More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_1677 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010531  Pnec_1677  glutathione peroxidase  100 
 
 
151 aa  312  8e-85  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1970  glutathione peroxidase  76.92 
 
 
193 aa  233  5.0000000000000005e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4659  glutathione peroxidase  75.22 
 
 
208 aa  187  4e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0237  putative glutathione peroxidase transmembrane protein  63.43 
 
 
205 aa  181  4.0000000000000006e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0042  glutathione peroxidase  70.69 
 
 
212 aa  180  5.0000000000000004e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.490429  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0018  glutathione peroxidase  69.83 
 
 
208 aa  179  9.000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5165  Peroxiredoxin  71.3 
 
 
202 aa  175  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.648504  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4667  glutathione peroxidase  65.22 
 
 
199 aa  172  1.9999999999999998e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3912  glutathione peroxidase  68.14 
 
 
189 aa  169  1e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.295477  normal  0.0278841 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0162  glutathione peroxidase  66.37 
 
 
231 aa  168  2e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.520461 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4024  glutathione peroxidase  63.85 
 
 
213 aa  169  2e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3374  glutathione peroxidase  66.38 
 
 
195 aa  169  2e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.479812  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0169  glutathione peroxidase  66.37 
 
 
231 aa  167  4e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0488  glutathione peroxidase  66.07 
 
 
185 aa  163  6.9999999999999995e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.642227  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0307  putative glutathione peroxidase transmembrane protein  64.6 
 
 
233 aa  162  1.0000000000000001e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0461  glutathione peroxidase  51.45 
 
 
191 aa  152  1e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1409  glutathione peroxidase  58.77 
 
 
184 aa  134  4e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2618  glutathione peroxidase  60.78 
 
 
195 aa  134  6.0000000000000005e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.137836  normal  0.142472 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02770  glutathione peroxidase  55.26 
 
 
160 aa  131  3e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.359164  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0020  glutathione peroxidase  53.04 
 
 
168 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1391  glutathione peroxidase  54.9 
 
 
153 aa  128  3e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1246  glutathione peroxidase  48.67 
 
 
192 aa  128  3e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.281187  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2461  glutathione peroxidase  53.77 
 
 
177 aa  127  4.0000000000000003e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01222  ABC transporter vitamin B12 uptake permease  55.75 
 
 
185 aa  127  4.0000000000000003e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.039958  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2526  glutathione peroxidase  45.7 
 
 
180 aa  127  5.0000000000000004e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.327392  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0265  Peroxiredoxin  53.91 
 
 
165 aa  127  7.000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000231119  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1178  glutathione peroxidase  52.73 
 
 
158 aa  127  7.000000000000001e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.375161  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02660  glutathione peroxidase  53.57 
 
 
158 aa  126  8.000000000000001e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1570  Glutathione peroxidase  55.86 
 
 
158 aa  125  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0324  Glutathione peroxidase  53.91 
 
 
165 aa  126  1.0000000000000001e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.324106  normal  0.0807721 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1872  glutathione peroxidase  51.72 
 
 
159 aa  125  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0683727  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01902  probable glutathione peroxidase  55.05 
 
 
165 aa  123  7e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.101099  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02196  Glutathione peroxidase  51.33 
 
 
184 aa  123  1e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0197549  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4117  Peroxiredoxin  51.75 
 
 
182 aa  123  1e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2453  glutathione peroxidase  50 
 
 
158 aa  121  3e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.70182 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0250  glutathione peroxidase  53.21 
 
 
164 aa  120  5e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0123  glutathione peroxidase  52.73 
 
 
161 aa  120  5e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5025  peroxiredoxin  51.26 
 
 
171 aa  120  5e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0652457 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1090  glutathione peroxidase  52.68 
 
 
160 aa  120  7e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.37333 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2152  putative glutathione peroxidase  58.95 
 
 
183 aa  120  7e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3267  glutathione peroxidase  53.15 
 
 
158 aa  120  7e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0565  glutathione peroxidase  49.61 
 
 
182 aa  120  8e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2683  Peroxiredoxin  54.55 
 
 
160 aa  120  9e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.299838  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0191  Glutathione peroxidase  49.15 
 
 
161 aa  119  9.999999999999999e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6295  glutathione peroxidase  50 
 
 
162 aa  119  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5344  glutathione peroxidase  51.72 
 
 
159 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.213102 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1334  Peroxiredoxin  53.64 
 
 
169 aa  119  9.999999999999999e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0131674  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0904  glutathione peroxidase  53.21 
 
 
158 aa  119  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000826936  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03223  glutathione peroxidase  55.67 
 
