More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3157 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3157  RpoD family RNA polymerase sigma factor  100 
 
 
345 aa  684    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2887  RpoD family RNA polymerase sigma factor  82.03 
 
 
351 aa  555  1e-157  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0367  RpoD family RNA polymerase sigma factor  61.81 
 
 
391 aa  412  1e-114  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000117749  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0905  RNA polymerase, sigma 70 subunit, RpoD subfamily  68.98 
 
 
361 aa  410  1e-113  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000725553  hitchhiker  0.000024964 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0191  RpoD family RNA polymerase sigma factor  56.21 
 
 
402 aa  353  2e-96  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000166048  decreased coverage  0.00192271 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0979  RNA polymerase, sigma 70 subunit, RpoD subfamily  56.48 
 
 
381 aa  353  2.9999999999999997e-96  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.048773  normal  0.10867 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4348  RpoD family RNA polymerase sigma factor  58.14 
 
 
399 aa  352  5.9999999999999994e-96  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.866985  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2614  RNA polymerase, sigma 70 subunit, RpoD subfamily  55.62 
 
 
345 aa  344  1e-93  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00168562  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2972  RpoD family RNA polymerase sigma factor  56.27 
 
 
348 aa  337  9.999999999999999e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000649715  hitchhiker  0.0000217703 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4672  RpoD family RNA polymerase sigma factor  53.14 
 
 
375 aa  335  5e-91  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2548  RpoD family RNA polymerase sigma factor  53.29 
 
 
386 aa  331  1e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000188671  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0418  RpoD family RNA polymerase sigma factor  55.15 
 
 
405 aa  323  2e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.36258  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4616  RpoD family RNA polymerase sigma factor  54.61 
 
 
401 aa  322  7e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3114  RpoD family RNA polymerase sigma factor  58.22 
 
 
349 aa  321  9.000000000000001e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000106711  hitchhiker  0.00595378 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0015  RpoD family RNA polymerase sigma factor  52.63 
 
 
400 aa  311  6.999999999999999e-84  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0128011  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0365  RNA polymerase, sigma 70 subunit, RpoD subfamily  48.9 
 
 
338 aa  303  4.0000000000000003e-81  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0713  RNA polymerase, sigma 70 subunit, RpoD subfamily  51.5 
 
 
417 aa  301  9e-81  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0157  RNA polymerase sigma factor RpoD  49.7 
 
 
375 aa  299  5e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1283  sigma 38  52.33 
 
 
409 aa  298  1e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2129  RpoD family RNA polymerase sigma factor  52.33 
 
 
409 aa  298  1e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2414  RNA polymerase sigma factor RpoD  50.8 
 
 
374 aa  296  4e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000700134  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3197  RNA polymerase, sigma 70 subunit, RpoD subfamily  50.3 
 
 
385 aa  295  5e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119315  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0624  RNA polymerase sigma factor RpoD  51.27 
 
 
361 aa  295  6e-79  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00076534  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0895  RNA polymerase sigma factor RpoD  51.66 
 
 
358 aa  295  7e-79  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000160053  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1113  RNA polymerase sigma factor RpoD  50.5 
 
 
373 aa  294  1e-78  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000049377  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3019  RNA polymerase sigma factor RpoD  50.16 
 
 
373 aa  293  3e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000207905  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4216  RNA polymerase sigma factor RpoD  51.16 
 
 
372 aa  292  7e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000301264  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4144  RNA polymerase sigma factor RpoD  49.84 
 
 
375 aa  291  1e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000635558  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4379  RpoD family RNA polymerase sigma factor  48.44 
 
 
400 aa  291  1e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.222017  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3036  RNA polymerase sigma factor RpoD  51.16 
 
 
359 aa  291  1e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0549205  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4409  RNA polymerase sigma factor RpoD  49.84 
 
 
375 aa  291  1e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000427068  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0824  RNA polymerase, sigma 70 subunit, RpoD subfamily  50.17 
 
 
455 aa  291  1e-77  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00671165  hitchhiker  0.000482481 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0827  RNA polymerase sigma factor RpoD  49.84 
 
 
375 aa  291  1e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000804536  decreased coverage  6.75333e-22 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2462  RNA polymerase sigma factor RpoD  51.16 
 
