More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1363 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1363  carbohydrate kinase, YjeF related protein  100 
 
 		 294 aa  593  1e-169  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0585  carbohydrate kinase, YjeF related protein  69.34 
 
 		 294 aa  387  1e-107  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2379  hypothetical protein  43.55 
 
 		 506 aa  185  9e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1527  carbohydrate kinase, YjeF related protein  43.27 
 
 		 531 aa  169  4e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.643488  normal  0.335611 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1860  carbohydrate kinase, YjeF related protein  42.91 
 
 		 531 aa  168  9e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000355774 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1720  hypothetical protein  41.24 
 
 		 531 aa  157  2e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.240927 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0339  hypothetical protein  35.62 
 
 		 498 aa  152  8e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00480998  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2384  hypothetical protein  38.41 
 
 		 522 aa  150  2e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3973  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.98 
 
 		 504 aa  150  3e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3726  hypothetical protein  39.27 
 
 		 514 aa  149  6e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.10556  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1915  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.88 
 
 		 529 aa  149  7e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.513601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4690  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.71 
 
 		 286 aa  146  3e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.993931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1084  hypothetical protein  39.05 
 
 		 494 aa  146  3e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.387482  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06226  sugar kinase  38.16 
 
 		 512 aa  147  3e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3924  hypothetical protein  38.37 
 
 		 510 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00146397  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1387  hypothetical protein  40.14 
 
 		 526 aa  145  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.176356  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4716  hypothetical protein  36.99 
 
 		 514 aa  143  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0539354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1817  hypothetical protein  40.29 
 
 		 490 aa  143  3e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5089  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.46 
 
 		 493 aa  143  3e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000420091  normal  0.19658 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3804  hypothetical protein  40.24 
 
 		 504 aa  144  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000026757  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4773  hypothetical protein  36.99 
 
 		 514 aa  143  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0676995 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4633  hypothetical protein  36.99 
 
 		 514 aa  143  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000149389  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4951  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.71 
 
 		 307 aa  143  4e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.479254  normal  0.232956 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4752  hypothetical protein  36.99 
 
 		 514 aa  143  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0825058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3658  hypothetical protein  40.24 
 
 		 504 aa  143  4e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000233957  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4623  hypothetical protein  36.99 
 
 		 514 aa  143  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3243  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.41 
 
 		 502 aa  143  4e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2628  hypothetical protein  37.89 
 
 		 493 aa  142  5e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0704  hypothetical protein  39.84 
 
 		 504 aa  142  5e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000056197  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4899  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.68 
 
 		 286 aa  142  8e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4775  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.68 
 
 		 307 aa  142  8e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.686463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3030  YjeF protein  37.41 
 
 		 496 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0530  hypothetical protein  38.49 
 
 		 503 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0814299  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1191  sugar kinase  37.59 
 
 		 486 aa  140  1.9999999999999998e-32  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.298101  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2755  hypothetical protein  37.94 
 
 		 493 aa  140  3e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1229  putative carbohydrate kinase  37.59 
 
 		 488 aa  140  3e-32  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2286  hypothetical protein  38.41 
 
 		 533 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.2474 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0630  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.48 
 
 		 499 aa  137  2e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.522163 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3545  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.79 
 
 		 492 aa  137  2e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0553  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.1 
 
 		 494 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000595011  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1912  YjeF-related protein-like protein  40.73 
 
 		 487 aa  137  2e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0133146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0592  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.5 
 
 		 499 aa  137  2e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000415893 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3715  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.1 
 
 		 494 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0598  yjeF protein  35.77 
 
 		 499 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3285  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.5 
 
 		 499 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00260957  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3846  hypothetical protein  36 
 
 		 510 aa  136  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000624619  hitchhiker  0.00000292473 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0593  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.5 
 
 		 499 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.320661  hitchhiker  0.00000405423 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3898  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.1 
 
 		 494 aa  136  4e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000196302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4408  hypothetical protein  36 
 
 		 515 aa  136  4e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000123487  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0792  carbohydrate kinase, YjeF-related protein  35.48 
 
