More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0091 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_0091  glutathione peroxidase  100 
 
 
174 aa  359  1e-98  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0137  glutathione peroxidase  82.72 
 
 
169 aa  282  1.0000000000000001e-75  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01621  glutathione peroxidase  75.8 
 
 
159 aa  248  2e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1214  glutathione peroxidase  66.46 
 
 
167 aa  218  1.9999999999999999e-56  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10951  glutathione peroxidase  63.69 
 
 
159 aa  215  2e-55  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11881  glutathione peroxidase  64.97 
 
 
159 aa  214  5e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.431432  normal  0.0622646 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1016  glutathione peroxidase  63.69 
 
 
159 aa  213  9.999999999999999e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0391982  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10951  glutathione peroxidase  63.06 
 
 
159 aa  213  1.9999999999999998e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.960114  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1209  glutathione peroxidase  60.51 
 
 
158 aa  209  2e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20841  glutathione peroxidase  59.87 
 
 
158 aa  206  1e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10911  glutathione peroxidase  60.51 
 
 
159 aa  205  2e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.604809  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2558  Peroxiredoxin  51.23 
 
 
162 aa  168  4e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.177554  normal  0.095865 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3507  glutathione peroxidase  49.43 
 
 
204 aa  164  5e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.721934  normal  0.622585 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0020  glutathione peroxidase  52.26 
 
 
168 aa  164  5.9999999999999996e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2329  putative glutathione peroxidase  48.12 
 
 
161 aa  159  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.509466  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3973  Peroxiredoxin  49.04 
 
 
165 aa  159  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000360978 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3925  Glutathione peroxidase  49.04 
 
 
165 aa  159  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1015  Glutathione peroxidase  48.77 
 
 
162 aa  158  3e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0150707 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2909  Peroxiredoxin  51.27 
 
 
198 aa  158  4e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1971  glutathione peroxidase  49.06 
 
 
160 aa  157  5e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.775227  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1926  glutathione peroxidase  49.06 
 
 
160 aa  157  5e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2119  glutathione peroxidase  49.06 
 
 
160 aa  157  5e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6245  Glutathione peroxidase  48.75 
 
 
163 aa  157  6e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.479243  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0565  glutathione peroxidase  47.51 
 
 
182 aa  157  6e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27520  putative glutathione peroxidase  47.5 
 
 
161 aa  157  7e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.78279  normal  0.0357307 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1950  glutathione peroxidase  49.06 
 
 
160 aa  157  9e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.210596  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2154  glutathione peroxidase  49.06 
 
 
160 aa  157  9e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4022  Glutathione peroxidase  47.51 
 
 
181 aa  156  1e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.350366 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00658  glutathione peroxidase  47.17 
 
 
161 aa  156  1e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0965068  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3617  Peroxiredoxin  47.8 
 
 
163 aa  156  1e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.78044  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2756  glutathione peroxidase  48.73 
 
 
158 aa  156  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.447473  hitchhiker  0.0000941143 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1199  glutathione peroxidase  46.41 
 
 
182 aa  156  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0894577  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0123  glutathione peroxidase  50.99 
 
 
161 aa  157  1e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2202  glutathione peroxidase  48.43 
 
 
161 aa  155  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0177431  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1318  Peroxiredoxin  50.65 
 
 
167 aa  156  2e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3184  glutathione peroxidase  49.06 
 
 
160 aa  155  2e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2131  glutathione peroxidase  49.06 
 
 
160 aa  155  2e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2454  Peroxiredoxin  49.34 
 
 
160 aa  155  2e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0184161  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2271  glutathione peroxidase  47.8 
 
 
160 aa  155  3e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1965  glutathione peroxidase  47.8 
 
 
160 aa  155  3e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0718131  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3685  glutathione peroxidase  53.02 
 
 
163 aa  155  4e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0118  glutathione peroxidase  48.41 
 
 
160 aa  154  6e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0841  glutathione peroxidase  48.7 
 
 
164 aa  153  1e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0436995  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0173  glutathione peroxidase  51.32 
 
 
161 aa  153  1e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.790659  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6518  Peroxiredoxin  49.69 
 
 
161 aa  153  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1354  glutathione peroxidase  47.77 
 
 
162 aa  152  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.525114 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0191  Glutathione peroxidase  50.66 
 
 
161 aa  152  2e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5382  Peroxiredoxin  49.03 
 
 
179 aa  152  2e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.0000126467  normal  0.555193 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1570  Glutathione peroxidase  47.47 
 
 
158 aa  152  2e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0226  Peroxiredoxin  47.53 
 
 
163 aa  152  2.9999999999999998e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3981  glutathione peroxidase  45 
 
 
161 aa  151  4e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.890862  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1334  Peroxiredoxin  48.1 
 
