More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3273 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_3273  glutathione peroxidase  100 
 
 
174 aa  355  9.999999999999999e-98  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2389  putative glutathione peroxidase  54.55 
 
 
176 aa  162  3e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.401751  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2055  putative glutathione peroxidase  52.32 
 
 
177 aa  158  5e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.265735 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1053  glutathione peroxidase  57.05 
 
 
176 aa  157  8e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.281088  normal  0.469721 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1883  glutathione peroxidase  56.08 
 
 
152 aa  157  9e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.255404  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1863  glutathione peroxidase  50.3 
 
 
195 aa  147  9e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3880  putative glutathione peroxidase  42.08 
 
 
191 aa  133  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.41902 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4667  glutathione peroxidase  48.61 
 
 
199 aa  132  1.9999999999999998e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0270  glutathione peroxidase  43.14 
 
 
158 aa  126  1.0000000000000001e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0297  glutathione peroxidase  44.97 
 
 
161 aa  125  3e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0981226  normal  0.609333 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3374  glutathione peroxidase  47.14 
 
 
195 aa  124  8.000000000000001e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.479812  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5165  Peroxiredoxin  42.95 
 
 
202 aa  122  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.648504  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4024  glutathione peroxidase  45.89 
 
 
213 aa  122  3e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0876  Peroxiredoxin  35.9 
 
 
177 aa  122  3e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1579  glutathione peroxidase  37.18 
 
 
164 aa  122  3e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0189646  normal  0.0451688 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2453  glutathione peroxidase  41.18 
 
 
158 aa  121  6e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.70182 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3912  glutathione peroxidase  42.36 
 
 
189 aa  119  1.9999999999999998e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.295477  normal  0.0278841 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0042  glutathione peroxidase  40 
 
 
212 aa  119  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.490429  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0018  glutathione peroxidase  40 
 
 
208 aa  119  3e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0488  glutathione peroxidase  41.72 
 
 
185 aa  118  3.9999999999999996e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.642227  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4117  Peroxiredoxin  41.36 
 
 
182 aa  118  3.9999999999999996e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02660  glutathione peroxidase  47.48 
 
 
158 aa  118  3.9999999999999996e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1762  glutathione peroxidase  41.67 
 
 
183 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.533866  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2249  glutathione peroxidase  44.3 
 
 
162 aa  117  6e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.487328  normal  0.155268 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1812  Peroxiredoxin  44.14 
 
 
162 aa  117  6e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00250469  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4103  putative glutathione peroxidase  41.32 
 
 
184 aa  117  7.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47550  putative glutathione peroxidase  41.32 
 
 
184 aa  117  7.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.532704 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2798  glutathione peroxidase  42.95 
 
 
164 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0360  glutathione peroxidase  45.81 
 
 
184 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.495486  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4659  glutathione peroxidase  40.97 
 
 
208 aa  115  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0316  glutathione peroxidase  45.81 
 
 
184 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.282271  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0461  glutathione peroxidase  44.29 
 
 
191 aa  115  3e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2067  glutathione peroxidase  42.95 
 
 
159 aa  115  3e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3685  glutathione peroxidase  41.83 
 
 
163 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3298  glutathione peroxidase  38.31 
 
 
161 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.40101  decreased coverage  0.0000000224321 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1936  glutathione peroxidase  42.95 
 
 
159 aa  115  5e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.634874 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1872  glutathione peroxidase  40 
 
 
159 aa  114  5e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0683727  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0190  glutathione peroxidase  37.66 
 
 
161 aa  114  6e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.926255  normal  0.776204 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0392  glutathione peroxidase  43.27 
 
 
188 aa  114  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0773128  normal  0.361866 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0169  glutathione peroxidase  41.67 
 
 
231 aa  114  6.9999999999999995e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2741  glutathione peroxidase  37.91 
 
 
162 aa  114  7.999999999999999e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000260986  hitchhiker  0.0000615291 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0307  putative glutathione peroxidase transmembrane protein  40.97 
 
 
233 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3447  glutathione peroxidase  37.25 
 
 
161 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0243575 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3022  glutathione peroxidase  38.35 
 
 
230 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00278721  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0162  glutathione peroxidase  41.67 
 
 
231 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.520461 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5344  glutathione peroxidase  41.67 
 
 
159 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.213102 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4077  glutathione peroxidase  42.31 
 
 
162 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.629032 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6042  glutathione peroxidase  41.67 
 
 
159 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0889  glutathione peroxidase  42.18 
 
