More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_08510 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013170  Ccur_08510  glutathione peroxidase  100 
 
 
180 aa  374  1e-103  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.44579 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20790  glutathione peroxidase  69.44 
 
 
180 aa  271  3e-72  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0968  Glutathione peroxidase  66.85 
 
 
184 aa  254  4e-67  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000061106  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2662  glutathione peroxidase  51.37 
 
 
181 aa  194  7e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0111206  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2679  Glutathione peroxidase  51.67 
 
 
184 aa  189  2e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0282  Glutathione peroxidase  52.25 
 
 
158 aa  177  4.999999999999999e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2597  Peroxiredoxin  47.78 
 
 
158 aa  176  2e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1570  Glutathione peroxidase  46.67 
 
 
158 aa  173  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1026  glutathione peroxidase  50.88 
 
 
178 aa  169  2e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.04413  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2756  glutathione peroxidase  46.67 
 
 
158 aa  169  2e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.447473  hitchhiker  0.0000941143 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1198  glutathione peroxidase  50.29 
 
 
178 aa  167  6e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00025984  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2910  Glutathione peroxidase  47.49 
 
 
165 aa  167  9e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2011  glutathione peroxidase  45.25 
 
 
159 aa  167  1e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0261647  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1334  Peroxiredoxin  45.86 
 
 
169 aa  166  1e-40  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0131674  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1571  glutathione peroxidase  45.25 
 
 
159 aa  166  2e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.154895  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2074  glutathione peroxidase  45.25 
 
 
159 aa  166  2e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.895406  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2599  glutathione peroxidase  45.25 
 
 
159 aa  166  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.391635  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3238  glutathione peroxidase  45.25 
 
 
159 aa  166  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.400465  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1346  glutathione peroxidase  45.25 
 
 
159 aa  166  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.909183  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2510  glutathione peroxidase  45.25 
 
 
159 aa  166  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2454  glutathione peroxidase  45.25 
 
 
159 aa  166  2e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0273  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3925  Glutathione peroxidase  44.13 
 
 
165 aa  165  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1872  glutathione peroxidase  46.11 
 
 
159 aa  165  2.9999999999999998e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0683727  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0867  glutathione peroxidase  45 
 
 
159 aa  165  2.9999999999999998e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000118287  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2504  Glutathione peroxidase  47.19 
 
 
165 aa  165  4e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.718008 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0904  glutathione peroxidase  45 
 
 
158 aa  164  4e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000826936  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3973  Peroxiredoxin  43.58 
 
 
165 aa  164  5.9999999999999996e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000360978 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1771  glutathione peroxidase  43.82 
 
 
161 aa  164  6.9999999999999995e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01902  probable glutathione peroxidase  45.86 
 
 
165 aa  164  8e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.101099  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2663  glutathione peroxidase  46.67 
 
 
157 aa  164  8e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.190046  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6295  glutathione peroxidase  45.51 
 
 
162 aa  163  1.0000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2764  glutathione peroxidase  43.26 
 
 
161 aa  163  1.0000000000000001e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0187221  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1242  glutathione peroxidase  45.51 
 
 
159 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1665  glutathione peroxidase  45.51 
 
 
159 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0389024 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2552  glutathione peroxidase  45.81 
 
 
161 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.40006  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3267  glutathione peroxidase  45.51 
 
 
158 aa  162  2.0000000000000002e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2674  putative glutathione peroxidase protein  46.63 
 
 
165 aa  162  3e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.552039 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5344  glutathione peroxidase  44.38 
 
 
159 aa  162  3e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.213102 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02770  glutathione peroxidase  43.75 
 
 
160 aa  162  3e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.359164  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1080  glutathione peroxidase  45.51 
 
 
164 aa  161  4.0000000000000004e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000852506  normal  0.679739 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1178  glutathione peroxidase  45.56 
 
 
158 aa  160  9e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.375161  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0265  Peroxiredoxin  43.89 
 
 
165 aa  160  1e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000231119  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1936  glutathione peroxidase  43.82 
 
 
159 aa  159  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.634874 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2054  glutathione peroxidase  43.82 
 
 
159 aa  159  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3253  Peroxiredoxin  43.26 
 
 
164 aa  159  2e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.350236  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2934  glutathione peroxidase  44.94 
 
 
164 aa  159  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0465616  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6042  glutathione peroxidase  43.82 
 
 
159 aa  159  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2067  glutathione peroxidase  43.82 
 
 
159 aa  159  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2035  glutathione peroxidase  43.82 
 
 
159 aa  159  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3447  glutathione peroxidase  43.58 
 
 
161 aa  159  3e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0243575 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2639  glutathione peroxidase  43.82 
 
