More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5649 on replicon NC_011366
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011366  Rleg2_5649  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  100 
 
 
200 aa  409  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0906449  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6585  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  94.5 
 
 
200 aa  387  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00458703 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4311  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.82 
 
 
1291 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2453  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.5 
 
 
969 aa  87  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.19952  normal  0.304956 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1002  signal transduction histidine kinase  32.58 
 
 
932 aa  82.4  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.353608  normal  0.0662086 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.71 
 
 
1771 aa  82  0.000000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0859  sensory box histidine kinase/response regulator  33.09 
 
 
1765 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0096  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  36.97 
 
 
407 aa  80.5  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.758352  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3200  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.14 
 
 
1768 aa  79  0.00000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5198  putative PAS/PAC sensor protein  31.03 
 
 
694 aa  77.8  0.00000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0858  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.71 
 
 
1792 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0870  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.71 
 
 
1786 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.71 
 
 
1782 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3110  putative integral membrane sensor protein  31.58 
 
 
1141 aa  77  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0940316 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3505  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.71 
 
 
1784 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2952  sensory box histidine kinase/response regulator  33.04 
 
 
1763 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.230032 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0628  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.7 
 
 
1765 aa  75.9  0.0000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3419  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.82 
 
 
1767 aa  75.5  0.0000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3461  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.8 
 
 
328 aa  74.7  0.0000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.948004  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3044  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  26.98 
 
 
325 aa  74.7  0.0000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.202604  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0715  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.82 
 
 
1767 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.82 
 
 
1767 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0245  signal transduction protein containing a membrane domain an EAL and a GGDEF domain  32.17 
 
 
1076 aa  73.2  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0647  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.89 
 
 
1064 aa  73.6  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2805  putative PAS/PAC sensor protein  30.09 
 
 
658 aa  73.2  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.126133 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2634  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  33.33 
 
 
768 aa  71.2  0.000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1087  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.36 
 
 
1121 aa  70.9  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.740067  hitchhiker  0.00000751372 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2804  putative PAS/PAC sensor protein  29.66 
 
 
711 aa  70.1  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0770283 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1352  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.67 
 
 
732 aa  69.3  0.00000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.161755  normal  0.747327 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3856  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  28.1 
 
 
419 aa  68.9  0.00000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.538878  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3722  ATP-binding region, ATPase-like protein  32.46 
 
 
1120 aa  68.2  0.00000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1419  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.57 
 
 
769 aa  65.5  0.0000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849788  normal  0.753623 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0082  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.73 
 
 
946 aa  65.1  0.0000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2841  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  27.39 
 
 
714 aa  64.3  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0729826  normal  0.310526 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1213  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.06 
 
 
1139 aa  63.2  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000299101 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2225  putative PAS/PAC sensor protein  31.06 
 
 
509 aa  62.4  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00360384  normal  0.281465 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0566  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.7 
 
 
452 aa  62.4  0.000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2731  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.41 
 
 
430 aa  62  0.000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1723  signal transduction histidine kinase  30.97 
 
 
764 aa  62  0.000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2249  methyl-accepting chemotaxis transducer  44.32 
 
 
643 aa  61.2  0.000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.477129  normal  0.786945 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0517  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  28.7 
 
 
1072 aa  61.2  0.000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.251594  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1880  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  44.32 
 
 
628 aa  61.2  0.000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.454316  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2083  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.91 
 
 
647 aa  60.8  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0223967  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3489  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.32 
 
 
628 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.228387  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2624  PAS domain-containing protein  31.07 
 
 
244 aa  60.5  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.100385  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3335  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.32 
 
 
1122 aa  60.8  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4964  methyl-accepting chemotaxis protein  41.11 
 
 
545 aa  60.5  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0933  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.22 
 
 
780 aa  60.1  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.156704 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0144  putative PAS/PAC sensor protein  26.79 
 
