More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNE00580 on replicon NC_006687
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006687  CNE00580  glutathione peroxidase, putative  100 
 
 
185 aa  375  1e-103  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.256439  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3685  glutathione peroxidase  53.09 
 
 
163 aa  187  1e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2597  Peroxiredoxin  55.83 
 
 
158 aa  184  5e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1769  glutathione peroxidase  52.76 
 
 
162 aa  182  2.0000000000000003e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0182367  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1178  glutathione peroxidase  54.66 
 
 
158 aa  182  2.0000000000000003e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.375161  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0128  glutathione peroxidase  52.47 
 
 
161 aa  181  6e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.594559  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1570  Glutathione peroxidase  53.37 
 
 
158 aa  180  8.000000000000001e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1090  glutathione peroxidase  53.33 
 
 
160 aa  180  1e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.37333 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4077  glutathione peroxidase  53.99 
 
 
162 aa  179  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.629032 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01902  probable glutathione peroxidase  61.7 
 
 
165 aa  178  2.9999999999999997e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.101099  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0484  glutathione peroxidase  52.5 
 
 
161 aa  178  4.999999999999999e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0226  Peroxiredoxin  51.53 
 
 
163 aa  176  1e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0190  glutathione peroxidase  54.05 
 
 
161 aa  175  3e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.926255  normal  0.776204 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0889  glutathione peroxidase  50.6 
 
 
168 aa  175  4e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.50899 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4148  Glutathione peroxidase  54.32 
 
 
158 aa  175  4e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.784559  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0118  glutathione peroxidase  52.12 
 
 
160 aa  174  5e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1771  glutathione peroxidase  49.7 
 
 
161 aa  173  9.999999999999999e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0694  glutathione peroxidase  52.76 
 
 
161 aa  173  9.999999999999999e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000130339  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02660  glutathione peroxidase  53.42 
 
 
158 aa  173  9.999999999999999e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02846  phospholipid hydroperoxide glutathione peroxidase (Eurofung)  54.17 
 
 
282 aa  172  1.9999999999999998e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.440988 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0191  Glutathione peroxidase  51.55 
 
 
161 aa  172  1.9999999999999998e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2764  glutathione peroxidase  56.08 
 
 
161 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0187221  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2756  glutathione peroxidase  50.62 
 
 
158 aa  171  3.9999999999999995e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.447473  hitchhiker  0.0000941143 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3981  glutathione peroxidase  57.93 
 
 
161 aa  171  5e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.890862  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1571  glutathione peroxidase  52.98 
 
 
159 aa  171  5.999999999999999e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.154895  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2599  glutathione peroxidase  52.98 
 
 
159 aa  171  5.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.391635  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2510  glutathione peroxidase  52.98 
 
 
159 aa  171  5.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1346  glutathione peroxidase  52.98 
 
 
159 aa  171  5.999999999999999e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.909183  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3665  glutathione peroxidase  53.37 
 
 
158 aa  171  5.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3925  Glutathione peroxidase  51.81 
 
 
165 aa  171  5.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3238  glutathione peroxidase  52.98 
 
 
159 aa  171  5.999999999999999e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.400465  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2454  glutathione peroxidase  52.98 
 
 
159 aa  171  5.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0273  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2074  glutathione peroxidase  52.98 
 
 
159 aa  171  5.999999999999999e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.895406  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1872  glutathione peroxidase  53.42 
 
 
159 aa  171  6.999999999999999e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0683727  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0250  glutathione peroxidase  55.71 
 
 
164 aa  170  9e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2910  Glutathione peroxidase  55.1 
 
 
165 aa  170  1e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1665  glutathione peroxidase  51.85 
 
 
159 aa  170  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0389024 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3973  Peroxiredoxin  51.2 
 
 
165 aa  170  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000360978 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0173  glutathione peroxidase  53.1 
 
 
161 aa  170  1e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.790659  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1781  glutathione peroxidase family protein  58.62 
 
 
161 aa  169  2e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2011  glutathione peroxidase  52.32 
 
 
159 aa  169  2e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0261647  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78456  glutathione peroxidase  54.94 
 
 
160 aa  169  2e-41  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.437317  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02770  glutathione peroxidase  50 
 
 
160 aa  169  2e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.359164  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1080  glutathione peroxidase  55.17 
 
 
164 aa  169  2e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000852506  normal  0.679739 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2683  Peroxiredoxin  50.62 
 
 
160 aa  169  3e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.299838  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2504  Glutathione peroxidase  54.42 
 
 
165 aa  168  4e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.718008 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2660  Glutathione peroxidase  50.33 
 
 
159 aa  168  4e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0609505 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4117  Peroxiredoxin  51.7 
 
 
182 aa  167  5e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27520  putative glutathione peroxidase  57.86 
 
