More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0968 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0968  Glutathione peroxidase  100 
 
 		 184 aa  380  1e-105  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000061106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20790  glutathione peroxidase  71.35 
 
 		 180 aa  275  4e-73  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08510  glutathione peroxidase  66.85 
 
 		 180 aa  254  4e-67  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.44579 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2662  glutathione peroxidase  53.33 
 
 		 181 aa  189  2e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0111206  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2679  Glutathione peroxidase  49.45 
 
 		 184 aa  184  6e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0282  Glutathione peroxidase  52.49 
 
 		 158 aa  182  2.0000000000000003e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1570  Glutathione peroxidase  48.6 
 
 		 158 aa  170  1e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01902  probable glutathione peroxidase  47.75 
 
 		 165 aa  164  9e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.101099  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2597  Peroxiredoxin  46.37 
 
 		 158 aa  163  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0265  Peroxiredoxin  46.37 
 
 		 165 aa  163  1.0000000000000001e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000231119  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2663  glutathione peroxidase  49.16 
 
 		 157 aa  163  1.0000000000000001e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.190046  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1026  glutathione peroxidase  49.71 
 
 		 178 aa  162  3e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.04413  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1198  glutathione peroxidase  50.29 
 
 		 178 aa  161  4.0000000000000004e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00025984  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0867  glutathione peroxidase  46.93 
 
 		 159 aa  160  9e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000118287  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1829  putative glutathione peroxidase  48.21 
 
 		 184 aa  159  3e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2615  putative glutathione peroxidase  48.21 
 
 		 184 aa  159  3e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0904  glutathione peroxidase  46.63 
 
 		 158 aa  159  3e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000826936  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1721  putative glutathione peroxidase  48.21 
 
 		 184 aa  159  3e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.326937  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1334  Peroxiredoxin  44.69 
 
 		 169 aa  157  8e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0131674  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3925  Glutathione peroxidase  45.6 
 
 		 165 aa  157  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3973  Peroxiredoxin  45.05 
 
 		 165 aa  155  2e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000360978 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1178  glutathione peroxidase  45 
 
 		 158 aa  155  2e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.375161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1080  glutathione peroxidase  46.67 
 
 		 164 aa  155  2e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000852506  normal  0.679739 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1771  glutathione peroxidase  41.53 
 
 		 161 aa  154  7e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0118  glutathione peroxidase  44.69 
 
 		 160 aa  154  8e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2552  glutathione peroxidase  45 
 
 		 161 aa  154  9e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.40006  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4022  Glutathione peroxidase  43.48 
 
 		 181 aa  153  1e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.350366 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2975  Glutathione peroxidase  45 
 
 		 161 aa  153  1e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.36322  normal  0.036622 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5485  glutathione peroxidase  44.44 
 
 		 178 aa  153  1e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.219921  normal  0.973287 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1368  glutathione peroxidase  45 
 
 		 165 aa  153  1e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2639  glutathione peroxidase  44.13 
 
 		 158 aa  152  2e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.833403 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2756  glutathione peroxidase  43.58 
 
 		 158 aa  152  2e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.447473  hitchhiker  0.0000941143 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2764  glutathione peroxidase  43.58 
 
 		 161 aa  152  2e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0187221  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2131  glutathione peroxidase  42.22 
 
 		 160 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0872  glutathione peroxidase  44.69 
 
 		 158 aa  152  2.9999999999999998e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1971  glutathione peroxidase  42.22 
 
 		 160 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.775227  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6295  glutathione peroxidase  44.2 
 
 		 162 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1390  glutathione peroxidase  47.19 
 
 		 158 aa  152  2.9999999999999998e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2119  glutathione peroxidase  42.22 
 
 		 160 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1364  glutathione peroxidase  47.19 
 
 		 158 aa  152  2.9999999999999998e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00178793  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1407  glutathione peroxidase  44.44 
 
 		 165 aa  151  4e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0308338  normal  0.103968 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2705  glutathione peroxidase  43.33 
 
 		 161 aa  151  4e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000249576  hitchhiker  0.0000800256 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2875  glutathione peroxidase  42.78 
 
 		 161 aa  152  4e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000745159  hitchhiker  0.0000749041 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1965  glutathione peroxidase  41.67 
 
 		 160 aa  151  5e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0718131  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1950  glutathione peroxidase  42.22 
 
 		 160 aa  151  5e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.210596  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1926  glutathione peroxidase  42.22 
 
 		 160 aa  151  5e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2154  glutathione peroxidase  42.22 
 
 		 160 aa  151  5e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2271  glutathione peroxidase  42.22 
 
 		 160 aa  151  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2146  Peroxiredoxin  44.13 
 
 		 160 aa  151  5.9999999999999996e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2773  glutathione peroxidase  42.78 
 