 
433 aa  60.1  0.00000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1120  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.84 
 
 
664 aa  60.5  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00177625  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3309  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.05 
 
 
625 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.776822 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1866  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.05 
 
 
650 aa  60.1  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0660  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.86 
 
 
675 aa  59.7  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.84238 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1776  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.84 
 
 
664 aa  60.5  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01755  putative two-component member protein  29.06 
 
 
1111 aa  60.1  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0872  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.38 
 
 
685 aa  60.1  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0683  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  52.17 
 
 
568 aa  59.7  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.268569  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2989  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45 
 
 
1093 aa  59.7  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.653084  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1298  methyl-accepting chemotaxis protein  52.17 
 
 
568 aa  59.7  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0950  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.3 
 
 
546 aa  59.7  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.187483 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3297  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.3 
 
 
548 aa  59.7  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3048  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.3 
 
 
601 aa  59.7  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.229221  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1735  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.72 
 
 
868 aa  59.7  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0949  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.3 
 
 
554 aa  59.7  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0219131 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3298  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.3 
 
 
553 aa  59.3  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.62981  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1191  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.84 
 
 
846 aa  59.7  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1122  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.96 
 
 
396 aa  59.7  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00175946  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1300  methyl-accepting chemotaxis protein  56.45 
 
 
563 aa  59.3  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1304  methyl-accepting chemotaxis protein  56.45 
 
 
566 aa  59.3  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0873  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50 
 
 
591 aa  58.9  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0791  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.19 
 
 
1118 aa  59.3  0.00000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3232  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.19 
 
 
1118 aa  58.9  0.00000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1733  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.72 
 
 
823 aa  59.3  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1790  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.86 
 
 
694 aa  59.3  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2408  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  34.86 
 
 
623 aa  58.9  0.00000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2440  methyl accepting chemotaxis protein  42.86 
 
 
770 aa  58.9  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1723  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  43.18 
 
 
626 aa  58.9  0.00000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.372844  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1104  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.86 
 
 
792 aa  58.9  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1538  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.33 
 
 
413 aa  58.5  0.00000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0288765 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3452  putative PAS/PAC sensor protein  32.73 
 
 
221 aa  58.5  0.00000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.413638  normal  0.532331 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1294  methyl-accepting chemotaxis protein  50.72 
 
 
962 aa  58.2  0.00000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56010  chemotactic transducer PctB  41.11 
 
 
629 aa  58.2  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4877  chemotactic transducer PctB  41.11 
 
 
629 aa  58.2  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.164155  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002906  methyl-accepting chemotaxis protein  33.96 
 
 
678 aa  58.2  0.00000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.816112  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2050  methyl-accepting chemotaxis protein  39.33 
 
 
704 aa  57.8  0.00000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.459277  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0295  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.52 
 
 
542 aa  58.2  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.579755 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55960  chemotactic transducer PctC  41.11 
 
 
632 aa  58.2  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.289325  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2985  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.28 
 
 
576 aa  58.2  0.00000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.293775  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0273  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  27.78 
 
 
1078 aa  58.2  0.00000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7320  methyl-accepting chemotaxis protein  43.24 
 
 
774 aa  57.4  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.364364  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00480  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.76 
 
 
676 aa  57.8  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3093  methyl-accepting chemotaxis protein  38.37 
 
 
576 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0379  methyl-accepting chemotaxis protein  39.53 
 
 
579 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2705  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.96 
 
 
509 aa  57.8  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3394  methyl-accepting chemotaxis protein  38.37 
 
 
530 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.834247  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0327  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.52 
 
 
544 aa  57.8  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.141004  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0861  chemotaxis sensory transducer  39 
 
 
481 aa  57.4  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04310  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.82 
 
 
689 aa  57.4  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2249  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.82 
 
 
1143 aa  57.8  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.673162  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4874  chemotactic transducer PctC  41.11 
 
 
632 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.153332  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>