 
169 aa  151  4e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0131674  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0851  glutathione peroxidase  49.69 
 
 
161 aa  151  5e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.425919  decreased coverage  0.00020946 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30390  glutathione peroxidase  45.18 
 
 
173 aa  150  5.9999999999999996e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0190  glutathione peroxidase  48.43 
 
 
161 aa  151  5.9999999999999996e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.926255  normal  0.776204 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1732  putative glutathione peroxidase  43.96 
 
 
183 aa  150  5.9999999999999996e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.305422 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2699  glutathione peroxidase  49.01 
 
 
160 aa  150  5.9999999999999996e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6295  glutathione peroxidase  51.72 
 
 
162 aa  150  7e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2004  putative glutathione peroxidase  43.96 
 
 
183 aa  150  8e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.375271 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1469  putative glutathione peroxidase  43.96 
 
 
183 aa  150  8e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02660  glutathione peroxidase  46.5 
 
 
158 aa  150  8.999999999999999e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3613  glutathione peroxidase  45 
 
 
161 aa  150  8.999999999999999e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.374005  normal  0.319321 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0265  Peroxiredoxin  45.28 
 
 
165 aa  150  8.999999999999999e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000231119  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1909  peroxiredoxin  45.62 
 
 
161 aa  149  1e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.154084  normal  0.204796 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1812  Peroxiredoxin  48.12 
 
 
162 aa  150  1e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00250469  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2472  Glutathione peroxidase  48.41 
 
 
159 aa  150  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.161656  decreased coverage  0.0000149935 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1452  putative glutathione peroxidase  43.41 
 
 
183 aa  149  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2152  putative glutathione peroxidase  43.41 
 
 
183 aa  149  2e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1832  putative glutathione peroxidase  43.65 
 
 
183 aa  149  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1781  glutathione peroxidase family protein  45 
 
 
161 aa  149  3e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0889  glutathione peroxidase  50 
 
 
168 aa  149  3e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.50899 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1655  Peroxiredoxin  41.76 
 
 
183 aa  148  3e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.401167  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14340  glutathione peroxidase  45.62 
 
 
166 aa  148  4e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1436  putative glutathione peroxidase  43.41 
 
 
183 aa  148  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0293827 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0250  glutathione peroxidase  49.32 
 
 
164 aa  148  5e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1665  glutathione peroxidase  48.41 
 
 
159 aa  147  6e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0389024 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4682  glutathione peroxidase  51.7 
 
 
160 aa  147  7e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3641  peroxiredoxin  50.68 
 
 
161 aa  147  7e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1080  glutathione peroxidase  49.34 
 
 
164 aa  147  7e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000852506  normal  0.679739 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0484  glutathione peroxidase  49.66 
 
 
161 aa  147  8e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2934  glutathione peroxidase  46.94 
 
 
164 aa  147  9e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0465616  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1178  glutathione peroxidase  45.75 
 
 
158 aa  147  9e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.375161  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15450  Glutathione peroxidase  47.62 
 
 
158 aa  147  1.0000000000000001e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0674744  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2597  Peroxiredoxin  46.84 
 
 
158 aa  146  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5485  glutathione peroxidase  42.13 
 
 
178 aa  145  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.219921  normal  0.973287 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1242  glutathione peroxidase  46.5 
 
 
159 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1059  glutathione peroxidase  41.01 
 
 
178 aa  146  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.428642  normal  0.565362 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53420  glutathione peroxidase  51.02 
 
 
160 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.31883  normal  0.0505345 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1201  Glutathione peroxidase  50.34 
 
 
160 aa  145  2.0000000000000003e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0952342  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02770  glutathione peroxidase  45.22 
 
 
160 aa  145  3e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.359164  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1449  glutathione peroxidase  44.72 
 
 
162 aa  145  3e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00937829  normal  0.354884 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2428  putative glutathione peroxidase  42.86 
 
 
183 aa  145  3e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.182778  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1914  glutathione peroxidase  43.89 
 
 
182 aa  145  3e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1721  putative glutathione peroxidase  42.08 
 
 
184 aa  145  4.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.326937  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3106  glutathione peroxidase  46.84 
 
 
167 aa  144  4.0000000000000006e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.422985  normal  0.284005 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2615  putative glutathione peroxidase  42.08 
 
 
184 aa  145  4.0000000000000006e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1929  putative glutathione peroxidase  42.86 
 
 
183 aa  145  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000186844  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1829  putative glutathione peroxidase  42.08 
 
 
184 aa  145  4.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1790  putative glutathione peroxidase  42.86 
 
 
183 aa  145  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.799217  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1480  putative glutathione peroxidase  42.86 
 
 
183 aa  145  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.854221 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>