 		 161 aa  151  5.9999999999999996e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000478947  hitchhiker  0.00587193 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2683  Peroxiredoxin  41.44 
 
 		 160 aa  150  7e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.299838  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1384  glutathione peroxidase  44.44 
 
 		 165 aa  150  8e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3267  glutathione peroxidase  43.89 
 
 		 158 aa  150  8e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7246  glutathione peroxidase  44.81 
 
 		 182 aa  150  8.999999999999999e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.156193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1872  glutathione peroxidase  44.69 
 
 		 159 aa  150  8.999999999999999e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0683727  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0841  glutathione peroxidase  43.02 
 
 		 164 aa  150  1e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0436995  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1469  putative glutathione peroxidase  44.92 
 
 		 183 aa  150  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2202  glutathione peroxidase  41.9 
 
 		 161 aa  150  1e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0177431  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2004  putative glutathione peroxidase  44.92 
 
 		 183 aa  150  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.375271 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3184  glutathione peroxidase  41.67 
 
 		 160 aa  150  1e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3298  glutathione peroxidase  43.65 
 
 		 161 aa  150  1e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.40101  decreased coverage  0.0000000224321 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1499  glutathione peroxidase  44.69 
 
 		 157 aa  150  1e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.278578  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1832  putative glutathione peroxidase  46.15 
 
 		 183 aa  149  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1909  peroxiredoxin  42.62 
 
 		 161 aa  149  2e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.154084  normal  0.204796 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1059  glutathione peroxidase  43.89 
 
 		 178 aa  149  2e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.428642  normal  0.565362 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0123  glutathione peroxidase  43.82 
 
 		 161 aa  149  2e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1452  putative glutathione peroxidase  44.39 
 
 		 183 aa  149  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3447  glutathione peroxidase  43.33 
 
 		 161 aa  148  4e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0243575 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1300  glutathione peroxidase  42.78 
 
 		 161 aa  148  4e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.448702  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2774  putative glutathione peroxidase  43.01 
 
 		 183 aa  148  4e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.956503  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1626  Peroxiredoxin  40.96 
 
 		 183 aa  147  6e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0694  glutathione peroxidase  43.09 
 
 		 161 aa  147  6e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000130339  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2468  putative glutathione peroxidase  43.01 
 
 		 183 aa  147  6e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.157307  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0559  glutathione peroxidase  43.41 
 
 		 161 aa  147  8e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1436  putative glutathione peroxidase  44.39 
 
 		 183 aa  147  9e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0293827 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1563  glutathione peroxidase, putative  41.67 
 
 		 162 aa  147  9e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1665  glutathione peroxidase  42.78 
 
 		 159 aa  147  9e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0389024 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0851  glutathione peroxidase  40.88 
 
 		 161 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.425919  decreased coverage  0.00020946 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2947  glutathione peroxidase  43.26 
 
 		 167 aa  147  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.781382  hitchhiker  0.0011995 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2964  glutathione peroxidase  43.58 
 
 		 160 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4148  Glutathione peroxidase  43.58 
 
 		 158 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.784559  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1090  glutathione peroxidase  42.54 
 
 		 160 aa  146  2.0000000000000003e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.37333 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4077  glutathione peroxidase  41.67 
 
 		 162 aa  145  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.629032 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2006  glutathione peroxidase family protein  43.09 
 
 		 160 aa  145  3e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3665  glutathione peroxidase  43.33 
 
 		 158 aa  145  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01679  predicted glutathione peroxidase  43.41 
 
 		 183 aa  145  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0313558  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1932  Glutathione peroxidase  43.41 
 
 		 183 aa  145  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0263246  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01668  hypothetical protein  43.41 
 
 		 183 aa  145  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0174889  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1655  Peroxiredoxin  40.96 
 
 		 183 aa  144  5e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.401167  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5344  glutathione peroxidase  42.78 
 
 		 159 aa  144  5e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.213102 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0484  glutathione peroxidase  41.9 
 
 		 161 aa  144  5e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1790  putative glutathione peroxidase  42.86 
 
 		 183 aa  144  6e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.799217  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2176  glutathione peroxidase  47.83 
 
 		 143 aa  144  6e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0884553  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02770  glutathione peroxidase  40.88 
 
 		 160 aa  144  7.0000000000000006e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.359164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03223  glutathione peroxidase  41.53 
 
 		 181 aa  144  7.0000000000000006e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0697  Glutathione peroxidase  43.09 
 
 		 170 aa  144  7.0000000000000006e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2428  putative glutathione peroxidase  42.86 
 
 		 183 aa  144  8.000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.182778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1929  putative glutathione peroxidase  42.86 
 
 		 183 aa  143  1e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000186844  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0190  glutathione peroxidase  41.9 
 
 		 161 aa  143  1e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.926255  normal  0.776204 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1480  putative glutathione peroxidase  42.86 
 
 		 183 aa  143  1e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.854221 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>