 		 492 aa  136  4e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0035803 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3826  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36 
 
 		 515 aa  136  5e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000026579  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2570  carbohydrate kinase, YjeF related protein  40.51 
 
 		 513 aa  136  5e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0989158  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4724  hypothetical protein  36 
 
 		 515 aa  136  5e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000041383  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4638  hypothetical protein  35.64 
 
 		 510 aa  136  5e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000291773  normal  0.0355337 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5683  hypothetical protein  36 
 
 		 510 aa  136  5e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000899207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65390  hypothetical protein  35.51 
 
 		 502 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0626  hypothetical protein  40.55 
 
 		 482 aa  135  7.000000000000001e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0494651  normal  0.803312 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3437  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.36 
 
 		 499 aa  135  8e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.446111  normal  0.221498 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04034  predicted carbohydrate kinase  36 
 
 		 515 aa  135  9e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00166005  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03996  hypothetical protein  36 
 
 		 515 aa  135  9e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000718963  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1453  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.97 
 
 		 501 aa  134  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.105421  normal  0.158331 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3022  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.47 
 
 		 520 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0350  hypothetical protein  35.74 
 
 		 508 aa  135  9.999999999999999e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00103587  hitchhiker  0.0000473112 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4175  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.78 
 
 		 488 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3772  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.04 
 
 		 494 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00405966  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0775  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.26 
 
 		 533 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00360184  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2084  hypothetical protein  37.1 
 
 		 496 aa  133  3e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1301  YjeF-related protein  35.52 
 
 		 436 aa  133  3e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4698  hypothetical protein  35.64 
 
 		 515 aa  133  3e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000112402  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000472  YjeF protein  36.17 
 
 		 513 aa  133  3.9999999999999996e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4947  YjeF-related protein  33.67 
 
 		 496 aa  132  6e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1020  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.38 
 
 		 530 aa  132  6e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2333  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.94 
 
 		 506 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0518  hypothetical protein  37.13 
 
 		 499 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.125953  normal  0.1584 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1261  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.45 
 
 		 514 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.169741  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6163  hypothetical protein  39.86 
 
 		 514 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1916  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.86 
 
 		 514 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.194731  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2005  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.5 
 
 		 496 aa  131  1.0000000000000001e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0487  hypothetical protein  39.56 
 
 		 513 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000620084  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2672  ribosomal protein S15  42.15 
 
 		 500 aa  130  2.0000000000000002e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1878  hypothetical protein  36.4 
 
 		 535 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00309539  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0320  YjeF family protein  34.86 
 
 		 524 aa  130  3e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0426  hypothetical protein  35.87 
 
 		 462 aa  129  5.0000000000000004e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.00000000379244  hitchhiker  0.000000929429 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1884  hypothetical protein  36.58 
 
 		 517 aa  129  6e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3771  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.36 
 
 		 519 aa  129  8.000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0302209  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00644  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.29 
 
 		 499 aa  128  9.000000000000001e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1954  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.87 
 
 		 509 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0698225  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1939  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.34 
 
 		 514 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.643573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2168  hypothetical protein  36.64 
 
 		 530 aa  127  3e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00013257  decreased coverage  0.0000197316 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2259  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.45 
 
 		 525 aa  127  3e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.997976  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1834  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.71 
 
 		 514 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.431343 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1905  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.03 
 
 		 511 aa  125  7e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0197843  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5217  hypothetical protein  40.07 
 
 		 514 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.434406 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1647  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.61 
 
 		 524 aa  125  8.000000000000001e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0299074  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3823  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.78 
 
 		 492 aa  125  1e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1904  carbohydrate kinase, YjeF related protein  40.07 
 
 		 514 aa  124  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0892  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.28 
 
 		 490 aa  124  1e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.177662  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0427  carbohydrate kinase family protein  30.8 
 
 		 512 aa  124  2e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00841365  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2757  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.05 
 
 		 494 aa  124  2e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0561  carbohydrate kinase, YjeF-related protein  35.25 
 
 		 492 aa  124  2e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0026662  normal  0.240164 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>