 
158 aa  158  4e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.833403 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1059  glutathione peroxidase  43.89 
 
 
178 aa  158  4e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.428642  normal  0.565362 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1769  glutathione peroxidase  45.51 
 
 
162 aa  157  7e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0182367  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2006  glutathione peroxidase family protein  43.58 
 
 
160 aa  157  8e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3470  glutathione peroxidase  44.94 
 
 
158 aa  157  9e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2964  glutathione peroxidase  43.26 
 
 
160 aa  156  1e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2472  Glutathione peroxidase  43.82 
 
 
159 aa  156  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.161656  decreased coverage  0.0000149935 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3053  peroxiredoxin  43.26 
 
 
164 aa  157  1e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.508134 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2741  glutathione peroxidase  44.44 
 
 
162 aa  156  1e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000260986  hitchhiker  0.0000615291 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1897  glutathione peroxidase  44.38 
 
 
158 aa  157  1e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4117  Peroxiredoxin  43.5 
 
 
182 aa  157  1e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1971  glutathione peroxidase  42.78 
 
 
160 aa  156  2e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.775227  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1926  glutathione peroxidase  42.78 
 
 
160 aa  156  2e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2119  glutathione peroxidase  42.78 
 
 
160 aa  156  2e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5485  glutathione peroxidase  42.78 
 
 
178 aa  155  3e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.219921  normal  0.973287 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0841  glutathione peroxidase  41.67 
 
 
164 aa  155  4e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0436995  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1950  glutathione peroxidase  42.78 
 
 
160 aa  155  4e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.210596  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3298  glutathione peroxidase  43.26 
 
 
161 aa  155  4e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.40101  decreased coverage  0.0000000224321 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2154  glutathione peroxidase  42.78 
 
 
160 aa  155  4e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0889  glutathione peroxidase  44.94 
 
 
168 aa  154  4e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.50899 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3277  Peroxiredoxin  42.7 
 
 
164 aa  155  4e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1965  glutathione peroxidase  42.22 
 
 
160 aa  154  5.0000000000000005e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0718131  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2202  glutathione peroxidase  42.22 
 
 
161 aa  154  7e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0177431  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0872  glutathione peroxidase  44.94 
 
 
158 aa  154  9e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2271  glutathione peroxidase  41.67 
 
 
160 aa  154  9e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2131  glutathione peroxidase  41.67 
 
 
160 aa  154  9e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1318  Peroxiredoxin  43.82 
 
 
167 aa  153  1e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1563  glutathione peroxidase, putative  41.34 
 
 
162 aa  153  1e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3665  glutathione peroxidase  42.7 
 
 
158 aa  153  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4148  Glutathione peroxidase  43.82 
 
 
158 aa  153  2e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.784559  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0191  Glutathione peroxidase  42.37 
 
 
161 aa  152  2.9999999999999998e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3184  glutathione peroxidase  41.11 
 
 
160 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0250  glutathione peroxidase  42.13 
 
 
164 aa  152  2.9999999999999998e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1364  glutathione peroxidase  44.94 
 
 
158 aa  151  4e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00178793  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1390  glutathione peroxidase  44.94 
 
 
158 aa  151  4e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1300  glutathione peroxidase  43.26 
 
 
161 aa  151  4e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.448702  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0173  glutathione peroxidase  42.13 
 
 
161 aa  151  4e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.790659  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2329  putative glutathione peroxidase  41.57 
 
 
161 aa  152  4e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.509466  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4077  glutathione peroxidase  42.7 
 
 
162 aa  151  4e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.629032 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0020  glutathione peroxidase  43.82 
 
 
168 aa  151  5e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1499  glutathione peroxidase  43.33 
 
 
157 aa  151  5e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.278578  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0851  glutathione peroxidase  41.01 
 
 
161 aa  150  7e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.425919  decreased coverage  0.00020946 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2699  glutathione peroxidase  42.94 
 
 
160 aa  150  8.999999999999999e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2947  glutathione peroxidase  43.33 
 
 
167 aa  150  8.999999999999999e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.781382  hitchhiker  0.0011995 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1384  glutathione peroxidase  42.13 
 
 
165 aa  149  1e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1909  peroxiredoxin  40.45 
 
 
161 aa  150  1e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.154084  normal  0.204796 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2798  glutathione peroxidase  41.01 
 
 
164 aa  149  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0118  glutathione peroxidase  42.13 
 
 
160 aa  150  1e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3613  glutathione peroxidase  43.1 
 
 
161 aa  149  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.374005  normal  0.319321 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0190  glutathione peroxidase  42.7 
 
 
161 aa  149  2e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.926255  normal  0.776204 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>