 
367 aa  291  1e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0127291  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4372  RNA polymerase sigma factor RpoD  49.84 
 
 
375 aa  291  2e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000624256  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4194  RNA polymerase sigma factor RpoD  49.84 
 
 
373 aa  291  2e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000145872  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4032  RNA polymerase sigma factor RpoD  49.84 
 
 
373 aa  291  2e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.92398e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4042  RNA polymerase sigma factor RpoD  49.84 
 
 
373 aa  291  2e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000102439  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1311  RNA polymerase, sigma 70 subunit, RpoD subfamily  50.83 
 
 
409 aa  290  2e-77  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.046516 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4426  RNA polymerase sigma factor RpoD  49.84 
 
 
375 aa  291  2e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000104378  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4515  RNA polymerase sigma factor RpoD  49.84 
 
 
373 aa  291  2e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000315443  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4314  RNA polymerase sigma factor RpoD  49.84 
 
 
373 aa  291  2e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.2227e-62 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0743  RNA polymerase sigma factor RpoD  49.83 
 
 
380 aa  290  2e-77  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000129687  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12400  RNA polymerase, sigma 70 subunit, RpoD family  51.83 
 
 
358 aa  290  3e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0607  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09100  RNA polymerase sigma factor RpoD, C-terminal domain/RNA polymerase sigma factor, sigma-70 family  51.97 
 
 
422 aa  290  4e-77  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.321739  normal  0.63498 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1726  RNA polymerase, sigma 70 subunit, RpoD subfamily  50.5 
 
 
369 aa  290  4e-77  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1619  RNA polymerase sigma factor RpoD  48.61 
 
 
368 aa  289  5.0000000000000004e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000324281  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1653  RNA polymerase sigma factor RpoD  48.61 
 
 
368 aa  289  5.0000000000000004e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000164842  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2352  RNA polymerase sigma factor RpoD  50.32 
 
 
392 aa  288  1e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0492  RNA polymerase sigma factor RpoD  50.17 
 
 
360 aa  288  1e-76  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.187427  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1127  RNA polymerase sigma factor RpoD  49.5 
 
 
368 aa  287  2e-76  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  unclonable  0.00000000000620377  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1188  RpoD subfamily RNA polymerase sigma-70  49.68 
 
 
367 aa  286  4e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0996  DNA-directed RNA polymerase, sigma subunit (sigma70/sigma32)  47.51 
 
 
458 aa  283  2.0000000000000002e-75  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.0000205805  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3521  RpoD family RNA polymerase sigma factor  48.68 
 
 
372 aa  283  4.0000000000000003e-75  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0582772  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0234  RpoD family RNA polymerase sigma factor  47.16 
 
 
371 aa  281  9e-75  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000417606  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1509  RNA polymerase sigma factor  48.85 
 
 
435 aa  280  3e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3764  RNA polymerase, sigma 70 subunit, RpoD subfamily  48.52 
 
 
448 aa  279  4e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.343389 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0757  RNA polymerase, sigma 70 subunit, RpoD subfamily  48.28 
 
 
326 aa  279  6e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1223  RNA polymerase, sigma 70 subunit, RpoD subfamily  48.42 
 
 
387 aa  278  9e-74  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0115586  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1314  RNA polymerase sigma factor RpoD  48.95 
 
 
357 aa  278  1e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000145678  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24330  RNA polymerase, sigma 70 subunit, RpoD  48.52 
 
 
439 aa  278  1e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.134736 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1241  DNA-directed RNA polymerase, sigma subunit (sigma70/sigma32)  48.17 
 
 
432 aa  277  2e-73  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00483871  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2139  RNA polymerase sigma factor  48.17 
 
 
616 aa  276  3e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2057  RNA polymerase, sigma 70 subunit, RpoD subfamily  48.17 
 
 
495 aa  276  4e-73  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.130961  normal  0.746729 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1215  RNA polymerase, sigma 70 subunit, RpoD family  49.83 
 
 
360 aa  276  5e-73  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000000256701  hitchhiker  0.00656648 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1427  RNA polymerase, sigma 70 subunit, RpoD subfamily  47.84 
 
 
504 aa  275  6e-73  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.744088 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1977  RNA polymerase, sigma 70 subunit, RpoD subfamily  51.5 
 
