More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1391 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1391  glutathione peroxidase  100 
 
 
153 aa  313  6e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01222  ABC transporter vitamin B12 uptake permease  55 
 
 
185 aa  154  3e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.039958  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1409  glutathione peroxidase  54.55 
 
 
184 aa  154  5.0000000000000005e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2618  glutathione peroxidase  60.87 
 
 
195 aa  150  8e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.137836  normal  0.142472 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1246  glutathione peroxidase  56.67 
 
 
192 aa  146  8e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.281187  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0237  putative glutathione peroxidase transmembrane protein  50 
 
 
205 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2526  glutathione peroxidase  52.14 
 
 
180 aa  143  7.0000000000000006e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.327392  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0488  glutathione peroxidase  53.9 
 
 
185 aa  142  1e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.642227  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1801  glutathione peroxidase  49.37 
 
 
199 aa  140  5e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.740072  hitchhiker  0.00000253639 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0169  glutathione peroxidase  53.85 
 
 
231 aa  137  3.9999999999999997e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0162  glutathione peroxidase  52.67 
 
 
231 aa  136  1e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.520461 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02196  Glutathione peroxidase  50.81 
 
 
184 aa  134  3.0000000000000003e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0197549  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0307  putative glutathione peroxidase transmembrane protein  55.65 
 
 
233 aa  134  4e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1970  glutathione peroxidase  50 
 
 
193 aa  134  5e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4659  glutathione peroxidase  51.56 
 
 
208 aa  134  6.0000000000000005e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0018  glutathione peroxidase  54.84 
 
 
208 aa  133  9e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0042  glutathione peroxidase  54.03 
 
 
212 aa  132  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.490429  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0359  glutathione peroxidase  45.77 
 
 
182 aa  130  5e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01902  probable glutathione peroxidase  53.64 
 
 
165 aa  129  1.0000000000000001e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.101099  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0461  glutathione peroxidase  46.36 
 
 
191 aa  129  1.0000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3912  glutathione peroxidase  50.39 
 
 
189 aa  129  2.0000000000000002e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.295477  normal  0.0278841 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1677  glutathione peroxidase  54.9 
 
 
151 aa  128  3e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0123  glutathione peroxidase  58.18 
 
 
161 aa  128  3e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2461  glutathione peroxidase  53.27 
 
 
177 aa  127  5.0000000000000004e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1334  Peroxiredoxin  56.86 
 
 
169 aa  126  1.0000000000000001e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0131674  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1571  glutathione peroxidase  54.24 
 
 
159 aa  125  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.154895  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1346  glutathione peroxidase  54.24 
 
 
159 aa  125  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.909183  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2454  glutathione peroxidase  54.24 
 
 
159 aa  125  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0273  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2599  glutathione peroxidase  54.24 
 
 
159 aa  125  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.391635  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3238  glutathione peroxidase  54.24 
 
 
159 aa  125  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.400465  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2510  glutathione peroxidase  54.24 
 
 
159 aa  125  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2074  glutathione peroxidase  54.24 
 
 
159 aa  125  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.895406  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2453  glutathione peroxidase  57.28 
 
 
158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.70182 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1570  Glutathione peroxidase  56.07 
 
 
158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0118  glutathione peroxidase  57.27 
 
 
160 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3022  glutathione peroxidase  42.55 
 
 
230 aa  125  3e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00278721  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05309  glutathione peroxidase  42.36 
 
 
181 aa  125  3e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2468  putative glutathione peroxidase  57.01 
 
 
183 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.157307  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2774  putative glutathione peroxidase  57.01 
 
 
183 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.956503  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0867  glutathione peroxidase  50.45 
 
 
159 aa  124  4.0000000000000003e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000118287  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3180  glutathione peroxidase  41.84 
 
 
179 aa  124  5e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000271589  normal  0.0170233 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4667  glutathione peroxidase  59.8 
 
 
199 aa  124  6e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2011  glutathione peroxidase  52.54 
 
 
159 aa  124  6e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0261647  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2597  Peroxiredoxin  57.58 
 
 
158 aa  124  6e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4024  glutathione peroxidase  53.97 
 
 
213 aa  124  6e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0904  glutathione peroxidase  50.45 
 
 
158 aa  124  7e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000826936  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3685  glutathione peroxidase  53.27 
 
 
163 aa  123  1e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3037  glutathione peroxidase  41.84 
 
 
230 aa  122  1e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000026286  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1300  glutathione peroxidase  53.21 
 