 
161 aa  167  7e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.78279  normal  0.0357307 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3841  glutathione peroxidase  57.14 
 
 
162 aa  167  8e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0688357  normal  0.342172 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2176  glutathione peroxidase  56.43 
 
 
143 aa  167  8e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0884553  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6295  glutathione peroxidase  50.92 
 
 
162 aa  167  9e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1909  peroxiredoxin  58.57 
 
 
161 aa  167  1e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.154084  normal  0.204796 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3470  glutathione peroxidase  51.23 
 
 
158 aa  166  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0123  glutathione peroxidase  50 
 
 
161 aa  167  1e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0265  Peroxiredoxin  51.02 
 
 
165 aa  166  2e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000231119  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3613  glutathione peroxidase  58.22 
 
 
161 aa  166  2e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.374005  normal  0.319321 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2472  Glutathione peroxidase  54.05 
 
 
159 aa  166  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.161656  decreased coverage  0.0000149935 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1897  glutathione peroxidase  49.38 
 
 
158 aa  166  2e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2329  putative glutathione peroxidase  57.14 
 
 
161 aa  166  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.509466  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3053  peroxiredoxin  54.36 
 
 
164 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.508134 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2975  Glutathione peroxidase  52.38 
 
 
161 aa  165  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.36322  normal  0.036622 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2131  glutathione peroxidase  50.92 
 
 
160 aa  165  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1368  glutathione peroxidase  54.61 
 
 
165 aa  165  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1965  glutathione peroxidase  50.92 
 
 
160 aa  165  4e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0718131  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1971  glutathione peroxidase  50.92 
 
 
160 aa  165  4e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.775227  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2119  glutathione peroxidase  50.92 
 
 
160 aa  165  4e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3277  Peroxiredoxin  54.36 
 
 
164 aa  165  4e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1407  glutathione peroxidase  52.38 
 
 
165 aa  164  5e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0308338  normal  0.103968 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1242  glutathione peroxidase  50.31 
 
 
159 aa  164  5.9999999999999996e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1563  glutathione peroxidase, putative  52.41 
 
 
162 aa  164  6.9999999999999995e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2798  glutathione peroxidase  52.38 
 
 
164 aa  164  6.9999999999999995e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2674  putative glutathione peroxidase protein  53.74 
 
 
165 aa  164  8e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.552039 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1950  glutathione peroxidase  50.92 
 
 
160 aa  164  8e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.210596  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1449  glutathione peroxidase  56.43 
 
 
162 aa  164  8e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00937829  normal  0.354884 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2154  glutathione peroxidase  50.92 
 
 
160 aa  164  8e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00658  glutathione peroxidase  47.31 
 
 
161 aa  164  8e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0965068  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3184  glutathione peroxidase  54.61 
 
 
160 aa  164  9e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2875  glutathione peroxidase  53.1 
 
 
161 aa  164  9e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000745159  hitchhiker  0.0000749041 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1874  glutathione peroxidase  55.71 
 
 
162 aa  163  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0631469  normal  0.307231 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1926  glutathione peroxidase  50.92 
 
 
160 aa  163  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1354  glutathione peroxidase  52.38 
 
 
162 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.525114 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2552  glutathione peroxidase  52.7 
 
 
161 aa  163  1.0000000000000001e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.40006  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2773  glutathione peroxidase  53.1 
 
 
161 aa  163  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000478947  hitchhiker  0.00587193 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2271  glutathione peroxidase  50.31 
 
 
160 aa  163  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2202  glutathione peroxidase  50.31 
 
 
161 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0177431  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3298  glutathione peroxidase  50.92 
 
 
161 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.40101  decreased coverage  0.0000000224321 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2705  glutathione peroxidase  52.41 
 
 
161 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000249576  hitchhiker  0.0000800256 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1300  glutathione peroxidase  51.7 
 
 
161 aa  162  3e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.448702  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1384  glutathione peroxidase  51.7 
 
 
165 aa  162  3e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2639  glutathione peroxidase  51.53 
 
 
158 aa  162  3e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.833403 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1936  glutathione peroxidase  47.85 
 
 
159 aa  162  3e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.634874 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5025  peroxiredoxin  57.69 
 
 
171 aa  162  3e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0652457 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5344  glutathione peroxidase  47.85 
 
 
159 aa  162  3e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.213102 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1334  Peroxiredoxin  50.31 
 
 
169 aa  162  3e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0131674  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3106  glutathione peroxidase  48.8 
 
 
167 aa  162  3e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.422985  normal  0.284005 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2067  glutathione peroxidase  47.85 
 
 
159 aa  162  3e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6042  glutathione peroxidase  48.47 
 
 
159 aa  161  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2035  glutathione peroxidase  48.47 
 
 
159 aa  161  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2054  glutathione peroxidase  48.47 
 
 
159 aa  161  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>