 
368 aa  276  6e-73  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.129295  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15880  RNA polymerase, sigma 70 subunit, RpoD  48.17 
 
 
516 aa  274  1.0000000000000001e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.876653  normal  0.155423 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2245  RNA polymerase sigma factor RpoD  47.85 
 
 
489 aa  274  1.0000000000000001e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0297  RNA polymerase sigma factor  45.9 
 
 
474 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1864  RNA polymerase, sigma 70 subunit, RpoD subfamily  48.18 
 
 
429 aa  274  1.0000000000000001e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.123565  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1761  RNA polymerase sigma factor  45.48 
 
 
559 aa  274  1.0000000000000001e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0201  RNA polymerase, sigma 70 subunit, RpoD subfamily  49.83 
 
 
398 aa  274  2.0000000000000002e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.974231  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1430  RNA polymerase, sigma 28 subunit  46.13 
 
 
495 aa  274  2.0000000000000002e-72  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.916682  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13280  RNA polymerase sigma factor RpoD, C-terminal domain/RNA polymerase sigma factor, sigma-70 family  46.15 
 
 
497 aa  273  3e-72  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00389203  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0692  RNA polymerase sigma factor RpoD  45.57 
 
 
489 aa  273  4.0000000000000004e-72  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2185  RNA polymerase sigma factor  47.71 
 
 
480 aa  273  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2231  RNA polymerase sigma factor  47.71 
 
 
480 aa  273  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.128274  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2174  RNA polymerase sigma factor  47.71 
 
 
480 aa  273  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.512894  hitchhiker  0.00228971 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1531  RNA polymerase sigma factor  46.33 
 
 
502 aa  272  5.000000000000001e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.138503  decreased coverage  0.00383208 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1448  RNA polymerase sigma factor RpoD  47.06 
 
 
369 aa  273  5.000000000000001e-72  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000454729  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1917  RNA polymerase sigma factor  47.16 
 
 
499 aa  272  5.000000000000001e-72  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0130031 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1991  RNA polymerase, sigma 70 subunit, RpoD subfamily  43.75 
 
 
549 aa  271  9e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.918536  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0762  RNA polymerase, sigma 70 subunit, RpoD subfamily  49.66 
 
 
364 aa  271  1e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09420  RNA polymerase sigma factor RpoD, C-terminal domain/RNA polymerase sigma factor, sigma-70 family  48.18 
 
 
394 aa  271  1e-71  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.702533 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1424  RNA polymerase sigma factor SigB  46.25 
 
 
328 aa  271  1e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0865315  hitchhiker  0.0000203032 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12718  RNA polymerase sigma factor  47.85 
 
 
528 aa  271  1e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3939  RNA polymerase sigma factor  46.56 
 
 
488 aa  271  1e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1426  RNA polymerase sigma factor RpoD  47.06 
 
 
369 aa  270  2e-71  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0144524  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1607  RNA polymerase, sigma 70 subunit, RpoD subfamily  47.33 
 
 
559 aa  271  2e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.512877  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1878  RNA polymerase, sigma 70 subunit, RpoD subfamily  47.21 
 
 
483 aa  270  2e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.230521  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0551  RNA polymerase sigma factor RpoD  53.78 
 
 
520 aa  270  2.9999999999999997e-71  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0248061  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0867  sigma-70 factor  47.26 
 
 
388 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.515579  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2264  RNA polymerase sigma factor RpoD  49.83 
 
 
366 aa  270  2.9999999999999997e-71  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0028881  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5068  RNA polymerase sigma factor RpoD  44.25 
 
 
386 aa  270  2.9999999999999997e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.651182  normal  0.814117 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1617  RNA polymerase, sigma 28 subunit  46.84 
 
 
441 aa  270  2.9999999999999997e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00878104  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2461  RNA polymerase sigma factor  47.19 
 
 
478 aa  270  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0257  RpoD family RNA polymerase sigma factor  55.33 
 
 
541 aa  270  4e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.201917 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1975  RNA polymerase sigma factor RpoD  49.83 
 
 
366 aa  270  4e-71  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000064083  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0287  RpoD family RNA polymerase sigma factor  55.79 
 
 
541 aa  270  4e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.332062  hitchhiker  0.00728099 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>