More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2187 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2187  glutathione peroxidase  100 
 
 		 170 aa  343  5e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.836515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0876  Peroxiredoxin  49.11 
 
 		 177 aa  167  4e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0040  Peroxiredoxin  50.97 
 
 		 206 aa  161  3e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0496109 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2679  glutathione peroxidase  50.93 
 
 		 194 aa  161  4.0000000000000004e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1579  glutathione peroxidase  51.66 
 
 		 164 aa  159  2e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0189646  normal  0.0451688 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0226  Peroxiredoxin  48.99 
 
 		 163 aa  144  5e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2558  Peroxiredoxin  45.7 
 
 		 162 aa  144  7.0000000000000006e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.177554  normal  0.095865 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1015  Glutathione peroxidase  45.89 
 
 		 162 aa  143  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0150707 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3641  peroxiredoxin  41.94 
 
 		 161 aa  142  3e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6245  Glutathione peroxidase  40.65 
 
 		 163 aa  141  5e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.479243  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0484  glutathione peroxidase  47.26 
 
 		 161 aa  140  6e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0250  glutathione peroxidase  44.9 
 
 		 164 aa  140  9.999999999999999e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4117  Peroxiredoxin  43.51 
 
 		 182 aa  139  1.9999999999999998e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0889  glutathione peroxidase  45.95 
 
 		 168 aa  139  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.50899 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3507  glutathione peroxidase  42.11 
 
 		 204 aa  139  1.9999999999999998e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.721934  normal  0.622585 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3198  Glutathione peroxidase protein  48.97 
 
 		 159 aa  139  1.9999999999999998e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.246451  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2597  Peroxiredoxin  48.3 
 
 		 158 aa  138  3.9999999999999997e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2944  glutathione peroxidase  47.22 
 
 		 195 aa  137  4.999999999999999e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0986023  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4077  glutathione peroxidase  46.58 
 
 		 162 aa  137  4.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.629032 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2931  glutathione peroxidase  48.63 
 
 		 159 aa  137  4.999999999999999e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.953337 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0845  Peroxiredoxin  42.95 
 
 		 179 aa  137  6e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.494379  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1214  glutathione peroxidase  42.95 
 
 		 167 aa  137  7e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1570  Glutathione peroxidase  46.94 
 
 		 158 aa  137  8.999999999999999e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0883  glutathione peroxidase  42.67 
 
 		 160 aa  136  1e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.961514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6295  glutathione peroxidase  43.24 
 
 		 162 aa  136  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5382  Peroxiredoxin  41.83 
 
 		 179 aa  137  1e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.0000126467  normal  0.555193 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0841  glutathione peroxidase  41.94 
 
 		 164 aa  135  2e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0436995  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2639  glutathione peroxidase  43.84 
 
 		 158 aa  135  2e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.833403 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3665  glutathione peroxidase  42.86 
 
 		 158 aa  136  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0694  glutathione peroxidase  45.52 
 
 		 161 aa  135  2e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000130339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0128  glutathione peroxidase  45.58 
 
 		 161 aa  135  2e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.594559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0190  glutathione peroxidase  44.97 
 
 		 161 aa  135  3.0000000000000003e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.926255  normal  0.776204 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3298  glutathione peroxidase  45.16 
 
 		 161 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.40101  decreased coverage  0.0000000224321 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6518  Peroxiredoxin  42.95 
 
 		 161 aa  134  5e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1926  glutathione peroxidase  45.64 
 
 		 160 aa  134  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2909  Peroxiredoxin  45.52 
 
 		 198 aa  134  6.0000000000000005e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1965  glutathione peroxidase  44.97 
 
 		 160 aa  134  7.000000000000001e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0718131  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3447  glutathione peroxidase  43.51 
 
 		 161 aa  134  8e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0243575 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2453  glutathione peroxidase  43.92 
 
 		 158 aa  134  9e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.70182 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4682  glutathione peroxidase  39.35 
 
 		 160 aa  133  9e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2131  glutathione peroxidase  44.97 
 
 		 160 aa  133  9e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1354  glutathione peroxidase  43.59 
 
 		 162 aa  134  9e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.525114 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0238  Peroxiredoxin  44.16 
 
 		 170 aa  133  9.999999999999999e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0297  glutathione peroxidase  43.45 
 
 		 161 aa  133  9.999999999999999e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0981226  normal  0.609333 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1199  glutathione peroxidase  43.02 
 
 		 182 aa  133  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0894577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3925  Glutathione peroxidase  44.23 
 
 		 165 aa  133  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41100  Glutathione peroxidase  40.26 
 
 		 160 aa  133  9.999999999999999e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.341833  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1812  Peroxiredoxin  41.4 
 