 
168 aa  113  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.50899 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3180  glutathione peroxidase  38.35 
 
 
179 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000271589  normal  0.0170233 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2054  glutathione peroxidase  41.67 
 
 
159 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2035  glutathione peroxidase  41.67 
 
 
159 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3037  glutathione peroxidase  38.35 
 
 
230 aa  112  3e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000026286  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1341  glutathione peroxidase  38.35 
 
 
179 aa  112  3e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0267656  hitchhiker  0.0000000425712 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1970  glutathione peroxidase  37.24 
 
 
193 aa  112  3e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2853  glutathione peroxidase  39.1 
 
 
177 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.154923  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2679  glutathione peroxidase  41.35 
 
 
192 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.241309  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0237  putative glutathione peroxidase transmembrane protein  40.79 
 
 
205 aa  110  7.000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1242  glutathione peroxidase  41.14 
 
 
159 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2684  glutathione peroxidase  36.84 
 
 
179 aa  110  8.000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.553323  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2187  glutathione peroxidase  32.69 
 
 
170 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.836515  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0128  glutathione peroxidase  37.91 
 
 
161 aa  110  1.0000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.594559  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1965  glutathione peroxidase  36.49 
 
 
160 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0718131  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1926  glutathione peroxidase  36.49 
 
 
160 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3929  glutathione peroxidase  43.75 
 
 
188 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.592022 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2756  glutathione peroxidase  39.35 
 
 
158 aa  109  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.447473  hitchhiker  0.0000941143 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0265  Peroxiredoxin  38.06 
 
 
165 aa  109  2.0000000000000002e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000231119  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1354  glutathione peroxidase  39.62 
 
 
162 aa  108  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.525114 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1197  glutathione peroxidase  36.84 
 
 
203 aa  108  3e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00644229  normal  0.718028 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1384  glutathione peroxidase  39.61 
 
 
165 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1801  glutathione peroxidase  45.26 
 
 
199 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.740072  hitchhiker  0.00000253639 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3641  peroxiredoxin  40.94 
 
 
161 aa  108  5e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0359  glutathione peroxidase  40.91 
 
 
182 aa  107  6e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3198  Glutathione peroxidase protein  37.66 
 
 
159 aa  107  6e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.246451  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1196  glutathione peroxidase  36.84 
 
 
203 aa  107  6e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0218447  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1267  glutathione peroxidase  36.84 
 
 
203 aa  107  6e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0133013  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02196  Glutathione peroxidase  38.97 
 
 
184 aa  107  7.000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0197549  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2131  glutathione peroxidase  35.81 
 
 
160 aa  107  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2202  glutathione peroxidase  35.81 
 
 
161 aa  106  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0177431  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2271  glutathione peroxidase  35.81 
 
 
160 aa  106  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3349  glutathione peroxidase, putative  35.34 
 
 
177 aa  106  1e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0697  Glutathione peroxidase  41.22 
 
 
170 aa  107  1e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05309  glutathione peroxidase  42.24 
 
 
181 aa  107  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2934  glutathione peroxidase  40.38 
 
 
164 aa  106  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0465616  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3184  glutathione peroxidase  35.81 
 
 
160 aa  107  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0559  glutathione peroxidase  40.79 
 
 
161 aa  106  1e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1971  glutathione peroxidase  35.81 
 
 
160 aa  106  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.775227  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2618  glutathione peroxidase  44.26 
 
 
195 aa  106  2e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.137836  normal  0.142472 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2119  glutathione peroxidase  35.81 
 
 
160 aa  106  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1665  glutathione peroxidase  38.31 
 
 
159 aa  106  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0389024 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1364  glutathione peroxidase  38.96 
 
 
158 aa  105  3e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00178793  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0484  glutathione peroxidase  35.95 
 
 
161 aa  105  3e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1390  glutathione peroxidase  38.96 
 
 
158 aa  105  3e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1334  Peroxiredoxin  33.73 
 
 
169 aa  105  3e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0131674  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2515  glutathione peroxidase  45.52 
 
 
185 aa  105  3e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4682  glutathione peroxidase  39.49 
 
 
160 aa  105  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0872  glutathione peroxidase  35.14 
 
 
158 aa  105  4e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1284  glutathione peroxidase  37.5 
 
 
183 aa  105  4e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.604655  normal  0.560913 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2552  glutathione peroxidase  34.23 
 
 
161 aa  105  4e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.40006  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1499  glutathione peroxidase  35.51 
 
 
157 aa  105  4e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.278578  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>