 
161 aa  123  1e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.448702  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2756  glutathione peroxidase  59 
 
 
158 aa  122  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.447473  hitchhiker  0.0000941143 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1341  glutathione peroxidase  41.84 
 
 
179 aa  122  1e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0267656  hitchhiker  0.0000000425712 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3374  glutathione peroxidase  60.61 
 
 
195 aa  122  2e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.479812  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3184  glutathione peroxidase  47.46 
 
 
160 aa  122  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2975  Glutathione peroxidase  53.21 
 
 
161 aa  122  2e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.36322  normal  0.036622 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2764  glutathione peroxidase  45.3 
 
 
161 aa  122  2e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0187221  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1080  glutathione peroxidase  55.56 
 
 
164 aa  122  2e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000852506  normal  0.679739 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1090  glutathione peroxidase  55.88 
 
 
160 aa  121  3e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.37333 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1665  glutathione peroxidase  56.36 
 
 
159 aa  121  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0389024 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1267  glutathione peroxidase  44.78 
 
 
203 aa  122  3e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0133013  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3925  Glutathione peroxidase  49.09 
 
 
165 aa  120  5e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3973  Peroxiredoxin  52 
 
 
165 aa  120  5e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000360978 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1407  glutathione peroxidase  52.29 
 
 
165 aa  120  5e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0308338  normal  0.103968 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1368  glutathione peroxidase  52.29 
 
 
165 aa  120  5e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1965  glutathione peroxidase  46.61 
 
 
160 aa  120  5e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0718131  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2131  glutathione peroxidase  46.61 
 
 
160 aa  120  5e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2853  glutathione peroxidase  44.36 
 
 
177 aa  120  5e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.154923  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1971  glutathione peroxidase  46.61 
 
 
160 aa  120  7e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.775227  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2119  glutathione peroxidase  46.61 
 
 
160 aa  120  7e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1196  glutathione peroxidase  44.78 
 
 
203 aa  120  7e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0218447  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1499  glutathione peroxidase  52.38 
 
 
157 aa  120  7e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.278578  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03223  glutathione peroxidase  62.92 
 
 
181 aa  120  8e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0191  Glutathione peroxidase  58 
 
 
161 aa  120  8e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2910  Glutathione peroxidase  56.57 
 
 
165 aa  120  9e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0226  Peroxiredoxin  53.27 
 
 
163 aa  120  9e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1950  glutathione peroxidase  50.46 
 
 
160 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.210596  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1769  glutathione peroxidase  53.27 
 
 
162 aa  119  9.999999999999999e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0182367  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2154  glutathione peroxidase  50.46 
 
 
160 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1178  glutathione peroxidase  51.82 
 
 
158 aa  119  9.999999999999999e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.375161  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1197  glutathione peroxidase  44.03 
 
 
203 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00644229  normal  0.718028 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2202  glutathione peroxidase  45.76 
 
 
161 aa  118  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0177431  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3349  glutathione peroxidase, putative  41.79 
 
 
177 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1926  glutathione peroxidase  46.61 
 
 
160 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4077  glutathione peroxidase  50 
 
 
162 aa  119  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.629032 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0173  glutathione peroxidase  57 
 
 
161 aa  118  1.9999999999999998e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.790659  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0484  glutathione peroxidase  48.72 
 
 
161 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2271  glutathione peroxidase  45.76 
 
 
160 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2504  Glutathione peroxidase  56.57 
 
 
165 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.718008 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1936  glutathione peroxidase  54.13 
 
 
159 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.634874 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2067  glutathione peroxidase  54.13 
 
 
159 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2152  putative glutathione peroxidase  59.55 
 
 
183 aa  119  1.9999999999999998e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1242  glutathione peroxidase  54.9 
 
 
159 aa  118  3e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000573  glutathione peroxidase  42.34 
 
 
181 aa  118  3e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5344  glutathione peroxidase  54.9 
 
 
159 aa  118  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.213102 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0889  glutathione peroxidase  52.29 
 
 
168 aa  118  3e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.50899 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1655  Peroxiredoxin  56.99 
 
 
183 aa  118  3e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.401167  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2054  glutathione peroxidase  54.9 
 
 
159 aa  118  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6042  glutathione peroxidase  54.9 
 
 
159 aa  118  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4117  Peroxiredoxin  53.27 
 
 
182 aa  118  3e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2035  glutathione peroxidase  54.9 
 
 
159 aa  118  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2875  glutathione peroxidase  54 
 
 
161 aa  118  3e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000745159  hitchhiker  0.0000749041 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>