 
181 aa  118  1.9999999999999998e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2674  putative glutathione peroxidase protein  53.21 
 
 
165 aa  118  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.552039 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2639  glutathione peroxidase  50 
 
 
158 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.833403 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2597  Peroxiredoxin  53.15 
 
 
158 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1214  glutathione peroxidase  48.25 
 
 
167 aa  118  1.9999999999999998e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0851  glutathione peroxidase  49.57 
 
 
161 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.425919  decreased coverage  0.00020946 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6042  glutathione peroxidase  51.72 
 
 
159 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0867  glutathione peroxidase  54.29 
 
 
159 aa  118  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000118287  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2472  Glutathione peroxidase  53.1 
 
 
159 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.161656  decreased coverage  0.0000149935 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1936  glutathione peroxidase  51.3 
 
 
159 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.634874 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1315  glutathione peroxidase  50.42 
 
 
173 aa  119  1.9999999999999998e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2035  glutathione peroxidase  51.72 
 
 
159 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0118  glutathione peroxidase  51.82 
 
 
160 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2054  glutathione peroxidase  51.72 
 
 
159 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2774  putative glutathione peroxidase  56.52 
 
 
183 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.956503  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3685  glutathione peroxidase  49.57 
 
 
163 aa  118  3e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0697  Glutathione peroxidase  48.03 
 
 
170 aa  118  3e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5332  glutathione peroxidase  49.58 
 
 
163 aa  118  3e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0814545  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1626  Peroxiredoxin  50 
 
 
183 aa  118  3e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3665  glutathione peroxidase  52.78 
 
 
158 aa  118  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2910  Glutathione peroxidase  54.13 
 
 
165 aa  118  3e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2067  glutathione peroxidase  51.3 
 
 
159 aa  118  3e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2504  Glutathione peroxidase  54.13 
 
 
165 aa  118  3e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.718008 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1863  glutathione peroxidase  50 
 
 
195 aa  118  3.9999999999999996e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1257  glutathione peroxidase  44.44 
 
 
182 aa  118  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2756  glutathione peroxidase  52.17 
 
 
158 aa  117  3.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.447473  hitchhiker  0.0000941143 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2875  glutathione peroxidase  54.46 
 
 
161 aa  118  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000745159  hitchhiker  0.0000749041 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0173  glutathione peroxidase  48.31 
 
 
161 aa  117  3.9999999999999996e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.790659  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1199  glutathione peroxidase  49.14 
 
 
182 aa  117  4.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0894577  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1665  glutathione peroxidase  53.1 
 
 
159 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0389024 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0297  glutathione peroxidase  47.86 
 
 
161 aa  117  4.9999999999999996e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0981226  normal  0.609333 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2705  glutathione peroxidase  54.46 
 
 
161 aa  117  4.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000249576  hitchhiker  0.0000800256 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2773  glutathione peroxidase  54.46 
 
 
161 aa  117  4.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000478947  hitchhiker  0.00587193 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2011  glutathione peroxidase  50.46 
 
 
159 aa  117  6e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0261647  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0226  Peroxiredoxin  49.57 
 
 
163 aa  117  7e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1242  glutathione peroxidase  51.3 
 
 
159 aa  117  7e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2454  glutathione peroxidase  50.46 
 
 
159 aa  116  7.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0273  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1571  glutathione peroxidase  50.46 
 
 
159 aa  116  7.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.154895  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1346  glutathione peroxidase  50.46 
 
 
159 aa  116  7.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.909183  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2599  glutathione peroxidase  50.46 
 
 
159 aa  116  7.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.391635  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2510  glutathione peroxidase  50.46 
 
 
159 aa  116  7.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3238  glutathione peroxidase  50.46 
 
 
159 aa  116  7.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.400465  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2074  glutathione peroxidase  50.46 
 
 
159 aa  116  7.999999999999999e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.895406  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0559  glutathione peroxidase  47.29 
 
 
161 aa  117  7.999999999999999e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2699  glutathione peroxidase  55.24 
 
 
160 aa  116  9e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1721  putative glutathione peroxidase  55.32 
 
 
184 aa  116  9e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.326937  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1829  putative glutathione peroxidase  55.32 
 
 
184 aa  116  9e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2615  putative glutathione peroxidase  55.32 
 
 
184 aa  116  9e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1364  glutathione peroxidase  56.19 
 
 
158 aa  116  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00178793  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1390  glutathione peroxidase  56.19 
 
 
158 aa  116  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05309  glutathione peroxidase  53.33 
 
 
181 aa  115  9.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1080  glutathione peroxidase  52.25 
 
 
164 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000852506  normal  0.679739 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>