 		 162 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00250469  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4413  glutathione peroxidase  40.26 
 
 		 160 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.312074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3973  Peroxiredoxin  43.59 
 
 		 165 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000360978 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2202  glutathione peroxidase  44.97 
 
 		 161 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0177431  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2756  glutathione peroxidase  45.27 
 
 		 158 aa  132  1.9999999999999998e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.447473  hitchhiker  0.0000941143 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1665  glutathione peroxidase  44.23 
 
 		 159 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0389024 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0118  glutathione peroxidase  42.58 
 
 		 160 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1971  glutathione peroxidase  44.97 
 
 		 160 aa  132  3e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.775227  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2271  glutathione peroxidase  44.3 
 
 		 160 aa  132  3e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2119  glutathione peroxidase  44.97 
 
 		 160 aa  132  3e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2660  Glutathione peroxidase  40.41 
 
 		 159 aa  131  3e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0609505 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02660  glutathione peroxidase  42.04 
 
 		 158 aa  131  3.9999999999999996e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0270  glutathione peroxidase  41.56 
 
 		 158 aa  131  3.9999999999999996e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0191  Glutathione peroxidase  42.86 
 
 		 161 aa  131  3.9999999999999996e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0123  glutathione peroxidase  41.94 
 
 		 161 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3184  glutathione peroxidase  44.3 
 
 		 160 aa  131  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE00580  glutathione peroxidase, putative  46.01 
 
 		 185 aa  131  5e-30  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.256439  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1863  glutathione peroxidase  39.74 
 
 		 195 aa  131  5e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3685  glutathione peroxidase  40.38 
 
 		 163 aa  130  6.999999999999999e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53420  glutathione peroxidase  38.71 
 
 		 160 aa  130  6.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.31883  normal  0.0505345 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1499  glutathione peroxidase  43.26 
 
 		 157 aa  130  6.999999999999999e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.278578  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0173  glutathione peroxidase  42.18 
 
 		 161 aa  130  7.999999999999999e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.790659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2472  Glutathione peroxidase  44.23 
 
 		 159 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.161656  decreased coverage  0.0000149935 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2154  glutathione peroxidase  44.97 
 
 		 160 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1950  glutathione peroxidase  44.97 
 
 		 160 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.210596  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4940  glutathione peroxidase  44.14 
 
 		 165 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.232541 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1016  glutathione peroxidase  46.48 
 
 		 159 aa  130  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0391982  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4557  glutathione peroxidase  44.14 
 
 		 165 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4645  glutathione peroxidase  44.14 
 
 		 165 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0872  glutathione peroxidase  43.15 
 
 		 158 aa  129  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1897  glutathione peroxidase  38.96 
 
 		 158 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10951  glutathione peroxidase  46.48 
 
 		 159 aa  129  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10951  glutathione peroxidase  45.77 
 
 		 159 aa  129  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.960114  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1247  Glutathione peroxidase  37.75 
 
 		 163 aa  128  3e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0148462  normal  0.0739839 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1010  glutathione peroxidase  40.91 
 
 		 162 aa  128  3e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14340  glutathione peroxidase  38.71 
 
 		 166 aa  128  3e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1059  glutathione peroxidase  39.08 
 
 		 178 aa  129  3e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.428642  normal  0.565362 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6042  glutathione peroxidase  44.22 
 
 		 159 aa  129  3e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2054  glutathione peroxidase  44.22 
 
 		 159 aa  129  3e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2035  glutathione peroxidase  44.22 
 
 		 159 aa  129  3e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5134  glutathione peroxidase  42.57 
 
 		 165 aa  128  3e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1619  glutathione peroxidase  43.45 
 
 		 164 aa  128  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3470  glutathione peroxidase  40.91 
 
 		 158 aa  128  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1936  glutathione peroxidase  41.67 
 
 		 159 aa  128  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.634874 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1315  glutathione peroxidase  42.48 
 
 		 173 aa  127  5.0000000000000004e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2798  glutathione peroxidase  43.45 
 
 		 164 aa  127  6e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7246  glutathione peroxidase  42.41 
 
 		 182 aa  127  6e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.156193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2067  glutathione peroxidase  41.67 
 
 		 159 aa  127  6e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0956  glutathione peroxidase  40.76 
 
 		 168 aa  127  7.000000000000001e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2741  glutathione peroxidase  43.84 
 
 		 162 aa  127  7.000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000260986  hitchhiker  0.0000615291 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2552  glutathione peroxidase  43.84 
 
 		 161 aa  127  8.000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.40006  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1390  glutathione peroxidase  42.57 
 
 		 158 aa  127  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0851  glutathione peroxidase  41.89 
 
 		 161 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.425919  decreased coverage  0.00020946 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>