxidase  47.47 
 
 		 161 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.374005  normal  0.319321 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1654  glutathione peroxidase  41.67 
 
 		 186 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.323621  hitchhiker  0.0047837 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1427  GMP synthase-like  42.19 
 
 		 190 aa  139  1.9999999999999998e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0694  glutathione peroxidase  50.35 
 
 		 161 aa  139  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000130339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2597  Peroxiredoxin  47.86 
 
 		 158 aa  139  3e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1909  peroxiredoxin  49.66 
 
 		 161 aa  139  3e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.154084  normal  0.204796 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1971  glutathione peroxidase  48.92 
 
 		 160 aa  138  3.9999999999999997e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.775227  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1950  glutathione peroxidase  48.92 
 
 		 160 aa  138  3.9999999999999997e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.210596  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2119  glutathione peroxidase  48.92 
 
 		 160 aa  138  3.9999999999999997e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2154  glutathione peroxidase  48.92 
 
 		 160 aa  138  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0020  glutathione peroxidase  46.58 
 
 		 168 aa  138  3.9999999999999997e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1926  glutathione peroxidase  48.92 
 
 		 160 aa  138  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02660  glutathione peroxidase  50.36 
 
 		 158 aa  138  4.999999999999999e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1872  glutathione peroxidase  45.03 
 
 		 159 aa  137  6e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0683727  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3349  glutathione peroxidase, putative  42.51 
 
 		 177 aa  137  7e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2472  Glutathione peroxidase  50.68 
 
 		 159 aa  137  7e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.161656  decreased coverage  0.0000149935 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0484  glutathione peroxidase  50 
 
 		 161 aa  137  7.999999999999999e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0851  glutathione peroxidase  47.89 
 
 		 161 aa  136  1e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.425919  decreased coverage  0.00020946 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2271  glutathione peroxidase  48.2 
 
 		 160 aa  136  1e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2202  glutathione peroxidase  47.52 
 
 		 161 aa  137  1e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0177431  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1563  glutathione peroxidase, putative  47.83 
 
 		 162 aa  137  1e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0226  Peroxiredoxin  49.33 
 
 		 163 aa  137  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3641  peroxiredoxin  48.67 
 
 		 161 aa  136  1e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1665  glutathione peroxidase  49.35 
 
 		 159 aa  137  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0389024 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1080  glutathione peroxidase  49.31 
 
 		 164 aa  137  1e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000852506  normal  0.679739 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1965  glutathione peroxidase  48.2 
 
 		 160 aa  136  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0718131  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2131  glutathione peroxidase  48.2 
 
 		 160 aa  136  2e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3184  glutathione peroxidase  48.2 
 
 		 160 aa  136  2e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1368  glutathione peroxidase  47.83 
 
 		 165 aa  135  2e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1407  glutathione peroxidase  47.83 
 
 		 165 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0308338  normal  0.103968 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3981  glutathione peroxidase  46.84 
 
 		 161 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.890862  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2515  glutathione peroxidase  44.65 
 
 		 185 aa  135  3.0000000000000003e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30390  glutathione peroxidase  47.65 
 
 		 173 aa  135  3.0000000000000003e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2975  Glutathione peroxidase  47.83 
 
 		 161 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.36322  normal  0.036622 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2067  glutathione peroxidase  50 
 
 		 159 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1936  glutathione peroxidase  50 
 
 		 159 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.634874 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3053  peroxiredoxin  48.23 
 
 		 164 aa  135  4e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.508134 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0190  glutathione peroxidase  48.59 
 
 		 161 aa  135  5e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.926255  normal  0.776204 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1570  Glutathione peroxidase  44.44 
 
 		 158 aa  134  5e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1300  glutathione peroxidase  47.14 
 
 		 161 aa  134  5e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.448702  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2934  glutathione peroxidase  49.65 
 
 		 164 aa  135  5e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0465616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0128  glutathione peroxidase  48.59 
 
 		 161 aa  134  6.0000000000000005e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.594559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1384  glutathione peroxidase  47.1 
 
 		 165 aa  134  7.000000000000001e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1677  glutathione peroxidase  58.77 
 
 		 151 aa  134  7.000000000000001e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4148  Glutathione peroxidase  51.82 
 
 		 158 aa  134  7.000000000000001e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.784559  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>